Caractérisation de l’importance clinique des rotavirus A et C dans la diarrhée des porcelets et leur excrétion jusqu’à l’âge adulte

Les rotavirus (RVs) sont une cause mondiale majeure de diarrhée néonatale chez une variété d’espèces animales, incluant le porc, ainsi que chez l’humain. Parmi les neuf sérogroupes de RVs (RVA à RVI) officiellement reconnus, les RVA sont considérés comme le groupe de RVs le plus important en raison de leur prévalence élevée et leur pathogénicité chez les humains ainsi que leur potentiel zoonotique fortement suspecté en lien avec le phénomène de réassortiment. Au Québec, aucune information récente n’est disponible concernant les souches de RVA en circulation chez l’espèce porcine. Par ailleurs, les RVC porcins ont été récemment étudiés dans plusieurs pays à travers le monde, révélant une implication potentielle de ces virus entériques dans les cas de diarrhées. Présentement, au Québec, les données de prévalence concernant les RVC chez le porc sont manquantes et leur caractérisation n’a pas été investiguée. La présente étude a donc évalué, sur une période de 29 mois, la prévalence et l’épidémiologie des RVA et RVC chez des porcs provenant de deux systèmes de production intégrée au Québec. Dans un premier système, l’importance clinique des RVs dans les élevages de maternité porcine a été évaluée et leur excrétion fécale jusqu’à l’âge de pré-abattage des porcs a été décrite. Pour le second système de production, la présence et la caractérisation des RVs en ferme d’engraissement porcin ont d’abord été étudiées. Par la suite, ces virus ont servi d’indicateurs de contamination virale entérique au sein de ce même système de production pré-abattage afin d’identifier des vecteurs et des réservoirs potentiels de transmission virale. Des analyses moléculaires basées sur la RT-PCR et le séquençage (Sanger et l’approche à haut débit) ont été utilisées pour détecter la présence des RVs et caractériser les génomes partiels et/ou complets afin de classifier les souches virales. Les résultats obtenus ont révélé la présence des RVA et RVC à tous les stades de production en ferme, avec une prédominance en période péri-sevrage. En maternité porcine, les RVC se sont révélés significativement associés au portrait clinique de diarrhée au niveau de la chambre (p=0.02), ce qui n’a pas été le cas pour les RVA. Les évaluations statistiques ont révélé une prévalence globale de 45.4% et 27.4% pour RVA et RVC chez le porcelet respectivement. Les analyses phylogénétiques ont démontré un changement fréquent des souches prédominantes de RVs d’un stade de production à l’autre. Dans le système de production pré-abattage, les résultats ont montré la contamination fréquente des fermes d’engraissement, des véhicules de transport animal et de la cour d’abattoir par les RVA. Une grande diversité génétique des souches de RVA a été décrite à travers les différents types d’environnements récoltés. Toutefois, des souches identiques de RVA ont pu être identifiées à partir d’échantillons de fermes, de la cour d’abattoir et des véhicules de transport d’animaux. Globalement, cette étude a permis de décrire la prévalence des RVA et RVC chez le porcelet au Québec et de caractériser les souches circulantes. Les résultats confirment l’importance des RVC comme agent causal de diarrhée chez les porcelets et décrivent, pour la première fois, des génomes complets de RVC porcins au Canada. Les résultats au niveau du système de pré-abattage suggèrent un rôle potentiel des abattoirs et des transporteurs d’animaux comme réservoirs et vecteurs de transmission pour les virus entériques. Ceux-ci pourraient contribuer à la propagation d’une contamination virale au sein d’un même système de production animale ou même entre différents systèmes.Rotaviruses (RVs) are a major global cause of neonatal diarrhea in a variety of animal species as well as humans. Among the nine officially recognized RV serogroups (RVA to RVI), RVA is considered to be the most important group due to their high prevalence and pathogenicity in humans and their zoonotic potential due to numerous evidence of reassortment events between human and animal strains, including swine. However, in Quebec, no recent information is available concerning the circulating strains of porcine RVA. Furthermore, RVC have been recently investigated in several countries across the world, revealing a potential involvement of these enteric viruses in swine diarrhea. Currently, in Quebec, data on prevalence of RVC in swine are lacking and characterisation of their strains has not been conducted. The present study evaluated the prevalence and epidemiology of RVA and RVC in swine from two integrated production systems in Quebec over a 29 month period. In a first system, the clinical importance of RVs in farrowing farms was investigated and dynamics of fecal excretion up to pre-slaughter age was described. For the second production system, the presence and characterization of RVs in fattening sites was first evaluated. Then, the dynamics of enteric viral contamination from this pre-slaughter system was investigated to identify potential vectors and reservoirs of viral transmission using porcine RVA as markers. Molecular analysis based on RT-PCR as well as Sanger and high-throughput sequencing were conducted to detect the presence of RVs and to characterize partial and/or complete viral genomes enabling classification of strains. Results revealed the presence of RVs throughout all stages of production on farm, with a predominance of these viruses surrounding the weaning period. In farrowing farms, RVC was found to be significantly associated to the clinical portrait of diarrhea (p=0.02) at the batch level, which was not the case for RVA. Statistical evaluations revealed an overall prevalence of 45.4% and 27.4% for RVA and RVC in piglets, respectively. Phylogenetic analysis of strains showed a frequent shift of predominant RV strains between production stages. In the pre-slaughter production system, the results revealed frequent contamination of fattening farms, livestock transportation vehicles and the abattoir yard by RVA. Although a large genetic diversity has been described throughout the different environmental sites collected, identical strains of RVA were identified from farm samples, the slaughter yard and the livestock transport vehicle. Overall, this study enabled the assessment of the current prevalence of porcine RVA and RVC in Quebec as well as the characterization of circulating strains. The results confirm the importance of RVC as a causative agent of diarrhea in piglets and describe, for the first time, complete porcine RVC genomes in Canada. Analysis from the pre-slaughter production system suggest a potential role for slaughterhouses and livestock transporters as reservoirs and vectors for enteric viruses, which may lead to the spread of viral contamination within an animal production system or even between different production systems

Association supramoléculaire à l'état solide des fullerènes C60 et C70 avec le centrohexaindane

Le fullerène C60, une molécule sphérique, et le C70, un analogue ellisoïde, sont des composés aromatiques convexes constitués exclusivement d'atomes de carbone. La nature aromatique de la surface de ces cages de carbone rend possible leur association à l'état solide avec d'autres molécules aromatiques de topologie complémentaire. En particulier, l'association des fullerènes avec des composés présentant des motifs concaves aromatiques, via une association de type concave-convexe, est favorable. En effet, les interactions π•••π de type concave-convexe sont amplifiées grâce à la complémentarité topologique des partenaires impliqués. Le centrohexaindane est un hydrocarbure non planaire rigide qui a été synthétisé pour la première fois en 1988 par Kuck et collaborateurs. Cette molécule possède quatre surfaces aromatiques concaves orientées dans une géométrie tétraédrique qui sont susceptibles d'interagir favorablement avec les fullerènes. Nous avons ainsi avec succès cocristallisé le centrohexaindane avec les fullerènes C60 et C70. Puis, nous avons étudié les assemblages à l'état solide entre le centrohexaindane et les fullerènes par l'analyse des structures résolues via diffraction des rayons X. Les surfaces concaves aromatiques du centrohexaindane se sont révélées être propices à une association avec les fullerènes C60 et C70 via des interactions π•••π de type concave-convexe, tel que prévu. En outre, nous avons découvert que les liaisons C-H situées à la périphérie du centrohexaindane prennent part à une multitude de contacts C-H•••π avec les molécules de fullerène. Les échantillons de cocristaux composés de centrohexaindane et de fullerène ont aussi été caractérisés par diffraction de poudre des rayons X et par analyse thermogravimétrique dans le but d'en évaluer l'homogénéité.Spherical fullerene C60 and C70, its ellipsoidal analogue, are convex aromatic compounds consisting exclusively of carbon atoms. The aromatic nature of the surface of these carbon cages enables their solid-state association with aromatic molecules that have complementary shapes. In particular, the association of fullerenes with compounds that have concave aromatic units, by a concave-convex type of association, is favored. Indeed, concave-convex π•••π interactions are enhanced because of the topological complementarity of the partners. Centrohexaindane is a rigid nonplanar hydrocardon that was first synthesized in 1988 by Kuck and coworkers. It contains four concave aromatic surfaces, oriented in a tetrahedral geometry, that are likely to interact favorably with fullerenes. To study this phenomenon, we successfully cocrystallized centrohexaindane with fullerenes C60 and C70. We then resolved the structure of the resulting solid-state assemblies by X-ray diffraction. The concave aromatic surfaces of centrohexaindane proved to be conducive for an association with fullerenes involving concave-convex π•••π interactions, as expected. In addition, we found that C-H bonds located at the periphery of centrohexaindane participate in a variety of C-H•••π contacts with the fullerene partners. Samples of cocrystals containing centrohexaindane and fullerene were also characterized using powder X-ray diffraction and thermogravimetric analysis in order to assess their homogeneity

Physiothérapie et douleur lombo-pelvienne chez la femme enceinte : Un appel à l’action

Travail d'intégration présenté à Isabelle Gagnon dans le cadre du cours PHT-6113.Problématique : La douleur lombo-pelvienne est une plainte fréquemment rencontrée chez la femme enceinte. Selon les études, l’incidence varie de 24% à 90%. Le mythe que la douleur lombo-pelvienne fait partie du processus normal de la grossesse et la croyance répandue qu’il n’y a rien à faire pour limiter les symptômes font en sorte que cette clientèle est sous-traitée par les physiothérapeutes. Objectifs : Les objectifs du projet étaient 1) d’explorer la pratique clinique actuelle en physiothérapie ainsi que l’attitude des physiothérapeutes face à la prise en charge de femmes enceintes souffrant de douleurs lombo-pelviennes, 2) d’identifier la prise en charge optimale à préconiser et 3) d’élaborer des stratégies de transfert des connaissances acquises. Méthodes : Un sondage a été effectué auprès de physiothérapeutes afin de déterminer la pratique clinique actuelle et leur sentiment de compétence face à cette clientèle. De plus, une recension des écrits concernant l’épidémiologie, les changements physiologiques, l’évaluation et le traitement en physiothérapie a été réalisée. Finalement, un site web visant les professionnels de la physiothérapie fut préparé. Résultats : Des incertitudes quant aux précautions et contre-indications à prendre face à l’évaluation (19,7%), au traitement (40,3%) et à la prescription d’entrainement musculaire (25,2%) et cardio-vasculaire (35,1%) persistent chez un nombre important de physiothérapeutes. Lors de l’évaluation, il est particulièrement important de différencier les douleurs d’origine lombaire et pelvienne. Il semble y avoir des évidences sur l’efficacité des exercices en piscine ainsi que sur l’acuponcture pour traiter cette clientèle. Conclusion : L’insuffisance d’évidences scientifiques ainsi que le manque de confiance des physiothérapeutes en ce qui concerne la pratique limitent la prise en charge optimale de cette clientèle

Dynamics of viral distribution in a defined swine production network using enteric viruses as molecular markers

Modern swine production systems represent complex and dynamic networks involving numerous stakeholders. For instance, livestock transporters carry live animals between fattening sites, abattoirs, and other premises on a daily basis. This interconnected system may increase the risk of microbial spread within and between networks, although little information is available in that regard. In the present study, a swine network composed of 10 finishing farms, one abattoir, and three types of stakeholders (veterinarians, livestock transporters, and nutritional technicians) in Quebec, Canada, was selected to investigate specific vectors and reservoirs of enteric viruses. Environmental samples were collected from the premises over a 12- month period. Samples were screened using targeted reverse transcription-PCR and sequencing of two selected viral markers, group A rotaviruses (RVA) and porcine astroviruses (PoAstV), both prevalent and genetically heterogeneous swine enteric viruses. The results revealed frequent contamination of farm sites (21.4 to 100%), livestock transporter vehicles (30.6 to 68.8%) and, most importantly, the abattoir yard (46.7 to 94.1%), depending on the sample types. Although high levels of strain diversity for both viruses were found, identical PoAstV and RVA strains were detected in specific samples from farms, the abattoir yard, and the livestock transporter vehicle, suggesting interconnections between these premises and transporters. Overall, the results from this study underscore the potential role of abattoirs and livestock transport as a reservoir and transmission route for enteric viruses within and between animal production networks, respectively

Genetic diversity of group A rotavirus in swine in Canada

Group A rotaviruses (RVA) in pigs have been poorly investigated in Canada. In a continued effort to fill this gap, ten finisher swine farms in Quebec, Canada, were sampled over a nine-month period. The presence of RVA was detected in healthy pigs on all farms investigated during the entire sampling period. The genotypes detected included G2, G5, G9 and G11; P[6], P[7], P[13], P[27] and P[34]; and I5 and I14. The predominant types were G2, P[13] and I5, which is different from previous global reports. Various fomites were consistently contaminated by RVA, suggesting that a resident viral flora remains in the farm environment and may play a role in the infection of incoming pigs. The results also suggest temporal or geographical specificities regarding strain distribution on pig farms

The Development of a Risk Assessment Model for Inedible Rendering Plants in Canada: Identifying and Selecting Feed Safety-Related Factors

The Canadian Food Inspection Agency (CFIA) is developing an establishment-based risk assessment model to categorize rendering plants that produce livestock feed ingredients (ERA-Renderer model) according to animal and human health risks (i.e., feed safety risks) and help in determining the allocation of inspection resources based on risk. The aim of the present study was to identify and select feed-safety-related factors and assessment criteria for inclusion in the ERA-Renderer model. First, a literature review was performed to identify evidence-based factors that impact the feed safety risk of livestock feed during its rendering processes. Secondly, a refinement process was applied to retain only those that met the inclusion conditions, such as data availability, lack of ambiguity, and measurability. Finally, an expert panel helped in selecting factors and assessment criteria based on their knowledge and experience in the rendering industry. A final list of 32 factors was developed, of which 4 pertained to the inherent risk of a rendering plant, 8 were related to risk mitigation strategies, and 20 referred to the regulatory compliance of a rendering plant. A total of 179 criteria were defined to assess factors based on practices in the Canadian rendering industry. The results of this study will be used in the next step of the model development to estimate the relative risks of the assessment criteria considering their impact on feed safety. Once implemented, the CFIA’s ERA-Renderer model will provide an evidence-based, standardized, and transparent approach to help manage the feed safety risks in Canada’s rendering sector

Journée sans culture : Troubler la fête, rallumer notre joie = To Spoil the Party, To Set Our Joy Ablaze

"Composed as an extension of the conversations that took place during the 2015 Journée sans culture, To Spoil the Party, to Set Our Joy Ablaze gathers contributions from those who moderated the discussions of the day as well as those who set up its sites of rest, reflection, and play. These authors work to remain true to the spirit of what they lived, led by the desire to find a source of collective energy that exceeds the pervasive effects of tiredness and resignation. Their texts are joined by others, commissioned by the editorial team, which explore matters of concern not sufficiently addressed during the day." -- Publisher's website