Prevalence of Escherichia coli adhesion-related genes in neonatal calf diarrhea in Uruguay

Introduction: Neonatal calf diarrhea (NCD), one of the most important diseases of neonatal dairy and beef calves in Uruguay, has become relevant in association with intensive systems. This disease generates substantial economic losses everyyear worldwide as a result of increased morbidity and mortality. Escherichia coli, one of the pathogens associated with NCD, can express several fimbrial and afimbrial adhesins. The objective of this study was to assess the presence of clpG, f5, f17A, f17G(II), and f17G(I)genes that encode three important adhesins expressed in diarrheagenic E. coli: F5, F17 and CS31A, isolated from feces of calves in Uruguay.Methodology: Feces of 86 (70 diarrheic and 16 healthy) calves, from 15 animal facilities in Uruguay, were collected between 2012 and 2013. Biochemical and molecular identification were performed to finally obtain 298 E. coliisolates. Partial amplification of adhesion-related genes was performed by polymerase chain reaction.Results: The most prevalent gene was f17A(31.2%), followed by f17G(II), clpG, f17G(I)andf5 (25.8%, 17.5%, 3.7% and 0.7%, respectively). All genes were present in diarrheic and healthy animals except f5and f17G(I); these genes were present only in affected calves, although in low numbers.Conclusions: This is the first report of the presence of F5, F17, and CS31A genes in E. coli strains from NCD cases in Uruguay. Prevalence values of the genes, except f5, were in accordance with regional findings. It is expected that further characterization of locally transmitted strains will contribute to control a problem of regional and international magnitude.Agencia Nacional de Investigación e Innovació

Draft genome sequence and gene annotation of the uropathogenic bacterium Proteus mirabilis Pr2921

Here, we report the genome sequence of Proteus mirabilis Pr2921, a uropathogenic bacterium that can cause severe complicated urinary tract infections. After gene annotation, we identified two additional copies of ucaA, one of the most studied fimbrial protein genes, and other fimbriae related-proteins that are not present in P. mirabilis HI4320

Detección de anticuerpos anti-CS31A de <i>Escherichia coli</i> en calostro de vacas lecheras en dos establecimientos de Uruguay con y sin vacunación

La diarrea neonatal en terneros (DNT) constituye un desafío de las industrias ganaderas mundialmente. En la región, las tasas de mortalidad por DNT pueden superar el 20 % y en Uruguay es una de las enfermedades infecciosas que se asocia a altos porcentajes de morbi-mortalidad. La vacunación en hembras gestantes es una estrategia utilizada para prevenir la DNT. La composición de las vacunas incluye antígenos virales y bacterianos de los principales patógenos, como variantes patogénicas de Escherichia coli, rotavirus y coronavirus.Trabajo publicado en Cagliada, Maria del Pilar Lilia y Galosi, Cecilia Mónica (comps.). I Congreso de Microbiología Veterinaria. Libro de resúmenes. La Plata: Facultad de Ciencias Veterinarias, 2021.Facultad de Ciencias Veterinaria

Real and virtual biological science living laboratory for science teachers' formation : promoting global scientific literacy and critical thinking for sustainable development

