Estabilidade fenotípica e previsibilidade da resistência de genótipos de sorgo a Colletotrichum graminicola.

Foram avaliados nove genotipos de sorgo (CMSXS112B, CMSXS156B, CMSXS202B, CMSXS203B, CMSXS204B, CMSXS207R, CMSXS221B, CMSXS101B e CMSXS173R), em duas epocas de plantio, com relacao a sua capacidade de produzir hibridos possuidores de resistencia dilatoria, atraves de inoculacao artificial com 6 racas de Colletotrichum graminicola )|(04a, 06B, 15C, 12A, 14C e 21E). Utilizou-se o conceito de estabilidade fenotipica para interpretar os resultados e expressar o nivel de resistencia dilatoria destes genotipos. Desta forma, considerou-se como genotipo com resistencia dilatoria elevada, estavel e previsivel aquele caracterizado por media baixa de doenca, b menor que 1,0 e R2 elevado. Os resultados obtidos indicaram os genotipos CMSXS221B, CMSXS207R, CMSXS173R e CMSXS10B como possuidores de resistencia dilatoria alta, moderadamente estavel e previsivel. Apesar destes genotipos apresentarem resistencia dilatoria moderadamente estavel e b's, significativos, portanto diferentes de zero, os mesmos podem ser considerados como progenitores promissores para a producao de hibridos de sorgo com resistencia dilatoria a C. graminicola

Evaluation of genetic mixtures of sorghum lines for anthracnose resistance management.

Este trabalho teve como objetivo avaliar a possibilidade de se utilizar a diversificação de populações hospedeiras de sorgo (Sorghum bicolor) como uma estratégia alternativa para o manejo da resistência ao agente causal da antracnose Colletotrichum graminicola. Foram avaliados 18 híbridos triplos obtidos a partir do cruzamento entre seis híbridos F1, resultantes do cruzamento entre linhagens A (com citoplasma macho-estéril) e linhagens B (com citoplasma fértil não restaurador de fertilidade) e três linhagens R (restauradoras), selecionadas com base na sua reação diferencial ao patógeno. Observou-se uma variação no nível de resistência dos híbridos avaliados. As linhagens contribuíram diferentemente em nível de resistência de cada híbrido triplo e todos aqueles em que a linhagem CMSXS169R foi utilizada como o progenitor masculino foram classificados como altamente resistentes a C. graminicola. Alguns cruzamentos apresentaram um nível final de resistência superior ao das três linhagens componentes do híbrido avaliadas individualmente. The main objective of this work was to evaluate the diversification of sorghum (Sorghum bicolor) populations as a way to manage resistance to the sorghum anthracnose fungus Colletotrichum graminicola. A total of 18 three-way hybrids were obtained by crossing six single cross male-sterile F1 hybrids, derived by crossing A (non restorer sterile cytoplasm) and B (non restorer normal cytoplasm) lines, with three fertile R (restorer) lines, previously evaluated for their differential reaction to the pathogen. Variation in the level of resistance was observed, as indicated by the values of the area under the disease progress curve (AUDPC) obtained for each hybrid. Lines contributed differently to the level of resistance of each hybrid. All hybrids in which CMSXS169R was the male progenitor were classified as highly resistant. Some hybrids had a level of resistance superior to the maximum levels of each line component individually

Resistência dilatória de genótipos de sorgo a diferentes raças de Colletotrichum graminicola.

Foi avaliada a resistencia dilatoria em nove genotipos de sorgo, em relacao a seis racas fisiologicas de Colletotrichum graminicola, agente causal da antracnose. Os experimentos foram conduzidos na Embrapa Milho e Sorgo, em Sete Lagoas, MG. O plantio de campo foi executado em duas diferentes epocas de semeadura (janeiro e setembro de 1995). O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso com parcelas subdivididas, com as racas na parcela e as linhagens nas subparcelas. Foram feitas inoculacoes artificiais na linhagem Tx623 e as avaliacoes foram feitas baseando-se na severidade de doenca. Os dados foram transformados para o valor de area abaixo da curva de progresso de doenca (AACPD). Para a avaliacao do periodo latente, os experimentos foram conduzidos em casa de vegetacao, nas epocas correspondentes ao plantios de campo, com as mesmas linhagens e racas utilizadas no experimento de campo. As linhagens CMSXS221B e CMSXS173R apresentaram alto nivel de resistencia dilatoria a C. graminicola. No plantio de campo, realizado em setembro , observou-se a mesma presenca de interacao significativa entre linhagens hospedeiras e racas do patogeno, ocorrida durante a conducao dos experimentos para avaliacao do periodo latente, sugerindo a existencia de resistencia do tipo vertical incompleta no patossistema Sorghum bicolor - C. graminicola

Identificação de raças fisiológicas de Hemileia vstatrix Berk. & Br. no Estado do Espírito Santo, Brasil.

Cento e trinta e nove isolados de Hemileia vastatrix foram coletados de plantas de cultivares de Coffea canephora e Coffea arabica, nos estados do Espírito Santo e Minas Gerais. Os isolados foram inoculados em plantas do cultivar Catuaí Vermelho LCH 2077-2-5-44 em condição de casa de vegetação, de junho de 1995 a julho de 1997. A identificação de raças foi acompanhada pela inoculação de isolados de H. vastatrix em clones diferenciadores, mantidos em casa de vegetação no Departamento de Fitopatologia da Universidade Federal de Viçosa. Raças de H. vastatrix foram determinada segundo D’Oliveira (1954, 1957). A raça II foi identificada em todos os 96 isolados de C. canephora do estado do Espírito Santo

Resistência de clones de Coffea. canephora VAR. conillon a quatro raças de Hemileia va statrix BERK et Br.

