119 research outputs found
La production fruitiÚre intégrée en France : le vert est-il dans le fruit ?
International audienceAvec la mise en place de la nouvelle Organisation commune de marchĂ© (OCM) des fruits et lĂ©gumes en 1996 (RĂšglement CE n°2200/96), la production fruitiĂšre a Ă©tĂ© confrontĂ©e Ă une double Ă©volution. Dâun cĂŽtĂ©, la politique europĂ©enne se donne pour objectif de structurer lâoffre. Elle institue les Organisations de producteurs, agents Ă©conomiques (coopĂ©ratives ou entreprises privĂ©es), quâelle dote de moyens financiers afin dâinciter les arboriculteurs Ă concentrer les volumes mis en marchĂ© et Ă mieux prendre en compte les prĂ©occupations en matiĂšre de santĂ©, de qualitĂ© des produits et de protection de lâenvironnement. Un engagement contractuel, le programme opĂ©rationnel, se substitue Ă lâintervention publique sur lâoffre au moyen de subventions au retrait de produits du marchĂ©. De lâautre, la libĂ©ralisation des marchĂ©s agricoles sâaccompagne dâune prolifĂ©ration de cahiers des charges, Ă lâinitiative soit des producteurs, soit des metteurs en marchĂ© ou de la grande distribution qui devient un acteur majeur dans la commercialisation des fruits et lĂ©gumes frais. La plupart de ces dĂ©marches se rĂ©clament du concept de Production fruitiĂšre intĂ©grĂ©e (PFI) dĂ©fini par lâOrganisation internationale de lutte biologique (OILB) comme « un systĂšme de production Ă©conomique de fruits de haute qualitĂ© donnant la prioritĂ© aux mĂ©thodes Ă©cologiquement plus sĂ»res, minimisant les effets secondaires indĂ©sirables et lâutilisation de produits agrochimiques, afin dâamĂ©liorer la protection de lâenvironnement et la santĂ© humaine » (OILB/SROP, 1997). La PFI se prĂ©sente donc comme une qualification dâun genre nouveau en agriculture qui associe Ă lâobjectif, classique, de qualitĂ© commerciale des fruits, un objectif de qualitĂ© Ă©cologique de leur mode de production. Elle met ainsi en relation, et en tension, plusieurs registres dâĂ©valuation des pratiques des arboriculteurs (Codron et al., 2003)
A Solve-RD ClinVar-based reanalysis of 1522 index cases from ERN-ITHACA reveals common pitfalls and misinterpretations in exome sequencing
Purpose
Within the Solve-RD project (https://solve-rd.eu/), the European Reference Network for Intellectual disability, TeleHealth, Autism and Congenital Anomalies aimed to investigate whether a reanalysis of exomes from unsolved cases based on ClinVar annotations could establish additional diagnoses. We present the results of the âClinVar low-hanging fruitâ reanalysis, reasons for the failure of previous analyses, and lessons learned.
Methods
Data from the first 3576 exomes (1522 probands and 2054 relatives) collected from European Reference Network for Intellectual disability, TeleHealth, Autism and Congenital Anomalies was reanalyzed by the Solve-RD consortium by evaluating for the presence of single-nucleotide variant, and small insertions and deletions already reported as (likely) pathogenic in ClinVar. Variants were filtered according to frequency, genotype, and mode of inheritance and reinterpreted.
Results
We identified causal variants in 59 cases (3.9%), 50 of them also raised by other approaches and 9 leading to new diagnoses, highlighting interpretation challenges: variants in genes not known to be involved in human disease at the time of the first analysis, misleading genotypes, or variants undetected by local pipelines (variants in off-target regions, low quality filters, low allelic balance, or high frequency).
