Metodologías para la evaluación de la agrobiodiversidad en sistemas agrícolas : atributos ecosistémicos y culturales

Spa: Este libro se fundamenta en una investigación doctoral desarrollada en la Orinoquia Colombiana a partir del segundo semestre del año 2012. El estudio, de carácter interdisciplinario, forma parte de un conjunto amplio de proyectos de investigación avalados por la Dirección de Investigaciones (DIN) por el grupo de investigación GIGASS (categoría B de Colciencias) en su Línea de Investigación de Agroecología.El documento consta de dos capítulos en los cuales se presenta una metodología para la evaluación de la agrobiodiversidad, en agroecosistemas citrícolas. La primera de ellas es la Estructura Agroecológica Principal (EAP) modificada, y la segunda, una novel e inédita metodología denominada como el Índice de Resiliencia Agroecosistémico (IRAg).Primera edició

Evaluación de la estructura agroecológica principal (EAP) en agroecosistemas citrícolas tipificados en el Departamento del Meta, Colombia

El presente trabajo de investigación corresponde a un objetivo de la tesis doctoral titulada “Resiliencia de agroecosistemas citrícolas a la variabilidad climática en el Departamento del Meta, Colombia”, que pretende responder a la pregunta de investigación: ¿Cuál es la resiliencia de los agroecosistemas citrícolas con diferentes Estructuras Agroecológicas Principales (EAP), frente a los efectos de la variabilidad climática en el departamento del Meta, Colombia? Esta pregunta surgió de un estudio previo realizado durante el año 2012 donde, a partir de un análisis estadístico de tipo multivariado, se diferenciaron seis grupos de agricultores o dominios de recomendación en la región. Se planteó como objetivo general determinar la Estructura Agroecológica Principal de los agroecosistemas citrícolas tipificados de Naranja Valencia Citrus sinensis L. (Fam. Rutácea), proyectando como hipótesis que un agroecosistema diversificado o biodiverso es más resiliente ante la ocurrencia de disturbios de origen hidroclimático o fitosanitario. Para corroborar lo anterior en cada en cada grupo tipificado y caracterizado se seleccionaron tres fincas tipo (18 en total) donde se evaluaron los diez parámetros de la EAP (sin ponderación), relacionándolos con la productividad (t/ha) y el número de controles fitosanitarios/año. Los resultados obtenidos evidenciaron que a mayor desarrollo de la EAP, la productividad aumenta; en forma similar se encontró que agroecosistemas con EAP articuladas, se efectúa menor número de fumigaciones, y que a menor número de controles fitosanitarios/año, asociado a una alta EAP, mayor es la productividad (t/ha/año). Con este trabajo se avanzó de igual manera en la relación conceptual de la EAP como una Estructura Disipativa (ED) de adaptación, la cual se origina en la ocurrencia del disturbio y se nutre del intercambio de materia, energía e información, e incide disminuyendo la vulnerabilidad de los sistemas agrícolas.This research corresponds to an objective of the doctoral thesis entitled "Resilience to climate citrus variability in the Department of Meta, Colombia", which aims to answer the research question: ¿What is the resilience of citrus agroecosystems with different Principal Agroecological Structure (EAP), against the effects of climate variability in the department of Meta, Colombia? This question arose from a previous study in 2012 where, from a statistical analysis of multivariate type six farmer groups or recommendation domains differ in the region. It was raised as a general objective to determine the Principal Agroecological Structure of citrus agro established in Valencia Orange Citrus sinensis L. (Fam. Rutaceae), projecting the hypothesis that a diversified agro-ecosystem is more resilient biodiverse or upon the occurrence of riots or hydro-plant origin. To corroborate this in each in each group defined and characterized three type farms (18 in total) where the ten parameters were evaluated EAP (unweighted), relating to productivity (t/ha) and the number of controls were selected phytosanitary/year. The results showed that the greater development of the EAP, productivity increases; similarly it found that agro EAP articulated fewer spraying is carried out, and that fewer pesticides/year controls associated with high EAP, higher productivity (ton/ha/year). With this work progressed equally in the conceptual relationship of the EAP as a dissipative structure (ED) adaptation, which arises from the occurrence of the disturbance and nourishes the exchange of matter, energy and information, and affects decreasing vulnerability of agricultural systems.Eje: A1 Sistemas de producción de base agroecológica (Trabajos científicos).Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Evaluación de la estructura agroecológica principal (EAP) en agroecosistemas citrícolas tipificados en el Departamento del Meta, Colombia

