Characterization of Toxoplasma gondii subtelomeric-like regions: identification of a long-range compositional bias that is also associated with gene-poor regions

Background Chromosome ends are composed of telomeric repeats and subtelomeric regions, which are patchworks of genes interspersed with repeated elements. Although chromosome ends display similar arrangements in different species, their sequences are highly divergent. In addition, these regions display a particular nucleosomal composition and bind specific factors, therefore producing a special kind of heterochromatin. Using data from currently available draft genomes we have characterized these putative Telomeric Associated Sequences in Toxoplasma gondii. Results An all-vs-all pairwise comparison of T. gondii assembled chromosomes revealed the presence of conserved regions of ∼ 30 Kb located near the ends of 9 of the 14 chromosomes of the genome of the ME49 strain. Sequence similarity among these regions is ∼ 70%, and they are also highly conserved in the GT1 and VEG strains. However, they are unique to Toxoplasma with no detectable similarity in other Apicomplexan parasites. The internal structure of these sequences consists of 3 repetitive regions separated by high-complexity sequences without annotated genes, except for a gene from the Toxoplasma Specific Family. ChIP-qPCR experiments showed that nucleosomes associated to these sequences are enriched in histone H4 monomethylated at K20 (H4K20me1), and the histone variant H2A.X, suggesting that they are silenced sequences (heterochromatin). A detailed characterization of the base composition of these sequences, led us to identify a strong long-range compositional bias, which was similar to that observed in other genomic silenced fragments such as those containing centromeric sequences, and was negatively correlated to gene density. Conclusions We identified and characterized a region present in most Toxoplasma assembled chromosomes. Based on their location, sequence features, and nucleosomal markers we propose that these might be part of subtelomeric regions of T. gondii. The identified regions display a unique trinucleotide compositional bias, which is shared (despite the lack of any detectable sequence similarity) with other silenced sequences, such as those making up the chromosome centromeres. We also identified other genomic regions with this compositional bias (but no detectable sequence similarity) that might be functionally similar.Fil: Dalmasso, Maria Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); ArgentinaFil: Carmona, Santiago Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); ArgentinaFil: Ángel, Sergio Oscar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas; ArgentinaFil: Agüero, Fernan Gonzalo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas; Argentin

Asymetric policies in Argentina and Brasil. Efects on their productive structure

El objetivo de este trabajo es, por un lado, analizar el aumento de las asimetrías productivas que se produjeron entre Argentina y Brasil durante las dos últimas décadas, vinculándolas con el déficit comercial de productos industriales que presenta hoy la Argentina en la relación bilateral. Por otro lado, se propone contribuir a la comprensión de las raíces de esas asimetrías a partir de las divergencias en las políticas implementadas por los dos países durante el período considerado que se extiende desde la implementación del MERCOSUR, a inicios de los años 90, hasta el año 2008.The papers aims, on the one hand, to analyze the increase of productive asymmetries that have occurred between Argentina and Brazil during the last two decades, relating them with the trade deficit of industrial products that Argentina shows today in the bilateral relationship. On the other hand, it intends to contribute to the understanding of the roots of these asymmetries looking at the differences in the public policies implemented by both countries during the period extending from the implementation of the MERCOSUR, in the early 90's, until 2008.Publicado en la sección "Tema central"Instituto de Integración Latinoamerican

