33 research outputs found
Genotoxicity Induced by Cypermethrin in the Zebrafish Retina
Cypermethrin (Cyp), is one of the most common contaminants in freshwater aquatic systems. We evaluated its possible genotoxic effect and oxidative stress in retinal cells of adult zebrafish exposed to 0.3 μg/L and 0.6 μg/L Cyp. Both the histological and immunofluorescence (IF) techniques showed the presence of apoptotic cells in the zebrafish retina after 9 days of treatment with 0.6 μg/L Cyp. Thus, histone γ-H2AX, a double-stranded DNA damage marker, was immunodetected in both the outer and inner nuclear layer after exposure to 0.6 μg/L Cyp for 12 days, while the anti-caspase-3 apoptotic antibody was detected in the outer nuclear layer. Compared with the morphological evidence, the damage index (DI) showed significant differences with 0.3 μg/L from day 9, while with 0.6 μg/L all the stages evaluated showed very significant differences. According to these results, it was verified that the activities of superoxide dismutase (SOD) and catalase (CAT) increased significantly after exposure to 0.6 μg/L Cyp. The same treatment caused a significant positive regulation of the mRNA levels of both genes. These results indicate that Cyp causes DNA damage and oxidative stress. This pyrethroid also has the potential to induce apoptosis in the cells of the retina
Nonlinear Microscopy Techniques: Principles and Biomedical Applications
Nonlinear optical microscopy techniques have emerged as a set of successful tools within the biomedical research field. These techniques have been successfully used to study autofluorescence signals in living tissues, structural protein arrays, and to reveal the presence of lipid bodies inside the tissular volume. In the first section, the nonlinear contrast technique foundations is described, and also, a practical approach about how to build and combine this setup on a single confocal system platform shall be provided. In the next section, examples of the usefulness of these approaches to detect early changes associated with the progression of different epithelial and connective tissular diseases are presented
Evaluation of 3D image-treatment algorithms applied to optical-sectioning microscopy
La información extraída de especimenes biológicos es inherentemente tridimensional. Los datos tridimensionales (3D) permiten un mejor entendimiento de las estructuras y los eventos biológicos, comparados con sus proyecciones bidimensionales (2D), aunque a veces son más difíciles de manejar. Esto explica porqué actualmente se están investigando y mejorando las técnicas de seccionamiento óptico. El principal objetivo del presente trabajo fue evaluar la relevancia de algoritmos de tratamiento de imágenes, los cuales incluyen métodos de preprocesamiento (tales como promediación de imágenes, corrección de background y normalización de intensidades) y procesamiento (desconvolución de desborroneo y de restauración). Esto se realizó mediante la implementación de un algoritmo de cuantificación basado en el Laplaciano y un detector de puntos brillantes. Los algoritmos se aplicaron a un modelo 3D de adhesión celular en piel, basado en un espécimen comúnmente utilizado por nuestro grupo de investigación. Los resultados indican que ciertos métodos de preprocesamiento son requeridos para mejorar el rendimiento de los algoritmos de procesamiento, mientras que otros no deben ser aplicados para asegurar una adecuada y precisa cuantificación.Information extracted from biological specimens is inherently three-dimensional. Though it is sometimes hard to handle, three-dimensional (3D) data provides greater understanding of biological structures and events than its bidimensional (2D) projections. This explains why optical-sectioning techniques are currently being explored and enhanced. The main objective of the present work was to evaluate the relevance of image-treatment algorithms, which included preprocessing (such as image-averaging, background correction and normalization of intensities) and processing (deblurring and restoration deconvolution) methods. This was done by implementing a quantification algorithm based on the Laplacian and a bright-point detector. Algorithms were applied to a 3D cell-adhesion skin model, based upon a specimen commonly used by our research group. Results indicated that certain preprocessing methods are required to enhance the performance of processing algorithms, while others must not be applied in order to ensure an adequate and precise quantification.IV Workshop de Computación Gráfica, Imágenes y Visualización (WCGIV)Red de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI
Diseño de un sistema de gestión de la calidad bajo la norma ISO 9001:2015 para mejorar la productividad de la empresa DATSUL, Piura 2021
La presente tesis establece como objetivo general diseñar un Sistema de Gestión
de la Calidad bajo la norma ISO 9001:2015 para mejorar la productividad de la
empresa DATSUL, Piura 2021. Por lo que fue fundamental analizar y evaluar el
contexto de la organización, el liderazgo, la planificación, el apoyo, las operaciones,
evaluar el desempeño y la mejora de los procesos de la empresa.