Foram avaliados, quanto aos tipos de reação às raças I, II, III e XIII de Hemileia vastatrix, 33 clones de Coffea canephora componentes de variedades clonais, sendo nove com ciclo de maturação precoce da variedade EMCAPA 8111; treze com ciclo de maturação intermediário da variedade EMCAPA 8121 e onze de ciclo de maturação tardio da variedade EMCAPA 8131. Empregou-se escala de notas de 1 a 6, sendo que graus médios de doença menores que 4 corresponderam a reação de resistência e maiores ou igual a 4, de suscetibilidade. Utilizou-se o intervalo de confiança do grau médio de doença como medida de estabilidade de reação dos clones em relação às raças inoculadas. Os clones 154 (precoce), 132, 149 e 201 (intermediários), e, 100 e 143 (tardios) mostraram-se resistentes às quatro raças do patógeno. Entretanto, observou-se variabilidade de reação entre repetições de 12 clones analisados. Os resultados mostraram que as três variedades clonais são constituídas por clones resistentes e suscetíveis às quatro raças do patógeno, indicando a necessidade de estudos mais detalhados, em relação à obtenção de clones com maior nível e durabilidade de resistência à H. vastatrix

Estratégia de controle químico da pinta preta do tomateiro (Alternaria solani) com base em critérios fenológicos.

O trabalho, realizado no período de fev.-jun./1995, foi montado em blocos casualizados, envolvendo os seguintes tratamentos: 1) pulverizações semanais com Chlorotalonil; 2) pulverizações até a emissão da quinta penca; 3) pulverizações até a emissão da terceira penca; 4) pulverização até a emissão da quarta penca; 5) pulverização após a emissão da quinta penca. Qualificou-se a producao em kg de frutos comercializaveis por planta. Em relacao ao progresso da doença, não houve diferenças significativas entre as medias de Area da Curva de Progresso da Doença (ACPD) entre as parcelas pulverizadas semanalmente e as pulverizadas ate a emissão da quinta e terceira pencas; entretanto, tais valores de ACPD foram menores quando comparados aqueles obtidos para parcelas pulverizadas apenas após o lançamento das terceira e quinta pencas, respectivamente. Os dados de producao obtidos para as parcelas pulverizadas semanalmente, por sua vez, foram significativamente superiores aos obtidos para as parcelas submetidas aos tratamentos baseados em lançamento de pencas. Para a época considerada, onde prevalecem condições altamente favoráveis a pinta preta, o controle da doença conforme o proposto não foi eficiente.Edição dos resumos do XXVIII Congresso Brasileiro de Fitopatologia. Resumo 588

Expected Genotype Quality and Diploidized Marker Data from Genotyping-by-Sequencing of Urocholoa spp. Tetraploids.

Although genotyping-by-sequencing (GBS) is a well-established marker technology in diploids, the development of best practices for tetraploid species is a topic of current research. We determined the theoretical relationship between read depth and the phred-scaled probability of genotype misclassification conditioned on the true genotype, which we call expected genotype quality (EGQ). If the GBS method has 0.5% allelic error, then 17 reads are needed to classify simplex tetraploids as heterozygous with 95% accuracy (EGQ = 13) vs. 61 reads to determine allele dosage. We developed an R script to convert tetraploid GBS data in variant call format (VCF) into diploidized genotype calls and applied it to 267 interspecific hybrids of the tetraploid forage grass Urochloa. When reads were aligned to a mock reference genome created from GBS data of the Urochloa brizantha (Hochst. ex A. Rich.) R. D. Webster cultivar Marandu, 25,678 biallelic single nucleotide polymorphism (SNPs) were discovered, compared with ~3000 SNPs when aligning to the closest true reference genomes, Setaria viridis (L.) P. Beauv. and S. italica (L.) P. Beauv. Crossvalidation revealed that missing genotypes were imputed by the random forest method with a median accuracy of 0.85 regardless of heterozygote frequency. Using the Urochloa spp. hybrids, we illustrated how filtering samples based only on genotype quality (GQ) creates genotype bias; a depth threshold based on EGQ is also needed regardless of whether genotypes are called using a diploidized or allele dosage model

The Brazilian Program for Biodiversity Research (PPBio) Information System.

The database of the Brazilian Program for Biodiversity Research (PPBio; GIVD ID SA-BR-001) includes data on the environment and biological groups such as plants. It is organized by site, which is usually a grid with 10 to 72 uniformly-distributed plots, and has already surveyed 1,638 relevés across different Brazilian ecosystems. The sampling design is based on the RAPELD system to allow integration of data from diverse taxa and ecosystem processes. RAPELD is a spatially-explicit sampling scheme to monitor biodiversity in long-term ecological research sites and during rapid appraisals of biodiversity that has attracted support from many management agencies, which are using it as their long-term monitoring system. Vegetation surveys include measurements of cover, biomass and number of individuals from woody and herbaceous vascular plants, along with environmental data. We have recently migrated to a metadata catalog and data repository which allows searching for specific groups across all sites. All RAPELD data have been collected since 2001, though the site also allows data from other long-term plots to be archived as associated projects