Influence of cyst maturation on apparent population increases of Heterodera schachtii on root remnants

Trois expériences ont été réalisées pour étudier le développement des nématodes à kyste de la betterave, #Heterodera schachtii, sur des plantes hôtes défoliées. Lors d'une expérience en micro-parcelles, la respiration des racines de chou diminue dans les racines infestées par #H. schachtii prélevées à intervalles réguliers. Lors d'une expérience en serre, la proportion de kystes bruns et le nombre de kystes par gramme de racine s'accroît avec le temps, que les plants soient défoliés ou non. Une troisième expérience, conduite en sacs, a révélé que les kystes mûrissent et que le nombre d'oeufs augmente dans les racines de plantes défoliées. Ces résultats démontrent que, sur des racines isolées de la tige, les kystes blancs mûrissent en devenant bruns, le nombre d'oeufs par kyste augmente et les juvéniles peuvent éclore à partir des oeufs. De ce fait, le nombre de kystes peut sembler s'accroître en l'absence de plante hôte si des racines vivantes demeurent dans le sol. La raison en est que kystes et oeufs continuent à se développer et aussi que les techniques d'extraction sont axées sur les kystes bruns. En conséquence, l'estimation de la densité de population peut être influencée par le moment du prélèvement en relation avec le développement du nématode sur les fragments de racines. Les stratégies de lutte fondées sur l'estimation de la densité des oeufs devraient donc tenir compte d'une augmentation possible de la densité des kystes due à ceux présents sur les restes de racines. (Résumé d'auteur

Influence of \u3ci\u3eLysobacter enzymogenes\u3c/i\u3e Strain C3 on Nematodes

Chitinolytic microflora may contribute to biological control of plant-parasitic nematodes by causing decreased egg viability through degradation of egg shells. Here, the influence of Lysobacter enzymogenes strain C3 on Caenorhabditis elegans, Heterodera schachtii, Meloidogyne javanica, Pratylenchus penetrans, and Aphelenchoides fragariae is described. Exposure of C. elegans to L. enzymogenes strain C3 on agar resulted in almost complete elimination of egg production and death of 94% of hatched juveniles after 2 d. Hatch of H. schachtii eggs was about 50% on a lawn of L. enzymogenes strain C3 on agar as compared to 80% on a lawn of E. coli. Juveniles that hatched on a lawn of L. enzymogenes strain C3 on agar died due to disintegration of the cuticle and body contents. Meloidogyne javanica juveniles died after 4 d exposure to a 7-d-old chitin broth culture of L. enzymogenes strain C3. Immersion of A. fragariae, M. javanica, and P. penetrans juveniles and adults in a nutrient broth culture of L. enzymogenes strain C3 led to rapid death and disintegration of the nematodes. Upon exposure to L. enzymogenes strain C3 cultures in nutrient broth, H. schachtii juveniles were rapidly immobilized and then lysed after three days. The death and disintegration of the tested nematodes suggests that toxins and enzymes produced by this strain are active against a range of nematode species

Influence of cyst maturation on apparent population increases of Heterodera schachtii on root remnants

Trois expériences ont été réalisées pour étudier le développement des nématodes à kyste de la betterave, #Heterodera schachtii, sur des plantes hôtes défoliées. Lors d'une expérience en micro-parcelles, la respiration des racines de chou diminue dans les racines infestées par #H. schachtii prélevées à intervalles réguliers. Lors d'une expérience en serre, la proportion de kystes bruns et le nombre de kystes par gramme de racine s'accroît avec le temps, que les plants soient défoliés ou non. Une troisième expérience, conduite en sacs, a révélé que les kystes mûrissent et que le nombre d'oeufs augmente dans les racines de plantes défoliées. Ces résultats démontrent que, sur des racines isolées de la tige, les kystes blancs mûrissent en devenant bruns, le nombre d'oeufs par kyste augmente et les juvéniles peuvent éclore à partir des oeufs. De ce fait, le nombre de kystes peut sembler s'accroître en l'absence de plante hôte si des racines vivantes demeurent dans le sol. La raison en est que kystes et oeufs continuent à se développer et aussi que les techniques d'extraction sont axées sur les kystes bruns. En conséquence, l'estimation de la densité de population peut être influencée par le moment du prélèvement en relation avec le développement du nématode sur les fragments de racines. Les stratégies de lutte fondées sur l'estimation de la densité des oeufs devraient donc tenir compte d'une augmentation possible de la densité des kystes due à ceux présents sur les restes de racines. (Résumé d'auteur