El tipo de investigación fue aplicado, de nivel explicativo, con un enfoque cuantitativo
y de corte longitudinal. Asimismo, el diseño del estudio fue preexperimental. La
población estuvo conformada por todos los procesos de la empresa y la muestra
fue determinada a través del muestreo no probabilístico por conveniencia. Dentro
de las técnicas de recolección de datos se aplicó la observación en campo y el
análisis documental, con sus instrumentos los formatos de registro de datos y lista
de verificación. Como resultado se obtuvo que con la implementación del diseño
realizado la productividad de la empresa DATSUL mejoraría en 15.72%, de igual
manera la eficiencia se incrementaría en 14.54% y la eficacia aumentaría en
15.81%. Lo cual, nos permite concluir que el “Diseño de un Sistema de Gestión de
la Calidad bajo la Norma ISO 9001:2015 mejora la productividad de la empresa
DATSUL, Piura 2021”
PARTICULAS FINAS EN EL AIRE DE LOCALES GASTRONOMICOS CON PARRILLA
La exposición a humo ambiental en lugares cerrados es peligrosa para la salud. Las partículas de hasta 2,5 micras son marcadores del humo en los lugares cerrados. Este estudio monitoreó la calidad de aire en 4 locales gastronómicos de Asunción, Paraguay, y algunas condiciones que influyen en los niveles de exposición explorados. Los niveles más altos de partículas encontrados fueron 9,9 μg/m3. En ninguno de los locales estudiados se detectaron fumadores. Falta mayor investigación sobre contaminación del aire en lugares cerrados para una mejor protección de la salud
Enhancement of an automatic algorithm for deconvolution and quantification of three-dimensional microscopy images
En trabajos previos hemos diseñado y desarrollado un software para la optimización del procesamiento de imágenes multidimensionales, el cual consiste de un algoritmo automático de desconvolución de restauración (desconvolución con restricción de positividad) y tres indicadores de restauración de la imágenes (Ancho Total a la Mitad del Máximo, Relación Contraste-Ruido y Relación Señal-Ruido) usados para evaluar cuantitativamente la calidad de restauración. Dado que el diseño del algoritmo se implementó en módulos desacoplados, hemos podido incorporar dos nuevos parámetros para evaluar la restauración de imágenes (indicadores tridimensionales basados en la función de Tenegrad) sin realizar cambios significativos en el código. La versión mejorada del algoritmo se utilizó para procesar imágenes tridimensionales utilizando diversas Funciones de Esparcimiento Puntual experimentales; las imágenes se obtuvieron mediante microscopia de campo amplio de fluorescencia del patrón de expresión de E-caderina en la piel de embriones de Rhinella arenarum y de microesferas fluorescentes. Se compararon los indicadores de restauración y el rendimiento de las versiones previa y mejorada del algoritmo. Los resultados indican que los indicadores basados en la función de Tenegrad coinciden con los evaluados previamente y que los nuevos módulos no incrementan significativamente el tiempo de procesamiento.In previous works we designed and developed a software tool for the optimization of multidimensional-image processing, which consisted of an automatic restoration deconvolution method (positive constrained deconvolution) and three image-restoration indicators (Full-Width at Half-Maximum, Contrast-to-Noise Ratio and Signal-to-Noise Ratio) used to assess the quality of restoration qualitatively. Since the algorithm’s design was implemented in uncoupled modules, we were able to introduce two new image-restoration parameters (two three-dimensional Tenegrad-based indicators) without mayor modifications to the script. The enhanced version of the algorithm was used to process raw three-dimensional images using several experimental Point Spread Functions; raw images were obtained by fluorescence wide-field microscopy of epidermal E-cadherin expression in Rhinella arenarum embryos and fluorescent microspheres. The image-restoration indicators and the performance of the previous and enhanced versions of the algorithm were compared. Results show that Tenengrad-based indicators concur with the previously used ones and that the new modules do not increase processing time significantly.Workshop de Computación Gráfica, Imágenes y Visualización (WCGIV)Red de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI
El rol de las hormonas tiroideas sobre la expresión de cadherinas-cateninas en el cáncer de colon: alternativas terapéuticas
El cáncer colo-rectal (CCR) es la cuarta y tercera causa de muerte en el mundo y en Argentina, respectivamente (OMS, 2008; MINCyT, 2014). Por ello, el diagnóstico temprano y nuevas formas de tratamiento resultan esenciales para controlar la morbi-mortalidad de la enfermedad.
