RNAs n?o codificadores longos em Schistosoma mansoni : predi??o e perfil de express?o diferencial no est?gio evolutivo de verme adulto.

Programa de P?s-Gradua??o em Biotecnologia. N?cleo de Pesquisas em Ci?ncias Biol?gicas, Pr?-Reitoria de Pesquisa de P?s Gradua??o, Universidade Federal de Ouro Preto.A esquistossomose ? considerada uma doen?a debilitante de grande impacto socioecon?mico no mundo causada por platelmintos do g?nero Schistosoma. Uma das principais esp?cies identificadas nesse g?nero ? o parasita Schistosoma mansoni, que apresenta um ciclo de vida bastante complexo. Acredita-se que a complexidade dos programas de diferencia??o e desenvolvimento observado entre os diferentes est?gios evolutivos e ambientes onde o parasita vive seja dependente da regula??o da express?o g?nica. Os RNAs n?o codificantes representam uma das principais classes de mol?culas que potencialmente controlam a regula??o g?nica nos n?veis: epigen?tico, transcricional, p?s-transcricional e traducional. Esses RNAs s?o divididos em dois grandes grupos, os RNAs pequenos n?o codificantes de prote?na e os RNAs longos n?o codificantes (lncRNAs), o foco desse projeto. Os lncRNAs correspondem aos transcritos com mais de 200 nucleot?deos e que n?o codificam prote?nas. Particularmente, est?o envolvidos em diversas fun??es regulat?rias celulares, como regular a transcri??o, induzir o remodelamento da cromatina e modifica??es em histonas, originar siRNAs end?genos, modular atividades de prote?nas, alterar a localiza??o celular de prote?nas, ser precursores de pequenos RNAs, entre outros. A hip?tese desse trabalho ? que o S. mansoni expresse um conjunto de lncRNAs de forma diferencial atrav?s da reprograma??o de sua express?o g?nica em determinados est?gios evolutivos. Para investig?-la foi utilizado um conjunto de dados de RNA-seq dispon?vel para a fase adulta do parasito objetivando: (i) a montagem de um pipeline para identificar e caracterizar lncRNAs a partir de dados de RNA-seq com alta confian?a; (ii) classificar os novos lncRNAs preditos utilizando a anota??o Gene Ontology; (iii) analisar a express?o de um conjunto de 20 lncRNAs em cerc?ria, esquistoss?mulos com 3,5h de cultivo in vitro, machos, f?meas, casal e ovos; (iv) analisar a express?o de lncRNAs em parasitos resistentes ao praziquantel e (v) analisar a express?o de lncRNAs em f?gado de camundongo infectado e n?o infectado com S. mansoni. Foram identificados 170 novos Sm-lncRNAs com termos de ontologia relacionados ao metabolismo, transporte e bioss?ntese. Quinze dos preditos lncRNAs mostraram express?o diferencial nos est?gios avaliados, bem como entre machos e f?meas. Alguns apresentaram express?o diferencial em parasitos com resist?ncia ao praziquantel e em f?gado de camundongos infectados. Esses achados abrem novas perspectivas para estudos funcionais focados em resist?ncia a essa droga e desenvolvimento de biomarcadores espec?ficos para a esquistossomose.Schistosomiasis is a debilitating disease of great socioeconomic impact in the world caused by flatworms of the genus Schistosoma. One of the main species identified in this genus is the parasite Schistosoma mansoni, which presents a very complex life cycle. The differentiation and development programs complexity observed among the different evolutionary stages and environments where the parasite lives depend on the gene expression. Non-coding RNAs represent one of the major classes of molecules that potentially control gene regulation at levels: epigenetic, transcriptional, post-transcriptional, and translational. These RNAs are divided into two large groups, the small non-coding RNAs and the long non-coding RNAs (lncRNAs), the focus of this study. The lncRNAs correspond to transcripts with more than 200 nucleotides and are not responsible for protein coding. In particular, they are involved in several cellular regulatory functions, such as regulating transcription, inducing chromatin remodeling and histone modifications, originating endogenous siRNAs, modulating protein activities, altering cell localization of proteins, being precursors of small RNAs and others functions. This study hypothesis is that S. mansoni expresses a set of lncRNAs differentially by reprogramming their gene expression at certain evolutionary stages. To investigate it, a set of available RNA-seq data was used for the adult phase of the parasite aiming at: (i) assembling a pipeline to identify and characterize lncRNAs from highly reliable RNA-seq data; (ii) classify the novel lncRNAs predicted using the Gene Ontology annotation; (iii) to analyze the expression of a set of 20 lncRNAs in cercariae, schistosomules with 3.5 h of in vitro culture, males, females, couple and eggs; (iv) to analyze the expression of lncRNAs in praziquantel resistant parasites and (v) to analyze the expression of lncRNAs in the liver of infected and uninfected S. mansoni mice. We identified 170 new Sm-lncRNAs with terms of ontology related to metabolism, transport and biosynthesis. Fifteen of them showed differential expression in the evaluated stages, as well as between males and females. Some showed differential expression in parasites with resistance to praziquantel and in liver of infected mice. These findings highlight new perspectives for functional studies focused on resistance to this drug and specific biomarkers development for schistosomiasis

