Genetic and Biochemical Analysis of a Conserved, Multi-Gene System Regulation Spore-Associated Proteins in Streptomyces Coelicolor

Streptomyces coelicolor is a Gram positive, filamentous soil dwelling bacterium that exhibits a complex life cycle including the transition from a vegetative mycelium to a sporulating, aerial mycelium. Early genetic studies identified two classes of genes that resulted in developmental blocks, bald and white. The bald (bld) phenotype occurs when colonies cannot produce aerial hyphae. White (whi) colonies exhibit incomplete sporulation and/or loss of production of the concurrently produced grey pigment. While some of the original mutants have been explored, the developmental functions of many of the identified genes are not well understood. Of particular interest is a multi-gene regulatory system, with multiple paralogs of each gene present in S. coelicolor chromosome, which are well conserved among other streptomycetes and morphologically complex actinomycetes. The three genes encode 1) a predicted helix-turn-helix protein (WhiJR-like proteins), 2) a small, acidic protein of unknown function (WhiJS-like proteins), and 3) an anti-sigma factor-like protein (WhiJA-like proteins). In order to explore the roles of these genes in development, one such gene system involved in the regulation of the spore-associated protein (sap) operon, sapCED, was analyzed. sapR (whiJR-like), sapS (whiJS-like) comprise a divergently transcribed operon from sasA (whiJA-like), which is the first gene in the sapCED operon. In order to investigate the potential roles of this gene system in the developmental regulation of this spore-associated protein operon, null mutants were isolated by recombineering. Single and double null mutants were isolated and the effects on expression were assayed by the extraction of spore-associated proteins and a transcriptional fusion of the sapCEDp to luciferase. These assays indicate that in the absence of sapR and sapS, (either individually or together) there was an increase in expression of the sapCED operon. However, a single deletion of sasA has no observed phenotype. To determine protein-protein interactions, sapR, sapS, and sasA were cloned into a bacterial adenylate cyclase two-hybrid (BACTH) system. Analysis suggests self-interactions of SapR, SapS, and SasA. SapR was shown to interact with SapS; and, SapS was shown to interact with SasA. These interactions, save for SapS interacting with SasA, were recapitulated in a homologous multi-gene system (SCO3421, SCO3423, SCO3424). Using an electrophoretic mobility shift assay, SapR has been shown to interact with the promoter region of sapCED. These results suggest a model for SapR and SapS in repressing the development-associated sapCED operon, while SasA may function as a feedback mechanism through its interactions with SapS. Additionally, nine spore associated-proteins were identified in common laboratory strains of S. coelicolor that may play important roles for nutrient harvesting during germination

Oulun läänin alueellinen jätesuunnitelma: Jätehuollon kehittämisohjelma vuosille 2008-2018

Oulun läänin alueellinen jätesuunnitelma on Kainuun ja Pohjois-Pohjanmaan ympäristökeskuksien yhteinen jätehuollon kehittämissuunnitelma. Sen laadinnassa on sovellettu SOVA-lain eli viranomaisten suunnitelmien ja ohjelmien ympäristövaikutusten arvioinnista annetun lain (200/2005) mukaista ympäristöarviointia, josta on laadittu ympäristöselostus. Käsillä olevassa Oulun läänin jätesuunnitelmassa on kolme osaa: jätehuollon nykytila (osa I), ympäristöselostus (osa II) ja suunnitelma (osa III). Jätesuunnitelmassa esitetään jätehuollon nykytila sekä tulevaisuuden kehittämistarpeet vuosille 2008 – 2018. Jätesuunnitelman taustatavoitteita ovat jätteen määrän vähentäminen (sisältäen jätteen synnyn ehkäisyn), jätteen hyötykäyttöasteen nostaminen, jätehuollon ympäristö- ja terveyshaittojen vähentäminen ja jätehuollon organisoinnin eko- ja kustannustehokkuus. Taustatavoitteiden mukaiselle kehitykselle on suunnitelmassa haettu kehittämisaskelia kahdeksalla painopistealueella. Ne ovat biohajoavan jätteen ohjaaminen pois kaatopaikoilta, jätteiden energiakäyttö, lietteiden jätehuolto mukaan lukien haja-asutuksen lietteet, energiantuotannon ja kaivosteollisuuden jätteet (tuhka, sivukivi, rikastushiekka), haja asutuksen jätehuollon palvelutaso ja kustannustehokkuus, roskaantumisen torjunta ja jätemaksujen kannustavuus sekä alueellinen yhteistyö keräilyssä, hyödyntämisessä ja käsittelyssä. Neljällä ensin mainitulla painopistealueilla on ympäristöarvioinnissa vertailtu erilaisia toteutusvaihtoehtoja. Vaihtoehtovertailussa edistämisen arvoisiksi vaihtoehdoiksi nousivat biohajoavien jätteiden syntypaikkalajittelun ja aineena hyödyntämisen (kompostointi, mädätys)kehittäminen, jätteiden energiakäytön osalta rinnakkaispolton edistäminen sille jätteelle, jonka muodostumista ei voida ehkäistä, ja jota ei voida kohtuullisin kustannuksin kierrättää, lietteiden osalta lannoitevalmistekäytön edistäminen ja tuhkan osalta sekä lannoitevalmiste- että maarakennuskäytön edistäminen. Sivukiven osalta jätteen synnyn ehkäisyn lisäksi edistetään sivukiven käyttöä maarakentamisessa. Jätteiden energiakäytön osalta myös muunlainen jätteiden poltto on mahdollista silloin, kun jätteiden synnyn ehkäisystä huolehditaan, hyödynnettävät jätelajit (mm. paperi, kartonki, biojäte) eivät kulkeudu polttoon, vaan ne hyödynnetään aineena, sekä polttoon menevien jätteiden määrä pidetään rajallisena

Statistical Studies of Giant Pulse Emission from the Crab Pulsar

We have observed the Crab pulsar with the Deep Space Network (DSN) Goldstone 70 m antenna at 1664 MHz during three observing epochs for a total of 4 hours. Our data analysis has detected more than 2500 giant pulses, with flux densities ranging from 0.1 kJy to 150 kJy and pulse widths from 125 ns (limited by our bandwidth) to as long as 100 microseconds, with median power amplitudes and widths of 1 kJy and 2 microseconds respectively. The most energetic pulses in our sample have energy fluxes of approximately 100 kJy-microsecond. We have used this large sample to investigate a number of giant-pulse emission properties in the Crab pulsar, including correlations among pulse flux density, width, energy flux, phase and time of arrival. We present a consistent accounting of the probability distributions and threshold cuts in order to reduce pulse-width biases. The excellent sensitivity obtained has allowed us to probe further into the population of giant pulses. We find that a significant portion, no less than 50%, of the overall pulsed energy flux at our observing frequency is emitted in the form of giant pulses.Comment: 19 pages, 17 figures; to be published in Astrophysical Journa