Comparative Analysis of Skin Cancer Image with Classification and Clustering Algorithms

Skin cancer is one of the most common and potentially life-threatening diseases worldwide. Early detection and accurate diagnosis are crucial for effective treatment and improved patient outcomes. In recent years, the integration of advanced technologies, such as artificial intelligence and image analysis, has revolutionized the field of dermatology. This article presents a comprehensive comparative analysis of algorithms for classifying and clustering skin cancer images. The goal is to improve the accuracy and efficiency of skin cancer diagnosis. The study explores various machine learning algorithms used for skin cancer image classification, such as support vector machines (SVM), decision trees, and k-nearest neighbors (KNN). These algorithms are evaluated based on their capacity to distinguish between benign and malignant skin lesions, with a particular emphasis on sensitivity, specificity, and accuracy. Apart from classification, clustering algorithms are also examined to determine their potential in grouping similar skin lesions. This can assist dermatologists in identifying patterns and anomalies within extensive datasets. K-means, hierarchical clustering, and DBSCAN are among the algorithms assessed for their effectiveness in organizing images of skin cancer. The comparative analysis in this article aims to provide insights into the strengths and weaknesses of various algorithms, their computational efficiency, and their performance on diverse datasets. Furthermore, it explores the potential of combining classification and clustering techniques to develop a skin cancer diagnosis system that is more robust and accurate

Uncovering a Regulatory Switch Controlling Tomato Fruit Ripening

AP2 is a major regulator of tomato fruit ripening and in the fruit pericarp, AP2a regulates the expression of CNR in a negative attitude [7]. Levels of CNR and AP2 gene expression in Wild-type tomato and Mutant type tomato were compared in order to investigate the mechanism of ethylene action [1]. This study is explained the relationship with types (Rin, Nor, Mutant and Wild) and time (breakpoints) for AP2 and CNR levels. The linear model and weighted least square model are created with the type and time variables for these levels. It was found that, AP2 level is not affected by time point. However, CNR level can be changed with type and time points.

Investigation of probability literacy test in terms of differential item function by methods based on item response theory

Test geliştirme sürecinin birçok adımı vardır. Bu süreçte en önemli adım, testin geçerliliğini ve güvenilirliğini belirlemektir. Madde yanlılığını belirlemek ise, testin geçerliliği ve güvenilirliği için önemli bir kavramdır. Bir maddenin yanlı olması için, Değişen Madde Fonksiyonu içermesi gerekir. Bununla birlikte, yalnızca DMF'nin varlığı, maddeyi yanlı yapmaz. Maddeye verilen cevaplardaki farklılık, alt gruplardaki deneklerin yetenek düzeylerinde farklılık ortaya çıktığında olması gereken bir durumdur. Bu durumu yanlılık olarak yorumlamak doğru değildir. Heterojen bir popülasyon üzerinde bir test yapılacaksa, yanlılık analizi ölçüm sürecinin en önemli bileşeni haline gelir. Buradaki en önemli hedef denekler için adil, hassas ve duyarlı ölçümler yapmaktır. Bu çalışmada, Karadeniz Teknik Üniversitesi İstatistik ve Bilgisayar Bilimleri Bölümü'ndeki 3. ve 4. sınıf öğrencilerinin olasılık teorisi okuryazarlık düzeyleri ölçülmüştür. 3. ve 4. sınıf öğrencilerine 10 maddelik bir okuryazarlık testi uygulanmıştır. Öğrencilerin cevaplarına göre cinsiyet ve sınıf seviyesinde yanlılık analizi yapılmıştır. DMF analizi yaparken, Raju’nun Alan Ölçümü ve Lord’un ... İstatistiği kullanılmıştır. Analizler R yazılımı kullanılarak yapılmıştır. DMF içeren maddeler için uzman görüşüne başvurulmuştur. Analiz sonuçlarına göre, bazı test maddelerinin cinsiyet ve sınıf düzeylerine göre yanlı olduğu tespit edilmiştir.The process of test development has many steps. The most important step in this process is to determine the validity and reliability of the test. Detection of item bias is an important concept for the validity and reliability of test. In order for an item to be biased, it must contain differential item function (DIF). However, the presence of DIF alone does not make the item biased. When there are differences in the skill levels of the subjects in the sub-groups, it is expected that there will be differences in the responses to the item. Nevertheless, it is not correct to interpret this situation as bias. If a test is to be performed on a heterogeneous population, bias analysis becomes the most important component of the measurement process. The primary objective here is to make fair, precise and sensitive measurement for subjects. In this study, probability theory literacy levels of 3rd and 4th grade students at the Department of Statistics and Computer Sciences of Karadeniz Technical University were measured. A 10-item literacy test was applied to all 3rd and 4th grade students. According to the answers of the students, bias analysis was conducted on gender and class level. When performing DIF analysis, Raju’s Area Measurement and Lord’s ...Statistics were used with the help of R software. Expert opinion was consulted for items containing DIF. According to the results of the analysis, some test items were found to be biased by gender and grade levels