O direito penal do inimigo : uma visão crítica da corrupção no Brasil

Orientador: Priscilla Placha Sá.Monografia (graduação) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Jurídicas, Curso de Graduação em DireitoResumo: O presente trabalho propõe-se a estudar a teoria do direito penal do inimigo relacionando-a com o delito da corrupção no Brasil. Assim, faz-se um breve retrospecto histórico acerca da referida teoria. Objetiva-se, desse modo, preparar a posterior análise da legislação penal que tenta acompanhar o avançar desse crime, para concluir pela eficiência, ou não, de tal regramento. Para alcançar esse resultado, foi necessário inicialmente, tentar diferenciar a imoralidade da corrupção além de se fazer um estudo da normativa internacional e nacional sobre o tema. Evidencia-se nessa perspectiva, o recrudescimento do direito penal com relação a esse delito, à medida que, a sociedade pressiona os governantes através de manifestações populares que pedem por justiça, onde se subentende – penas mais duras. No contexto, será destacada outra proposta, que não a punitivista, com o objetivo de dificultar a prática da corrupçã

Lugar, sujeito e polissemias do patrimônio em Goiás, Brasil

The recent heritage concept expansion allows new approaches and challenges to interpreting the different social groups cultural references. This article suggests a dialogue between memory and heritage in Pilar, Crixás, and Pirenópolis (Goiás - Brazil), through understanding of their histories, reminiscences, absences in modified places, disputes around memory and different meanings. The methodology is based on a bibliographic review, a documentary research, participant observation in fieldwork and interviews (semi-structured, narratives and photo interviews) with residents of the three municipalities, during 2013 and 2021. Despite, the different spatial clipping, and the multiple motivations that are consolidated around the theme of heritage in the cases studied, all of them point to the centrality of the people and their values, demonstrating their polysemic, pluri-significant character and loaded with “will of memory”.La reciente ampliación del concepto de patrimonio permite nuevas perspectivas y impone desafíos en la interpretación de referencias culturales de diferentes grupos sociales. Este artículo propone un diálogo que problematiza la memoria y el patrimonio en Pilar, Crixás y Pirenópolis (Goiás - Brasil), considerando sus historias, reminiscencias, ausencias en lugares modificados, disputas en torno a la memoria, así como sus diferentes significados. El diseño metodológico consistió en una revisión bibliográfica y documental, observación participante en campo y aplicación de entrevistas (semiestructuradas, narrativas y fotoentrevistas) a residentes de los tres municipios, entre 2013 y 2021. A pesar de los diferentes recortes espaciales y de las múltiples motivaciones que se consolidan en torno al patrimonio en los casos estudiados, todo señala la centralidad de los sujetos y sus valoraciones, demonstrando su carácter polisémico, plurisignificativo y cargado de “voluntad de memoria”.A recente expansão do conceito de patrimônio possibilita novos olhares e nos impõe desafios de interpretação das referências culturais dos distintos grupos sociais. Este artigo propõe um diálogo que problematiza a memória e o patrimônio em Pilar, Crixás e Pirenópolis (Goiás – Brasil), considerando suas histórias, suas reminiscências, suas ausências nos lugares modificados, suas disputas em torno da memória e seus diferentes sentidos. Como metodologia de pesquisa, nos valemos de revisão bibliográfica, documental e pesquisas de campo, com observação participante e entrevistas (semiestruturada, narrativas e fotoentrevistas) com moradores dos três municípios entre 2013 e 2021. Apesar dos diferentes recortes espaciais e das múltiplas motivações que se consolidam em torno do patrimônio nos casos estudados, todos apontam para os sujeitos e suas valorações, demonstrando seu caráter polissêmico, plurissignificativo e carregado de “vontade de memória”

