Cloning of chimerical translocations as positive control for molecular genetic diagnosis of leukemia

The diagnosis of leukemia-specific mRNAs by polymerase chain reaction (PCR) and reverse transcription-PCR (RT-PCR) require well-known positive standard controls. In general, the positive controls are obtained from cell lines and leukemia patients who have been diagnosed at the molecular level by RT-PCR. These are expensive and restricted sources for standard positive controls. Thus, there is a need for less expensive and reproducible standard positive controls in this area. We have cloned the t (9: 22) p190, t (9: 22) p210, t (4: 11), t (1: 19), t (15: 17), t (12; 21) breakpoint junctions of fusion genes into the plasmids. Cloned fusion genes are suitable for testing PCR experiments of the molecular genetic diagnosis of leukemia samples. We cloned and optimized fusion gene junctions as a standard positive control to check PCR efficiency and as a standard positive marker for diagnosis

Applied Genomics in the Clinic

"Applied genomics in the Clinic" was organised in Istanbul on 17-19 October 2012. The main aim of the workshop was to get an overview of the state of the art of applied genomics in the clinical context in accession and candidate countries, as well as new members, to share best practices in EU and to evaluate these in the light of a public health perspective. There is a clear divide behind the genomic services offered in a country and the awareness among research scientists of the available genomic applications and the future impact of genomic technologies on health services and clinical approaches. In all countries there are a number of common obstacles that delay penetration of genomic technologies in clinical applications : lack of recognised experts ( medical genetics HAS to be recognised as a medical specialty) lack of a regulatory framework that involves political determination of decision makers, lack of common databases on methods and experts, lack of ongoing education for physicians and most importantly reimbursement of testing. Stronger connections and collaborations with the EU for research and technology transfer will function as a leverage for these countries in adopting genomic tools and harmonising the quality of healthcare services they offer. It is very important to establish recognized objective state of the art guidelines for application of genomic technologies in clinical practice. Such guidelines adopted by countries will form the basis of reimbursement policies at national and cross border levels. In addition establishing reliable, not for profit, open access databases for building reference datasets for correct and efficient interpretation of complex data generated by advanced genomic technologies will speed up adoption of the technology in the clinic.JRC.I.1-Chemical Assessment and Testin

Basınç kontrollü ve volüm kontrollü ventilasyon sırasında düşük doz dopamin ve dobutamin uygulamalarının oksijen sunumuna etkileri

TEZ2398Tez (Uzmanlık) -- Çukurova Üniversitesi, Adana, 1997.Kaynakça (s. 65-69) var.69 s. ; 30 cm.

Sosyal zeka tabanlı yönlendirme algoritmaları incelenmesi ve karşılaştırılması

06.03.2018 tarihli ve 30352 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan “Yükseköğretim Kanunu İle Bazı Kanun Ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılması Hakkında Kanun” ile 18.06.2018 tarihli “Lisansüstü Tezlerin Elektronik Ortamda Toplanması, Düzenlenmesi ve Erişime Açılmasına İlişkin Yönerge” gereğince tam metin erişime açılmıştır.Bu çalışmada arılar ve karıncalar gibi sosyal canlıların kolektif davranışlarından birebir ilham alınarak tasarlanan ağ yönlendirme algoritmaları incelenip özellikleri ele alınmıştır. Biyolojik sistemlerden esinlenen yönlendirme algoritmaları son 10 yılda geliştirilmiştir. Günümüz ve gelecek nesil ağların mevcut zorluklarla mücadele edebilmesinde, ilham alınan biyolojik sistemlerden aktarılan otonomi, kendi kendine organizasyon, uyarlanabilirlik, sağlamlık ve ölçeklenebilirlik karakteristik özellikler bu algoritmaları güçlendirmektedir. Çalışmada kablolu ve kablosuz ağları farklı sınıflar olarak göz önünde bulundurup her bir sınıf için literatürde yer alan karınca ve arı koloni algoritmalarının özellikleri ele alınmıştır. Algoritmaların ayırt edici özelliklerini ortaya çıkarıp ve bağlantılı olduğu en gelişmiş algoritmalarla genel olarak artı ve eksi yönleri detaylandırılmıştır.In this study I am discuss the properties and review the main instances of network routing algorithms whose bottom-up design has been inspired by collective behaviors of social insects such as ants and bees. This class of bio-inspired routing algorithms includes a relatively large number of algorithms mostly developed during the last ten years. The characteristics inherited by the biological systems of inspiration almost naturally empower these algorithms with characteristics such as autonomy, self-organization, adaptivity, robustness, and scalability, which are all desirable if not necessary properties to deal with the challenges of current and next-generation networks. In this study I am consider di?erent classes of wired and wireless networks, and for each class I briey discuss the characteristics of the main ant- and bee-colony-inspired algorithms which can be found in literature. I point out their distinctive features and discuss their general pros and cons in relationship to the state of the art