Conclusion
The âClinVar low-hanging fruitâ analysis represents an effective, fast, and easy approach to recover causal variants from exome sequencing data, herewith contributing to the reduction of the diagnostic deadlock
Gouvernance des systÚmes fromagers au lait cru: reconnaissance, différenciations qualitatives, modalités de coexistence entre producteurs et filiÚres
SĂ©minaire REPASTOL "Revisiter l'Ă©vidence pasteurienne" 3° sĂ©ance - 15 et 16 juin 2017, Montpellier SupAgro Organisatrices : [email protected] et [email protected] Session 1 : Des modes dâexistence des fromages au lait cru Cette premiĂšre session dresse un Ă©tat des lieux de la diversitĂ© des productions fromagĂšres au lait cru Ă partir dâune analyse multisites des terrains sur lesquels travaillent les chercheurs de REPASTOL et leurs partenaires. Qui produit des fromages au la..
Produits laitiers: les réseaux d'influence sur le Web
Avec la transformation des modes dâaccĂšs Ă lâinformation, le web est devenu un terrain dâenquĂȘte fertile pour les sciences sociales. De quoi lâunivers fromager contemporain est-il fait ? Qui sont les acteurs qui Ă©changent des informations sur la toile ? Le fromage au lait cru est-il prĂ©sent, et si oui, comment est-il reprĂ©sentĂ©Â dans les contenus des sites ? Quels problĂšmes ou controverses soulĂšvent-ils ? DĂ©bora de Carvalho Pereira prĂ©sente ci-aprĂšs les rĂ©sultats de son Ă©tude exploratoire des ..
Parution : "Can raw milk cheese and pasteurised milk cheese coexist? Unthinkable or never really considered?"
Les recherches menĂ©es dans le cadre du projet REPASTOL ("Revisiter l'Ă©vidence pasteurienne : les systĂšmes fromagers au lait cru") ont donnĂ© lieu Ă une publication intitulĂ©e "Can raw milk cheese and pasteurised milk cheese coexist? Unthinkable or never really considered?", soit "La coexistence entre fromages au lait cru et fromages pasteurisĂ©s : impensable ou impensĂ©e ?", par Christine de Sainte Marie, Mariagiulia Mariani, Morgane Millet, Claire Cerdan, François Casabianca (INRAE â CIRAD). Ce ..
Result-based payments for âFlowering Meadowsâ in France : Support tools and collective learning process
The shift from management prescriptions to result-oriented schemes in France emerged fromthe largely unpredicted success of collaboration between a team of scientists from INRA andNatural regional Parks that started in 2005 in the Northern Alps.Iâm a cofounder and promoter of the Flowering Meadows programme that I will present from asocial sciences standpoint, focusing on what makes change happen and why it was wellreceived by farmers. I will thus concentrate on the hidden work which played a crucial role in thesuccess of the French scheme. Finally, I will show how the approach is evolving and point outthe key factors and obstacles to effective RBPs.Letâs start with a brief outline of existing RBPs in France.The first set of result-based measures aimed at maintaining the species richness of naturalgrasslands has been introduced in France in 2007.I have to mention the GRASS_09, or âPastoral management planâ, that aims at achievingspecific features of the mosaic of vegetation strata by grazing herds. However, the agreementscurrently implemented are mostly action-based and hardly promotes a step-by-step adaptationof management specifications to achieve the desired outcome.The desired ecological outcome of the flagship measure -GRASS_07, commonly known asâFlowering Meadowsâ, was modelled after the MEKA measure presented by Rainer Oppermannso I wonât go into details. Unlike Germany, the list must be specific to local condition
Modernisation de lâagriculture et reproduction des inĂ©galitĂ©s de dĂ©veloppement en Ăgypte
La politique de modernisation de lâagriculture menĂ©e depuis dix ans accentue les inĂ©galitĂ©s dans les campagnes Ă©gyptiennes en concentrant les moyens collectifs de dĂ©veloppement sur une Ă©troite couche de moyennes et grandes exploitations dĂ©jĂ rentables ; les bas prix versĂ©s pour les rĂ©coltes grĂšvent la capacitĂ© dâĂ©pargne et compromettent la viabilitĂ© des exploitations paysannes, qui nâont pas accĂšs aux nouveaux matĂ©riels mĂ©caniques et gĂ©nĂ©tiques subventionnĂ©s par lâĂtat, alors quâelles recĂšlent pourtant le plus fort potentiel dâintensification.
