Référentiel Habitats Benthiques. Contribution à la mise à jour d’EUNIS. Région Atlantique

A l’échelle de l’Europe, la typologie EUNIS tend à s’étendre pour prendre en compte progressivement l’ensemble des habitats européens avec une grande finesse de définition. Conçue initialement à partir des données et de l’expérience britannique, cette typologie est parfois incomplète, notamment pour certaines zones biogéographiques comme la zone atlantique qui s’étend des côtes françaises jusqu’au Portugal. Le présent document est une synthèse de l’ensemble des fiches descriptives élaborées jusqu’à present, sur la base d’observations et des données collectées lors des campagnes Ifremer. L’objectif est  de favoriser, dans le processus de mise à jour d’EUNIS, la prise en compte des habitats manquants ou decrits de manière incomplète au regard des spécificités régionales. Une phase de discussion au sein de la communauté scientifique sera cependant nécessaire afin d’harmoniser l’intégration de nouvelles classes d'habitats dans le référentiel européen

Inversion de modèle de transfert radiatif et application à l'observation en zone côtière

International audienc

HYSCORES : Cartographies hyperspectrales appliquées aux écosystèmes coralliens et à leur état de santé.

En 2013, les résultats des travaux menés dans le cadre des projets "Spectrhabent-OI" (2009-2012), étendus au projet "Bioindication" (2012-2013) ont permis d'illustrer le potentiel important représenté par les nouvelles techniques d'imagerie aérienne hyperspectrale appliquées sur les plateformes récifales de l'île de La Réunion. L'objectif principal du projet HYSCORES (2015-2016) est de consolider ces premiers résultats dans une perspective de mise en œuvre opérationnelle de ces nouvelles méthodes dans le cadre de la DCE (directive-cadre européenne sur l’eau (2000/60/CE)). Pour cela 3 axes de recherche sont proposés : 1) l’étude et l'évaluation de la pertinence de l'indicateur VCH (vitalité corallienne hyperspectrale) proposé en 2012 ; 2) la capacité de l'indicateur à mettre en évidence une évolution de l'état global entre 2009 et 2015 ; 3) mieux cerner et quantifier les moyens et les ressources nécessaires à la mise en œuvre de ces nouvelles techniques en routine. Le projet s'appuie pour cela sur une nouvelle campagne d'acquisition de données brutes hyperspectrales réalisée en 2015 et couvrant les 4 principaux récifs frangeants de La Réunion. Ce rapport final présente le projet et ses objectifs dans leur globalité. Il détaille l'ensemble des méthodologies mises en œuvre dans le cadre des traitements numériques et décrit les résultats produits. Il s'attache également à l'analyse des résultats de la campagne 2015 HYSCORES en regard des résultats antérieurs (Spectrhabent-OI / BioIndication). A travers une analyse diachronique il confirme et illustre l'intérêt de ces nouvelles techniques pour évaluer les changements (gains et pertes) tant pour la Vitalité Corallienne Hyperspectrale (VCH) que pour le recouvrement corallien en général. Ce travail ouvre également sur de nouvelles perspectives en termes d'Indices (types coralliens par exemple) susceptibles de venir compléter la VCH dans le cadre de l'évaluation de l'Etat des plateformes récifales. L'ensemble des données et des résultats produits sont diffusés librement à travers les portails Sextant océan Indien et Archimer

Spatial characterization of marine vegetation using semisupervised hyperspectral unmixing

International audienc

HYSCORES : Cartographies hyperspectrales appliquées aux écosystèmes coralliens et à leur état de santé. Rapport intermédiaire de fin de campagne d'acquisition

