Analyse génétique et fonctionnelle du gène OCRL1 associé au syndrome de Lowe

The OCRL1 gene, responsible for Lowe syndrome X-linked disease, encodes a PIP2 5-phosphatase localized in the trans Golgi network. 107 mutations were identified among 146 families. Segregation analysis showed three cases of germinal and somatic mosaicism among 18 families. 6 mutations were identified in the OCRL1 gene in 23 patients affected with Dent disease but without CLCN5 mutation. The PIP2 5-phosphatase activity in total fibroblast cellular extracts of 23 patients (21 Lowe and 2 Dent) is greatly reduced compared to normal fibroblast. Western blot analysis of the OCRL1 protein showed an important reduction for the splicing mutations and the genomic deletion but a more variable quantity for the misssense mutations. OCRL1 transcript are present in variable quantity in the patients affected with Lowe syndrome but also in the control patients. The preliminary clinical study of 55 patients with Lowe syndrome showed no evidence of a genotype-phenotype correlation.Le gène OCRL1, responsable du syndrome de Lowe de transmission récessive liée à l'X, code pour une PIP2 5-phosphatase associée à l'appareil de Golgi. 107 mutations du gène OCRL1 ont été identifiées chez 146 familles de syndrome de Lowe et 6 mutations ont été identifiées chez 23 patients atteints de maladie de Dent sans mutation du gène CLCN5. L'haplotypage de 18 familles a mis en évidence 3 cas de mosaïcisme germinal et somatique. L'activité PIP2 5-phosphatase fibroblastique des patients est très abaissée par rapport à des fibroblastes normaux. L'analyse par Western blot de la protéine OCRL1 montre une diminution variable de la quantité protéique et pas forcément corrélée à l'activité résiduelle de la protéine. L'analyse des transcrits d'OCRL1 montre qu'il existe une variabilité quantitative chez les patients mais également chez les témoins. Les premières études cliniques chez 55 patients atteints de syndrome de Lowe ne montrent pas de corrélation génotype-phénotype évidente

Analyse génétique et fonctionnelle du gène OCRL1 associé au syndrome de Lowe

Le syndrome oculo-cérébro-rénal de Lowe (OCRL), de transmission récessive liée à l'X, est caractérisé par une cataracte congénitale bilatérale, un retard psychomoteur et un syndrome de Fanconi rénal. Le gène OCRL 1 code pour une PIP2 5-phosphatase de 105 kDa associée à l'appareil de Golgi. La recherche de mutations chez 146 familles a permis de caractériser 107 mutations dont 86 différentes. Parmi les mutations identifiées 2 sont des délétions en phase d'un seul acide aminé, 27 des mutations faux sens, 29 des mutations non sens, 23 des insertions ou délétions avec décalage du cadre de lecture, 19 des mutations d'épissage et 7 des délétions génomiques. L'haplotypage de 18 familles par des marqueurs fortement liés à OCRL 1 a mis en évidence 3 cas de mosaTcisme germinal et somatique. Vingt trois patients atteints de maladie de Dent sans mutation du gène CLCN5 ont été étudiés et 6 mutations ont été identifiées dans le gène OCRL1. L'activité PIP25-phosphatase mesurée dans les extraits cellulaires de fibroblastes de 21 garçons atteints de syndrome de Lowe et de 2 atteints de maladie de Dent est très abaissée par rapport à des fibroblastes normaux. L'analyse par Western blot de la protéine OCRL 1 montre une diminution très importante pour les mutations d'épissage et une délétion génomique. Pour les mutations faux sens la quantité est plus variable mais pas forcément corrélée à l'activité résiduelle de la protéine. L'analyse des transcrits d'OCRL 1 montre qu'il existe une variabilité quantitative chez les patients mais également chez les témoins. Les premières études cliniques chez 55 patients atteints de syndrome de Lowe ne montrent pas de corrélation génotype-phénotype évidente.Lowe syndrome is a rare X-linked disease characterized by congenital cataracts, renal Fanconi syndrome an mental retardation. The OCRL 1 gene encodes a 105 kDa PIP2 5-phosphatase localized in the trans Golgi network. 146 families were analyzed and 107 mutations were identified, 86 are new ones. Two mutations are an aminoacid in trame deletion, 27 are misssense mutations, 29 nonsense mutations, 23 are nucleotide deletion or insertion responsible of a frameshift, 19 are splicing mutations and 7 genomic deletions. Segregation analysis with microsatellite markers linked to the OCRL 1 gene showed three cases of germinal and somatic mosaicism among 18 families. Twenty three patients affected with Dent disease but without CLCN5 mutation were analyzed and 4 missense mutations, 1 splicing mutation and 1 genomic deletion were identified in the OCRL 1 gene. The PIP2 5-phosphatase activity in total fibroblast cellular extracts of 21 patient: affected with Lowe syndrome and 2 affected with Dent disease is greatly reduced compared to normal fibroblast. Western blot analysis of the OCRL 1 protein showed an important reduction for thé splicing mutations and the genomic deletion but a more variable quantity for the misssense mutations. OCRL 1 transcript are present in variable quantity in the patients affected with Lowe syndrome but also in the control patients. The preliminary clinical study of 55 patients with Lowe syndrome showed no evidence of a genotype phenotype correlation.GRENOBLE1-BU Sciences (384212103) / SudocSudocFranceF