Hemşehri Dernekleri, Hemşehrilik Bilinci ve Kentlileşme İlişkisi Üzerine Bir Araştırma: İstanbul/Sultangazi’deki Karslı Hemşehri Dernekleri Örneği

Farklısosyal ve kültürel özelliklere sahip grupların, kentsel yaşam kurallarıçerçevesinde yaşamlarınısürdürdükleri yer olarak tanımlanabilecek olan kent, kırsal kesimde hızlınüfus artışı, tarım alanlarının bölünmesi, tarım alanlarında makineleşme, kentlerde işimkanlarının artması, kentsel yaşamın sosyal ve kültürel açıdan daha cazip hale gelmesi gibi nedenlerle kırsal kesimlerden veya yaşam standartlarıbakımından daha düşük imkanlara sahip yerleşim yerlerinden göç eden insanların yerleşmeleriyle birlikte, fiziksel ve sosyal dokularında bazıdeğişimlere uğramakta ve bu değişim aynızamanda bu kentlerde bir çok problemi de beraberinde getirmektedir. Göç alan kentlerde ortaya çıkan sorunlar arasında; göç sonucu kente gelenlerin daha çok herhangi bir mesleğe mensup olmayan insanlardan olmasıonların kentlerde işbulmalarınızorlaştırmakta veya daha düşük gelirli ve kötü şartlarda çalışmalarına neden olmaktadır. Yine ayrıca hızlıgöç nedeniyle kentteki yapılaşmanın ihtiyacıkarşılayamamasıgecekondu sorununu da beraberinde getirmektedir. Bunlara ilaveten, kentlerdeki altyapı, ulaşım ve çevre sorunları, bölgelerarasıyatırımlarda, kentleşme oranlarında ve nüfus yoğunluklarında eşitsizlik, kente göç edenlerin kentle bütünleşememe gibi sorunlar ortaya çıkmaktadır. özellikle metropol kentlerde ortaya çıkan hırsızlık, kapkaççılık gibi suçların artmasıda kentlerde ortaya çıkan sorunlar arasında sayılabilir. Türkiye’de; 1950’lerle birlikte ortaya çıkan sanayileşme süreci ve buna paralel olarak tarımdaki hızlımakineleşme, yine kırsal kesimde toprak-nüfus dengesinin değişmesi, işsizlik, gelir yetersizliği, kentlerin olanaklarından yararlanma isteği gibi nedenler, göçlerin nedenleri arasındadır. Göçler, genel olarak geri kalmışbölge ve kentlerden daha gelişmişbölge ve kentlere doğru yaşanmaktadır. 1980’li yıllarda ise göç nedenleri arasına terör de eklenmiştir. Bu tarihten sonraki göçler, kırdan kente değil de kentlerden kentlere doğru ağırlık kazanmaya başlamıştır. Teröre ilaveten, Güneydoğu Anadolu Projesi GAP kapsamında yapılan barajlar da göçü tetiklemiştir. Gaziantep, Diyarbakır, Şanlıurfa gibi kentler, “zorunlu göç”lerin yaşanmasıyla birlikte, nüfuslarında ciddi anlamda artışolan kentler arasında sayılabilir. Sanayileşmeyle birlikte başlayan söz konusu göç hareketleri, kentlerin oluşmasına ve kentlerde olumlu veya olumsuz birtakım etkilerin ortaya çıkmasına yol açmıştır. Kırsal kesimden kente göç eden bireylere yardımcıolan hemşehri dernekleri, göç edenler için önemli bir yere sahiptir. Hemşehri dernekleri, hemşehrilik bilincinin ve hemşehri dayanışmasının oluşmasında etkili bir kurumdur. Bu çalışmada hemşehri derneklerinin, kentlileşme ve hemşehrilik bilinci üzerinde etkisinin olup olmadığıyapılan anket çalışmasıyla ortaya konulmuştur. Bu bağlamda önce yapılan teorik araştırmalarda, Türkiye’de kentleşme sürecine bakılarak kentleşmenin nedenleri, sonuçlarıve ortaya çıkardığısorunlar irdelenmiş, daha sonra da kentleşmeyle birlikte kentlerde dayanışma ve yardımlaşma amacıyla kurulan hemşehri dernekleri ve hemşehri derneklerinin kentlileşme ve hemşehrilik bilinci üzerindeki etkisi değerlendirilmiştir