Integração produtiva e políticas industriais: O caso da Argentina e do Brasil

La crisis europea nos plantea un conjunto de reflexiones que cobran gran relevancia en el contexto del MERCOSUR. Se vinculan, más allá de los problemas de endeudamiento que muestran algunos países, primero con la creación de una moneda común entre economías tan distintas y, luego, con la falta de convergencia en materia de competitividad que mostraron esas economías a lo largo del tiempo. . Nos demuestra claramente las serias tensiones que pueden generarse a partir de la falta de convergencia en la implementación de políticas y en el desarrollo de la competitividad de los países miembros. Es que en todos los procesos de integración regional pueden existir mayores o menores diferencias entre los países que se integran. El desafío es, hasta que punto la marcha de esos procesos contribuye a acercar los niveles de competitividad de esos países.En el caso de Argentina y Brasil, las asimetrías productivas que ambos países presentaban inicialmente tendieron a acentuarse durante el proceso de reestructuración que vivieron durante los ’90 y se vieron agravadas durante las crisis macroeconómicas sufridas hacia fines de esos años. En ese contexto, este trabajo se propone explorar los principales lineamientos de las políticas industriales llevadas a cabo por Brasil desde el inicio de los’90 y compararlas con las realizadas por la Argentina, a fin de determinar posibles razones del aumento en la brecha productiva que se ha generado entre ambos países y aportar al debate sobre estrategias futuras a nivel nacional y regional.En la sección II de este trabajo presentaremos un análisis comparativo de las reformas neoliberales que tuvieron lugar en Brasil durante los años ’90, señalando las similitudes y contrastes más relevantes respecto de lo ocurrido en la Argentina.. En la tercera sección ,analizaremos los principales lineamientos de la política industrial brasileña de la década presente o era Lula y sus resultados hasta el año 2008, y los compararemos con lo acontecido en la Argentina. Finalmente, expondremos algunas conclusiones que se desprenden del trabajo.A crise europeia nos impõe um conjunto de reflexões de grande relevância no contexto do Mercosul. Essas reflexões vão além dos problemas de endividamento de alguns países e dizem respeito, em primeiro lugar, à criação de uma moeda comum entre economias tão distintas e, em segundo lugar, à falta de convergência em matéria de competitividade apresentada por tais economias ao longo do tempo. A crise, de fato, põe em evidência as sérias tensões que podem ser geradas a partir da falta de convergência na implementação de políticas e no desenvolvimento da competitividade dos países membros. Em todos os processos de integração regional podem existir maiores ou menores diferenças entre os países que procuram se integrar. O desafio reside justamente em determinar até que ponto o desenrolar desses processos contribui no sentido de aproximar os níveis de competitividade desses países...Fil: Bekerman, Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Económicas. Instituto de Investigaciones Económicas. Centro de Estudios de la Estructura Económica; ArgentinaFil: Dalmasso, Gonzalo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Económicas. Instituto de Investigaciones Económicas. Centro de Estudios de la Estructura Económica; Argentin

ESTRUCTURA INDUSTRIAL Y ASIMETRÍAS DE POLÍTICA. ARGENTINA Y BRASIL, A 20 AÑOS DEL TRATADO DE ASUNCIÓN

The papers aims, on the one hand, to analyze the increase of productive asymmetries that have occurred between Argentina and Brazil during the last two decades, relating them with the trade deficit of industrial products that Argentina shows today in the bilateral relationship. On the other hand, it intends to contribute to the understanding of the roots of these asymmetries looking at the differences in the public policies implemented by both countries during the period extending from the implementation of the MERCOSUR, in the early 90's, until 2008. Keywords: Argentina, Brazil, Regional integration, Asymmetries, Industrial policyEl objetivo de este trabajo es, por un lado, analizar el aumento de las asimetrías productivas que se produjeron entre Argentina y Brasil durante las dos últimas décadas, vinculándolas con el déficit comercial de productos industriales que presenta hoy la Argentina en la relación bilateral. Por otro lado, se propone contribuir a la comprensión de las raíces de esas asimetrías a partir de las divergencias en las políticas implementadas por los dos países durante el período considerado que se extiende desde la implementación del MERCOSUR, a inicios de los años ‘90, hasta el año 2008. Palabras clave: Argentina, Brasil, Integración regional, Asimetrías, Política industrial&nbsp

Characterization of Toxoplasma gondii subtelomeric-like regions: identification of a long-range compositional bias that is also associated with gene-poor regions

