Diagnostic Performance Assessment of Saliva RT-PCR and Nasopharyngeal Antigen for the Detection of SARS-CoV-2 in Peru

Widely available and reliable testing for SARS-CoV-2 is essential for the public health response to the COVID-19 pandemic. We estimated the diagnostic performance of reverse transcription PCR (RT-PCR) performed on saliva and the SD Biosensor STANDARD Q antigen test performed on nasopharyngeal swab compared to the reference standard, nasopharyngeal swab (NP) RT-PCR. We enrolled participants living and/or seeking care in health facilities in North Lima, Peru from November 2020 to January 2021. Consenting participants underwent same-day RT-PCR on both saliva and nasopharyngeal swab specimens, antigen testing on a nasopharyngeal swab specimen, pulse oximetry, and standardized symptom assessment. We calculated sensitivity, specificity, and predictive values for the nasopharyngeal antigen and saliva RT-PCR compared to nasopharyngeal RT-PCR. Of 896 participants analyzed, 567 (63.3%) had acute signs/symptoms of COVID-19. The overall sensitivity and specificity of saliva RT-PCR were 85.8% and 98.1%, respectively. Among participants with and without acute signs/symptoms of COVID-19, saliva sensitivity was 87.3% and 37.5%, respectively. Saliva sensitivity was 97.4% and 56.0% among participants with cycle threshold (CT) values of #30 and .30 on nasopharyngeal RT-PCR, respectively. The overall sensitivity and specificity of nasopharyngeal antigen were 73.2% and 99.4%, respectively. The sensitivity of the nasopharyngeal antigen test was 75.1% and 12.5% among participants with and without acute signs/symptoms of COVID-19, and 91.2% and 26.7% among participants with CT values of #30 and .30 on nasopharyngeal RT-PCR, respectively. Saliva RT-PCR achieved the WHO-recommended threshold of .80% for sensitivity for the detection of SARS-CoV-2, while the SD Biosensor nasopharyngeal antigen test did not. IMPORTANCE In this diagnostic validation study of 896 participants in Peru, saliva reverse transcription PCR (RT-PCR) had .80% sensitivity for the detection of SARS-CoV-2 among all-comers and symptomatic individuals, while the SD Biosensor STANDARD Q antigen test performed on nasopharyngeal swab had,80% sensitivity, except for participants whose same-day nasopharyngeal RT-PCR results showed cycle threshold values of,30, consistent with a high viral load in the nasopharynx. The specificity was high for both tests. Our results demonstrate that saliva sampling could serve as an alternative noninvasive technique for RT-PCR diagnosis of SARS-CoV-2. The role of nasopharyngeal antigen testing is more limited; when community transmission is low, it may be used for mass screenings among asymptomatic individuals with high testing frequency. Among symptomatic individuals, the nasopharyngeal antigen test may be relied upon for 4 to 8 days after symptom onset, or in those likely to have high viral load, whereupon it showed .80% sensitivity.Revisión por pare

Prescripción de antibióticos en consulta externa pediátrica de un hospital de Lima, Perú