En 2013, les résultats des travaux menés dans le cadre des projets "Spectrhabent-OI" (2009-2012), étendus au projet "Bioindication" (2012-2013) ont permis d'illustrer le potentiel important représenté par les nouvelles techniques d'imagerie aérienne hyperspectrale appliquées sur les plateformes récifales de l'île de La réunion. Au-delà de l'apport de l'hyperspectral dans une dimension descriptive, il a été montré que la combinaison d'indices de couverture algale et corallienne permettait d'envisager l’élaboration d’un indice surfacique d'état, adapté aux plateformes récifales, appelé "vitalité corallienne hyperspectrale" (VCH). L'objectif principal du projet HYSCORES (2015-2016) est de consolider ces premiers résultats tout en évaluant les possibilités de mise en œuvre opérationnelle de ces nouvelles méthodes dans le cadre de la DCE (directive-cadre européenne sur l’eau (2000/60/CE)). Pour cela 3 axes de recherche sont proposés : 1) l’étude et l'évaluation de la pertinence de l'indicateur VCH proposé en 2012 ; 2) la capacité de l'indicateur à mettre en évidence une évolution de l'état global entre 2009 et 2015 ; 3) mieux cerner et quantifier les moyens et les ressources nécessaires à la mise en œuvre de ces nouvelles techniques en routine. Le projet s'appuie pour cela sur une nouvelle campagne d'acquisition de données brutes hyperspectrales couvrant les 4 principaux récifs frangeants de La réunion. Faisant suite à la 1ère réunion du comité de pilotage du projet HYSCORES, ce rapport intermédiaire présente le projet et ses objectifs dans leur globalité. Il dresse le bilan de la nouvelle campagne d'acquisition de données (images hyperspectrales et "vérités terrain") et ajuste les perspectives et jalons pour les phases de traitements, d’analyses et d’exploitations de données pour en vue de finaliser le projet

REBENT - Atlas de cartes d'habitats historiques - Réseau Benthique. Edition 2011

Ce document présente un atlas relativement exhaustif de cartes d’habitats concernant les façades Manche et Atlantique du littoral français : cartes historiques de peuplements benthiques à diverses échelles et de végétation marine à des échelles variant entre 1/5000 et 1/20000. Ces différentes cartes sont présentées telles qu’elles ont été publiées par leurs auteurs respectifs et aussi, dans le cas des cartes à petite échelle, en typologie européenne normalisée EUNIS1 (Version 200410). Toutes ces cartes sont disponibles sur le site Web Rebent http://www.rebent.org/ En effet, dans le cadre du projet Rebent, une compilation a permis de recenser des cartographies qui, pour la plupart, résultent de campagnes de prospection réalisées dans les années 60-70. Pendant cette période, un gros effort fut consenti pour étudier, du point de vue sédimentaire et biologique, les fonds marins de la Manche et du Golfe de Gascogne. Ces données, systématiquement intégrées à un Système d’Information Géographique et harmonisées, couvrent l’essentiel des Eaux territoriales, avec toutefois des lacunes importantes dans les très petits fonds et la zone de balancement des marée

Directive Cadre sur l'Eau. Bassin Loire-Bretagne. Etude préliminaire pour la mise à jour des données surfaciques relatives aux herbiers zostères

Le bilan des données surfaciques est basé sur une collecte auprès de différents organismes. Une harmonisation des données cartographiques a été effectuée afin d’obtenir une valeur surfacique par masse d’eau, par année et par espèce de zostères. La configuration des herbiers de chaque masse d’eau a été établie selon différents paramètres. Elle permet de faire une proposition des supports et méthodes de numérisation les plus adaptés, à l’heure actuelle, pour le suivi surfacique des herbiers - dans le bassin Loire-Bretagne. Ce dernier a lieu tous les 6 ans dans le cadre de la Directive Cadre sur l’Eau

Hyperspectral 3D Mapping of Underwater Environments

Hyperspectral imaging has been increasingly used for underwater survey applications over the past years. As many hyperspectral cameras work as push-broom scanners, their use is usually limited to the creation of photo-mosaics based on a flat surface approximation and by interpolat- ing the camera pose from dead-reckoning navigation. Yet, because of drift in the navigation and the mostly wrong flat surface assumption, the quality of the obtained photo- mosaics is often too low to support adequate analysis. In this paper we present an initial method for creating hyper- spectral 3D reconstructions of underwater environments. By fusing the data gathered by a classical RGB camera, an inertial navigation system and a hyperspectral push- broom camera, we show that the proposed method creates highly accurate 3D reconstructions with hyperspectral tex- tures. We propose to combine techniques from simultaneous localization and mapping, structure-from-motion and 3D reconstruction and advantageously use them to create 3D models with hyperspectral texture, allowing us to overcome the flat surface assumption and the classical limitation of dead-reckoning navigation