Quantitative Trait Locus (QTL) involved in the resistance of barley (Hordeum vulgare L.) to the mildew under different water treatments, in semi-arid Mediterranean region

In the present study we evaluated the contribution of molecular marking to the breeding of barley ( Hordeum vulgare L.) for resistance to the mildew ( Erysiphe graminis sp L. hordei ) in semi-arid Mediterranean region. For this study a F8 progeny of 167 recombinants inbred lines (RILs) from two row barley was cultivated at the experimental station of the National Institute of Agronomic Research of Tunisia (INRAT), at Kef during the cropping season of 1999/2000. The trials, in a completely randomized design, were conducted under three water treatments: (1) irrigation at seedling emergence, (2) no water addition and (3) irrigation at first observation of water stress symptoms. Assessment of natural infection by mildew of was made every fifteen days starting from the day when water treatments were setup. Statistical analyses of data showed a high among progeny variation within the progeny of RILs regardless a water treatments; however plants of treatment 1 (irrigation since seedling emergence) appeared to be the most susceptible. A combination of data on susceptibility of barley to natural infection by mildew and data from the genetic map generated from the crossing of Er/Apm vs Tadmor (parents of the 167RILs) allowed the detection and localization of several QTLs on chromosomes 3(3H), 4(4H) and 7(5H) of the barley. The most significant QTLs were located on the longer arm of chromosome 4(4H); on a portion where several authors have located reaction genes of barley to E. graminis. Overall, our results showed that the detection of QTL responsible of the expression of the resistance to E. graminis seemed to be intimately linked to the initial cropping conditions (e.g. temperature and optimum humidity). Indeed, no primary QTL were observed for dry conditions treatment (no irrigation). Moreover, the available literature reports did not allow us to confirm the relative situations of the secondary QTLs found for these treatments. Thus, genes of resistance to E. graminis would express themselves only in conditions that are favorable for the development of the pathogen. Improving the resistance of barley to mildew infection requires therefore, by a good knowledge on the process that governs expression of these genes

Comportement de principaux bioagresseurs et maladies du cotonnier sur les variétés éprouvées de cotonnier (Gossypium hirsutum) sous différentes doses d’engrais à Angaradébou au Bénin

Au Bénin, la filière coton participe activement à l’économie    nationale.Quatre nouvelles variétés issues du Centre de Recherches  Agricoles Coton et Fibres ont été testées au Nord Bénin dans l'optique d'identifier la variété la mieux adaptée. Ces variétés ont été comparées à la variété H 279-1en vulgarisation. L’objectif est  d’évaluer les   comportements des variétés vis-à-vis des bioagresseurs et des maladies dans la zone. Le dispositif expérimental est un split plot à six répétitions, composé d’un facteur principal représenté par trois doses d’engrais  chimique à savoir D1 (témoin) = 150 kg de NPKSB + 50 kg d’Urée à  l’hectare, D2=200 kg de NPKSB + 50 kg d’Urée à l’hectare et D3= 250 kg de NPKSB + 50 kg d’Urée à l’hectare. Le facteur secondaire est composé de cinq variétés : H 279-1, I875-3, E956-2, H769-5 et H782-3. Il a été révélé que la pression parasitaire a été la même au niveau de toutes les variétés et ne dépend pas des doses d’engrais  appliquées. Les variétés E956-2 et H782-3 sont moins sensibles à la bactériose que les variétés H 279-1,  I875-3 et H 769-5 avec des valeurs respectivement de 0,37;0,29; 0,67; 0,68 et 0,59 plants attaqués sur 10 observés.Mots clés: Comportement, variétés, engrais chimique, pression parasitaire, ravageurs, bactériose

OCCURRENCE AND CHARACTERISATION OF Xanthomonas axonopodis pv. glycines, CAUSING BACTERIAL PUSTULES ON SOYBEAN IN GUINEA SAVANNA OF BENIN