El presente trabajo de investigación corresponde a un objetivo de la tesis doctoral titulada “Resiliencia de agroecosistemas citrícolas a la variabilidad climática en el Departamento del Meta, Colombia”, que pretende responder a la pregunta de investigación: ¿Cuál es la resiliencia de los agroecosistemas citrícolas con diferentes Estructuras Agroecológicas Principales (EAP), frente a los efectos de la variabilidad climática en el departamento del Meta, Colombia? Esta pregunta surgió de un estudio previo realizado durante el año 2012 donde, a partir de un análisis estadístico de tipo multivariado, se diferenciaron seis grupos de agricultores o dominios de recomendación en la región. Se planteó como objetivo general determinar la Estructura Agroecológica Principal de los agroecosistemas citrícolas tipificados de Naranja Valencia Citrus sinensis L. (Fam. Rutácea), proyectando como hipótesis que un agroecosistema diversificado o biodiverso es más resiliente ante la ocurrencia de disturbios de origen hidroclimático o fitosanitario. Para corroborar lo anterior en cada en cada grupo tipificado y caracterizado se seleccionaron tres fincas tipo (18 en total) donde se evaluaron los diez parámetros de la EAP (sin ponderación), relacionándolos con la productividad (t/ha) y el número de controles fitosanitarios/año. Los resultados obtenidos evidenciaron que a mayor desarrollo de la EAP, la productividad aumenta; en forma similar se encontró que agroecosistemas con EAP articuladas, se efectúa menor número de fumigaciones, y que a menor número de controles fitosanitarios/año, asociado a una alta EAP, mayor es la productividad (t/ha/año). Con este trabajo se avanzó de igual manera en la relación conceptual de la EAP como una Estructura Disipativa (ED) de adaptación, la cual se origina en la ocurrencia del disturbio y se nutre del intercambio de materia, energía e información, e incide disminuyendo la vulnerabilidad de los sistemas agrícolas.This research corresponds to an objective of the doctoral thesis entitled "Resilience to climate citrus variability in the Department of Meta, Colombia", which aims to answer the research question: ¿What is the resilience of citrus agroecosystems with different Principal Agroecological Structure (EAP), against the effects of climate variability in the department of Meta, Colombia? This question arose from a previous study in 2012 where, from a statistical analysis of multivariate type six farmer groups or recommendation domains differ in the region. It was raised as a general objective to determine the Principal Agroecological Structure of citrus agro established in Valencia Orange Citrus sinensis L. (Fam. Rutaceae), projecting the hypothesis that a diversified agro-ecosystem is more resilient biodiverse or upon the occurrence of riots or hydro-plant origin. To corroborate this in each in each group defined and characterized three type farms (18 in total) where the ten parameters were evaluated EAP (unweighted), relating to productivity (t/ha) and the number of controls were selected phytosanitary/year. The results showed that the greater development of the EAP, productivity increases; similarly it found that agro EAP articulated fewer spraying is carried out, and that fewer pesticides/year controls associated with high EAP, higher productivity (ton/ha/year). With this work progressed equally in the conceptual relationship of the EAP as a dissipative structure (ED) adaptation, which arises from the occurrence of the disturbance and nourishes the exchange of matter, energy and information, and affects decreasing vulnerability of agricultural systems.Eje: A1 Sistemas de producción de base agroecológica (Trabajos científicos).Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Evaluación de la estructura agroecológica principal (EAP) en agroecosistemas citrícolas tipificados en el Departamento del Meta, Colombia

