Identification of MarvelD3 as a tight junction-associated transmembrane protein of the occludin family

Background: Tight junctions are an intercellular adhesion complex of epithelial and endothelial cells, and form a paracellular barrier that restricts the diffusion of solutes on the basis of size and charge. Tight junctions are formed by multiprotein complexes containing cytosolic and transmembrane proteins. How these components work together to form functional tight junctions is still not well understood and will require a complete understanding of the molecular composition of the junction. Results: Here we identify a new transmembrane component of tight junctions: MarvelD3, a four-span transmembrane protein. Its predicted transmembrane helices form a Marvel (MAL and related proteins for vesicle traffic and membrane link) domain, a structural motif originally discovered in proteins involved in membrane apposition and fusion events, such as the tight junction proteins occludin and tricellulin. In mammals, MarvelD3 is expressed as two alternatively spliced isoforms. Both isoforms exhibit a broad tissue distribution and are expressed by different types of epithelial as well as endothelial cells. MarvelD3 co-localises with occludin at tight junctions in intestinal and corneal epithelial cells. RNA interference experiments in Caco-2 cells indicate that normal MarvelD3 expression is not required for the formation of functional tight junctions but depletion results in monolayers with increased transepithelial electrical resistance. Conclusions: Our data indicate that MarvelD3 is a third member of the tight junction-associated occludin family of transmembrane proteins. Similar to occludin, normal expression of MarvelD3 is not essential for the formation of functional tight junctions. However, MarvelD3 functions as a determinant of epithelial paracellular permeability properties

Insect Communities: Ellensburg Upstream Versus Downstream Sites

Urban stream syndrome occurs when an urban area affects a stream system. Stream burial is common in urban systems, and burial blocks incoming light, potentially affecting available food resources and, in turn, affecting the insect communities. I tested for changes to the stream ecosystem as a result of urbanization by measuring insect community parameters upstream and downstream of buried sites in the three creeks in Ellensburg, Washington, that are affected by urban stream syndrome. I measured chlorophyll on rocks, total suspended sediments (TSS), fine benthic organic matter (FBOM), ammonium, and phosphorus to relate to insect communities characteristics. I hypothesized that there would be an overall significant difference between insect communities in the upstream and downstream sites. Each creek was tested at two sites, with an upstream and a downstream testing location, totaling twelve sample sites. To find the significance of the data, a paired t-test was used to find any significance between the upstream and the downstream sites. I found no significant difference in chlorophyll, FBOM, or TSS between the upstream and downstream sites, p = 0.92, p = 0.47, and p = 0.50, respectively. However, I did find higher phosphorus concentrations upstream of a buried stream segment compared to downstream, p = 0.048, implying net phosphorus uptake in the buried reach. The identification of the individual insects within their respected communities will show whether or not burial is affecting these communities

Infografía animada para la campaña Premios OSPAR 2015 (Ártico) de Greenpeace España

Treballs de l'alumnat del Grau de Comunicació Audiovisual, Facultat de Biblioteconomia i Documentació, Universitat de Barcelona, Treball Final de Grau TFG. Curs: 2013-2014, Tutors: Lydia Sánchez i Jaume VilasecaDirector, Guionista i Direcció de so: Irati Aguirre, Tècnic de so: Ignasi Jacob, Veu en off: Inés Vallvé y Alex Ramis, Muntatge i Animació: Irati Aguirre, Disseny Gràfic: Oier Irisarri i Irati Aguirre, Música: JahzzarMemòria: El presente proyecto creativo es una infografía animada que explica el convenio OSPAR, sus objetivos y funciones, y el importante papel que tiene para proteger el Ártico. Esta vídeo es una producción para la campaña del Ártico de la organización ecologista Greenpeace, a parte de un reto personal para conocer y aprender a utilizar mejor el programa de efectos y composición Adobe After Effects.Vídeo: Durante sus 23 años de existencia, OSPAR y sus delegados han jugado un papel fundamental, con decisiones audaces y positivas destinadas a proteger de la presión humana las aguas del Atlántico nororiental. Estas son las historias a las que OSPAR ha contribuido para dar un final feliz. El mismo final feliz que casi 7 millones de Defensores del Ártico alrededor del mundo están pidiendo para la película ”Salvar la primera parte del Santuario Ártico”. www.savethearctic.org/ospa

Risk Analysis: an Approach for Safety-related Projects at CERN

In recent years Risk Analysis has become increasingly important for any kind of project for both personnel and equipment safety assessments. Many divisional projects must respect the rules imposed by the French regulatory authority (INB) and the requirements of applicable international standards. This document proposes a systematic approach for the setting up of a complete Risk Analysis, and it defines coherent steps to be undertaken in order to check the achievement of the project safety goals. Several techniques are discussed, and some ST projects to which they have been applied or are going to be applied are presented. The proposed Risk Analysis structure should be associated and adapted to the different stages of the design and allows the definition of safety requirements; it furthermore traces the guidelines for qualitative and quantitative assessments