To improve soybean ( Glycine max L.) production in Benin, knowledge of bacterial diseases is needed. The objective of this study was to establish the disease occurrence and to identify Xanthomonas axonopodis pv.glycines, the causal agent of soybean bacterial pustule. Soybean bacterial pustule disease was studied during the flowering and at pod maturation, in thirty four sites of the main soybean cultivation areas in eight districts of the Guinea Savanna in Benin. Twenty and 10 soybean plants were randomly inspected for incidence and severity, respectively, on two diagonals through the field. Seven isolates from 6 different locations with highest severity, were submitted for virulence tests. The most virulent was characterised by Polymerase Chain Reaction. Bacterial pustules were present in 33 of 34 sites. Incidence and severity per district ranged from 15.8 to 70%, and 6.0 to 26.14%, respectively. Severity was highest at Binassi (34.33%) in Perere and Baka (33.2%) in Parakou. Among the seven strains isolated, UP-PK-S3 from Baka (Parakou) was the most virulent, and was characterised as Xanthomonas axonopodis pv. glycines.Une prospection a \ue9t\ue9 conduite sur la pustule bact\ue9rienne du soja durant la phase de floraison et de formation des gousses sur trente-quatre sites de production du soja localis\ue9s dans 8 Communes de la savane guin\ue9enne du B\ue9nin en 2011. L\u2019objectif \ue9tait d\u2019\ue9tablir la pr\ue9sence de la maladie et d\u2019identifier Xanthomonas axonopodis pv. glycines, l\u2019agent responsable de la pustule bact\ue9rienne du soja. Trois \ue0 six sites ont \ue9t\ue9 prospect\ue9s par commune et sur chaque site 20 et 10 plants sont respectivement inspect\ue9s au hasard sur deux diagonales du champ pour \ue9valuer l\u2019incidence et la s\ue9v\ue9rit\ue9. Sept isolats provenant de 6 diff\ue9rentes localit\ue9s \ue0 fortes valeurs de s\ue9v\ue9rit\ue9s ont \ue9t\ue9 soumis \ue0 un test de virulence et l\u2019isolat le plus virulent a \ue9t\ue9 caract\ue9ris\ue9 par PCR et s\ue9quenc\ue9. Les r\ue9sultats ont montr\ue9 que la pustule bact\ue9rienne \ue9tait pr\ue9sente sur 33 des 34 champs prospect\ue9s. L\u2019analyse statistique de la moyenne d\u2019incidence et de s\ue9v\ue9rit\ue9 par commune a r\ue9v\ue9l\ue9 une variabilit\ue9 de 15,8 \ue0 70% pour l\u2019incidence et de 6,0 \ue0 26,14% pour la s\ue9v\ue9rit\ue9. Parmi les sept souches isol\ue9es, la souche UP-PK-S3 provenant de Baka (Parakou) \ue9tait la plus virulente et a \ue9t\ue9 caract\ue9ris\ue9e comme Xanthomonas axonopodis pv. glycines et pourrait \ueatre utilis\ue9e pour le criblage pour la r\ue9sistance en milieu contr\uf4l\ue9

Typologie Et Structure Des Parcs Agroforestiers Dans La Zone Soudanienne Du Nord Bénin