El presente trabajo de investigación corresponde a un objetivo de la tesis doctoral titulada “Resiliencia de agroecosistemas citrícolas a la variabilidad climática en el Departamento del Meta, Colombia”, que pretende responder a la pregunta de investigación: ¿Cuál es la resiliencia de los agroecosistemas citrícolas con diferentes Estructuras Agroecológicas Principales (EAP), frente a los efectos de la variabilidad climática en el departamento del Meta, Colombia? Esta pregunta surgió de un estudio previo realizado durante el año 2012 donde, a partir de un análisis estadístico de tipo multivariado, se diferenciaron seis grupos de agricultores o dominios de recomendación en la región. Se planteó como objetivo general determinar la Estructura Agroecológica Principal de los agroecosistemas citrícolas tipificados de Naranja Valencia Citrus sinensis L. (Fam. Rutácea), proyectando como hipótesis que un agroecosistema diversificado o biodiverso es más resiliente ante la ocurrencia de disturbios de origen hidroclimático o fitosanitario. Para corroborar lo anterior en cada en cada grupo tipificado y caracterizado se seleccionaron tres fincas tipo (18 en total) donde se evaluaron los diez parámetros de la EAP (sin ponderación), relacionándolos con la productividad (t/ha) y el número de controles fitosanitarios/año. Los resultados obtenidos evidenciaron que a mayor desarrollo de la EAP, la productividad aumenta; en forma similar se encontró que agroecosistemas con EAP articuladas, se efectúa menor número de fumigaciones, y que a menor número de controles fitosanitarios/año, asociado a una alta EAP, mayor es la productividad (t/ha/año). Con este trabajo se avanzó de igual manera en la relación conceptual de la EAP como una Estructura Disipativa (ED) de adaptación, la cual se origina en la ocurrencia del disturbio y se nutre del intercambio de materia, energía e información, e incide disminuyendo la vulnerabilidad de los sistemas agrícolas.This research corresponds to an objective of the doctoral thesis entitled "Resilience to climate citrus variability in the Department of Meta, Colombia", which aims to answer the research question: ¿What is the resilience of citrus agroecosystems with different Principal Agroecological Structure (EAP), against the effects of climate variability in the department of Meta, Colombia? This question arose from a previous study in 2012 where, from a statistical analysis of multivariate type six farmer groups or recommendation domains differ in the region. It was raised as a general objective to determine the Principal Agroecological Structure of citrus agro established in Valencia Orange Citrus sinensis L. (Fam. Rutaceae), projecting the hypothesis that a diversified agro-ecosystem is more resilient biodiverse or upon the occurrence of riots or hydro-plant origin. To corroborate this in each in each group defined and characterized three type farms (18 in total) where the ten parameters were evaluated EAP (unweighted), relating to productivity (t/ha) and the number of controls were selected phytosanitary/year. The results showed that the greater development of the EAP, productivity increases; similarly it found that agro EAP articulated fewer spraying is carried out, and that fewer pesticides/year controls associated with high EAP, higher productivity (ton/ha/year). With this work progressed equally in the conceptual relationship of the EAP as a dissipative structure (ED) adaptation, which arises from the occurrence of the disturbance and nourishes the exchange of matter, energy and information, and affects decreasing vulnerability of agricultural systems.Eje: A1 Sistemas de producción de base agroecológica (Trabajos científicos).Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

The Principal Agroecological Structure (PAS): a new tool for planning agroecosystems

