Prevalence of Enterobacteriaceae producing carbapenemase (OXA-48) responsible for urinary tract infections in Casablanca.

In recent years, we have witnessed the appearance of strains increasingly resistant to antibiotics. The large-scale spread of this resistance in the community today suggests that it will become a major public health problem shortly. Among the resistant strains are Enterobacteriaceae, which are responsible for numerous infections, particularly urinary tract infections. The present study focused on the phenotypic and genotypic characterization of uropathogenic enterobacteria isolated from the community environment. Our study included a total of 78 strains collected from UTIs during the year 2019. The confirmation of the species was performed by the Biomérieux VITEK system. The study of their antibiotic resistance was carried out by the method of diffusion on agar Mueller Hinton according to the recommendations of SFM-EUCAST 2019.The search for resistance genes bla(NDM, KPC, OXA-48) was performed by PCR. The results obtained showed that out of 78 samples of urinary enterobacteria, E.coli species dominated by a percentage of 58%, followed by K.pneumonia at 33%, and E.cloacae 8%. The study of antibiotic resistance profile showed high resistance to penicillins 91% followed by cephalosporins 58%. Carbapenems have a low activity on the studied strains with resistance percentages of 41% and 33% for imipenem and ertapenem respectively. The carbapenems resistance study allowed the detection of the blaOXA-48gene in three strains among the studied strains

The susceptibility of Escherichia coli strains to essential oils of Rormarinus officinalis and Eucalyptus globulus

Essential oils are frequently used for flavour and fragrance in the perfume, pharmaceutical, cosmetic and food industries. They are also suitable raw material for production of new synthetic agents. The antibacterial activity of the essential oils obtained by steam distillation of Rosmarinus officinalis L and Eucalyptus globules collected in south Morocco was studied by micro-atmospheric technique against Escherichia coli CIP54127 and E. coli isolated from urine and resistant to several antibiotics. Both essential oils were effective against the two strains bacteria in particularly against E. coli CIP54127. MIQ of both oils ranged from 60 to 70 ìl for both bacteria. In conclusion, results show that essential oils are effective and could be considered as a natural antimicrobial source that can be used on production of natural antimicrobial agents

Toxicity of south Morocco Rosmarinus officinalis essential oil: antibacterial and histopathological effects

Le romarin (Rosmarinus officinalis) possède de nombreuses propriétés médicinales. Il est connu pour ses effets antimicrobiens et anti-oxydatifs. Le but de ce travail est d’étudier la toxicité de son huile essentielle (HE) via un test antibactérien selon la technique de micro-atmosphère et un autre histopathologique au niveau des organes de souris (Swiss albinos). L’analyse de la composition chimique de cette HE a été effectuée par CPG. Les constituants majoritaires de l’HE de R. officinalis sont le 1,8-cinéole (42%), l’alpha-pinène (11,92%) et le camphre (13.99%). Les quantités minimales inhibitrices des souches bactériennes testées varient entre 40 ?l et 90 ?l. Au plan histopathologique, une dilatation des alvéoles pulmonaires et une hypertrophie des cellules corticales et médullaires des surrénales ont été relevées. En conclusion, l’HE de R. officinalis ne présente pas de toxicité à la dose 50 ?l/g mais possède des effets stimulants des glandes surrénales et du système respiratoire

Study and design of a microfluidic platform for DNA sequence detection by impedance spectroscopy

L’objectif de cette thèse est la conception de biocapteurs capables de détecter la présence de séquences d’ADN sans utilisation de marqueurs chimiques ou de traitement préalable de l’échantillon. Le principe de mesure utilise la spectroscopie d’impédance pour la détection du changement provoqué par la présence de la séquence ADN sur le biocapteur. Notre étude s’appuie sur des simulations analytiques et numériques pour définir les dimensions des capteurs adaptés aux mesures en basse fréquence ainsi que le développement d’un modèle de circuit équivalent qui prend en considération les effets d'interfaces. La fabrication du capteur a été réalisée en plusieurs étapes. Dans un premier temps, la conception et la fabrication en salles blanches ont été optimisées pour des structures interdigitées avec différentes géométries et différents types de substrat (Verre, Si, SiO2). Après la validation du modèle, par des mesures sur des solutions de conductivité étalon et sur plusieurs concentrations d’ADN, l’analyse des résultats nous a conduits à proposer une nouvelle structure à électrodes concentriques mieux adaptée aux mesures d’impédance en basses fréquences pour des milieux liquides. Deux prototypes de taille micrométriques, l’un à électrode interdigitée et l’autre à électrode concentrique ont été développés pour une étude comparativeThe objective of this thesis is the conception of a biosensor able to detect the presence of DNA sequences without any use of chemical markers or a prior treatment of the samples. The measurements are performed using impedance spectroscopy technique to detect the changes caused by the presence of DNA sequences on the biosensor. Our study is based on analytic and numeric simulations, which allows us to define the dimensions of the sensors adapted to low frequency measurements and to propose an equivalent circuit model taking into account the effects of the electrical double layer. The sensor was manufactured in several steps. Initially, clean room design and manufacturing were optimized for interdigitated structures with different geometries and substrate types (Glass, Si, SiO2). The data analysis of the measurement on standard conductivity and on several DNA concentrations using interdigitated electrode biosensor, allows us to propose a new design with concentric electrodes which is more adapted to low frequency impedance measurement according to a comparative study between interdigitated and concentric electrode

Étude et conception d’une plateforme microfluidique pour la détection de séquence ADN par spectroscopie d’impédance

The objective of this thesis is the conception of a biosensor able to detect the presence of DNA sequences without any use of chemical markers or a prior treatment of the samples. The measurements are performed using impedance spectroscopy technique to detect the changes caused by the presence of DNA sequences on the biosensor. Our study is based on analytic and numeric simulations, which allows us to define the dimensions of the sensors adapted to low frequency measurements and to propose an equivalent circuit model taking into account the effects of the electrical double layer. The sensor was manufactured in several steps. Initially, clean room design and manufacturing were optimized for interdigitated structures with different geometries and substrate types (Glass, Si, SiO2). The data analysis of the measurement on standard conductivity and on several DNA concentrations using interdigitated electrode biosensor, allows us to propose a new design with concentric electrodes which is more adapted to low frequency impedance measurement according to a comparative study between interdigitated and concentric electrodesL’objectif de cette thèse est la conception de biocapteurs capables de détecter la présence de séquences d’ADN sans utilisation de marqueurs chimiques ou de traitement préalable de l’échantillon. Le principe de mesure utilise la spectroscopie d’impédance pour la détection du changement provoqué par la présence de la séquence ADN sur le biocapteur. Notre étude s’appuie sur des simulations analytiques et numériques pour définir les dimensions des capteurs adaptés aux mesures en basse fréquence ainsi que le développement d’un modèle de circuit équivalent qui prend en considération les effets d'interfaces. La fabrication du capteur a été réalisée en plusieurs étapes. Dans un premier temps, la conception et la fabrication en salles blanches ont été optimisées pour des structures interdigitées avec différentes géométries et différents types de substrat (Verre, Si, SiO2). Après la validation du modèle, par des mesures sur des solutions de conductivité étalon et sur plusieurs concentrations d’ADN, l’analyse des résultats nous a conduits à proposer une nouvelle structure à électrodes concentriques mieux adaptée aux mesures d’impédance en basses fréquences pour des milieux liquides. Deux prototypes de taille micrométriques, l’un à électrode interdigitée et l’autre à électrode concentrique ont été développés pour une étude comparativ

Design and Realization of a Planar Interdigital Microsensor for Biological Medium Characterization

International audienceIn this work, we present the design of a planar interdigital microsensor for the characterization of biological mediums by impedance spectroscopy. We propose a theoretical optimization of the geometrical parameters of this sensor. The optimization allows to extend the measurement frequency range by reducing the polarization effect which is manifested by a double layer (DL). We present also a new method for a planar interdigital transducer to determine the parameters (relative permittivity, capacitance) of the double layer (DL) on the surface of the electrode loaded by a biological medium. The CoventorWare® software was used to simulate the model design of interdigital transducer in three dimensions (3D). The simulation results are coherent with the method proposed. Therefore, this method can be used to determine the parameters of double layers of a planar interdigital sensor in order to match its frequency band to the intented application