Global attempts to renew scientific education aim to stop the decline of young people's interest in science and technology, and to promote the development of citizens' scientific literacy for sustainable development. Among other changes, these aims require the adaptation of K12 Biological Science Teacher’s training to meet the new objectives. Scientific literacy involves knowing science and how knowledge is developed and validated, recognizing the interactions between science, technology and society, that is, the nature of science (NoS; a set of meta-scientific contents that encompass historical, epistemological and sociological aspects of science with great value for scientific education). It also involves grasping of cognitive skills underlying critical thinking (CT; a set of cognitive abilities, including self-regulation and metacognitive processes) and creative problem solving. Therefore, scientific literacy contributes to making informed decisions, facilitating the participation of citizens in situations and dilemmas of scientific tenor. In addition, CT is closely related to the performance of educators in their professional work. Particularly, in the teaching of science, CT skills favour and enhance the learning of concepts and theories linked not only to science but also to the NoS. Considering the current conditions of middle-higher K12 Biological Science Teachers’ formation and classrooms´ limitations in our country and the region, we propose a pilot project aiming to promote the transformation of initial teachers´ training, seeking to improve the development of CT skills and to deepen NoS comprehension. It will involve the immersion of K12 Biological Science Teacher students in Biological Science Living Physical and "mirror" Virtual Reality Laboratories. These laboratories will be equipped with "do it yourself" (DIY), "do it with others" (DIWO) and "bring your own device" (BYOD) technologies for the implementation of research-type activities framed in the philosophy of the "fabrication laboratories". The virtual platform will also comprise a library with didactic resources under permissive licenses to ensure a broader impact. Within these environments, K12 Biological Science Teacher students will engage in the creation of didactic units involving problem solving and knowledge building in parallel to deeper understanding of scientific processes. We also hope to promote the creativity and innovation of the participants, and the appropriation of DIY/DIWO/BYOD and virtual reality technologies as educational resources in the classroom and everyday life. Thanks to the virtual environment, this approach would also allow to reach both National and International K12 Biological Science Teacher students and graduate Biological Science Teachers. Considering the universal access to the Internet and free access to educational platforms in several countries, we also hope to impact on the non-formal and informal Biological Science education and contribute to achieving quality education for all (Objective # 4 of the Agenda for Sustainable Development 2030, UNESCO) beyond geographical and cultural barriers. This pilot project will be implemented by an interinstitutional, multidisciplinary and international team. It will capitalize on confluent groups´ previous experience and complementary strengths in Science didactics (particularly biology), engineering, arts, virtual reality, fabrication, as well as open hardware and open software culture. The experimental approach corresponds to a quasi-experimental pre-test/post-test design with control groups, and formative and summative evaluation. As a result of the implementation of this educational innovation we expect to contribute to the improvement of Biological Science Teachers students´ CT skills and promote their active involvement in practical activities that should enhance their professional activity

Efectos de la flagelina de Proteus Mirabilis en la modulación de la respuesta inmune innata en el tracto urinario

Orientador: Dr. Pablo Zunino

Zoonotic potential and antibiotic resistance of Escherichia coli in neonatal calves in Uruguay

Escherichia coli is one of the main etiological agents of neonatal calf diarrhea (NCD). The objective of this study was to assess the presence of virulence genes, genetic diversity, and antibiotic resistance mechanisms in E. coli associated with NCD in Uruguay. PCR was used to assess the presence of intimin, Shiga-like toxin, and stable and labile enterotoxin genes. Resistance to fluoroquinolones and oxyimino-cephalosporins was estimated on Müller-Hinton agar plates. Further antibiotic disc-diffusion tests were performed to assess bacterial multi-resistance. The presence of PMQR, ESBL, MCR-1, and integron genes was evaluated. Isolates were typed using ERIC-PCR, and 20 were selected for MLST, adhesion to Hep-2 cells, in vitro biofilm formation, and eukaryotic cytotoxicity. The prevalence of ETEC genes was lower than 3% in each case (estA and elt). Six isolates were EPEC (eae+) and 2 were EHEC/STEC (eae+/stx1+). The results of a diversity analysis showed high genetic heterogenicity among isolates. Additionally, different sequence types, including ST10, ST21, and ST69, were assigned to selected isolates. Thirty-six percent (96/264) of the isolates were fluoroquinolone-resistant, with 61/96 (63.5%) being multidrug-resistant. Additionally, 6 were oxyimino-cephalosporin-resistant. The qnrB, qnrS1, and blaCTX-M-14 genes were detected, whereas no isolates carried the mcr-1 gene. Isolates had the ability to adhere to Hep-2 cells and form biofilms. Only 1 isolate expressed toxins in vitro. E. coli from NCD cases in Uruguay are very diverse, potentially virulent, and may interact with eukaryotic cells. Zoonotic potential, together with resistance traits and the presence of horizontal transfer mechanisms, may play a significant role in infections caused by these microorganisms.Fil: Umpiérrez, Ana. Instituto de Investigaciones Biológicas "Clemente Estable"; UruguayFil: Bado, Inés. Universidad de la República; UruguayFil: Oliver, Martín. Instituto de Investigaciones Biológicas "Clemente Estable"; UruguayFil: Acquistapace, Sofía. Instituto de Investigaciones Biológicas "Clemente Estable"; UruguayFil: Etcheverría, Analía Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Padola, Nora Lía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; ArgentinaFil: Vignoli, Rafael. Universidad de la República; UruguayFil: Zunino, Pablo. Instituto de Investigaciones Biológicas "Clemente Estable"; Urugua