1 recurso en línea (páginas 441-449) : ilustraciones color.This document presents, from the environmental prespective (ecosystem-culture relationships), the concept of the Principal Agroecological Structure (PAS) of agroecosystems, considered a dissipative structure. It discusses possible applications (resilience, production, and diversity) both inside and outside farms. The PAS can be useful in land use planning on farms, based on the concept of potential PAS, which allows for the quantification of the management of internal and external corridors, including natural vegetation. At the same time, it can be useful in the context of landscape management because it shows a series of cultural relationships (economic, social, symbolic and technological), hidden from the partial analysis of landscape ecology.Este documento presenta a partir del pensamiento ambiental (relaciones ecosistema-cultura): el concepto de la Estructura Agroecológica Principal (EAP), de los agroecosistemas mayores considerada como una estructura disipativa de orden cultural y se discute sus posibles aplicaciones (resiliencia, producción, diversidad) al interior como al exterior de las fincas. La EAP puede ser útil en la planificación del uso de la tierra, teniendo en cuenta el concepto de la EAP potencial (que permite cuantificar el manejo de los corredores internos y externos, incluyendo la vegetación natural). Al mismo tiempo, puede ser utilizada en el contexto del ordenamiento territorial, porque visibiliza una serie de relaciones culturales (económicas, sociales, simbólicas y tecnológicas) ocultas desde el análisis parcial de la ecología del paisaje.Bibliografía: páginas 447-449

Gallstones, Body Mass Index, C-Reactive Protein, and Gallbladder Cancer: Mendelian Randomization Analysis of Chilean and European Genotype Data

BACKGROUND AND AIMS: Gallbladder cancer (GBC) is a neglected disease with substantial geographical variability: Chile shows the highest incidence worldwide, while GBC is relatively rare in Europe. Here, we investigate the causal effects of risk factors considered in current GBC prevention programs as well as C-reactive protein (CRP) level as a marker of chronic inflammation. APPROACH AND RESULTS: We applied two-sample Mendelian randomization (MR) using publicly available data and our own data from a retrospective Chilean and a prospective European study. Causality was assessed by inverse variance weighted (IVW), MR-Egger regression, and weighted median estimates complemented with sensitivity analyses on potential heterogeneity and pleiotropy, two-step MR, and mediation analysis. We found evidence for a causal effect of gallstone disease on GBC risk in Chileans (P = 9 × 10−5) and Europeans (P = 9 × 10−5). A genetically elevated body mass index (BMI) increased GBC risk in Chileans (P = 0.03), while higher CRP concentrations increased GBC risk in Europeans (P = 4.1 × 10−6). European results suggest causal effects of BMI on gallstone disease (P = 0.008); public Chilean data were not, however, available to enable assessment of the mediation effects among causal GBC risk factors. CONCLUSIONS: Two risk factors considered in the current Chilean program for GBC prevention are causally linked to GBC risk: gallstones and BMI. For Europeans, BMI showed a causal effect on gallstone risk, which was itself causally linked to GBC risk. (Hepatology 2021;73:1783-1796).Fil: Barahona Ponce, Carol. Ruprecht Karls Universitat Heidelberg; Alemania. Universidad de Chile; ChileFil: Scherer, Dominique. Ruprecht Karls Universitat Heidelberg; AlemaniaFil: Brinster, Regina. Ruprecht Karls Universitat Heidelberg; AlemaniaFil: Boekstegers, Felix. Ruprecht Karls Universitat Heidelberg; AlemaniaFil: Marcelain, Katherine. Universidad de Chile; ChileFil: Gárate Calderón, Valentina. Ruprecht Karls Universitat Heidelberg; Alemania. Universidad de Chile; ChileFil: Müller, Bettina. Instituto Nacional del Cáncer; ChileFil: de Toro, Gonzalo. Hospital Puerto Montt; Chile. Universidad Austral de Chile; ChileFil: Retamales, Javier. Instituto Nacional del Cáncer; ChileFil: Barajas, Olga. Universidad de Chile; ChileFil: Ahumada, Monica. Universidad de Chile; ChileFil: Morales, Erik. Hospital Regional de Talca; Chile. Universidad Católica del Maule; ChileFil: Rojas, Armando. Universidad Católica del Maule; ChileFil: Sanhueza, Verónica. Hospital Padre Hurtado; ChileFil: Loader, Denisse. Hospital Padre Hurtado; ChileFil: Rivera, María Teresa. Hospital del Salvador; ChileFil: Gutiérrez, Lorena. Hospital San Juan de Dios; ChileFil: Bernal, Giuliano. Universidad Católica del Norte; ChileFil: Ortega, Alejandro. Hospital Regional; ChileFil: Montalvo, Domingo. Hospital Regional Juan Noé Crevani; ChileFil: Portiño, Sergio. Universidad de Chile; ChileFil: Bertrán, Maria Enriqueta. Ministerio de Salud; ChileFil: Gabler, Fernando. Universidad de Santiago de Chile. Hospital Clinico San Borja Arriaran; ChileFil: Spencer, Loreto. Hospital Regional Guillermo Grant Benavente; ChileFil: Olloquequi, Jordi. Universidad Autónoma de Chile; ChileFil: Fischer, Christine. Ruprecht Karls Universitat Heidelberg; AlemaniaFil: Jenab, Mazda. International Agency For Research On Cancer; AlemaniaFil: Aleksandrova, Krasimira. German Institute Of Human Nutrition; AlemaniaFil: Katzke, Verena. German Cancer Research Center; AlemaniaFil: Gonzalez-Jose, Rolando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; Argentin