La typologie et la structure des parcs agroforestiers des communes Gogounou et de Ouaké dans la région soudanienne du Nord Bénin ont été investiguées. A partir de 180 relevés, divers paramètres floristiques et dendrométriques des ligneux ont été calculés. La typologie des parcs a été réalisée à travers l’analyse hiérarchique en considérant les paramètres tels que la richesse spécifique, la surface terrière et la densité des arbres. La structure en diamètre des ligneux a été ajustée à la distribution de Weibull à trois paramètres. Bien que les deux espèces caractéristiques (néré et karité) représentent 71 à 76 % de l’effectif total des ligneux épargnés dans les champs et jachères, les parcs agroforestiers du milieu d’étude ne sont pas uniformes. Quatre types de parcs agroforestiers, qui s’ordonnent suivant la maturité et les modes de gestion, ont été discriminés : à Gogounou, le parc à Vitellaria paradoxa, Parkia biglobosa et des ligneux fourragers dans les arrondissements de Gounarou et de Zougou ; le parc à Vitellaria paradoxa, Parkia biglobosa et Adansonia digitata dans l’arrondissement de Bagou ; à Ouaké, le parc à Parkia biglobosa et des essences exotiques dans les arrondissements de Badjoudè et Sèmèrè ; le parc constitué presque exclusivement de Parkia biglobosa dans l’arrondissement de Tchalinga. On note une différence hautement significative pour la plupart des variables floristiques et dendrométriques (richesse spécifique, diversité spécifique, Equitabilité de Pielou et surface terrière). La structure en diamètre des parcs agroforestiers est normale dans les deux parcs à karité et néré de Gogounou et dissymétrique gauche pour les deux parcs à dominance néré de Ouaké. Il est préconisé la promotion de la régénération naturelle assistée pour améliorer les taux de survie des jeunes plants des ligneux protégés ; et une meilleure gestion des parcs agroforestiers qui garantirait la multifonctionnalité des ligneux épargnés.Mots clés : Parc agroforestier, savanes, Nord Bénin.The typology and structural characteristics of agroforestry parklands from Gogounou and Ouaké districts in the soudanian zone of north Benin were studied through linear transects and dendrometric relevés. The typology was derived from hierarchical classification, basedon species richness, basal area and stem density. The diameter structure was adjusted to Weibull distribution with 3 parameters. The two characteristics species (i.e. Parkia biglobosa and Vitellaria paradoxa) represented 71 to 76% of the abundance of protected stems in these parklands. Four parklands types were discriminated, according to maturity and managements methods : - in Gogounou district, they were Parkia biglobosa and Vitellaria paradoxa parkland with fodder tree species at Gounarou and Zougou; Parkia biglobosa, Vitellaria paradoxa and Adansonia digitata parkland at Bagou ; - in Ouaké district, they were Parkia biglobosa parkland with exotic trees at Badjoudè and Sèmèrè; Parkia biglobosa dominated parkland at Tchalinga. Values of the floristic, dendrometric and structural parameters varied from one park to another; and the four parks were statistically different regarding species richness, Shannon diversity index, Pielou evenness index and basal area. The stem diameter structure showed a bell shape type for the two parks from Gogounou; and a left-dissymmetry type for those from Ouaké. To improve these parklands, we suggested assisted regeneration and a better management of Parkia biglobosa and Vitellaria paradoxa trees.Keywords : Agroforestry parkland, savannah, North Benin

Typologie Et Structure Des Populations Naturelles De Pentadesma Butyracea Dans La Zone Soudano-Guineenne Du Benin