Background Chromosome ends are composed of telomeric repeats and subtelomeric regions, which are patchworks of genes interspersed with repeated elements. Although chromosome ends display similar arrangements in different species, their sequences are highly divergent. In addition, these regions display a particular nucleosomal composition and bind specific factors, therefore producing a special kind of heterochromatin. Using data from currently available draft genomes we have characterized these putative Telomeric Associated Sequences in Toxoplasma gondii. Results An all-vs-all pairwise comparison of T. gondii assembled chromosomes revealed the presence of conserved regions of ∼ 30 Kb located near the ends of 9 of the 14 chromosomes of the genome of the ME49 strain. Sequence similarity among these regions is ∼ 70%, and they are also highly conserved in the GT1 and VEG strains. However, they are unique to Toxoplasma with no detectable similarity in other Apicomplexan parasites. The internal structure of these sequences consists of 3 repetitive regions separated by high-complexity sequences without annotated genes, except for a gene from the Toxoplasma Specific Family. ChIP-qPCR experiments showed that nucleosomes associated to these sequences are enriched in histone H4 monomethylated at K20 (H4K20me1), and the histone variant H2A.X, suggesting that they are silenced sequences (heterochromatin). A detailed characterization of the base composition of these sequences, led us to identify a strong long-range compositional bias, which was similar to that observed in other genomic silenced fragments such as those containing centromeric sequences, and was negatively correlated to gene density. Conclusions We identified and characterized a region present in most Toxoplasma assembled chromosomes. Based on their location, sequence features, and nucleosomal markers we propose that these might be part of subtelomeric regions of T. gondii. The identified regions display a unique trinucleotide compositional bias, which is shared (despite the lack of any detectable sequence similarity) with other silenced sequences, such as those making up the chromosome centromeres. We also identified other genomic regions with this compositional bias (but no detectable sequence similarity) that might be functionally similar.Fil: Dalmasso, Maria Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); ArgentinaFil: Carmona, Santiago Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); ArgentinaFil: Ángel, Sergio Oscar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas; ArgentinaFil: Agüero, Fernan Gonzalo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas; Argentin

La industria automotriz argentina ante el desafío de la apertura a la UE: cambios estructurales, conductas empresariales e impactos en el desempeño sectorial

This article provides elements for an impact scenario of the eventual Association Agreement between Mercosur and the EU on the Argentine automotive industry. It is inquired how companies would react to this shock and how it would impact sector performance, based on a survey to key industry players. It is concluded that -given the current situation of the environment- the Agreement would entail more risks than opportunities for the value chain, particularly for auto parts companies. The intensification of competition would induce changes in business behavior in terms of specialization, modernization, cooperation and sourcing. In contrast, there is skepticism that it can propitiate offensive-type adaptation strategies to take advantage of new business opportunities (exports, greenfield investments, innovations). The impact on local value added and employment would therefore be predominantly contractive.Este trabajo aporta elementos para un escenario de impacto del eventual Acuerdo de Asociación entre el Mercosur y la UE sobre la industria automotriz argentina. Se indaga en cómo reaccionarían las empresas ante este shock y cómo impactaría en el desempeño sectorial, en base a una encuesta a referentes del sector. Se concluye que -dada la situación actual del entorno- el Acuerdo conllevaría más riesgos que oportunidades para la cadena, particularmente para las autopartistas. La intensificación de la competencia induciría a cambios en las conductas empresariales en términos de especialización, modernización, cooperación y aprovisionamiento. En contraste, existe escepticismo de que logre propiciar estrategias de adecuación de tipo ofensivo para aprovechar nuevas oportunidades de negocios (exportaciones, inversiones greenfield, innovaciones). El impacto sobre el valor agregado y empleo local sería entonces predominantemente contractivo

Sistema Arduino en las prácticas de Química: Aplicación a una celda electroquímica

El estudio de la Química como ciencia básica y experimental en las carreras de ingenierías es un desafío constante. Permanentemente los docentes buscan captar la atención, desarrollar y favorecer la motivación y creatividad de los estudiantes. En la búsqueda de lograr un acercamiento a la Química y el entendimiento por parte de los estudiantes de Ingeniería Electrónica, se desarrolló un trabajo práctico que permita entender los principios de la electroquímica articulando materias de su especialidad con Química General, mediante la utilización de herramientas técnicas que permitan fijar conceptos teóricos mediante el desarrollo práctico, que les servirán en materias de niveles superiores.Ibero-American Science and Technology Education Consortiu

Sistema Arduino en las prácticas de Química: Aplicación a una celda electroquímica

El estudio de la Química como ciencia básica y experimental en las carreras de ingenierías es un desafío constante. Permanentemente los docentes buscan captar la atención, desarrollar y favorecer la motivación y creatividad de los estudiantes. En la búsqueda de lograr un acercamiento a la Química y el entendimiento por parte de los estudiantes de Ingeniería Electrónica, se desarrolló un trabajo práctico que permita entender los principios de la electroquímica articulando materias de su especialidad con Química General, mediante la utilización de herramientas técnicas que permitan fijar conceptos teóricos mediante el desarrollo práctico, que les servirán en materias de niveles superiores.Ibero-American Science and Technology Education Consortiu