Lugar, sujeito e polissemias do patrimônio em Goiás, Brasil

A recente expansão do conceito de patrimônio possibilita novos olhares e nos impõe desafios de interpretação das referências culturais dos distintos grupos sociais. Este artigo propõe um diálogo que problematiza a memória e o patrimônio em Pilar, Crixás e Pirenópolis (Goiás – Brasil), considerando suas histórias, suas reminiscências, suas ausências nos lugares modificados, suas disputas em torno da memória e seus diferentes sentidos. Como metodologia de pesquisa, nos valemos de revisão bibliográfica, documental e pesquisas de campo, com observação participante e entrevistas (semiestruturada, narrativas e fotoentrevistas) com moradores dos três municípios entre 2013 e 2021. Apesar dos diferentes recortes espaciais e das múltiplas motivações que se consolidam em torno do patrimônio nos casos estudados, todos apontam para os sujeitos e suas valorações, demonstrando seu caráter polissêmico, plurissignificativo e carregado de “vontade de memória”

Mathematical modeling applied to the analysis of magmatic intrusions thermal influence in Paraná Basin

This paper has the objective to present equations capable of generating one-dimensional models that permit to quantify the thermal influence caused by igneous intrusions. In Paraná Basin, the petroleum systems were great influenced by igneous activitiesin which they as presented by a thick lava effusion, a large number of dykes in the entire sedimentary section and various levels of sills intruded in stratifications in order to provide thermal energy for organic maturation. Thus, a better understanding of how and how much the intrusions affect the generation of oil and gas is extremely necessary since the knowledge related to the effects of intrusions in such atypical petroleum system is still insufficient. The obtained results show: the thermal influence caused by igneous intrusions is much higher than that proposed in the literature; the presence of multiple intrusions, based on the oil and gas window considered and as a function of it thickness, causes between them, unfavorable thermal influence to the generation of hydrocarbons in small distances and favorable thermal influence in large distances

Photochemistry of 5-Hydroxy-4'-Dimethylaminoflavylium in the presence of SDS micelles. The role of metastable states of flavylium cation-quinoidal base and trans-chalcones

UIDB/50006/2020 UIDP/50006/2020 PTDC/QUI-OUT/29013/2017 SFRH/BD/143309/2019 SFRH/BD/146549/2019 MEX/Ref. 288188 IF/00225/2015The multistate of species originated by the compound 5-hydroxy-4′-dimethylaminoflavylium was studied in the presence of sodium dodecyl sulfate micelles 0.1 M. A series of pH jumps obtained by addition of base to the equilibrated solutions of the flavylium cation results in a metastable equilibrium between the flavylium cation and the quinoidal base with pKa = 7.6. In neutral to moderately basic medium, only at 60 °C and after 5 days a new distribution involving the flavylium cation and trans-chalcones is achieved. On the other hand, the anionic trans-chalcone can be formed in few minutes in very basic medium at room temperature and from this, another meta-stable state constituted by protonated, neutral and anionic trans-chalcones, pKCt+/Ct = 2.6 and pKCt/Ct- = 10.7 is reached. The equilibrium is apparently attained between flavylium cation, neutral and anionic trans-chalcones respectively for pKAH+/Ct = 4.1 and pKCt/Ct- = 10.7. Irradiation of the neutral (stable or metastable) and protonated (meta-stable) trans-chalcones yields to the appearance of the quinoidal base or the flavylium cation in an extended pH region 1 < pH < 10. The peculiar properties of this flavylium based photochromic system are explained by means of an energy level diagram where cis-chalcone and hemiketal lay above the quinoidal base.authorsversionpublishe

Produção de biomassa de guandu (Cajanus cajan L.) e milho (Zea mays L.) para silagem em função de sistemas mecanizados de preparo do solo