Joint beamforming and power control technique for femtocell networks

The need for high data rate increases with the growing demand for wireless communication. In order to meet this demand, one of the most effective ways is deployment of small cells which are considered as a promising technique for future wireless networks. However, the deployment of these low-power base stations brings many challenges. Interference management will be one of the major drawbacks for the deployment of small cells in coverage of the macro base stations. In order to cope with interference problem, we propose a joint beamforming and power allocation technique for a two-tier network system involving femtocell and macrocell layers to design power efficient networks. The beamforming technique is applied by using partial zero-forcing method to remove the highest cross-tier interference while satisfying the macro and femtocell users’ data rate requirements. Then, we perform power allocation to further reduce interference and design power efficient femtocell networks. The performance results of the proposed technique are illustrated in terms of power consumption in femtocell networks

Tıp Bilişimi

Biyobankalar, yaşam ve sağlık bilimleri açısından önemli alt yapılardır. Bu kitap bölümünde, biyobankalama konusunun incelenmesi ve biyobanka bileşenlerinin tanımlanması amaçlanmaktadır. Biyobankalar özellikle genom teknolojileri, veri analizleri ve robotik gibi alanlarda meydana gelen gelişmeler doğrultusunda basit biyolojik örnek depolarından karmaşık ve dinamik birimlere dönüşmüşlerdir. Bu yapı altında, farklı alanlarda çalışan birçok araştırmacı ve sağlık uzmanı, biyolojik örneklerin eldesi ve ilgili verilerin toplanması için işbirliği yapmaktadır. Biyobankalar profesyonel yapılanmalar olup katı bir iş akışı içerisinde organize edilmektedir. Biyolojik örneklerin işlenmesi (numunelerin toplanması, depolama ve dağıtım vb.) ve veri tabanı yönetim sistemleri (katılımcı ile ilgili klinik veriler, bilgilendirilmiş olur formu vb.) biyobankaların iki ana bileşenini oluşturmaktadır. Aynı zamanda biyobankalar, katılımcıların etik ve yasal haklarını gözetmekle yükümlüdürler. Yasal ve etik düzenlemeler, katılımcı haklarının bir parçası olarak gizliliğin sağlanması, katılımcı sağlığı ile ilişkili çıktı ve bildirimlere ulaşımı da kapsamalıdır. Modern biyobankalar biyobelirteç çalışmaları, ilaç taramaları ve kişiselleştirilmiş tıp alanlarında elzem olan büyük ölçekli analizlerin yapılabilmesi için gerekli olan yüksek kalitede örnek ve veri sunmaktadır. Bununla birlikte, biyobankalar arası veri paylaşımı ve harmonizasyonun sağlanması, çevrimsel araştırmaların hızlanması için önemlidir. Ancak saklama koşuları ve örnek koleksiyonlarındaki heterojenite, örneklere erişim konusunda var olan etik ve yasal sorunlar, katılımcı haklarının korunması, katılımcı olurlarındaki sınırlamalar, araştırma amaçlı veri yönetimindeki sorunlar, halkın katılımı ve sürdürülebilirlik konuları biyobankalamada karşılaşılan zorluklar arasındadır. Bu nedenle biyobankalarda, yenilikçi ve etkin bilişim teknolojilerinin entegrasyonu, veri paylaşımları için esnek ağ yapılanmalarının geliştirilmesi, standartların uygulanması, örnek ve veri vesayetinin uluslararası standartlara uygun olarak gerçekleştirilmesi önemlidir