Determination Of Sample Size In Survival Analysis Using Group Sequential Test Methods

Bu çalışmada, grup ardışık test yöntemlerinin sağkalım analizinde uygulamaları için kullanılabilecek uygun örnek hacmi büyüklüğü değerleri araştırıldı. Klinik çalışmalarda iki tedavi yöntemi/grubu karşılaştırılıyorsa, çalışmanın sonu beklenmeden hangi tedavi yönteminin/grubunun daha iyi sonuç verdiği grup ardışık test yöntemleri ile tespit edilebilir. Böylece belli bir aşamadan sonra hastalar diğer tedavi yöntemine/grubuna yönlendirilerek, hastaların sağkalım süreleri uzatılabilir. Bu tür çalışmalarda örnek hacminin kaç alınacağı ve hastalardan ne kadarının ölü olacağı, ne kadarının sansürlü olacağı önemli bir sorundur. Bunun için grup ardışık test yöntemlerinde kullanılan 5 harcama fonksiyonu için simülasyon çalışması yapıldı. Her bir harcama fonksiyonu için örnek hacmi değerleri ve çalışmada gerçekleşmesi beklenen ölü birey sayıları bulundu

Determination Of Sample Size In Survival Analysis Using Group Sequential Test Methods

Bu çalışmada, grup ardışık test yöntemlerinin sağkalım analizinde uygulamaları için kullanılabilecek uygun örnek hacmi büyüklüğü değerleri araştırıldı. Klinik çalışmalarda iki tedavi yöntemi/grubu karşılaştırılıyorsa, çalışmanın sonu beklenmeden hangi tedavi yönteminin/grubunun daha iyi sonuç verdiği grup ardışık test yöntemleri ile tespit edilebilir. Böylece belli bir aşamadan sonra hastalar diğer tedavi yöntemine/grubuna yönlendirilerek, hastaların sağkalım süreleri uzatılabilir. Bu tür çalışmalarda örnek hacminin kaç alınacağı ve hastalardan ne kadarının ölü olacağı, ne kadarının sansürlü olacağı önemli bir sorundur. Bunun için grup ardışık test yöntemlerinde kullanılan 5 harcama fonksiyonu için simülasyon çalışması yapıldı. Her bir harcama fonksiyonu için örnek hacmi değerleri ve çalışmada gerçekleşmesi beklenen ölü birey sayıları bulundu

Cox Oransal Hazard Modelinde Kayıp Veri Analizi Yöntemlerinin Karşılaştırılması

Data with missing value are common in clinical studies. This study investigated to assess the effects of different missing data analysis techniques on the performance of Cox proportional hazard model. Material and Methods: In order to see how sample size and missing rate effect the missing data analysis techniques, we derived the survival data with 25, 50 and 100 sample sizes. Some elements of the survival data with different sample size were deleted in different rates under MAR (Missing at Random) assumption to generate incomplete data sets which had 5%, 10%, 20% and 40% missing value for each data. Data sets with missing values were completed by five missing data analysis techniques (complete case Analysis-CCA, mean imputation, regression imputation-REG, expectation maximization-EM algorithm, multiple imputation-MI). The new completed data sets were analyzed by Cox proportional hazard model and their results were compared with results of original data. Results: The difference between the techniques grew for increasing missing rate and while the sample size increased the methods were similar to each other. CCA was the most affected from sample size. The estimates from the methods REG, EM and MI were very similar to each other and real value. Conclusion: Multiple imputation method as impute more than one value for each missing value should be preferred instead of single imputation methods as impute only one value for each missing value

The neurotoxic effects of prenatal gabapentin and oxcarbazepine exposure on newborn rats