Large expert-curated database for benchmarking document similarity detection in biomedical literature search

Document recommendation systems for locating relevant literature have mostly relied on methods developed a decade ago. This is largely due to the lack of a large offline gold-standard benchmark of relevant documents that cover a variety of research fields such that newly developed literature search techniques can be compared, improved and translated into practice. To overcome this bottleneck, we have established the RElevant LIterature SearcH consortium consisting of more than 1500 scientists from 84 countries, who have collectively annotated the relevance of over 180 000 PubMed-listed articles with regard to their respective seed (input) article/s. The majority of annotations were contributed by highly experienced, original authors of the seed articles. The collected data cover 76% of all unique PubMed Medical Subject Headings descriptors. No systematic biases were observed across different experience levels, research fields or time spent on annotations. More importantly, annotations of the same document pairs contributed by different scientists were highly concordant. We further show that the three representative baseline methods used to generate recommended articles for evaluation (Okapi Best Matching 25, Term Frequency-Inverse Document Frequency and PubMed Related Articles) had similar overall performances. Additionally, we found that these methods each tend to produce distinct collections of recommended articles, suggesting that a hybrid method may be required to completely capture all relevant articles. The established database server located at https://relishdb.ict.griffith.edu.au is freely available for the downloading of annotation data and the blind testing of new methods. We expect that this benchmark will be useful for stimulating the development of new powerful techniques for title and title/abstract-based search engines for relevant articles in biomedical science. © The Author(s) 2019. Published by Oxford University Press

Marrow versus peripheral blood for geno-identical allogeneic stem cell transplantation in acute myelocytic leukemia: Influence of dose and stem cell source shows better outcome with rich marrow

Several studies have compared bone marrow (BM) and peripheral blood (PB) as stem cell sources in patients receiving allografts, but the cell doses infused have not been considered, especially for BM. Using the ALWP/EBMT registry, we retrospectively studied 881 adult patients with acute myelocytic leukemia (AML), who received a non-T-depleted allogeneic BM (n = 515) or mobilized PB (n = 366) standard transplant, in first remission (CR1), from an HLA-identical sibling, over a 5-year period from January 1994. The BM cell dose ranged from 0.17 to 29 × 108/kg with a median of 2.7 × 108/kg. The PB cell dose ranged from 0.02 to 77 × 10 8/kg with a median of 9.3 × 108/kg. The median dose for patients receiving BM (2.7 × 108/kg) gave the greatest discrimination. In multivariate analyses, high-dose BM compared to PB was associated with lower transplant-related mortality (RR = 0.61; 95% CI, 0.39-0.98; P = .04), better leukemia-free survival (RR = 0.65; 95% CI, 0.46-0.91; P = .013), and better overall survival (RR = 0.64; 95% CI, 0.44-0. 92; P = .016). The present study in patients with AML receiving allografts in first remission indicates a better outcome with BM as compared to PB, when the dose of BM infused is rich. © 2003 by The American Society of Hematology

Marrow versus peripheral blood for geno-identical allogeneic stem cell transplantation in acute myelocytic leukemia: Influence of dose and stem cell source shows better outcome with rich marrow

PubMed ID: 12829583Several studies have compared bone marrow (BM) and peripheral blood (PB) as stem cell sources in patients receiving allografts, but the cell doses infused have not been considered, especially for BM. Using the ALWP/EBMT registry, we retrospectively studied 881 adult patients with acute myelocytic leukemia (AML), who received a non-T-depleted allogeneic BM (n = 515) or mobilized PB (n = 366) standard transplant, in first remission (CR1), from an HLA-identical sibling, over a 5-year period from January 1994. The BM cell dose ranged from 0.17 to 29 × 10 8 /kg with a median of 2.7 × 10 8 /kg. The PB cell dose ranged from 0.02 to 77 × 10 8 /kg with a median of 9.3 × 10 8 /kg. The median dose for patients receiving BM (2.7 × 10 8 /kg) gave the greatest discrimination. In multivariate analyses, high-dose BM compared to PB was associated with lower transplant-related mortality (RR = 0.61; 95% CI, 0.39-0.98; P = .04), better leukemia-free survival (RR = 0.65; 95% CI, 0.46-0.91; P = .013), and better overall survival (RR = 0.64; 95% CI, 0.44-0. 92; P = .016). The present study in patients with AML receiving allografts in first remission indicates a better outcome with BM as compared to PB, when the dose of BM infused is rich. © 2003 by The American Society of Hematology