Structured probabilistic inference

AbstractProbabilistic inference is among the main topics with reasoning in uncertainty in AI. For this purpose, Bayesian Networks (BNs) is one of the most successful and efficient Probabilistic Graphical Model (PGM) so far. Since the mid-90s, a growing number of BNs extensions have been proposed. Object-oriented, entity-relationship and first-order logic are the main representation paradigms used to extend BNs. While entity-relationship and first-order models have been successfully used for machine learning in defining lifted probabilistic inference, object-oriented models have been mostly underused. Structured inference, which exploits the structural knowledge encoded in an object-oriented PGM, is a surprisingly unstudied technique. In this paper we propose a full object-oriented framework for PRM and propose two extensions of the state-of-the-art structured inference algorithm: SPI which removes the major flaws of existing algorithms and SPISBB which largely enhances SPI by using d-separation

An early guidance system for a general knowledge-based aiding framework using probabilistic interventions

International audienceA common decision problem repeats a lot of time with the same kind of alternatives and the same set of criteria, but with a different decision case in each occurrence. The objective of early guidance in this kind of problem is to facilitate the selection of a subset of satisfactory alternatives for each new decision case, without asking the user any knowledge of the problem. This article proposes an early guidance system based on a model of knowledge of the common decision problem. It first presents the construction of a Bayesian network for a common decision problem to embed the knowledge in the aiding framework. Second, the concept of intervention proposed by Pearl is extended to prob-abilistic interventions for a single variable and for a set of variables. Finally the early guidance procedure is presented on the basis of the Bayesian network and using a proba-bilistic intervention to set a decision case even though it is partially observed.Un problème de décision courant se répète de nom-breuses fois, avec le même type d'alternatives et le même ensemble de critères, mais avec une situation de décision différente à chaque occurence du problème. Dans ce type de problème, le conseil en amont vise à faciliter la sélec-tion d'un sous ensemble d'alternatives satisfaisantes pour le cas de décision considéré, sans demander à l'utilisateur d'avoir des connaissances sur le problème. Cet article propose un système de conseil en amont basé sur un modèle de connaissances du problème de décision courant. Pour commencer, l'article présente la construction d'un réseau bayésien pour embarquer la connaissance dans le système. Ensuite, le concept d'intervention dans un réseau bayésien proposé par Pearl est étendu aux interventions probabilistes pour des variables simples et des ensembles de variables. Enfin, la procédure de conseil en amont pour un problème de décision courant est présentée, sur la base du modèle de connaissance et en utilisant les interventions probabilistes pour fixer l'écosystème de la personne, même lorsque le cas de décision n'est que partiellement observé

Regulation of MMP-9 by p53 in first trimester cytotrophoblastic cells

BACKGROUND The matrix metalloproteinase (MMP) family is known to play a key role in tissue remodelling during embryonic development and in pathological conditions, such as cardiovascular disease, arthritis and cancer metastasis. It has been shown previously that p53 regulates positively or negatively the expression of different MMPs. Because of p53 overexpression in trophoblastic cells, and its potential role in regulating MMP-2 and MMP-9 expression in different cell lines, we hypothesized that the expression of MMP-9 could also be regulated by p53 in first trimester cytotrophoblasts (CTB). METHODS and RESULTS Transfection experiments in CTB demonstrated that wild-type p53 down-regulates the −670 (P < 0.001) but not the −531 and −90 human MMP-9 promoter/CAT reporter plasmid activity, whereas p53 mutants partially lost this repressive activity. However, endogenous p53 is not able to regulate MMP-9 expression in CTB. The presence of high molecular weight complexes of p53 in CTB suggests a potential mechanism of inactivation of p53 transcriptional activity towards MMPs in these cells. CONCLUSIONS Although p53 is mutated in trophoblast, it is functionally incompetent towards MMPs in these cell

Faciliter et soutenir le travail des chercheurs ::état des lieux, perspectives et réflexions sur l’exemple de la Haute école de travail social de Genève

Open science, diffusion et archivage en open access, gestion des données de recherche ; c’est cet immense mur de thématiques qui se dresse devant les chercheurs. Pour la plupart, ces enjeux sont les fruits de lentes, mais sûres transformations de la recherche vers une forme toujours plus collaborative et axée sur les données. De plus, les chercheurs doivent faire face à une compétitivité toujours plus féroce où le nerf de la guerre réside dans la capacité à sécuriser des financements. Or, dans la continuité du foisonnement des nouveaux enjeux, les bailleurs de fonds durcissent leurs exigences d’année en année. Pris en tenaille entre leurs responsabilités et un temps limité, les chercheurs sont souvent débordés et désarmés pour faire face à tous ces aspects. Pourtant, les chercheurs possèdent des alliés de taille autour d’eux qui peuvent les épauler sur ces divers sujets : les services institutionnels.Open Science, Open Access Verbreitung und Archivierung, Forschungsdatenmanagement; es ist diese riesige Themenwand, die vor den Forschern steht. Diese Herausforderungen sind zum größten Teil das Ergebnis langsamer, aber sicherer Transformationen der Forschung in Richtung einer zunehmend kollaborativen und datengesteuerten Form. Zusätzlich stehen die Forscher in einem immer härteren Konkurrenzumfeld, in dem der Schlüssel zum Erfolg in der Fähigkeit zur Finanzierung liegt. Allerdings verschärfen die Geldgeber im Zuge der zunehmenden neuen Herausforderungen ihre Anforderungen von Jahr zu Jahr. Die Forscher, die zwischen ihrer Verantwortung und der begrenzten Zeit gefangen sind, sind oft überfordert und enttäuscht, um sich mit all diesen Fragen zu befassen. Dennoch haben Forscher starke Verbündete um sich herum, die sie bei diesen verschiedenen Themen unterstützen können: institutionelle Dienstleistungen.Open science, open access dissemination and archiving, research data management; it is that wide range of topics that researchers must currently address. These challenges are largely the result of slow but sure transformations of the research process into an increasingly collaborative and data-driven form. In addition, researchers face an increasingly competitive environment where the key to success lies in the ability to secure funding. However, as new challenges grow, research funders are tightening their requirements. Researchers caught between their responsibilities and their limited time are often overwhelmed and unprepared for dealing with these issues. Nevertheless, researchers can count on institutional services to help and support them through these issues

A kd-tree algorithm to discover the boundary of a black box hypervolume or how to peel potatoes by recursively cutting them in halves

11 pagesInternational audienceGiven a subset of \R^\ndim of non-zero measure, defined through a blackbox function (an oracle), and assuming some regularity properties on this set, we build an efficient data structure representing this set. The naive approach would consists in sampling every point on a regular grid. As compared to it, our data structure has a complexity close to gaining one dimension both in terms of space and in number of calls to the oracle. This data structure produces a characteristic function (i.e. a function that can be used in lieu of the oracle), allows to measure the volume of the set, and allows to compute the distance to the boundary of the set for any point

Spotting Solid Oxide Fuel Cell Degradation Effects by Electron Microscopy

Extended abstract of a paper presented at Microscopy and Microanalysis 2012 in Phoenix, Arizona, USA, July 29 - August 2, 201

État des lieux des services de soutien à la gestion des données de recherche à l\u27Université de Genève

Le présent document a été rédigé à la demande du Service de Coordination de la Division de l’Information Scientifique (CODIS) de l\u27Université de Genève. Son but est de proposer un premier état des lieux du soutien à la gestion des données de recherche (GDR) au sein de l’Université de Genève, avec une attention particulière sur l’apport de la Division de l’information scientifique (DIS), et de le comparer à l’état de l’art en Suisse et à l’international. La finalité de ce travail est de permettre à la DIS de fixer les axes de développement de ses services en la matière dans le moyen/long terme. C’est également l’occasion de réfléchir à l’avenir du métier de bibliothécaire en rapport avec l’émergence de l’Open Science et en particulier de l’Open Data