Analyse génétique et fonctionnelle des mutations du gène OCRL1 associées au syndrome oculo-cérébro-rénal de Lowe

GRENOBLE1-BU Médecine pharm. (385162101) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

La documentation sur Césarée de Maurétanie (Cherchel, Algérie) au Centre Camille-Jullian.De l’inventaire à une base de données épigraphique

International audienceLes recherches et les fouilles de la ville antique de Caesarea de Maurétanie, actuelle Cherchel (Algérie), ont produit une documentation considérable qui est aujourd’hui partiellement conservée au Centre Camille Jullian. Ce fonds composé de notes, photographies, relevés, plans, cartes commentées, a fait l’objet d’un inventaire. Grâce à des financements du programme MASA, l’intégralité des négatifs photographiques a pu être numérisée afin de permettre sa valorisation, sa réexploitation et sa conservation. La partie du fonds illustrant l’épigraphie a fait l’objet d’un traitement particulier car elle est actuellement utilisée dans le cadre de la publication du corpus des inscriptions de Cherchel. Après leur indexation et leur archivage dans la photothèque du laboratoire, les clichés constituent l’illustration d’une base de données de recherche construite en accompagnement de l’opération éditoriale. Ce système d’information répond au besoin de gestion et de collecte des données des chercheurs qui travaillent sur le projet, ainsi qu’aux nécessités de questionnement des informations. Une deuxième étape du projet est actuellement engagée pour encoder l’ensemble des données sur les inscriptions avec EpiDoc, sous-ensemble de la TEI

La documentation sur Césarée de Maurétanie (Cherchel, Algérie) au Centre Camille-Jullian. De l’inventaire à une base de données épigraphique

Introduction : les fonds documentaires sur Cherchel au Centre Camille-Jullian En raison de son histoire, le Centre Camille-Jullian conserve d’importants fonds documentaires sur l’archéologie française en Afrique du Nord. Il en a hérité notamment des services des antiquités de Rabat et d’Alger installés à Aix-en-Provence après l’indépendance du Maroc et de l’Algérie, mais aussi du travail des chercheurs et personnels du Cnrs et de l’Université de Provence rattachés aux programmes du laboratoir..

Génétique de l’infertilité masculine

L’infertilité concerne de 10 % à 15 % des couples ayant un désir d’enfant et une composante masculine est retrouvée dans près de la moitié des cas. Dans une proportion importante de cas, une base génétique chromosomique ou génique connue, parfois transmise par les parents, est en cause. L’utilisation des nouvelles techniques de génotypage pangénomique a récemment permis d’impliquer de nouveaux gènes dans des phénotypes spécifiques d’infertilité masculine. Pour les patients concernés, ces avancées permettent de réaliser un diagnostic, d’affiner le pronostic et donc de mieux orienter la prise en charge. À terme, ce travail permettra de mieux comprendre les mécanismes moléculaires de la spermatogenèse et donc de proposer des solutions thérapeutiques qui pourront être applicables au plus grand nombre

Lowe syndrome protein Ocrl1 is translocated to membrane ruffles upon Rac GTPase activation: a new perspective on Lowe syndrome pathophysiology.

International audienceOculocerebrorenal Lowe syndrome is a rare X-linked disorder characterized by bilateral cataract, mental retardation and renal Fanconi syndrome. The Lowe syndrome protein Ocrl1 is a PIP2 5-phosphatase, primarily localized to the trans-Golgi network (TGN), which 'loss of function' mutations result in PIP2 accumulation in patient's cells. Although PIP2 is involved in many cell functions including signalling, vesicle trafficking and actin polymerization, it has been difficult so far to decipher molecular/cellular mechanisms responsible for Lowe syndrome phenotype. We have recently shown that, through its C-terminal RhoGAP domain, Ocrl1 forms a stable complex with Rac GTPase within the cell. In line with this finding, we report here that upon epidermal growth factor induced Rac activation in COS-7 cells, a fraction of Ocrl1 translocates from TGN to plasma membrane and concentrates in membrane ruffles. In order to investigate the functionality of Ocrl1 in plasma membrane, we have analysed PIP2 distribution in human dermal fibroblasts (HDFs) from Lowe patients versus control HDFs. As revealed by both immunodetection and green fluorescent protein-PH binding, PIP2 was found strikingly to accumulate in PDGF induced ruffles in Lowe HDFs when compared with control. This suggests that Ocrl1 is active as a PIP2 5-phosphatase in Rac induced membrane ruffles. Cellular properties such as cell migration and establishment of cell-cell contacts, which depend on ruffling and lamellipodia formation, should be further investigated to understand the pathophysiology of Lowe syndrome

FISH and tips: a large scale analysis of automated versus manual scoring for sperm aneuploidy detection

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Interphase fluorescent in situ hybridization detection of the 7q11.23 chromosomal inversion in a clinical laboratory: automated versus manual scoring.

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