Hiv-1 regulatory gene dependent expression of a toxic gene

Thesis(Master)--İzmir Institute of Technology, Biology, İzmir, 2006Includes bibliographical references (p.103-110)Text in English; Abstract: Turkish and Englishxvii, 116 leavesFrom the first day it was discovered, HIV remains as one the major health threats of 21st century and the methods tried up to now focused on the short-term solutions which were efficient at blocking HIV replication, but also resulted with drugresistant strains, instead of methods which would completely eliminate HIV-infected cells from potential reservoirs. In this study, the design of a special DNA vector encoding a toxic protein to be expressed only in cells infected with HIV, thereby not damaging to healthy cells and the test of the efficacy of this vector in the cell culture conditions without using HIV infection was aimed. The toxic gene (suicide gene) presumed to create the desired effect was placed under the transcriptional control of HIV promoter LTR and so that the expression of the toxic gene was made dependent upon the tat regulator gene of HIV. In order to prevent leaky gene expression stemming from the basal gene expression from LTR even if it was not induced by Tat, and thereby having potential to damage healthy cells, the prerequisite cis-acting DNA sequences were cloned downstream of the toxic gene. So that, the transcripts produced could retain in the nucleus and would require the function of a second regulator protein 'Rev' which is a molecular chaperone for being transmitted into the cytoplasm. If the efficiency of this model prooved, a full-protective suicide vector will have been designed and this vector may be suggested to be tested in gene therapy trials of HIV infection in the future

On submanifolds of pseudo-hyperbolic space with 1-type pseudo-hyperbolic gauss map

In this paper, we examine pseudo-Riemannian submanifolds of a pseudo-hyperbolic space ℍm-1 s (-1) ⊂ Em s+1 with finite type pseudo-hyperbolic Gauss map. We begin by providing a characterization of pseudo-Riemannian sub- manifolds in ℍm-1 s (-1) with 1-type pseudo-hyperbolic Gauss map, and we obtain the classification of maximal surfaces in ℍm-1 2 (-1) ⊂ Em 3 with 1-type pseudo-hyperbolic Gauss map. Then we investigate the submanifolds of ℍm-1 s (-1) with 1-type pseudo-hyperbolic Gauss map containing nonzero constant component in its spectral decomposition.Publisher's Versio

Differential dose contributions on total dose distribution of 125I brachytherapy source

AbstractThis work provides an improvement of the approach using Monte Carlo simulation for the Amersham Model 6711 125I brachytherapy seed source, which is well known by many theoretical and experimental studies. The source which has simple geometry was researched with respect to criteria of AAPM Tg-43 Report. The approach offered by this study involves determination of differential dose contributions that come from virtual partitions of a massive radioactive element of the studied source to a total dose at analytical calculation point. Some brachytherapy seeds contain multi-radioactive elements so the dose at any point is a total of separate doses from each element. It is momentous to know well the angular and radial dose distributions around the source that is located in cancerous tissue for clinical treatments. Interior geometry of a source is effective on dose characteristics of a distribution. Dose information of inner geometrical structure of a brachytherapy source cannot be acquired by experimental methods because of limits of physical material and geometry in the healthy tissue, so Monte Carlo simulation is a required approach of the study. EGSnrc Monte Carlo simulation software was used. In the design of a simulation, the radioactive source was divided into 10 rings, partitioned but not separate from each other. All differential sources were simulated for dose calculation, and the shape of dose distribution was determined comparatively distribution of a single-complete source. In this work anisotropy function was examined also mathematically

Otomotiv sektörü için menteşe tork ölçümü ve kalite kontrol bankosu tasarımı ve prototip imalatı

06.03.2018 tarihli ve 30352 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan “Yükseköğretim Kanunu İle Bazı Kanun Ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılması Hakkında Kanun” ile 18.06.2018 tarihli “Lisansüstü Tezlerin Elektronik Ortamda Toplanması, Düzenlenmesi ve Erişime Açılmasına İlişkin Yönerge” gereğince tam metin erişime açılmıştır.Otomotiv sektöründe, kullanıcıların gittikçe artan yüksek performans ve konfor beklentileri, başta otomotiv üreticilerini, dolaylı olarak da yan sanayiyi yeni sistemler ve üretim teknikleri arayışına zorlamaktadır. Bu konfor beklentilerine paralel olarak, günümüzde taşıtlarda mevcut menteşeli hareketli kısımların açılıp kapanma tork değerlerinin de belirli bir aralıkta olması istenmektedir. Bunun doğal bir sonucu olarak, otomobil üreticileri yan sanayiden temin ettikleri menteşelerin öngörülen tork değerlerinde üretilmesini ve bu tür parçalar için öngörülen test ve ölçüm raporlarının tork ölçüm sonuçlarını da içermesini talep etmektedirler. Yapılan çalışmanın amacı araç ön kaput menteşesinin belirli tork aralıklarında (0,2 – 2,5 Nm) olup olmadığının ölçümü için kullanılan bir sistemin tasarlanması ve gerçekleştirilmesidir. Bu tez çalışması, otomasyona dayalı kapsamlı bir montaj projesinin parçası olduğundan, tork ölçüm sisteminin de bu ana sisteme uyumlu çalışması istenmektedir. Ayrıca, bu çalışmanın bir başka amacı da proje çıktısı menteşenin kritik kısımlarının boyut ve geometrik ölçülerinin kontrol edilmesidir. Geliştirilen bu sistem ile otomotiv firması tarafından menteşenin açılıp kapanması için gerekli olan tork değerleri belirlenecektir. Bu torkun mevcut sistemlerle geliştirilen montaj sistemine uyumlu olarak ölçülmesi çok zordur. Tasarlanan ve prototipi yapılan sistem ile söz konusu ölçüm kolaylıkla yapılabilecektir. Geliştirilen sistemde servo motor, tork sensörü, pnömatik piston, kaplin ve yataklar kullanılmıştır. Bu sistemdeki verilerin bilgisayara aktarılması ve sistemin bilgisayar kontrollü hale getirilmesi amacıyla DAQ (Data acquisition) kartından yararlanılmıştır. Bu işlemlerin gerçekleştirilmesi için LabVIEW programında bir arayüz tasarlanmıştır. Arayüz sayesinde servo motorun hassas bir şekilde kontrolü yapılmaktadır. DAQ kartı vasıtası ile sensörden alınan veriler arayüz‟e aktarılıp tork değerlerinin istenilen aralıkta olup olmadığı ölçülerek operatörün buna göre onay veya ret vermesi sağlanmaktadır. Tork ölçümü yapıldıktan sonra kalite kontrol işleminin de yapılması gerekmektedir. Kalite kontrol işlemi, tork ölçümü gibi parçanın geçer onayı alması için gerekli olan basamaklardan birisidir. Bu basamakta parçanın ana gövdesi ve döner kol üzerinde belirlenecek olan kritik noktaların kontrolü yapılarak parçanın istenen ölçülerde olup olmadığı algılanacak ve boyutsal ve geometrik toleransların dışına çıkılması halinde parçaya program tarafından ret verilecektir. Yapılan bu çalışmanın bir çıktısı olarak tasarlanan ve prototip imalatı gerçekleştirilen bu tork ölçüm sisteminin sektörde önemli bir boşluğu dolduracağı ve yaygın bir kullanım alanı bulacağı ümit edilmektedir. Anahtar Kelimeler: Sistem Tasarımı, Menteşe Tork Ölçümü, LabVIEW Programı, Tork Sensörü.In the automotive sector, users' increasing performance and comfort expectations forced the automotive manufacturers firstly and indirectly the supply industry to searching new systems and production techniques. Correspondingly to these comfort expectations, present hinged moving parts' opening and closing torque values of vehicles are demanded to be within a certain range. Corollary, car manufacturers request to be manufactured the hinges in the specified torque values from supply industry and also want torque measurement results in the parts' anticipated test report. The purpose of the study is to design of the system which used for measuring the the vehicle's front hood hinge's are in the specified torque limits (0,2 – 2,5 Nm) or not. Because of the this thesis is a part of comprehensive assembly project which based on automation, the torque measurement system must work compatible with main system. Also another purpose of this project is to control the critical parts' size and gemetrical dimensions of the hinge. Torque required for opening and closing the hinge will be determined with this system. Ġt is very diffucult to measure this torque compatible to assembly system with existing systems. The mentioned measurement can be done easily with designed prototype system. In the proposed system; servo motors, torque sensors, pneumatic pistons, couplings and bearings are used. To transferring data to the computer and to make the system computer-controlled DAQ card was used. An Interface is designed in LABVIEW program in order to carry out these actions. Servo motor control is carried out sensitively through the interface. The data coming from sensor transferred to interface with DAQ card and measured whether the torque values are in the desired ranges. The operator is provided accordingly give approval or rejection. After the torque measurement, quality control process must be performed. Quality control process is one of the steps required to get approval like torque measurement. In this step, the main body of the part and specified critical points on the rotary arm will be controlled and it will be determined that the part is in desired dimensions. If the program exceeded dimensional and geometric tolerances, the program will give a reject to the part. As an output of the designed and produced prototype model of the torque measurement system, It will fill an important vacancy and hoped to find a common use area. Keywords: Torque Measurement System, LabVIEW Program, Torque Measurement, Positioning Accuracy, Front Hood Hing

Kütahya'da Siyanür Barajı Çökmek Üzere

Bazı kelimeler dokunulmaz oluyorlar. Şehir meydanlarının ortasına dikilmiş koca lider heykelleri gibiler. Kimse onlara dokunmuyor, seyrederek önünden geçip gidiyorsun ya da çoğu zaman orada olduğunu bile unutuyorsun. Ekoloji ve Demokrasi son yılların iki heykeli. Demokrasi zaten oradaydı aslında. Faşist generaller bile hep demokrasiyi kurtardılar, demokrasi inşa ettiler ve demokrasi korudular. Demokrasi adına ülkeler bombalandı. -Gözümün önünden hiçbir zaman gitmiyor, Hiroşima ve Nagazaki’ye atılacak bombalarıyla havalanacak uçakların görüntüsü. Üstüne isim yazmışlardı sempatik görünüşlü pilotları. Dünya demokrasisini kurtarmak için görkemle süzülen uçakların altında atıldılar evlerin, sokakların ve tabiî ki insanların üstüne ve eminim ki hepiniz biliyorsunuz ve hatırlıyorsunuzdur; o atom bombasının patladıktan sonra gökyüzüne yükselme görüntüsünü. İşte o demokrasiydi ve küçük kızlar ve yanan saçları

Effects of Various Chairside Surface Treatments on Zirconia-Resin Cement Bond Strength

Introduction: Various surface treatments have been used to improve the adhesion of resin cement to zirconia restorations. The present study aimed to investigate the effects of different surface treatments on the bond strength of resin cement to zirconia (Y-TZP) in clinical practice. Methods: thirty square Y-TZP samples were classified into three groups of 10, including group SB (50 µm sandblasted Al2O3 particles), group B (diamond burs), and group C (control). One sample from each group was subjected to X-ray powder diffraction, scanning electron microscopy (SEM), and profilometer analysis. The shear bond strength (SBS) of zirconia-resin cement was measured using a universal testing machine at the crosshead speed of 1 mm/min until bonding failure. SBS values were analyzed using analysis of variance (ANOVA) and Tukey’s HSD test (α=0.05). Results: According to the results of ANOVA, SBS was significantly affected by the treatment method. Tukey’s HSD test showed significant differences between the groups (

Numerical Computation of H∞ Optimal Controllers for Time Delay Systems Using YALTA

Numerical computation of H∞ controllers for time delay systems has been a challenge since 1980s. Even though significant techniques are developed to obtain direct optimal controllers, application of these methods may require manual computation depending on the plant. In this paper, an alternative computational technique is proposed for direct optimal controllers originally obtained by Toker and Özbay (1995). The new controller expression contains finite dimensional transfer functions and an infinite dimensional term, which is stable. Thus it is suitable for finite dimensional approximations and practical non-fragile implementations. In this method, in order to eliminate manual computation of the plant factorization for neutral and retarded delay systems YALTA (a tool developed at INRIA) is used. The new controller computation is implemented in Matlab, and it is illustrated on an example. © 201