La présente étude, conduite dans la région soudano-guinéenne du centre Bénin, a pour objectif la caractérisation écologique de Pentadesma butyracea, une espèce vulnérable au Bénin, à travers l’inventaire, la typologie et la caractérisation structurale de ses populations naturelles. Les inventaires floristiques et dendrométriques ont été faits dans cent placeaux de 500 m2, de longueur et largueur variables, dans tous les sites de forêts galeries à dominance P. butyracea. Les données collectées sont l’abondance, la richesse spécifique, la densité, la surface terrière, l’Indice Shannon et l’équitabilité de Pielou. Dans la région soudano-guinéenne du Centre Bénin, P. butyracea est présent dans 76 sites avec une abondance de 1.132 individus adultes (dbh ≥ 10 cm). Sur la base des caractéristiques écologiques des sites, cinq populations de P. butyracea ont été identifiées. Il s’agit des populations de Bassila, Koura, Manigri, Pénéssoulou et Agbassa, qui sont différentes sur le plan statistique pour chacun des paramètres écologiques à savoir la densité, la surface terrière, la richesse spécifique, l’Indice de Shannon et l’Equitabilité de Pielou (Prob. < 0,001). La structure en diamètre de l’espèce dans la plupart des sites est en cloche avec une dissymétrie droite caractéristique des peuplements monospécifiques jeunes. Trois facteurs/gradients (i.e. climat, formations végétales et pression anthropique) expliquent au mieux la typologie et la structure en diamètre des cinq populations discriminées. Il est préconisé comme stratégies de protection et exploitation durables de P. butyracea dans le milieu d’étude la conservation in situ et ex situ, le respect de la législation forestière en matière de protection des forêts galeries, les essais de domestication et la sensibilisation des populations à la limitation des pressions et préservation de cette espèce vulnérable auBénin.Mots clés : Ligneux, Usage Multiple, Pentadesma butyracea, répartition géographique, structure, Bénin.The present study, conducted in the Soudano-guinean region of centre Benin, aimed to characterize the ecology of Pentadesma butyracea, a vulnerable multipurpose species in Benin Republic. All the riparian forest sites where the species was present have been inventoried to map its spatial distribution and quantify its abundance. Floristic and dendrometric relevés were done in 100 plots, each 500 m² in size, in the P. butyracea dominated riparian forest sites to assessed the flora diversity and the structure of the targeted species. In the soudano-guinean region of centre Benin, P. butyracea was present in 76 riparian forest sites with an overall abundance of 1.132 stems (dbh ≥ 10 cm). The values of trees density, basal area, species richness, Shannon diversity index and Pielou equitability index permitted to discriminated five P. butyracea populations (i.e. Bassila, Koura, Manigri, Pénéssoulou and Agbassa) that were significantly different for all the parameters used for the typology (Prob. < 0,001). Three factors/gradients (i.e. climate, vegetation, anthropogenic disturbance) were the underlying factors of the typology and structure of the discriminated populations. The stem diameter structure of P. butyracea in most of the stands had a Gaussian shape with however a right-dissymmetry, characteristic of young monospecific populations. Among the strategies for sustainable protection and uses of P. butyracea in the study area we suggest to promote in situ and ex situ conservation, to enforce of the forest law regarding the protection of riparian forests, to undertake domestication trials and to raise awareness among local people as a means to reduce anthropogenic disturbance and preserve remnants populations of this vulnerable species in Benin.Keywords : Tree Species, Pentadesma butyracea, spatial distribution, structure, Benin.Article in Frenc

Sélection des variétés de soja pour la résistance à la pustule bactérienne au Bénin

Selection of Soybean Varieties for Resistance to Bacterial Pustule in Benin. Bacterial pustule caused by Xanthomonas axonopodis pv. glycines is a dreaded disease on soybeans inducing considerable yield losses worldwide. The aim of this study is to test 16 soybean varieties for resistance to bacterial pustule under natural infection and artificial inoculation. The study was conducted under greenhouse and field conditions at the experimental farm of the University of Parakou from July to October in 2013 and in 2014. The results show that the varieties JUPITER, ISRA25/72, TGX1985-77F, TGX1910-2F and TGX1985-11F are sensitive to moderately sensitive. The varieties TGX1448-2E, TGX1987-62F, TGX1990-15F, TGX1987-10F, TGX1835-10F, TGX1740-2F and TGX1440-1E are moderately resistant to resistant. The varieties TGX1988-5F, TGX1910-14F, TGX1989-21F and TGX1989-19F revealed moderately resistant in the greenhouse, but sensitive to moderately sensitive in the field. In 2013, yield losses from 2.7 to 28.1% were recorded with the varieties TGX1910-2F, ISRA25/72, JUPITER, TGX1910-2F, TGX1987-10F, TGX1835-10F and TGX1740-2F. Yield losses were calculated for each variety considering the yield difference between the natural infection and the artificial inoculation. The difference was than divided by the yield obtained in the natural infection. In 2014, varieties TGX1985-77F, TGX1740-2F, ISRA25/72, TGX1987-62F and TGX1910-14F showed losses ranging from 4.7 to 21.4%. The other varieties showed yield increases from 2.7 to 26% in 2013 and from 2.2 to 36.6% in 2014. With variety TGX1985-11F neither yield loss nor gain were observed over the two years. T For the 16 tested varieties, TGX1987-62F and TGX1990-15F are the most resistant; while TGX1989-19F, TGX1985-11F, TGX1440-1E, TGX1985-77F and TGX1910-14F are partial resistant. Those varieties have a high yield and could be recommended to the farmers. The two most resistant varieties could be integrated in a plant breeding program