Development and internal validation of a multifactorial risk prediction model for gallbladder cancer in a high-incidence country

Since 2006, Chile has been implementing a gallbladder cancer (GBC) prevention program based on prophylactic cholecystectomy for gallstone patients aged 35 to 49 years. The effectiveness of this prevention program has not yet been comprehensively evaluated. We conducted a retrospective study of 473 Chilean GBC patients and 2137 population-based controls to develop and internally validate three GBC risk prediction models. The Baseline Model accounted for gallstones while adjusting for sex and birth year. Enhanced Model I also included the non-genetic risk factors: body mass index, educational level, Mapuche surnames, number of children and family history of GBC. Enhanced Model II further included Mapuche ancestry and the genotype for rs17209837. Multiple Cox regression was applied to assess the predictive performance, quantified by the area under the precision-recall curve (AUC-PRC) and the number of cholecystectomies needed (NCN) to prevent one case of GBC at age 70 years. The AUC-PRC for the Baseline Model (0.44%, 95%CI 0.42-0.46) increased by 0.22 (95%CI 0.15-0.29) when non-genetic factors were included, and by 0.25 (95%CI 0.20-0.30) when incorporating non-genetic and genetic factors. The overall NCN for Chileans with gallstones (115, 95%CI 104-131) decreased to 92 (95%CI 60-128) for Chileans with a higher risk than the median according to Enhanced Model I, and to 80 (95%CI 59-110) according to Enhanced Model II. In conclusion, age, sex and gallstones are strong risk factors for GBC, but consideration of other non-genetic factors and individual genotype data improves risk prediction and may optimize allocation of financial resources and surgical capacity.Fil: Boekstegers, Felix. Ruprecht Karls Universitat Heidelberg; AlemaniaFil: Scherer, Dominique. Ruprecht Karls Universitat Heidelberg; AlemaniaFil: Barahona Ponce, Carol. Ruprecht Karls Universitat Heidelberg; AlemaniaFil: Marcelain, Katherine. Universidad de Chile; ChileFil: Gárate Calderón, Valentina. Universidad de Chile; ChileFil: Waldenberger, Melanie. No especifíca;Fil: Morales, Erik. Universidad Católica de Maule; ChileFil: Rojas, Armando. Universidad Católica de Maule; ChileFil: Munoz, César. Universidad Católica de Maule; ChileFil: Retamales, Javier. Instituto Nacional del Cáncer; ChileFil: de Toro, Gonzalo. Universidad Austral de Chile; ChileFil: Barajas, Olga. Universidad de Chile; ChileFil: Rivera, María Teresa. Hospital del Salvador; ChileFil: Cortés, Analía. Hospital del Salvador; ChileFil: Loader, Denisse. Hospital Padre Hurtado; ChileFil: Saavedra, Javiera. Hospital Padre Hurtado; ChileFil: Gutiérrez, Lorena. Hospital San Juan de Dios; ChileFil: Ortega, Alejandro. Hospital Regional; ChileFil: Bertrán, Maria Enriqueta. Hospital Base de Valdivia; ChileFil: Bartolotti, Leonardo. Hospital Base de Valdivia; ChileFil: Gabler, Fernando. Hospital Clínico San Borja Arriarán; ChileFil: Campos, Mónica. Hospital Clínico San Borja Arriarán; ChileFil: Alvarado, Juan. Hospital Regional de Concepción - Dr. Guillermo Grant Benavente; ChileFil: Moisán, Fabricio. Hospital Regional de Concepción - Dr. Guillermo Grant Benavente; ChileFil: Spencer, Loreto. Hospital Regional de Concepción - Dr. Guillermo Grant Benavente; ChileFil: Nervi, Bruno. No especifíca;Fil: Carvajal Hausdorf, Daniel. Universidad del Desarrollo; ChileFil: Losada, Héctor. Universidad de La Frontera; ChileFil: Almau, Mauricio. Hospital de Rancagua; ChileFil: Fernández, Plinio. Hospital de Rancagua; ChileFil: Olloquequi, Jordi. Universidad de Barcelona; EspañaFil: Fuentes Guajardo, Macarena. Universidad de Tarapacá; ChileFil: Gonzalez-Jose, Rolando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; ArgentinaFil: Bortolini, Maria Cátira. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; BrasilFil: Acuña Alonzo, Victor. No especifíca;Fil: Gallo, Carla. Universidad Peruana Cayetano Heredia; PerúFil: Ruiz-Linares, Andres. Colegio Universitario de Londres; Reino UnidoFil: Rothhammer, Francisco. Universidad de Tarapacá; ChileFil: Lorenzo Bermejo, Justo. Ruprecht Karls Universitat Heidelberg; Alemani