Sistema Arduino en las prácticas de Química: Aplicación a una celda electroquímica

El estudio de la Química como ciencia básica y experimental en las carreras de ingenierías es un desafío constante. Permanentemente los docentes buscan captar la atención, desarrollar y favorecer la motivación y creatividad de los estudiantes. En la búsqueda de lograr un acercamiento a la Química y el entendimiento por parte de los estudiantes de Ingeniería Electrónica, se desarrolló un trabajo práctico que permita entender los principios de la electroquímica articulando materias de su especialidad con Química General, mediante la utilización de herramientas técnicas que permitan fijar conceptos teóricos mediante el desarrollo práctico, que les servirán en materias de niveles superiores.Ibero-American Science and Technology Education Consortiu

The Argentine Network of Ecological Restoration (REA): Progress, gaps and future pathway

En un contexto latinoamericano y nacional de degradación ambiental creciente, describimos la percepción de los miembros de la REA sobre el estado actual de la restauración en la Argentina e identificamos el panorama de avances y logros a fin de sugerir acciones de restauración ecológica. La REA se formalizó en 2012 y realizó su primer encuentro nacional organizativo en 2017. Al presente, cuenta con 198 miembros distribuidos en ocho nodos regionales. Los análisis efectuados en este encuentro muestran relativamente pocas iniciativas de restauración a nivel institucional y a escala de paisaje. La mayoría de las acciones son realizadas a escala local por científicos que aportan la investigación y gestores que promueven la actividad en un rango amplio de contextos sociales y ecológicos. Los practicantes de la restauración (i.e., quienes ejecutan los proyectos a campo) usan la información que generan los sectores científico, social, privado y de gobierno. Entre otras deficiencias, mencionan la baja disponibilidad de información ecológica de base y la inexistencia o insuficiencia de marcos legales y capacidades técnicas e institucionales. Esperamos que la consolidación de la REA le permita a todos los interesados e involucrados en la restauración ecológica del país compartir experiencias y generar vínculos para aportar a la continuidad de un trabajo multidisciplinario, participativo, integrado a la problemática socio ambiental del país, a diferentes escalas y con una perspectiva a largo plazo.In a Latin American and national context of increasing environmental degradation, we describe the perception of the members of the REA on the current state of restoration in Argentina, and we identify the current prospect of progress and achievements in order to suggest ecological restoration actions in the country. The REA was formalized in 2012 and held its first national organizational meeting in 2017. It currently has 198 members distributed in eight regional nodes. Analyses carried out at this meeting indicate relatively few restoration initiatives at the institutional and landscape levels. Most of the actions are carried out at the local level by scientists who contribute through research and practitioners who promote the activity in a wide range of social and ecological contexts. Restoration practitioners (i.e., those who execute projects in the field) use information generated by the scientific, social, private and government sectors. Among other deficiencies, they mention the limited availability of basic ecological information, the inexistence or inadequacy of legal frameworks, institutional and technical capacities. We hope the consolidation of the REA will allow all those interested and involved in the ecological restoration of the country to share experiences and generate links to contribute to the continuity of a multidisciplinary, participatory work, integrated to the socio-environmental problems of the country, at different scales and with a long-term perspective.Fil: Perez, Daniel. Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Ciencias del Ambiente y la Salud; ArgentinaFil: Meli, Paula. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Renison, Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Centro de Ecología y Recursos Naturales Renovables; ArgentinaFil: Barri, Fernando Rafael. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Diversidad y Ecología Animal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto de Diversidad y Ecología Animal; ArgentinaFil: Beider, Adriana Mariela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; ArgentinaFil: Burgueño Galván, Gabriel Alejandro. Cuerpo Municipal de Guardaparques. Reserva Municipal Los Robles; ArgentinaFil: Dalmasso, Antonio Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas; ArgentinaFil: Dardelli, Sebastián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Norte. Estación Experimental Agropecuaria Delta del Paraná; ArgentinaFil: de Paz, Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente. Universidad Nacional del Comahue. Centro Regional Universidad Bariloche. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente; ArgentinaFil: Farinaccio, Fernando Miguel. Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Ciencias del Ambiente y la Salud; ArgentinaFil: Papazian, Gabriela. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco"; ArgentinaFil: Sirombra, Martín Gonzalo. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo; ArgentinaFil: Torres, Romina Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Centro de Ecología y Recursos Naturales Renovables; Argentin