Constructos teóricos y metodológicos del enfoque socioepistemológico de la matemática educativa. Avances de una investigación

Los procesos de enseñanza-aprendizaje están claramente ligados al contexto en el cual las personas que construyen su conocimiento viven y se desenvuelven (Cantoral, 2013); es así que el reconocimiento de lo social en la construcción del saber se constituye en una deuda que como educadores debemos asumir y fortalecer. En este sentido, la teoría Socioepistemológica adquiere valides en la medida que aborda la construcción del conocimiento matemático a través de cuatro dimensiones de manera sistémica, y otorga al mismo significados propios, contextualizados, que se construyen y reconstruyen con una intención. (Arrieta & Otros, 2013). Siendo así, este enfoque se constituye en un excelente medio teórico de guía para el análisis de construcciones matemáticas situadas, el cual se desarrollará el presente artículo a la luz de cada uno de los constructos teóricos que la componen, su propuesta metodológica, y sus alcances en el campo de la matemática educativa

Re-conceptualizing the International System: The Need for nsa Inclusion in the International Human Rights Regime

The growing role of nonstate actors in an international system that was created to deal mainly with state and not entities has allowed these actors considerable freedom from the accountability of their actions, especially in the realm of human rights. Both International Relations theory and International Law need to deal in an interdisciplinary manner to close this loophole in order to at least offer an incentive for nonstate actors to avoid further violations of human rights and humanitarian law in the future.El papel creciente de actores no gubernamentales en un sistema internacional que fue creado para dar principalmente con el estado y no a entidades ha permitido a estos actores la libertad considerable de la responsabilidad de sus acciones, sobre todo en el reino de derechos humanos. Tanto la teoría de Relaciones Internacional como el Derecho Internacional tienen que dar en una manera interdisciplinaria para cerrar esta escapatoria para al menos ofrecer un incentivo para actores no gubernamentales para evitar remotas violaciones de derechos humanos y la ley humanitaria en el futuro

Behaviour modelling with data obtained from the Internet and contributions to cluster validation