Mendelian Randomization Analysis of the Relationship Between Native American Ancestry and Gallbladder Cancer Risk

Background A strong association between the proportion of Native American ancestry and the risk of gallbladder cancer (GBC) has been reported in observational studies. Chileans show the highest incidence of GBC worldwide, and the Mapuche are the largest Native American people in Chile. We set out to investigate the causal association between Native American Mapuche ancestry and GBC risk, and the possible mediating effects of gallstone disease and body mass index (BMI) on this association. Methods Markers of Mapuche ancestry were selected based on the informativeness for assignment measure and then used as instrumental variables in two-sample mendelian randomization (MR) analyses and complementary sensitivity analyses. Result We found evidence of a causal effect of Mapuche ancestry on GBC risk (inverse variance-weighted (IVW) risk increase of 0.8% for every 1% increase in Mapuche ancestry proportion, 95% CI 0.4% to 1.2%, p = 6.6×10-5). Mapuche ancestry was also causally linked to gallstone disease (IVW risk increase of 3.6% per 1% increase in Mapuche proportion, 95% CI 3.1% to 4.0%, p = 1.0×10-59), suggesting a mediating effect of gallstones in the relationship between Mapuche ancestry and GBC. In contrast, the proportion of Mapuche ancestry showed a negative causal effect on BMI (IVW estimate -0.006 kg/m2 per 1% increase in Mapuche proportion, 95% CI -0.009 to -0.003, p = 4.4×10-5). Conclusions The results presented here may have significant implications for GBC prevention and are important for future admixture mapping studies. Given that the association between Mapuche ancestry and GBC risk previously noted in observational studies appears to be causal, primary and secondary prevention strategies that take into account the individual proportion of Mapuche ancestry could be particularly efficient