Performance evaluation of the Hilbert–Huang transform for respiratory sound analysis and its application to continuous adventitious sound characterization

© 2016. This manuscript version is made available under the CC-BY-NC-ND 4.0 license http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/The use of the Hilbert–Huang transform in the analysis of biomedical signals has increased during the past few years, but its use for respiratory sound (RS) analysis is still limited. The technique includes two steps: empirical mode decomposition (EMD) and instantaneous frequency (IF) estimation. Although the mode mixing (MM) problem of EMD has been widely discussed, this technique continues to be used in many RS analysis algorithms. In this study, we analyzed the MM effect in RS signals recorded from 30 asthmatic patients, and studied the performance of ensemble EMD (EEMD) and noise-assisted multivariate EMD (NA-MEMD) as means for preventing this effect. We propose quantitative parameters for measuring the size, reduction of MM, and residual noise level of each method. These parameters showed that EEMD is a good solution for MM, thus outperforming NA-MEMD. After testing different IF estimators, we propose Kay¿s method to calculate an EEMD-Kay-based Hilbert spectrum that offers high energy concentrations and high time and high frequency resolutions. We also propose an algorithm for the automatic characterization of continuous adventitious sounds (CAS). The tests performed showed that the proposed EEMD-Kay-based Hilbert spectrum makes it possible to determine CAS more precisely than other conventional time-frequency techniques.Postprint (author's final draft

Análisis de la intensidad de los sonidos respiratorios para el diagnóstico de la parálisis frénica unilateral

El análisis acústico de la intensidad de los sonidos respiratorios (ISR) es una medida indirecta y no invasiva de la función respiratoria, que permite comparar la actividad en los dos hemitórax de los pacientes con parálisis frénica unilateral. Se registraron los sonidos y el flujo respiratorio en 10 hombres con parálisis frénica unilateral y 10 sujetos sanos (5 hombres/5 mujeres) en posición sentada. Se colocaron 2 micrófonos de contacto en la espalda, uno a cada lado de la columna. La ISR se calculó en el rango frecuencial 70-2000 Hz a partir de la densidad espectral de potencia y para flujos entre 1,2 y 2,4 l/s. Se encontró que las diferencias en la ISR media de los dos hemitórax era significativamente mayor en los pacientes (13.5 dB) que en los sujetos sanos (2.3 dB). Además, se comprobó que esa diferencia era mayor en pacientes con un VEF1 menor. Por lo tanto, el análisis acústico de la ISR es una técnica no invasiva muy útil para valorar la función respiratoria. Esta técnica puede mejorar la fiabilidad en el diagnóstico de la parálisis frénica unilateral así como la monitorización a largo plazo de estos pacientes.Peer ReviewedPostprint (published version

Analysis of normal and continuous adventitious sounds for the assessment of asthma

Peer ReviewedPostprint (author’s final draft

Propuesta de innovación curricular y didáctica para el abordaje jurídico del deporte y de las organizaciones deportivas en la asignatura Periodismo Deportivo II de la Tecnicatura en Periodismo Deportivo, de la Facultad de Periodismo y Comunicación Social de la UNLP

El presente Trabajo Final Integrador (TFI), realizado en el marco de la Especialización en Docencia Universitaria que dicta la Universidad Nacional de La Plata (UNLP), consiste en la elaboración de una propuesta de innovación curricular y didáctica mediante la incorporación, al programa de estudio de la materia Periodismo Deportivo II (Cátedra I) de la carrera Tecnicatura Superior Universitaria en Periodismo Deportivo, de la Facultad de Periodismo y Comunicación Social (FPyCS) de la UNLP, de una unidad temática a partir de la identificación de un área de vacancia en esta propuesta curricular, en la que se incluyan, además de contenidos historiográficos y sociológicos, saberes de tipo jurídico referidos a las confederaciones, federaciones, asociaciones, ligas y clubes deportivos, así como el diseño de secuencias didácticas para la enseñanza del mencionado contenido.Asesora: Andrea IottiFacultad de Periodismo y Comunicación Socia

Net sea-air CO2 flux uncertainties in the Bay of Biscay based on the choice of wind speed products and gas transfer parameterizations