WOS: 000450690600016PubMed: 28931341Aim: Teratogenicity is a problematic issue for pregnant women because of X-ray radiation, drugs, and genetic and unknown variables. First-generation antiepileptic drugs (AED) like valproic acid are well-known teratogens for developing fetuses. However, their usage is necessary in order to prevent maternal seizures. The underlying mechanism of birth defects associated with AED exposure remains unclear and information about the neurotoxic effects of prenatal exposure to AED is still limited. Oxcarbazepine (OXC) and gabapentin (GBP) are second-generation AED. It still remains unclear how much these drugs are safe during pregnancy. This study aimed to investigate whether any neurotoxic effect of OXC and GBP in utero exposure on the developing brain. Methods: Eighteen pregnant Wistar albino rats were divided into six groups. The first group was exposed to OXC at 100 mg/kg/day, the second to GBP at 50 mg/kg/day, and third to saline (0.9% NaCl) at 1.5 ml/day between the first and the fifth days of gestation. The same procedure was applied at the same dosages between the 6th and the 15th days of gestation for the 2nd three groups. Five female offspring (total n = 30, 45 days old) were taken from each group and stereological methods were applied in order to analyze the total and dopaminergic neuron number of the substantia nigra pars compacta (SNc). Conclusion: The result is that the OXC and GBP exposure at different gestational periods may not give rise to congenital malformation and it appears that the GBP exposure during the organogenesis period proliferatively affects the total number of neurons.Ondokuz Mayis University's Scientific Research Project Office [PYO.TIP.1904.10.025]Ondokuz Mayis University's Scientific Research Project Office supported this project (project number: PYO.TIP.1904.10.025). We wish to thank Biopharma Drug Company for their support in providing the drugs

Rüptüre posterior fossa arteriovenöz malformasyonlarda hematom volümü ile klinik sonuç arasındaki ilişki ve hematomun cerrahi tedavisinin önemi

AMAÇ: Rüptüre posterior fossa arteriovenöz malformasyonlarda hematom volümü ile klinik sonuç arasındaki İlişki retrospektif olarak değerlendirildi. YÖNTEM ve GEREÇ: 1998 ile 2009 arasında kliniğimizde 127 hasta intrakranyal arteriovenöz malformasyon nedeniyle mikrocerrahi ile ameliyat edildi. Bu hastaların 15 tanesi (%11,8) posterior fossa AVM’si idi. Bu Serebellar AVM li hastaların da 12’si serebellar hematoma ile başvurdu. Serebellar hematomlu AVM hastalarının; ameliyat öncesi modifiye Rankin Skalası (mRS), Spetzler-Martin grade (SMG) ve hematom volümü, ameliyat sonrası modifiye Rankin Skalası ile karşılaştırmalı olarak değerlendirildi. BULGULAR: Postoperatif mRS skoru istatistiksel olarak anlamlı şekilde preoperatif skordan daha düşük bulundu (p=0,0001). Postoperatif klinik sonuç; AVM’nin SMG’I (r=0,67, p=0,033), hematom volümü (r=0,537, p=0,072) ve preoperatif mRS (r=0,764, p=0,004) ile uyumlu bulundu. Nörolojik defisit AVM’nin SMG’i ile uyumlu şekilde artmış idi. İncelemeler göstermektedir ki, postoperatif mRS, preoperatif mRS, hematom volümü ve SMG ile daha fazla ilişkilidir. SONUÇ: Posterior fossa AVM ler, kanama riski ile beraber artan morbidite ve mortalite riski taşıyan kompleks nörovasküler lezyonlardır. Hematomlu vakalar acil şekilde opere edilmelidir. Hematom volümü klinik sonuç ile ilişkidir. Biz hematom hacminin, postoperatif klinik sonuç ve prognoz üzerinde etkili bir faktör olduğu sonucuna vardık. Ayrıca preoperatif SMG ve mRS de klinik sonuç üzerinde etkilidir.AIM: The correlation between hematoma volume and outcome in ruptured arteriovenous malformations (AVM) with accompanying posterior fossa hematoma was retrospectively evaluated. MATERIAL and METHODS: Microsurgery operations were performed on 127 patients with intracranial AVM between January 1998 and January 2009 at our clinic. Fifteen (11.8%) patients were identified as suffering from posterior fossa AVM, and twelve of these patients presented with a cerebellar hematoma. All patients were clinically evaluated according to the following criteria: modified Rankin Scale (mRS) prior to surgery, Spetzler-Martin grade (SMG) of the AVMs, hematoma volume prior to surgery, and mRS following surgery. RESULTS: Postoperative mRS scores were significantly lower than preoperative scores (p=0.0001). Postoperative outcomes were concordant with the SMG of the AVMs (r=0.67, p=0.033), hematoma volume (r=0.537, p=0.072) and preoperative mRS scores (r=0.764, p=0.004). These analyses show that the postoperative mRS score is strongly correlated with a preoperative mRS score, hematoma volume and SMG. CONCLUSION: Posterior fossa AVMs present an increased risk for hemorrhage and for increased morbidity and mortality. Cases with hematoma should be operated on an urgent basis. We conclude that hematoma volume is a factor that impacts postoperative results and prognosis. SMG and preoperative mRS scores were also correlated with outcome