[EN]This PhD thesis makes contributions in modelling behaviours found in different types of data acquired from the Internet and in the field of clustering evaluation. Two different types of Internet data were processed, on the one hand, internet traffic with the objective of attack detection and on the other hand, web surfing activity with the objective of web personalization, both data being of sequential nature. To this aim, machine learning techniques were applied, mostly unsupervised techniques. Moreover, contributions were made in cluster evaluation, in order to make easier the selection of the best partition in clustering problems. With regard to network attack detection, first, gureKDDCup database was generated which adds payload data to KDDCup99 connection attributes because it is essential to detect non-flood attacks. Then, by modelling this data a network Intrusion Detection System (nIDS) was proposed where context-independent payload processing was done obtaining satisfying detection rates. In the web mining context web surfing activity was modelled for web personalization. In this context, generic and non-invasive systems to extract knowledge were proposed just using the information stored in webserver log files. Contributions were done in two senses: in problem detection and in link suggestion. In the first application a meaningful list of navigation attributes was proposed for each user session to group and detect different navigation profiles. In the latter, a general and non-invasive link suggestion system was proposed which was evaluated with satisfactory results in a link prediction context. With regard to the analysis of Cluster Validity Indices (CVI), the most extensive CVI comparison found up to a moment was carried out using a partition similarity measure based evaluation methodology. Moreover, we analysed the behaviour of CVIs in a real web mining application with elevated number of clusters in which they tend to be unstable. We proposed a procedure which automatically selects the best partition analysing the slope of different CVI values.[EU]Doktorego-tesi honek internetetik eskuratutako datu mota ezberdinetan aurkitutako portaeren modelugintzan eta multzokatzeen ebaluazioan egiten ditu bere ekarpenak. Zehazki, bi mota ezberdinetako interneteko datuak prozesatu dira: batetik, interneteko trafikoa, erasoak hautemateko helburuarekin; eta bestetik, web nabigazioen jarduera, weba pertsonalizatzeko helburuarekin; bi datu motak izaera sekuentzialekoak direlarik. Helburu hauek lortzeko, ikasketa automatikoko teknikak aplikatu dira, nagusiki gainbegiratu-gabeko teknikak. Testuinguru honetan, multzokatzeen partizio onenaren aukeraketak dakartzan arazoak gutxitzeko multzokatzeen ebaluazioan ere ekarpenak egin dira. Sareko erasoen hautemateari dagokionez, lehenik gureKDDCup datubasea eratu da KDDCup99-ko konexio atributuei payload-ak (sareko paketeen datu eremuak) gehituz, izan ere, ez-flood erasoak (pakete gutxi erabiltzen dituzten erasoak) hautemateko ezinbestekoak baitira. Ondoren, datu hauek modelatuz testuinguruarekiko independenteak diren payload prozesaketak oinarri dituen sareko erasoak hautemateko sistema (network Intrusion Detection System (nIDS)) bat proposatu da maila oneko eraso hautemate-tasak lortuz. Web meatzaritzaren testuinguruan, weba pertsonalizatzeko helburuarekin web nabigazioen jarduera modelatu da. Honetarako, web zerbizarietako lorratz fitxategietan metatutako informazioa soilik erabiliz ezagutza erabilgarria erauziko duen sistema orokor eta ez-inbasiboak proposatu dira. Ekarpenak bi zentzutan eginaz: arazoen hautematean eta esteken iradokitzean. Lehen aplikazioan sesioen nabigazioa adierazteko atributu esanguratsuen zerrenda bat proposatu da, gero nabigazioak multzokatu eta nabigazio profil ezberdinak hautemateko. Bigarren aplikazioan, estekak iradokitzeko sistema orokor eta ez-inbasibo bat proposatu da, eta berau, estekak aurresateko testuinguruan ebaluatu da emaitza onak lortuz. Multzokatzeak balioztatzeko indizeen (Cluster Validity Indices (CVI)) azterketari dagokionez, gaurdaino aurkitu den CVI-en konparaketa zabalena burutu da partizioen antzekotasun neurrian oinarritutako ebaluazio metodologia erabiliz. Gainera, CVI-en portaera aztertu da egiazko web meatzaritza aplikazio batean normalean baino multzo kopuru handiagoak dituena, non CVI-ek ezegonkorrak izateko joera baitute. Arazo honi aurre eginaz, CVI ezberdinek partizio ezberdinetarako lortzen dituzten balioen maldak aztertuz automatikoki partiziorik onena hautatzen duen prozedura proposatu da.[ES]Esta tesis doctoral hace contribuciones en el modelado de comportamientos encontrados en diferentes tipos de datos adquiridos desde internet y en el campo de la evaluación del clustering. Dos tipos de datos de internet han sido procesados: en primer lugar el tráfico de internet con el objetivo de detectar ataques; y en segundo lugar la actividad generada por los usuarios web con el objetivo de personalizar la web; siendo los dos tipos de datos de naturaleza secuencial. Para este fin, se han aplicado técnicas de aprendizaje automático, principalmente técnicas no-supervisadas. Además, se han hecho aportaciones en la evaluación de particiones de clusters para facilitar la selección de la mejor partición de clusters. Respecto a la detección de ataques en la red, primero, se generó la base de datos gureKDDCup que añade el payload (la parte de contenido de los paquetes de la red) a los atributos de la conexión de KDDCup99 porque el payload es esencial para la detección de ataques no-flood (ataques que utilizan pocos paquetes). Después, se propuso un sistema de detección de intrusos (network Intrusion Detection System (IDS)) modelando los datos de gureKDDCup donde se propusieron varios preprocesos del payload independientes del contexto obteniendo resultados satisfactorios. En el contexto de la minerı́a web, se ha modelado la actividad de la navegación web para la personalización web. En este contexto se propondrán sistemas genéricos y no-invasivos para la extracción del conocimiento, utilizando únicamente la información almacenada en los ficheros log de los servidores web. Se han hecho aportaciones en dos sentidos: en la detección de problemas y en la sugerencia de links. En la primera aplicación, se propuso una lista de atributos significativos para representar las sesiones de navegación web para después agruparlos y detectar diferentes perfiles de navegación. En la segunda aplicación, se propuso un sistema general y no-invasivo para sugerir links y se evaluó en el contexto de predicción de links con resultados satisfactorios. Respecto al análisis de ı́ndices de validación de clusters (Cluster Validity Indices (CVI)), se ha realizado la más amplia comparación encontrada hasta el momento que utiliza la metodologı́a de evaluación basada en medidas de similitud de particiones. Además, se ha analizado el comportamiento de los CVIs en una aplicación real de minerı́a web con un número elevado de clusters, contexto en el que los CVIs tienden a ser inestables, ası́ que se propuso un procedimiento para la selección automática de la mejor partición en base a la pendiente de los valores de diferentes CVIs.Grant of the Basque Government (ref.: BFI08.226); Grant of Ministry of Economy and Competitiveness of the Spanish Government (ref.: BES-2011-045989); Research stay grant of Spanish Ministry of Economy and Competitiveness (ref.: EEBB-I-14-08862); University of the Basque Country UPV/EHU (BAILab, grant UFI11/45); Department of Education, Universities and Research of the Basque Government (grant IT-395-10); Ministry of Economy and Competitiveness of the Spanish Government and by the European Regional Development Fund - ERDF (eGovernAbility, grant TIN2014-52665-C2-1-R)