La molécula de adhesión intercelular E-cadherina y su molécula conectora al citoesqueleto de actina, b-catenina, son críticas en las transformaciones epitelio-mesénquima y en el desarrollo de adenomas y adenocarcinomas colo-rectales. Por estas razones, el control de su expresión y actividad son claves en la regulación de proliferación, diferenciación, movilidad y agresividad de las células tumorales (Izaguirre y col. 2018; 2019).
ARK: http://id.caicyt.gov.ar/ark:/s22504559/erv2ntua
Cellular outline segmentation using fractal estimators
Segmentation in biological images is essential for the determination of biological parameters that allow the construction of models of several biological problems. This helps to establish clear relationships between those models and the parameter estimation, and for elaboration of key experiments that give support to biological theories. Segmentation is the process of qualitative or quantitative information extraction (shape, texture, physical and geometric properties, among others). These quantities are needed to compute the biological descriptors for further classification (v.g., cell counting, development stage assessment, and many others). This process is almost always supervised (i.e., human assisted), since the quality of the images that are produced with classic microscopy technologies have defects that in general disallow the application of unsupervised segmentation techniques. In this paper we investigate the use of the a local fractal dimension estimation as an image descriptor for microscopy images. This local descriptor appears to be robust enough to perform unsupervised or semisupervised segmentations, specifically in our study. We applied this technique on microscopy images of amphibian embryos' skin in which, using immunofluorescence techniques, we have labeled the cell adhesion molecule E-Cadherin. This molecule is one of the key factors of the Ca2+- dependent cell-cell adhesion. Segmentation of the cellular outlines was performed using a processing workflow, which can be repeatedly applied to a set of similar images, from which information is extracted for characterization and eventual quantification purposes.Facultad de Informátic
Segmentación de contornos celulares utilizando estimadores fractales
La segmentación en imágenes biológicas es de importancia crucial para la determinación de descriptores que permitan, entre otras cosas, elaborar modelos de diversos procesos biológicos, cotejar parámetros en dichos modelos, y proponer o rebatir teorías. Sin embargo, el proceso de segmentación de la información necesaria para el cómputo de los descriptores es casi siempre un proceso asistido, dado que la calidad de las imágenes que se pueden generar con la tecnología actual de microscopía clásica, adolecen de defectos que impiden el uso adecuado de técnicas de segmentación autónoma.
En este trabajo se propone el uso de la dimensión fractal box (FBD) como descriptor local, para la segmentación de imágenes de microscopía de la piel de embriones de anfibios en las que, usando técnicas de imnunofluorescencia, se ha marcado E-Cadherina, una molécula de adhesión celular, expresada en membranas celulares y responsable de la adhesión dependiente de Ca2+. El propósito del presente trabajo fue elaborar un workflow de procesamiento para ser aplicado sin supervisión a un grupo no determinado de imágenes de la misma naturaleza, de las que se intenta extraer la información requerida para los propósitos de caracterización y eventual cuantificación.Red de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI
Segmentación de contornos celulares utilizando estimadores fractales
La segmentación en imágenes biológicas es de importancia crucial para la determinación de descriptores que permitan, entre otras cosas, elaborar modelos de diversos procesos biológicos, cotejar parámetros en dichos modelos, y proponer o rebatir teorías. Sin embargo, el proceso de segmentación de la información necesaria para el cómputo de los descriptores es casi siempre un proceso asistido, dado que la calidad de las imágenes que se pueden generar con la tecnología actual de microscopía clásica, adolecen de defectos que impiden el uso adecuado de técnicas de segmentación autónoma.
En este trabajo se propone el uso de la dimensión fractal box (FBD) como descriptor local, para la segmentación de imágenes de microscopía de la piel de embriones de anfibios en las que, usando técnicas de imnunofluorescencia, se ha marcado E-Cadherina, una molécula de adhesión celular, expresada en membranas celulares y responsable de la adhesión dependiente de Ca2+. El propósito del presente trabajo fue elaborar un workflow de procesamiento para ser aplicado sin supervisión a un grupo no determinado de imágenes de la misma naturaleza, de las que se intenta extraer la información requerida para los propósitos de caracterización y eventual cuantificación.Red de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI