linguistic and conceptual aspects

UIDB/03213/2020 UIDP/03213/2020This paper describes work carried out for the OntoAndalus project at NOVA CLUNL. This project aims at establishing the foundations for a terminological knowledge base (TKB) on Islamic archaeology. The main part of the work carried out so far is the development of an ontology of artefact types in al-Andalusian pottery studies, which was done by reusing the DOLCE+DnS Ultralite foundational ontology. Subsequently, Portuguese and Spanish terms for artefact types were extracted from a corpus of specialised texts and represented by means of lexical networks. The Lexicon Model for Ontologies (Lemon), recently developed by a W3C Community Group, was put forward as a promising framework for integrating language-specific and language-independent information in a future TKB on the domain. The possibility of aligning OntoAndalus with Lemon is also discussed in this paper.publishersversionpublishe

The eco-geography of the brown shrimp Crangon crangon in Europe

Kooijman, S.A.L.M. [Promotor]Veer, H. van der [Copromotor

an ontology of Islamic artefacts for terminological purposes

UID/LIN/03213/2019OntoAndalus aims at constituting a shared conceptualisation of the domain within a future multilingual terminological resource targeted at experts and students of Islamic archaeology. The present version of OntoAndalus is aligned with DOLCE+DnS Ultralite (DUL), an established top-level ontology for the Semantic Web. This article describes the modelling assumptions underlying OntoAndalus, as well as the more relevant design patterns (i.e. artefact types, events and individuals). The latter are exemplified through relevant case studies in the domain, namely those of lighting artefacts, the life cycle of pottery and the several descriptions of Vaso de Tavira.authorsversionpublishe

an ontology of Islamic artefacts for terminological purposes

UID/LIN/03213/2019OntoAndalus aims at constituting a shared conceptualisation of the domain within a future multilingual terminological resource targeted at experts and students of Islamic archaeology. The present version of OntoAndalus is aligned with DOLCE+DnS Ultralite (DUL), an established top-level ontology for the Semantic Web. This article describes the modelling assumptions underlying OntoAndalus, as well as the more relevant design patterns (i.e. artefact types, events and individuals). The latter are exemplified through relevant case studies in the domain, namely those of lighting artefacts, the life cycle of pottery and the several descriptions of Vaso de Tavira.authorsversionepub_ahead_of_prin

New cell lines for the manufacture of lentivirus

Background: Gene therapy consists on medical treatment that aims to modulate an individual’s gene expression. To this end, many different gene transfer vehicles called vectors have been developed, including virus derived vectors. Showing promising characteristics, lentiviral vectors still have problems associated to them, especially in their production process, limited by low titers. To increase viral vector titer and producer cell growth, oncogenes such as SV40 Large T (T-Ag) antigen are expressed in producer cell lines, which decrease the safety of the vector preparations. Objectives: With the objective to find alternative cell substrates to HEK293T suitable for high titer vector production, three non-human cell lines were transformed with T-Ag oncogene and transfected with a lentiviral construct. Their vector production and transfection efficiency was characterized. The strength of several promoters to drive the expression of viral components was also evaluated in these cell lines. Results and conclusions: CAG and CMV revealed to be the most promising, although CAG delivers lower titers. In this work, it was shown that Age1.CR and Vero cell lines have the potential to deliver enhanced lentivector titers when expressing T-Ag, which conferred higher transfection efficiencies. Also, HEK293 cells expressing T-Ag were compared to their parental cell line in terms of cell growth and glycolysis in an attempt to understand cellular alterations induced by the oncogene. The results herein obtained will contribute to the development of stable lentivector producer cell lines and for the further understanding of the T-Ag’s influence in virus production.Contexto: A terapia génica consiste num tratamento médico que visa a modulação da expressão génica de um individuo. Com este fim, foram desenvolvidos diversos veículos de transferência de genes, denominados vectores. Estes incluem os vectores derivados de vírus. Apresentando características promissoras, os vectores lentivirais ainda têm problemas a si associados, especialmente no processo de produção, que é limitado pelos baixos títulos obtidos. Para aumentar os títulos de vectores virais e o crescimento das células produtoras, estas expressam oncogenes, tais como o Large T antigen (T-Ag) do SV40, a custo de preparações do vector menos seguras. Objectivos: Com o objectivo de encontrar linhas celulares alternativas às HEK293T adequadas à produção de elevados títulos de vectores virais, três linhas celulares não humanas foram transformadas com o oncogene T-Ag e transfectadas com uma construção lentiviral. A produção do vector e eficiência de transfecção foram caracterizadas. Também foi avaliada a força de vários promotores para a expressão dos componentes virais nestas células. Resultados e conclusões: O CAG e o CMV foram os mais promissores, mas com o CAG obtiveram-se títulos mais baixos. Neste trabalho, foi observado que as linhas celulares Age1.CR e Vero têm potencial para produzir títulos de vectores superiores quando expressam o T-Ag, o que pode estar ligado a maiores eficiências de transfecção. Para além disso, células HEK293 que expressam o T-Ag foram comparadas à sua linha parental em termos de crescimento celular e glicólise, tentando compreender melhor as alterações induzidas pelo oncogene. Os resultados obtidos neste trabalho vão contribuir para o desenvolvimento de linhas celulares estáveis para produção de vectores lentivirais, e para o aumento da compreensão da influência do T-Ag na produção viral

