Estimation of species relative abundances and habitat preferences using opportunistic data

We develop a new statistical procedure to monitor, with opportunist data, relative species abundances and their respective preferences for dierent habitat types. Following Giraud et al. (2015), we combine the opportunistic data with some standardized data in order to correct the bias inherent to the opportunistic data collection. Our main contributions are (i) to tackle the bias induced by habitat selection behaviors, (ii) to handle data where the habitat type associated to each observation is unknown, (iii) to estimate probabilities of selection of habitat for the species. As an illustration, we estimate common bird species habitat preferences and abundances in the region of Aquitaine (France)

L'éléphant dans la pièce : le rôle des grandes banques françaises dans les causes de la crise de la zone euro et dans sa résolution.

International audienceAprès avoir rappelé les raisons historiques qui ont amené la France à disposer au début des années 2010 d’un système bancaire dominée par un tout petit nombre de banques universelles too big to fail, très fortement intégrées aux flux financiers européens et mondiaux, on étudie la manière dont le modèle économique de ces dernières a joué un rôle central dans les causes de ce qui a été communément appelé après 2010 la « crise des dettes souveraines » en Europe » ou, plus communément, la « crise de la zone euro ». Puis on montre que le risque systémique lié à ces établissements et les réseaux économiques et politico-administratifs dont ils occupent de longue date le cœur leur a permis de favoriser une explication de cette crise qui les exonère de toutes leurs responsabilités. Ce cadrage favorable aux banques de la crise a ainsi été entièrement repris par les pouvoirs exécutifs français qui se sont succédé depuis 2010 à la tête de l’État français. On montre ensuite que, lors du processus de résolution de la crise, aussi bien au niveau européen que français, les choix de ces derniers ont été systématiquement favorables au maintien du modèle de la « banque universelle à la française » qui reste jugé comme le meilleur possible pour l’économie française. Ce poids persistant d’acteurs économiques au modèle économique pourtant dangereux pour l’économie et les finances publiques plaide pour une meilleure prise en compte de l’action politique des grandes entreprises par la science politique française

Orbits and reversals of a drop rolling inside a horizontal circular hydraulic jump

We explore the complex dynamics of a non-coalescing drop of moderate size inside a circular hydraulic jump of the same liquid formed on a horizontal disk. In this situation the drop is moving along the jump and one observes two different motions: a periodic one (it orbitates at constant speed) and an irregular one involving reversals of the orbital motion. Modeling the drop as a rigid sphere exchanging friction with liquid across a thin film of air, we recover the orbital motion and the internal rotation of the drop. This internal rotation is experimentally observed.Comment: 5 pages, 6 figure

Creep motion of a granular pile induced by thermal cycling

We report a time-resolved study of the dynamics associated with the slow compaction of a granular column submitted to thermal cycles. The column height displays a complex behavior: for a large amplitude of the temperature cycles, the granular column settles continuously, experiencing a small settling at each cycle; By contrast, for small-enough amplitude, the column exhibits a discontinuous and intermittent activity: successive collapses are separated by quiescent periods whose duration is exponentially distributed. We then discuss potential mechanisms which would account for both the compaction and the transition at finite amplitude.Comment: 4 pages, 5 figures, accepted for publication in Physical Review Letters (05sep08

Trusting Computations: a Mechanized Proof from Partial Differential Equations to Actual Program

Computer programs may go wrong due to exceptional behaviors, out-of-bound array accesses, or simply coding errors. Thus, they cannot be blindly trusted. Scientific computing programs make no exception in that respect, and even bring specific accuracy issues due to their massive use of floating-point computations. Yet, it is uncommon to guarantee their correctness. Indeed, we had to extend existing methods and tools for proving the correct behavior of programs to verify an existing numerical analysis program. This C program implements the second-order centered finite difference explicit scheme for solving the 1D wave equation. In fact, we have gone much further as we have mechanically verified the convergence of the numerical scheme in order to get a complete formal proof covering all aspects from partial differential equations to actual numerical results. To the best of our knowledge, this is the first time such a comprehensive proof is achieved.Comment: N° RR-8197 (2012). arXiv admin note: text overlap with arXiv:1112.179

Plant growth-promoting bacteria in the rhizo- and endosphere of plants: Their role, colonization, mechanisms involved and prospects for utilization

In both managed and natural ecosystems, beneficial plant-associated bacteria play a key role in supporting and/or increasing plant health and growth. Plant growth-promoting bacteria (PGPB) can be applied in agricultural production or for the phytoremediation of pollutants. However, because of their capacity to confer plant beneficial effects, efficient colonization of the plant environment is of utmost importance. The majority of plant-associated bacteria derives from the soil environment. They may migrate to the rhizosphere and subsequently the rhizoplane of their hosts before they are able to show beneficial effects. Some rhizoplane colonizing bacteria can also penetrate plant roots, and some strains may move to aerial plant parts, with a decreasing bacterial density in comparison to rhizosphere or root colonizing populations. A better understanding on colonization processes has been obtained mostly by microscopic visualisation as well as by analysing the characteristics of mutants carrying disfunctional genes potentially involved in colonization. In this review we describe the individual steps of plant colonization and survey the known mechanisms responsible for rhizosphere and endophytic competence. The understanding of colonization processes is important to better predict how bacteria interact with plants and whether they are likely to establish themselves in the plant environment after field application as biofertilisers or biocontrol agents

Segmentation automatique par modèle déformable implicite à l'aide de statistiques de Weibull locale/globale : Application en IRM cardiaque

National audienceCet article propose une méthode de segmentation automatique du ventricule gauche (VG) en IRM par modèle déformable implicite (Level Set) à l'aide d'un cadre variationnel. Pour ces approches, les degrés de liberté sont l'initialisation et la fonctionnelle à minimiser. Le premier est souvent laissé au soin du praticien. Afin d'éviter cette intervention humaine, nous présentons une méthode d'initialisation fondée sur une transformée de Hough exploitant les informations spatio-temporelles du VG. Classiquement, la fonctionnelle énergétique utilise des informations issues des contours, des régions mais également des contraintes de formes. Nous proposons de coupler un terme d'énergie contour calculé par une mesure d'asymétrie via le signal monogène, des statistiques de l'intensité des pixels (modèle de Weibull) et une contrainte sur l'épaississement myocardique. La présence de plusieurs tissus (myocarde, sang, . . .) implique la non-stationnarité des données. Afin d'estimer au mieux les paramètres de la distribution, nous proposons un modèle déformable maximisant localement et/ou globalement la log-vraisemblance pour être cohérent avec l'anatomie. Finalement, nous évaluons notre méthode sur les données du challenge MICCAI 2009