Objetivo: Evaluar la proporción y calidad de la prescripción antibiótica en consulta externa del Departamento de Pediatría del Hospital Nacional Cayetano Heredia de Lima, Perú. Métodos: Se realizó un estudio transversal descriptivo entre agosto y setiembre del año 2002. La población estuvo formada por la totalidad de personas que acudieron a consulta externa. Para determinar la calidad de la prescripción se obtuvo una muestra por saturación de 164 personas. La información fue revisada y calificada por tres pediatras, teniendo como patrón referencial la United States Pharmacopeial Drug Information. Resultados: La proporción de prescripción fue 8,9% (IC 95%: 8,3%- 9,6%). Los diagnósticos más frecuentes fueron: sinusitis, oxiuriasis e infecciones de piel. Los antibióticos más prescritos fueron: amoxicilina, albendazol y eritromicina. 82,8% de antibióticos fueron prescritos con nombre genérico y 80,8% se encontraron en el Petitorio Nacional de Medicamentos Esenciales. 42,8% (IC 95%: 35,3%-50,3%) de las prescripciones fueron consideradas inadecuadas: 25,1% por errores en la dosificación, 16,7% por error en la duración del antibiótico y 15,5% por error en el intervalo del uso de los antibióticos. Conclusiones: La proporción de prescripción de antibióticos fue baja e inferior a la reportada en la literatura nacional y extranjera, mientras que la calidad de prescripción fue similar a los estudios reportados. Las investigaciones en este campo son todavía escasas y aisladas a nivel nacional, por ello resulta imperativo llevar a cabo estudios que permitan documentar y analizar la prescripción y el uso inadecuado de los antibióticos

Evaluación de la prueba ICT malaria P.f./P.v. (AMRAD®) para la detección de P. falciparum y P. vivax en una zona endémica de la amazonía peruana

Objetivo: Evaluar el rendimiento del ICT MALARIA P.f/P.v (AMRAD®) en pacientes febriles del departamento de Loreto, Perú. Materiales y métodos: Estudio transversal realizado de agosto a setiembre del 2000, en pacientes con historia de fiebre (temperatura axilar 37,5°C) en los últimos 3 días, sin un foco aparente. Se obtuvo una muestra de sangre para gota gruesa cuya lectura se realizó por un microscopista experto. Simultáneamente, se realizó la prueba rápida por un asistente de campo. Se calculó la sensibilidad, especificidad, valores predictivos, exactitud e índice de concordancia utilizando la gota gruesa como prueba de oro. Resultados: Se incluyeron 79 pacientes de 5 meses - 70 años de edad. La sensibilidad y especificidad del AMRAD® fueron 60,0% y 70,0%, respectivamente. El valor predictivo positivo (VPP), valor predictivo negativo (VPN) y exactitud de la prueba fueron 36,0%, 88,8% y 70,9%, respectivamente. Se encontró pobre concordancia de la prueba con la gota gruesa (kappa=0,279). Conclusión: Es necesario continuar con la evaluación de las pruebas rápidas para un diagnóstico oportuno y un tratamiento efectivo de la malaria

Aproximación al efecto del programa de desayunos escolares sobre el rendimiento intelectual en alumnos de educación inicial y primaria del Perú

Objetivos: Evaluar el efecto del Programa de Desayunos Escolares (PDE) sobre el rendimiento intelectual en alumnos pertenecientes al nivel inicial y primario, atendidos por el PDE en el año 2001. Materiales y métodos: En este estudio transversal descriptivo se evaluaron mediante las pruebas cognitivas Catell 1 (4-8 años) y Catell 2 (9-13 años) escolares de 4 a 13 años (seleccionados por muestreo probabilístico multietápico) de los distritos atendidos por el PDE, calculándose los promedios del puntaje total y puntajes de cada uno de los subtests incluidos en estas pruebas. Para identificar a los niños que recibieron la intervención, se usó dos modalidades: el testimonio del profesor de "consumo usual" del desayuno escolar y la observación del consumo el día de la evaluación. Resultados: Fueron evaluados 1787 escolares: 922 de inicial y 865 de primaria. La proporción de niñas y niños fue similar. El consumo reciente del desayuno mostró efectos positivos en el puntaje total y subtests específicos en escolares de inicial de Lima, la costa y la selva con el Catell 1 y en escolares de primaria de la costa con el Catell 2. El consumo usual mostró efectos positivos en el puntaje total y subtests específicos en escolares de inicial de la costa y la selva con el Catell 1. Conclusiones: Existen efectos positivos del consumo reciente y consumo regular de la ración del PDE sobre el rendimiento intelectual, siendo este efecto mayor en escolares del nivel inicial y en lugares de la costa y la selva