Hierarchical Virtual Screening of Potential Insectides Inhibitors of Acetylcholinesterase and Juvenile Hormone from Temephos

Aedes aegypti (Linnaeus, 1762; Diptera: Culicidae) is the main vector transmitting viral diseases such as dengue fever, dengue haemorrhagic fever, urban yellow fever, zika and chikungunya. Worldwide, especially in the Americas and Brazil, many cases of dengue have been reported in recent years, which have shown significant growth. The main control strategy is the elimination of the vector, carried out through various education programs, to change human habits, but the most usual is biological control, together with environmental management and chemical control. The most commonly insecticide used is temephos (an organophosphorus compound), but Aedes aegypti populations have shown resistance and the product is highly toxic, so we chose it as a template molecule to perform a ligand-based virtual screening in the ChemBrigde (DIVERSet-CL subcollection) database, searching for derivatives with similarity in shape (ROCS) and electrostatic potential (EON). Thus, fourty-five molecules were filtered based on their pharmacokinetic and toxicological properties and 11 molecules were selected by a molecular docking study, including binding affinity and mode of interaction. The L46, L66 and L68 molecules show potential inhibitory activity for both the insect (-9.28, -10.08 and -6.78 kcal/mol, respectively) and human (-6.05, 6.25 and 7.2 kcal/mol respectively) enzymes, as well as the juvenile hormone protein (-9.2; -10.96 and -8.16 kcal/mol, respectively), showing a significant difference in comparison to the template molecule temephos. Molecules L46, L66 and L68 interacted with important amino acids at each catalytic site of the enzyme reported in the literature. Thus, the molecules here investigated are potential inhibitors for both the acetylcholinesterase enzymes and juvenile hormone protein–from insect and humans, characterizing them as a potential insecticide against the Aedes aegypti mosquito

extraction and representation of Portuguese and Spanish terms in the archaeology of al-Andalus

UID/LIN/03213/2019Cet article se concentre sur les termes des artefacts d’éclairage dans un corpus sur l’archéologie d’al-Andalus. Le but de ce travail est la création d’une ressource terminologique multilingue basée sur une ontologie. La connaissance du domaine est représentée par OntoAndalus, une ontologie OWL qui repose sur DOLCE + DnS Ultralite. Les informations spécifiques à la langue sont représentées par le modèle Lemon, le Modèle lexical pour les ontologies, lequel est en cours de développement par le W3C. Lemon permet la représentation d’informations grammaticales et sémantiques, notamment les relations lexicosémantiques entre les termes et sa référence aux éléments ontologiques dans OntoAndalus.publishersversionpublishe

Controlo de qualidade em laboratório clínico: hemoglobinopatias

Dissertação defendida no Instituto Superior de Ciências da Saúde Egas MonizO laboratório clínico deve utilizar metodologias de controlo de qualidade que permitam identificar, prevenir e corrigir possíveis falhas e assim garantir a exatidão dos seus resultados. O Controlo de Qualidade laboratorial é de elevada importância quer através da aplicação de metodologias de Controlo de Qualidade Interno (CQI) para avaliação da precisão analítica, quer através da participação em programas de Avaliação Externa da Qualidade (AEQ) para avaliação da exatidão analítica. As hemoglobinopatias são doenças monogénicas com transmissão de forma autossómica recessiva, causadas por mutações ao nível dos genes das globinas humanas, que conduzem à síntese reduzida da hemoglobina (talassémias) ou à formação de hemoglobinas estruturalmente anómalas (variantes). O estudo apresentado incidiu sobre os resultados do CQI e da participação em programas de AEQ da Unidade de Diagnóstico Laboratorial de Referência (UDR) do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, bem como dos ensaios de AEQ organizados pelo Programa Nacional de Avaliação Externa da Qualidade (PNAEQ) ao nível do doseamento de Hb A2, Hb F e Hb S realizados entre 2011 e 2014. Ao nível do CQI, verificou-se uma melhoria da precisão analítica no doseamento de amostras controlo de nível de concentração normal para a Hb A2, normal e elevado para a Hb F. O erro total associado ao doseamento da Hb A2 e da Hb F apresenta, de um modo geral, uma tendência decrescente. Relativamente ao doseamento da Hb S o mesmo só se verifica para as amostras analisadas no equipamento HA 8160. Entre 2011 e 2014 foram organizados pelo PNAEQ oito ensaios no âmbito das hemoglobinopatias. Os resultados obtidos indicam que, para as diferentes hemoglobinas estudadas, existe uma grande variabilidade nos resultados entre os laboratórios participantes

Terminologia da economia monetária : relações conceptuais e semânticas numa sistemática terminológica e lexicográfica

Dissertação de Mestrado em Lexicologia e LexicografiaA dissertação que apresentamos tem como ponto de partida uma interrogação sobre a contribuição da Terminologia para a estruturação coerente dos conceitos e respectivas unidades terminológicas do domínio da Economia Monetária. A Terminologia, ponto de encontro entre o campo conceptual e o campo linguístico, visa por um lado a normalização linguística, que pode ser entendida como a recomendação ou imposição institucional na utilização de determinado termo; por outro lado visa a normalização dos formatos terminográficos e informáticos, que implicam a associação de normas técnicas (SGML, fichas ISO, ... ) com normas de descrição terminográficas. Sem esta normalização, a difusão, a divulgação e o intercãmbio terminológico é dificultado. A representação linguística com a sua faceta normativa são tanto mais necessárias quanto se sabe que a Economia é hOJe, uma das ciências mais solicitadas no seio da Comunidade Europeia e, será, mais ainda no contexto do grande mercado único. A construção da Europa acelera-se. Uma moeda única esboça-se para o fim do século e o grande mercado sem fronteiras avança, embora timidamente. A defesa económica comum, mas também uma cidadania europeia são assuntos que preenchem as crónicas quotidianas dos média e estão entre muitos outros assuntos que com certeza contribuirão para a política e, maioritariamente, reclamada Europa de Maastrichl. Há uma Comunidade Económíca Europeia. Haverá, com a aplicação do Tratado de Maastricht. uma Comunidade Europeia. Haverá ainda maior necessidade de comunicar, multilinguisticamente, os debates e as resoluções emanadas das instituiçõesque a dirigem. Neste quadro eminentemente politico, económico, social e cultural, as Ciências Económicas desempenham um dos mais importantes papeis e porventura, são aquelas que mais alimentam os discursos que saem das várias instituições da Comunidade. Temos. portanto. em mente, a ideia de que a grande produção de documentos especializados, de índole económica, em especial de Economia Monetária Europeia, deve ser acompanhada de uma elaboraçã.o conceptual que passe também pelo . trabalho de Terrrunoloqia. De resto, a grande quantidade de textos que diariamente se produz nas ditas msntuíções, justificam, plenamente. um trabalho de denominação dos conceitos de especialidade, linguistcamente coerente. Às considerações que acabámos de expor devemos aduzir, por um lado, o carácter técnico-científico de grande parte dos textos a traduzir em várias línguas. e por outro, a inevitabilidade do serviço da Terminologia como suporte de qualidade das traduções. Se isto é verdade para muitos domínios do saber, é-o ainda mais no quadro da Economia Monetária Europeia, não porque ela desempenhe um papel mais nobre entre as ciências. mas porque ela é hoje e será, ainda, a mais solicitada na Europa Comunitária que se prevê para o final deste século

MEMORIAL SOBRE A TRAJETÓRIA ESCOLAR BÁSICA DE DAYSE HELLEN COSTA DE VILHENA

O presente texto trata do memorial sobre a trajetória escolar de Dayse Hellen Costa de Vilhena, ex-integrante do Programa Conexões de Saberes. Tem como objetivo apresentar os passos percorridos desde o início da educação básica até a entrada à UFPA e quais os principais entraves de estudantes das comunidades populares adentrarem o ensino superior público. A memória foi usada como principal referência para construção do material. Em seus resultados, apresenta os esforços individual e coletivo para que de fato a educação seja uma questão de direito e não de privilégio de poucos