Le dĂ©veloppement de lâĂ©levage, ainsi que du travail salariĂ© hors de lâexploitation (polyactivitĂ©. Ă©migration vers les pays arabes voisins.) ont permis Ă cette agriculture familiale Ă petite Ă©chelle de se maintenir.
Les revenus extĂ©rieurs, liĂ©s Ă la conjoncture rĂ©gionale et internationale, ont pu jusquâici amortir les effets de la modernisation de lâagriculture, mais jusquâĂ quand ?De Sainte Marie Christine. Modernisation de lâagriculture et reproduction des inĂ©galitĂ©s de dĂ©veloppement en Ăgypte. In: Terroirs et sociĂ©tĂ©s au Maghreb et au Moyen Orient
Ătat et paysans dans les systĂšmes hydrauliques de la vallĂ©e du Nil (Egypte)
The State and Peasants in Modern Egypt's Hydraulic Systems
Until the Aswan dam's reservoir was put in use 25 years ago, the Egyptian "agricultures" were so numerous as the ways to use the Nile's waters : methods, practised for 5000 years, using floodwaters ; methods for drawing water from lowlands and along the river banks ; methods using dams during the 19th century to intensively farm irrigated land. Attention has been focused too narrowly on bid hydraulic projects designed and managed by the State rather than on the irrigation techniques and social organization at the village- and field-levels. By following the water course beyond the public system, we can observe the complexity of relations between peasants and the state.La vallĂ©e du Nil a Ă©tĂ© amĂ©nagĂ©e par Ă©tapes et selon des modalitĂ©s diverses. Jusqu'Ă l'entrĂ©e en service du rĂ©servoir d'Assouan, il y a vingt-cinq ans, coexistaient autant d'agricultures Ă©gyptiennes que de façons d'utiliser les eaux du Nil : culture de dĂ©crue des bassins d'inondation, pratiquĂ©e depuis cinq millĂ©naires ; culture par puisage des bas-fonds et des berges ; culture intensive des pĂ©rimĂštres irriguĂ©s avec la construction de barrages de surĂ©lĂ©vation dans le courant du XIXe siĂšcle. La grande hydraulique, conçue et gĂ©rĂ©e par l'Ătat, a focalisĂ© l'attention, aux dĂ©pens des techniques et de l'organisation sociale de l'irrigation au niveau du terroir villageois et des champs. En s'attachant Ă suivre le circuit de l'eau lorsque celle-ci quitte le rĂ©seau public, cet article entend restituer la complexitĂ© des rapports entre les paysans et l'Ătat.De Sainte Marie Christine. Ătat et paysans dans les systĂšmes hydrauliques de la vallĂ©e du Nil (Egypte). In: Ătudes rurales, n°115-116, 1989. Hydraulique. pp. 59-91
Amélioration de la culture et de la pollinisation du palmier dattier. Constat de situation en palmeraies égyptiennes. Oasis de la Nouvelle Vallée, Assiout, Assouan
La mission avait pour objet d'Ă©tablir un diagnostic de situation concernant la pollinisation en palmeraies Ă©gyptiennes. L'Ă©tude a Ă©tĂ© centrĂ©e sur des rĂ©gions pour lesquelles la phoeniciculture revĂȘtait une importance particuliĂšre : oasis du dĂ©sert occidental (Kharga, Dakhla) et haute vallĂ©e du Nil (Assouan). Il s'agissait : d'observer les pratiques traditionnelles de pollinisation afin d'Ă©valuer l'impact de l'introduction de poudreuses pollinisatrices, d'Ă©tudier les relations entre ces pratiques de pollinisation et les types de systĂšmes de production dans lesquelles elles prennent place, d'identifier les contraintes, les atouts et les tendances d'Ă©volution de ces systĂšmes phoenicicoles, de dĂ©gager enfin des voies de recherche et d'amĂ©lioration. Les enquĂȘtes ont Ă©tĂ© effectuĂ©es auprĂšs des phoeniciculteurs pendant la pĂ©riode de floraison. Elles ont Ă©tĂ© approfondies par des Ă©changes de vues avec les autres parties concernĂ©es : directions rĂ©gionales de l'agriculture, coopĂ©ratives locales, services de l'irrigation, commerçants et transformateur
- âŠ