Mechanical soil management has a huge impact on early plant development and can promote effects at all stages of the silage forage production cycle. Thus, this work was conducted to verify if a mechanized system of soil preparation influences the accumulation of pigeon pea and corn biomass. The experiment was conducted at the farm school of Federal University of Mato Grosso do Sul, Faculty of Veterinary Medicine and Animal Science. The experimental delimitation chosen was randomized blocks, the treatments were two systems of tillage (conventional and reduced), associated to two crops (Cajanus cajan L., cv. BRS Mandarim e Zea mays L. hybrid TG Status). The cv. BRS Mandarim in conventional tillage system impacted higher biomass values. In addition, the same soil preparation system promoted oscillations between the crops (P<0.05), where cv. BRS Mandarim showed biomass values 7% higher than cv. Status TG. In reduced handling system, the crops presented the same biomass productivity. Despite the increase of dry weight during the cycle of cv. BRS Mandarim biomass production, there was a reduction in the dry matter fraction, indicating that the specific weight per plant decreased at the end of the evaluation period. The tillage system that was fulfilled conventionally promoted higher estimates of pigeon pea biomass. Corn was not influenced by mechanized tillage system.La gestión mecánica del suelo afecta al desarrollo inicial de las plantas y puede promover efectos en todas las fases del ciclo de producción de forraje para ensilado. Por lo tanto, este trabajo se llevó a cabo para verificar si el sistema de preparación del suelo mecanizado influye en la acumulación de biomasa de guandu y maíz. El experimento se llevó a cabo en la granja escolar de la Universidad Federal de Mato Grosso do Sul, de la Facultad de Medicina Veterinaria y Ciencias Animales. El diseño experimental utilizado fue bloques aleatorizados, los tratamientos son dos sistemas de preparación del suelo (convencionales y reducidos), asociados con dos cultivos (Cajanus cajan L., cv BRS Mandarin y Zea mays L. hybrid TG Status). cv. BRS Mandarin en el sistema de preparación del suelo realizado convencionalmente impactó mayores valores de biomasa. Además, el mismo sistema de preparación del suelo promovió oscilaciones entre cultivos (P<0.05), en los que cv.  BRS Mandarin presentó valores de biomasa 7% más altos que cv. Status TG. En el sistema de gestión reducido, los cultivos presentaron el mismo rendimiento de biomasa. A pesar del aumento del peso seco durante el ciclo de producción de biomasa de cv. BRS Mandarin hubo una reducción en la fracción de materia seca, lo que indica que el peso específico por planta se redujo al final del ciclo de evaluación. El sistema de preparación del suelo realizó convencionalmente mayores estimaciones de biomasa de guandu. El maíz no fue influenciado por el sistema mecanizado de preparación del sueloOs manejos mecânicos do solo impactam no desenvolvimento inicial das plantas podendo promover efeitos em todas as fases do ciclo de produção de forragem para silagem. Assim, este trabalho foi conduzido para verificar se o sistema mecanizado de preparo do solo influência no acúmulo de biomassa de guandu e milho. O experimento foi conduzido na fazenda escola da Universidade Federal do Mato Grosso do Sul, da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. O delineamento experimental empregado foi de blocos ao acaso, os tratamentos são dois sistemas de preparo do solo (convencional e reduzido), associados a duas culturas (Cajanus cajan L., cv BRS Mandarim e Zea mays L. híbrido TG Status). A cv. BRS Mandarim no sistema de preparo do solo realizado de forma convencional impactou em maiores valores de biomassa. Além disso, o mesmo sistema de preparo do solo promoveu oscilações entre as culturas (P<0,05), em que a cv.  BRS Mandarim apresentou valores de biomassa 7% superiores ao da cv. Status TG. No sistema de manejo reduzido, as culturas apresentaram a mesma produtividade de biomassa. Apesar do aumento do peso seco durante o ciclo de produção de biomassa da cv. BRS Mandarim ocorreu redução na fração de matéria seca, indicando que o peso especifico por planta reduziu ao final do ciclo de avaliação. O sistema de preparo do solo realizado de forma convencional promoveu maiores estimativas de biomassa de guandu. O milho não foi influenciado pelo sistema mecanizado de preparo de solo.

MATHEMATICAL MODELING APPLIED TO THE ANALYSIS OF MAGMATIC INTRUSIONS THERMAL INFLUENCE IN PARANÁ BASIN

This paper has the objective to present equations capable of generating one-dimensional models that permit to quantify the thermal influence caused by igneous intrusions. In Paraná Basin, the petroleum systems were great influenced by igneous activities in which they are presented by a thick lava effusion, large number of dykes in the entire sedimentary section and various levels of sills intruded in stratifications to provide thermal energy for organic maturation. Thus, a better understanding of how and how much the intrusions affect the generation of oil and gas is extremely necessary since the knowledge related to the effects of intrusions in such atypical petroleum system is still insufficient. The obtained results show: the thermal influence caused by igneous intrusions is much higher than that proposed in the literature; the greater the number of intrusions and the thicker they are, the thermal influence is unfavorable at short distances and favorable at large distances

Does pre-training on brain-related tasks results in better deep-learning-based brain age biomarkers?

Brain age prediction using neuroimaging data has shown great potential as an indicator of overall brain health and successful aging, as well as a disease biomarker. Deep learning models have been established as reliable and efficient brain age estimators, being trained to predict the chronological age of healthy subjects. In this paper, we investigate the impact of a pre-training step on deep learning models for brain age prediction. More precisely, instead of the common approach of pre-training on natural imaging classification, we propose pre-training the models on brain-related tasks, which led to state-of-the-art results in our experiments on ADNI data. Furthermore, we validate the resulting brain age biomarker on images of patients with mild cognitive impairment and Alzheimer's disease. Interestingly, our results indicate that better-performing deep learning models in terms of brain age prediction on healthy patients do not result in more reliable biomarkers.Comment: Accepted at BRACIS 202