Laboratorio de Ciencias Vivas con técnologías de código abierto

En este documento se presenta el Laboratorio de Ciencias Vivas con Técnologías de Código Abierto, creado en el marco del “Proyecto Piloto "Laboratorio de Ciencias Vivas con tecnologías `Házlo tú mismo mismo´, `Házlo con Otros´ y `Trae tu propio dispositivo`dispositivo`[ apoyado por Fondo Sectorial "Inclusión Digital Educación con Nuevos Horizontes CFE ANII (FSED_ 2 2018 1 150716 ) y desarrollado por un grupo de investigación interdisciplinario e interinstitucional integrado por Virginia E. Pellegrino1, Sandra Alonso1, Carolina Pereira1, Pablo M. Sedraschi2, Marcos I. Gimenez2, Fernando N. Acosta2, Marcos Umpiérrez2, Daniel A. Argente2, Jose Gomez-Marquez3, Anne Young3, Nikolas Albarran3, Javier Calvelo4, Martin Figares4, Maria I. Rehermann de Sagastizabal4 and Milka D. Radmilovich5 y María E. Castelló4 El Laboratorio Virtual de Ciencias Vivas consta de dos Laboratorios, uno de Fisiología y otro de Biología Celular. En el Laboratorio Virtual de Fisiología, los usuarios podrán hacer experimentos virtuales de registro de potenciales de acción en el sistema nervioso periférico de un invertebrado. Se puede visualizar registros en condiciones basales (sin estimulación) o en respuesta a distintos tipos estímulos (mecánico por una varilla o por aire a presión). En este caso se puede variar la intensidad del estímulo. De acuerdo a lo seleccionado, se pueden adquirir virtualmente registros que luego pueden ser visualizados y analizados. Por ejemplo, seleccionar una ventana teporal y contabilizar el número de potenciales estableciendo una ventana de amplitud de la señal. En el Laboratorio de Biología Celular, los usuarios podrán experimentar la Reacción de Hill. • Los laboratorios Virtuales Fisiología y Biología Celular son espacios en los que se puede aprender y experimentar sin peligro de daño personal, contaminación o pérdida de las muestras o rotura de equipos. Pueden ser descargados en sistema Ubuntu o Windows y los datos generados durante la experimentación pueden ser almacenados en las computadoras de los usuarios para posterior análisis.Agencia Nacional de Investigación e Innovació

Informe final del proyecto: Proyecto Piloto Laboratorio de Ciencias Vivas con tecnologías `Házlo tú mismo` (DIY), `Házlo con Otros´ (DIWO) y, `Trae tu propio dispositivo` [BYOD]

En Uruguay y mundialmente los jóvenes expresan bajo interés por la ciencia y las tecnologías, y se trata entonces, de renovar la educación científica para revertirlo y promover el desarrollo de la cultura científica ciudadana para el desarrollo sostenible. El principal objetivo de este proyecto, desarrollado por un equipo interinstitucional, multidisciplinario e internacional, fue promover el desarrollo de competencias de pensamiento crítico en estudiantes de las modalidades presencial y semipresencial de profesorado del CFE, potenciar la apropiación de tecnologías de bajo costo y código abierto como recursos educativos en el aula, y promover la creatividad e innovación. Se utilizó un diseño cuasi-experimental pre-test/post-test con grupo control. En el primer año se trabajó en un espacio de laboratorio físico de CFE que se equipó con tecnologías de bajo costo (MIT Little Devices Lab) y posteriormente cortadora laser, una impresora 3D, equipos de código abierto y de bajo costo de microscopía (Foldscope Instruments) y electrofisiología (Backyard Brains), herramientas e insumos de electrónica y robótica, laptop, impresora, cañón de proyección y microscopio de campo claro equipado con cámara digital. En el segundo año se desarrolló y trabajó en un laboratorio virtual interactivo de ciencias vivas que posibilitó la continuidad de la actividad práctica durante la pandemia por SARS-CoV-2. Está formado por dos estaciones experimentales descargables - Fisiología y Biología Celular- que simulan la generación de datos, que pueden ser almacenados, procesados o exportados, y una guía de recursos didácticos, disponibles en repositorio de CFE (http://repositorio.cfe.edu.uy/handle/123456789/1632). No se encontraron cambios significativos en destrezas de pensamiento crítico, probablemente debido al bajo n logrado y los trabajos-reportes elaborados por los estudiantes revelaron tanto fortalezas como debilidades. Se considera que los recursos físicos y virtuales desarrollados podrán apoyar la educación formal, no formal e informal de las ciencias y contribuir al ODS #4.Agencia Nacional de Investigación e Innovació