25 páginas, 4 figuras, 1 tablaThe estimation of sea-air CO2 fluxes are largely dependent on wind speed through the gas transfer velocity parameterization. In this paper, we quantify uncertainties in the estimation of the CO2 uptake in the Bay of Biscay resulting from using different sources of wind speed such as three different global reanalysis meteorological models (NCEP/NCAR 1, NCEP/DOE 2 and ERA-Interim), one regional high-resolution forecast model (HIRLAM-AEMet) and QuikSCAT winds, in combination with some of the most widely used gas transfer velocity parameterizations. Results show that net CO2 flux estimations during an entire seasonal cycle may differ up to 240% depending on the wind speed product and the gas exchange parameterization. The comparison of satellite and model derived winds with observations at buoys advises against the systematic overestimation of NCEP-2 and the underestimation of NCEP-1. In this region, QuikSCAT has the best performing, although ERA-Interim becomes the best choice in areas near the coastline or when the time resolution is the constraint.This work was developed and funded by the ECO project (MCyT REN2002-00503/MAR) and EU FP7 project CARBOCHANGE “Changes 5 in carbon uptake and emissions by oceans in a changing climate” under agreement no. 264879Peer reviewe

Evidencias do cambio climático na hidrografía e a dinámica das rías e da plataforma galega

16 páginas, 9 figuras, 3 tablas[EN] This study is focused on multidecadal-scale variations of the hydrographic and hydrodynamic features of Rías and shelf waters off Galicia. Water masses take, through their thermohaline characteristics, a footprint of the climatic variability, mainly caused by changes either in the hydrological budget (precipitation, evaporation, runoff), in heat exchange and wind stress. In this study we focus in the evidences of change in the surface and sub-surface water mass characteristics. Regarding surface water masses, a significant warming during the last 45 years has been noticed, at a rate of 0.17 ºC/ decade. This warming was especially intense from the 1970’s, 0.27 ºC/decade. The tendency is opposite in subsurface waters, but it only takes into account data from the last 15 years. Regarding hydrodynamics, because of its strong influence in the renewal time of the Rías and consequently in their living resources, a study of decadal changes in the estuarine circulation of the Rías de Vigo and Arousa has been made. Results showed a progressive decay in the estuarine circulation, which causes an increase of renewal times. On the other hand, indirect evidence of a possible deceleration of the winter Iberian Poleward Current (IPC) are reported. This slow down is partially caused by a decrease in the meridional (N-S) temperature gradient off the Iberian coast. Nevertheless, the fall of the meridional gradient is not clear because it has been inferred from surface waters. On the contrary, IPC seems to be intensified by the increasing southerly autumn winds, although it appears weakened by the decreasing southerly winter winds. Thus, the overall effect of the CIP is still uncertain. Finally, a study of sea level and wave changes on the Galician coast has been made. An increase of (2-2.5 cm/ decade) in the sea level as well as a decrease in the wave height (3 cm/decade) has been reported, but in this last topic results are not significant[GA] Este estudo centrarase en determinar as variacións que ocorren a escalas multidecadais nas características hidrográficas e hidrodinámicas das augas das rías e da plataforma fronte a Galicia. As masas de auga reciben a través das súas características termohalinas unha pegada das alteracións climáticas, principalmente a causa de cambios no balance hidrolóxico (precipitación, evaporación, achegas continentais), do intercambio de calor e da acción do vento. Neste estudo analizaremos as evidencias de cambio nas características das masas de auga superficiais e subsuperficiais. Nas primeiras detectouse quentamento de xeito significativo nos últimos 45 anos a unha taxa media de 0,17 ºC por década, especialmente intenso desde hai 30 anos, 0,27 ºC por década. Nas augas subsuperficiais a tendencia é a inversa, aínda que só se conta con datos dos últimos 15 anos. En canto á hidrodinámica, e pola súa forte implicación nos tempos de renovación da ría e, polo tanto, nos recursos mariños que viven nela, fíxose un estudo sobre os cambios na circulación estuárica das rías de Vigo e Arousa nas últimas décadas. Os resultados amosan un descenso paulatino a longa escala temporal da circulación que causa un aumento dos tempos de renovación. Por outra banda, achéganse evidencias indirectas dunha posible ralentización da corrente invernal cara ao Polo (CIP) causada por un descenso no gradiente meridional (N-S) de temperatura fronte ás costas ibéricas. Non obstante, o descenso do gradiente meridional non está claro, pois induciuse só a partir de datos superficiais. Ademais, a propia CIP amosa estar intensificada pola maior intensidade dos ventos sur no outono e debilitada polo descenso dos ventos do sur no inverno, polo que o efecto global na CIP é aínda incerto. Por último, faise un estudo dos cambios do nivel do mar e da ondada nas costas galegas que amosa un aumento daquel (2-2,5 cm/década) e un descenso desta (3 cm/década), aínda que no caso da ondada os resultados non son concluíntesPeer reviewe

La Nación y El Mundo: coberturas periodísticas de la Segunda Guerra Ruso-Chechena

El presente trabajo consiste en un estudio en comunicación social, que analiza la cobertura periodística que los diarios La Nación (Argentina) y El Mundo (España) realizaron sobre la Segunda Guerra Ruso-Chechena. Para ello, se toma como corpus de estudio a las noticias publicadas por ambos matutinos entre el 1° de octubre de 1999, día en el que se inició la invasión rusa a Chechenia, y el 5 de marzo de 2000, fecha en la que se cumplieron dos semanas del final de la guerra a gran escala y de la caída de la ciudad de Grozny (capital chechena) a manos del ejército de la Federación Rusa.Facultad de Periodismo y Comunicación Socia

La Nación y El Mundo: coberturas periodísticas de la Segunda Guerra Ruso-Chechena

El presente trabajo consiste en un estudio en comunicación social, que analiza la cobertura periodística que los diarios La Nación (Argentina) y El Mundo (España) realizaron sobre la Segunda Guerra Ruso-Chechena. Para ello, se toma como corpus de estudio a las noticias publicadas por ambos matutinos entre el 1° de octubre de 1999, día en el que se inició la invasión rusa a Chechenia, y el 5 de marzo de 2000, fecha en la que se cumplieron dos semanas del final de la guerra a gran escala y de la caída de la ciudad de Grozny (capital chechena) a manos del ejército de la Federación Rusa.Facultad de Periodismo y Comunicación Socia

Tuberculine reaction measured by infrared thermography

Setting: The infection with Mycobacterium tuberculosis gives a delayed immune response, measured by the tuberculine skin test. We present a new technique for evaluation based on automatic detection and measurement of skin temperature due to infrared emission.; Design: 34 subjects (46.8+/-16.9 years) (12/22, M/F) with suspected tuberculosis disease were examined with an IR thermal camera, 48h after tuberculin skin injection.; Results: In 20 subjects, IR analysis was positive for tuberculine test. Mean temperature of injection area was higher, around 1 degrees C, for the positive group (36.2+/-1.1 degrees C positive group; 35.1+/-1.6 degrees C negative group, p < 0.02 T test for unpaired groups).; Conclusion: IR image analysis achieves similar estimation of tuberculin reaction as the visual evaluation, based on higher temperature due to increased heat radiation from the skin lesion.Peer ReviewedPostprint (author's final draft

Impact of RSUME Actions on Biomolecular Modifications in Physio-Pathological Processes

The small RWD domain-containing protein called RSUME or RWDD3 was cloned from pituitary tumor cells with increasing tumorigenic and angiogenic proficiency. RSUME expression is induced under hypoxia or heat shock and is upregulated, at several pathophysiological stages, in tissues like pituitary, kidney, heart, pancreas, or adrenal gland. To date, several factors with essential roles in endocrine-related cancer appear to be modulated by RWDD3. RSUME regulates, through its post-translational (PTM) modification, pituitary tumor transforming gene (PTTG) protein stability in pituitary tumors. Interestingly, in these tumors, another PTM, the regulation of EGFR levels by USP8, plays a pathogenic role. Furthermore, RSUME suppresses ubiquitin conjugation to hypoxia-inducible factor (HIF) by blocking VHL E3-ubiquitin ligase activity, contributing to the development of von Hippel-Lindau disease. RSUME enhances protein SUMOylation of specific targets involved in inflammation such as IkB and the glucocorticoid receptor. For many of its actions, RSUME associates with regulatory proteins of ubiquitin and SUMO cascades, such as the E2-SUMO conjugase Ubc9 or the E3 ubiquitin ligase VHL. New evidence about RSUME involvement in inflammatory and hypoxic conditions, such as cardiac tissue response to ischemia and neuropathic pain, and its role in several developmental processes, is discussed as well. Given the modulation of PTMs by RSUME in neuroendocrine tumors, we focus on its interactors and its mode of action. Insights into functional implications and molecular mechanisms of RSUME action on biomolecular modifications of key factors of pituitary adenomas and renal cell carcinoma provide renewed information about new targets to treat these pathologies.Fil: Fuertes, Mariana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Elguero, María Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Gonilski Pacin, David Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Herbstein, Florencia Lucía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Rosmino, Josefina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Ciancio del Giudice, Nicolas Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Fiz, Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Falcucci, Lara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Arzt, Eduardo Simon. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentin