12 research outputs found
CDC2 mediates progestin initiated endometrial stromal cell proliferation: a PR signaling to gene expression independently of its binding to chromatin
Although non-genomic steroid receptor pathways have been studied over the past decade, little is known about the direct gene expression changes that take place as a consequence of their activation. Progesterone controls proliferation of rat endometrial stromal cells during the peri-implantation phase of pregnancy. We showed that picomolar concentration of progestin R5020 mimics this control in UIII endometrial stromal cells via ERK1-2 and AKT activation mediated by interaction of Progesterone Receptor (PR) with Estrogen Receptor beta (ERb) and without transcriptional activity of endogenous PR and ER. Here we identify early downstream targets of cytoplasmic PR signaling and their possible role in endometrial stromal cell proliferation. Microarray analysis of global gene expression changes in UIII cells treated for 45 min with progestin identified 97 up- and 341 down-regulated genes. The most over-represented molecular functions were transcription factors and regulatory factors associated with cell proliferation and cell cycle, a large fraction of which were repressors down-regulated by hormone. Further analysis verified that progestins regulate Ccnd1, JunD, Usf1, Gfi1, Cyr61, and Cdkn1b through PR-mediated activation of ligand-free ER, ERK1-2 or AKT, in the absence of genomic PR binding. ChIP experiments show that progestin promoted the interaction of USF1 with the proximal promoter of the Cdc2 gene. Usf1 knockdown abolished Cdc2 progestin-dependent transcriptional regulation and cell proliferation, which also blocked Cdc2 knockdown. We conclude that progestin-induced proliferation of endometrial stromal cells is mediated by ERK1-2 and AKT dependent early regulation of USF1, which directly induces Cdc2. To our knowledge, this is the first description of early target genes of progestin-activated classical PR via crosstalk with protein kinases and independently of hormone receptor binding to the genomic targets.Fil: Vallejo, Griselda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental (i); ArgentinaFil: la Greca, Alejandro Damián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental (i); ArgentinaFil: Tarifa Reischle, Inti C.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental (i); ArgentinaFil: Mestre Citrinovitz, Ana Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental (i); ArgentinaFil: Ballaré, Cecilia. Centro de Regulación Genómica; EspañaFil: Beato, Miguel. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; EspañaFil: Saragüeta, Patricia Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental (i); Argentin
Identification of the miRNAome of early mesoderm progenitor cells and cardiomyocytes derived from human pluripotent stem cells
MicroRNAs are small non-coding RNAs involved in post-transcriptional regulation of gene expression related to many cellular functions. We performed a small-RNAseq analysis of cardiac differentiation from pluripotent stem cells. Our analyses identified some new aspects about microRNA expression in this differentiation process. First, we described a dynamic expression profile of microRNAs where some of them are clustered according to their expression level. Second, we described the extensive network of isomiRs and ADAR modifications. Third, we identified the microRNAs families and clusters involved in the establishment of cardiac lineage and define the mirRNAome based on these groups. Finally, we were able to determine a more accurate miRNAome associated with cardiomyocytes by comparing the expressed microRNAs with other mature cells. MicroRNAs exert their effect in a complex and interconnected way, making necessary a global analysis to better understand their role. Our data expands the knowledge of microRNAs and their implications in cardiomyogenesis.Fil: Garate, Ximena. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: la Greca, Alejandro Damián. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Neiman, Gabriel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Bluguermann, Carolina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Santín Velazque, Natalia Lucía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Moro, Lucía Natalia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Luzzani, Carlos Daniel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Scassa, Maria Elida. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Sevlever, Gustavo. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Romorini, Leonardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Miriuka, Santiago Gabriel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin
Single cell transfection of human-induced pluripotent stem cells using a dropletbased microfluidic system
Microfluidic tools have recently made possible many advances in biological and biomedical research. Research in fields such as physics, engineering, chemistry and biology have combined to produce innovation in microfluidics which has positively impacted diverse areas such as nucleotide sequencing, functional genomics, single-cell studies, single molecules assays and biomedical diagnostics. Among these areas, regenerative medicine and stem cells have benefited from microfluidics since these tools have had a profound impact on their applications. In this study, we present a high-performance droplet-based system for transfecting individual human-induced pluripotent stem cells. We will demonstrate that this system has great efficiency in single cells and captured droplets, like other microfluidic methods but with lower cost. Moreover, this microfluidic approach can be associated with the PiggyBac transposase-based system to increase its transfection efficiency. Our results provide a starting point for subsequent applications in more complex transfection systems, single-cell differentiation interactions, cell subpopulations and cell therapy, among other potential applications.Fil: Pérez Sosa, Camilo José. Fundacion P/la Lucha C/enferm.neurologicas Infancia. Instituto de Neurociencias. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Neurociencias.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Sanluis Verdes, Anahi. Fundacion P/la Lucha C/enferm.neurologicas Infancia. Instituto de Neurociencias. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Neurociencias.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Waisman, Ariel. Fundacion P/la Lucha C/enferm.neurologicas Infancia. Instituto de Neurociencias. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Neurociencias.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Lombardi, Antonella. Fundacion P/la Lucha C/enferm.neurologicas Infancia. Instituto de Neurociencias. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Neurociencias.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Rosero, Gustavo. Universidad Tecnológica Nacional; ArgentinaFil: la Greca, Alejandro Damián. Fundacion P/la Lucha C/enferm.neurologicas Infancia. Instituto de Neurociencias. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Neurociencias.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Bhansali, Shekhar. Florida International University; Estados UnidosFil: Bourguignon, Natalia. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Luzzani, Carlos Daniel. Fundacion P/la Lucha C/enferm.neurologicas Infancia. Instituto de Neurociencias. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Neurociencias.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Perez, Maximiliano Sebastian. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Miriuka, Santiago Gabriel. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Lerner, Betiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Tecnológica Nacional; Argentin
Celldeath: A tool for detection of cell death in transmitted light microscopy images by deep learning-based visual recognition
Cell death experiments are routinely done in many labs around the world, these experiments are the backbone of many assays for drug development. Cell death detection is usually performed in many ways, and requires time and reagents. However, cell death is preceded by slight morphological changes in cell shape and texture. In this paper, we trained a neural network to classify cells undergoing cell death. We found that the network was able to highly predict cell death after one hour of exposure to camptothecin. Moreover, this prediction largely outperforms human ability. Finally, we provide a simple python tool that can broadly be used to detect cell death.Fil: la Greca, Alejandro Damián. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Pérez, Nelba. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Castañeda, Sheila Lucia. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Milone, Paula Melania. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Scarafia, Maria Agustina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Möbbs, Alan Miqueas. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Waisman, Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Moro, Lucía Natalia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Sevlever, Gustavo Emilio. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Luzzani, Carlos Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Miriuka, Santiago Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentin
Extracellular vesicles from pluripotent stem cell-derived mesenchymal stem cells acquire a stromal modulatory proteomic pattern during differentiation
Mesenchymal stem/stromal cells (MSCs) obtained from pluripotent stem cells (PSCs) constitute an interesting alternative to classical MSCs in regenerative medicine. Among their many mechanisms of action, MSC extracellular vesicles (EVs) are a potential suitable substitute for MSCs in future cell-free-based therapeutic approaches. Unlike cells, EVs do not elicit acute immune rejection, and they can be produced in large quantities and stored until ready to use. Although the therapeutic potential of MSC EVs has already been proven, a thorough characterization of MSC EVs is lacking. In this work, we used a label-free liquid chromatography tandem mass spectrometry proteomic approach to identify the most abundant proteins in EVs that are secreted from MSCs derived from PSCs (PD-MSCs) and from their parental induced PSCs (iPSCs). Next, we compared both datasets and found that while iPSC EVs enclose proteins that modulate RNA and microRNA stability and protein sorting, PD-MSC EVs are rich in proteins that organize extracellular matrix, regulate locomotion, and influence cell–substrate adhesion. Moreover, compared to their respective cells, iPSCs and iPSC EVs share a greater proportion of proteins, while the PD-MSC proteome appears to be more specific. Correlation and principal component analysis consistently aggregate iPSCs and iPSC EVs but segregate PD-MSC and their EVs. Altogether, these findings suggest that during differentiation, compared with their parental iPSC EVs, PD-MSC EVs acquire a more specific set of proteins; arguably, this difference might confer their therapeutic properties.Facultad de Ciencias MédicasConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnica
HLA-G gene editing in tumor cell lines as a novel alternative in cancer immunotherapy
Cancer immunotherapies based mainly on the blockade of immune-checkpoint (IC) molecules by anti-IC antibodies offer new alternatives for treatment in oncological diseases. However, a considerable proportion of patients remain unresponsive to them. Hence, the development of novel clinical immunotherapeutic approaches and/or targets are crucial.W In this context, targeting the immune-checkpoint HLA-G/ILT2/ILT4 has caused great interest since it is abnormally expressed in several malignancies generating a tolerogenic microenvironment. Here, we used CRISPR/Cas9 gene editing to block the HLA-G expression in two tumor cell lines expressing HLA-G, including a renal cell carcinoma (RCC7) and a choriocarcinoma (JEG-3). Different sgRNA/Cas9 plasmids targeting HLA-G exon 1 and 2 were transfected in both cell lines. Downregulation of HLA-G was reached to different degrees, including complete silencing. Most importantly, HLA-G − cells triggered a higher in vitro response of immune cells with respect to HLA-G + wild type cells. Altogether, we demonstrated for the first time the HLA-G downregulation through gene editing. We propose this approach as a first step to develop novel clinical immunotherapeutic approaches in cancer.Fil: Palma, Maria Belen. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Departamento de Ciencias Morfológicas. Cátedra de Citología y Embriología A; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; ArgentinaFil: Tronik Le Roux, Diana. Saint-Louis Hospital; Francia. Universite de Paris 1 - Pantheon Sorbonne.; FranciaFil: Amin, Guadalupe. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Castañeda, Sheila Lucia. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Möbbs, Alan Miqueas. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Scarafia, Maria Agustina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: la Greca, Alejandro Damián. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Daouya, Marina. Hôpital Saint-louis; Francia. Universite de Paris 1 - Pantheon Sorbonne.; FranciaFil: Poras, Isabelle. Hôpital Saint-louis; Francia. Universite de Paris 1 - Pantheon Sorbonne.; FranciaFil: Inda, Ana María. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Departamento de Ciencias Morfológicas. Cátedra de Citología y Embriología A; Argentina. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas; ArgentinaFil: Moro, Lucía Natalia. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Carosella, Edgardo Delfino. Hôpital Saint-louis; Francia. Universite de Paris 1 - Pantheon Sorbonne.; FranciaFil: García, Marcela Nilda. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Departamento de Ciencias Morfológicas. Cátedra de Citología y Embriología A; ArgentinaFil: Miriuka, Santiago Gabriel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin
Higher-order chromatin organization defines Progesterone Receptor and PAX2 binding to regulate estradiol-primed endometrial cancer gene expression
Estrogen (E2) and Progesterone (Pg), via their specific receptors (ER and PR respectively), are major determinants in the development and progression of endometrial malignancies. Here, we have studied how E2 and the synthetic progestin R5020 affect genomic functions in Ishikawa endometrial cancer cells. Using ChIPseq in cells exposed to the corresponding hormones, we identified cell specific binding sites for ER (ERbs) and PR (PRbs), which mostly correspond to independent sites but both adjacent to sites bound by PAX2. Analysis of long-range interactions by Hi-C showed enrichment of regions co-bound by PR and PAX2 inside TADs that contain differentially progestin-regulated genes. These regions, which we call “progestin control regions” (PgCRs), exhibit an open chromatin state prior to the exposure to the hormone. Our observations suggest that endometrial response to progestins in differentiated endometrial tumor cells results in part from binding of PR together with partner transcription factors to PgCRs, compartmentalizing hormone-independent open chromatin.Fil: la Greca, Alejandro Damián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Bellora, Nicolás. Comision Nacional de Energia Atomica. Gerencia de Area de Aplicaciones de la Tecnologia Nuclear. Instituto de Tecnologias Nucleares Para la Salud.; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente. Universidad Nacional del Comahue. Centro Regional Universidad Bariloche. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente; ArgentinaFil: Le Dily, Francois. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; EspañaFil: Jara, Rodrigo Agustin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Quilez Oliete, Javier. Centro de Regulación Genómica; EspañaFil: Villanueva, José Luis. Centro de Regulación Genómica; EspañaFil: Vidal, Enrique. Centro de Regulación Genómica; EspañaFil: Merino, Gabriela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba; ArgentinaFil: Fresno Rodríguez, Cristóbal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba; ArgentinaFil: Tarifa Reischle, Inti Carlos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Vallejo, Griselda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Vicent, Guillermo P.. Centro de Regulación Genómica; EspañaFil: Fernandez, Elmer Andres. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba; ArgentinaFil: Beato, Miguel. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; EspañaFil: Saragueta, Patricia Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentin
Analysis of the expression of PIWI-interacting RNAs during cardiac differentiation of human pluripotent stem cells
PIWI-interacting RNAs (piRNAs) are a class of non-coding RNAs initially thought to be restricted exclusively to germline cells. In recent years, accumulating evidence has demonstrated that piRNAs are actually expressed in pluripotent, neural, cardiac and even cancer cells. However, controversy remains around the existence and function of somatic piRNAs. Using small RNA-seq samples from H9 pluripotent cells differentiated to mesoderm progenitors and cardiomyocytes we identified the expression of 447 piRNAs, of which 241 were detected in pluripotency, 218 in mesoderm and 171 in cardiac cells. The majority of them originated from the sense strand of protein coding and lncRNAs genes in all stages of differentiation, though no evidences for secondary piRNAs (ping-pong) were found. Genes hosting piRNAs in cardiac samples were related to critical biological processes in the heart, like contraction and cardiac muscle development. Our results indicate that somatic piRNAs might have a role in fine-tuning the expression of genes involved in differentiation of pluripotent cells to cardiomyocytes.Fil: la Greca, Alejandro Damián. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Scarafia, Maria Agustina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Hernández Cañás, María Clara. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Perez, Maria Nelba. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Castañeda, Sheila Lucia. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Colli, Carolina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Möbbs, Alan Miqueas. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Santín Velazque, Natalia Lucía. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Neiman, Gabriel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Garate, Ximena. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Aban, Cyntia Estefania. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Waisman, Ariel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Moro, Lucía Natalia. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Sevlever, Gustavo. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Luzzani, Carlos Daniel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Miriuka, Santiago Gabriel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin
Integrin alpha-5 subunit is critical for the early stages of human pluripotent stem cell cardiac differentiation
The stem cell niche has a strong influence in the differentiation potential of human pluripotent stem cells with integrins playing a major role in communicating cells with the extracellular environment. However, it is not well understood how interactions between integrins and the extracellular matrix are involved in cardiac stem cell differentiation. To evaluate this, we performed a profile of integrins expression in two stages of cardiac differentiation: mesodermal progenitors and cardiomyocytes. We found an active regulation of the expression of different integrins during cardiac differentiation. In particular, integrin α5 subunit showed an increased expression in mesodermal progenitors, and a significant downregulation in cardiomyocytes. To analyze the effect of α5 subunit, we modified its expression by using a CRISPRi technique. After its downregulation, a significant impairment in the process of epithelial-to-mesenchymal transition was seen. Early mesoderm development was significantly affected due to a downregulation of key genes such as T Brachyury and TBX6. Furthermore, we observed that repression of integrin α5 during early stages led to a reduction in cardiomyocyte differentiation and impaired contractility. In summary, our results showed the link between changes in cell identity with the regulation of integrin α5 expression through the alteration of early stages of mesoderm commitment.Fil: Neiman, Gabriel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Scarafia, Maria Agustina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: la Greca, Alejandro Damián. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Santín Velazque, Natalia Lucía. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Garate, Ximena. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Waisman, Ariel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Möbbs, Alan Miqueas. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Kasai-Brunswick, Tais Hanae. Universidade Federal do Rio de Janeiro; BrasilFil: Mesquita, Fernanda. Universidade Federal do Rio de Janeiro; BrasilFil: Martire Greco, Daiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires; ArgentinaFil: Moro, Lucía Natalia. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Luzzani, Carlos Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Bastos Carvalho, Adriana. Universidade Federal do Rio de Janeiro; BrasilFil: Sevlever, Gustavo. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; ArgentinaFil: Campos de Carvalho, Antonio. Universidade Federal do Rio de Janeiro; BrasilFil: Guberman, Alejandra Sonia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Miriuka, Santiago Gabriel. Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin
Genome-wide analysis of estradiol and progesterone action on human endometrial epithelial cancer cells
En esta tesis estudiamos la especificidad tisular de la acción de Estradiol (E2) y la progestina R5020 en el endometrio usando tecnologías de secuenciación masiva y análisis bioinformáticos sobre la respuesta de la línea de adenocarcinoma endometrial Ishikawa comparada con la línea de cáncer de mama T47D. Análisis de RNAseq revelaron una cantidad similar de genes diferencialmente regulados por E2 (Ishikawa:506, T47D:470) y por R5020 (Ishikawa:1287, T47D:2330), sólo el 10% presentó una regulación común en ambos tipos celulares. E2 reguló migración, locomoción celular y modulación de la vía de TGFb, mientras que R5020 estaría involucrada en mecanismos secretorios y defensivos, y regulación vía spliceosoma en células Ishikawa. En las células T47D ambas hormonas modificaron señalización y regulación del ciclo celular. El reclutamiento de RP (Sitios de unión en Ishikawa~2.500, sitios de unión en T47D:~25.000) y RE al genoma de ambos tipos celulares en respuesta a tratamientos cortos con R5020 y E2 se estudió mediante ChIPseq. Por otra parte, el RP unido a ligando indujo la rápida y transitoria fosforilación de Erk pero no de Akt, siendo dicha fosforilación dependiente de RE, mientras que el RE unido a ligando fue capaz de activar Erk y Akt en células Ishikawa y no así en T47D. La activación de estas quinasas es crucial para la respuesta proliferativa en ambos tipos celulares. Proponemos al reclutamiento diferencial de los receptores hormonales y la activación selectiva de quinasas como los motores de la regulación génica dependiente de las hormonas que conducen a la distinción morfológica y funcional entre la mama y el endometrio.In this Thesis we studied the tissue specific action of estradiol (E2) and the progestin R5020 in endometrium using deep sequencing technologies and bioinformatics analyses on Ishikawa endometrial cancer cell line compared to T47D breast cancer cell line. RNAseq analysis revealed similar number of differentially regulated genes by E2 (Ishikawa:506, T47D:470) and by R5020 (Ishikawa:1287, T47D:2330) and only 10% of these regulated genes is shared between cell lines. E2 regulated migration, locomotion and TGFb pathway, whilst R5020 would be involved in secretory and defensive mechanisms and gene regulation via spliceosoma in Ishikawa cells. In T47D cells both hormones modulated signaling and cell cycle progression. Recruitment of PR (PR binding sites in Ishikawa:~2.500, PR binding sites in T47D:~25.000) and ER to the genome of both cell lines in response to short treatments with R5020 and E2 respectively were studied by ChIPseq. Concomitantly, ligandbound PR induced rapid and transient phosphorylation of Erk but not Akt and this phosphorylation was dependent on ligand-free ER, while ligand-bound ER activated Erk and Akt in Ishikawa cells. This is not exactly the case in T47D cells where Erk and Akt are rapidly activated by both hormones. Activation of these kinases is crucial for the proliferative response in both cell types. We propose that differential recruitment of the steroid receptors together with selective kinases activation are the engines of the hormone-dependent gene regulation which ultimately derives in the morphological and functional differences between breast and endometrium.Fil: la Greca, Alejandro Damián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentin