SPEAR: Systematic ProtEin AnnotatoR

Summary We present SPEAR, a lightweight and rapid SARS-CoV-2 variant annotation and scoring tool, for identifying mutations contributing to potential immune escape and transmissibility (ACE2 binding) at point of sequencing. SPEAR can be used in the field to evaluate genomic surveillance results in real-time and features a powerful interactive data visualisation report. Availability and implementation SPEAR and documentation are freely available on GitHub: https://github.com/m-crown/SPEAR and is implemented in Python and installable via Conda environment. Supplemental Supplementary data are available at Bioinformatics online

SARS-CoV-2 pandemic impact in asthmatic exacerbations emergency visits in Spain

SARS-CoV-2; Exacerbaciones asmáticasSARS-CoV-2; Exacerbacions asmàtiquesSARS-CoV-2; Asthmatic exacerbation

Impact of BCR-ABL1 Transcript Type on Response, Treatment-Free Remission Rate and Survival in Chronic Myeloid Leukemia Patients Treated with Imatinib

The most frequent BCR-ABL1-p210 transcripts in chronic myeloid leukemia (CML) are e14a2 and e13a2. Imatinib (IM) is the most common first-line tyrosine-kinase inhibitor (TKI) used to treat CML. Some studies suggest that BCR-ABL1 transcript types confer different responses to IM. The objective of this study was to correlate the expression of e14a2 or e13a2 to clinical characteristics, cumulative cytogenetic and molecular responses to IM, acquisition of deep molecular response (DMR) and its duration (sDMR), progression rate (CIP), overall survival (OS), and treatment-free remission (TFR) rate. We studied 202 CML patients, 76 expressing the e13a2 and 126 the e14a2, and correlated the differential transcript expression with the above-mentioned parameters. There were no differences in the cumulative incidence of cytogenetic responses nor in the acquisition of DMR and sDMR between the two groups, but the e14a2 transcript had a positive impact on molecular response during the first 6 months, whereas the e13a2 was associated with improved long-term OS. No correlation was observed between the transcript type and TFR rate

Manual de señalética

Con el objetivo de garantizar unas indicaciones claras y efectivas que ayuden a orientarse en las instalaciones de la Universidad de Zaragoza, se crea este Manual de Señalética. Además, este documento trata de unificar y consolidad la imagen gráfica presente en los espacios de la Universidad de Zaragoza, basada en la actual imagen corporativa. Por tanto, el punto de partida de este manual lo constituye el Manual de Identidad Corporativa aprobado por el Consejo de Gobierno de la Universidad de Zaragoza el 6 de julio de 2010. El presente manual cumple con la normativa actual vigente UNE 170002 Requisitos de accesibilidad para la rotulación. Durante el proceso de redacción, el manual ha sido consultado por la Oficina Universitaria de Atención a la Diversidad para ofrecer un mayor grado de accesibilidad en los diseños propuestos

Early mobilisation in critically ill COVID-19 patients: a subanalysis of the ESICM-initiated UNITE-COVID observational study

Background Early mobilisation (EM) is an intervention that may improve the outcome of critically ill patients. There is limited data on EM in COVID-19 patients and its use during the first pandemic wave. Methods This is a pre-planned subanalysis of the ESICM UNITE-COVID, an international multicenter observational study involving critically ill COVID-19 patients in the ICU between February 15th and May 15th, 2020. We analysed variables associated with the initiation of EM (within 72 h of ICU admission) and explored the impact of EM on mortality, ICU and hospital length of stay, as well as discharge location. Statistical analyses were done using (generalised) linear mixed-effect models and ANOVAs. Results Mobilisation data from 4190 patients from 280 ICUs in 45 countries were analysed. 1114 (26.6%) of these patients received mobilisation within 72 h after ICU admission; 3076 (73.4%) did not. In our analysis of factors associated with EM, mechanical ventilation at admission (OR 0.29; 95% CI 0.25, 0.35; p = 0.001), higher age (OR 0.99; 95% CI 0.98, 1.00; p ≤ 0.001), pre-existing asthma (OR 0.84; 95% CI 0.73, 0.98; p = 0.028), and pre-existing kidney disease (OR 0.84; 95% CI 0.71, 0.99; p = 0.036) were negatively associated with the initiation of EM. EM was associated with a higher chance of being discharged home (OR 1.31; 95% CI 1.08, 1.58; p = 0.007) but was not associated with length of stay in ICU (adj. difference 0.91 days; 95% CI − 0.47, 1.37, p = 0.34) and hospital (adj. difference 1.4 days; 95% CI − 0.62, 2.35, p = 0.24) or mortality (OR 0.88; 95% CI 0.7, 1.09, p = 0.24) when adjusted for covariates. Conclusions Our findings demonstrate that a quarter of COVID-19 patients received EM. There was no association found between EM in COVID-19 patients' ICU and hospital length of stay or mortality. However, EM in COVID-19 patients was associated with increased odds of being discharged home rather than to a care facility. Trial registration ClinicalTrials.gov: NCT04836065 (retrospectively registered April 8th 2021)

Medidas de refuerzo y apoyo educativos en la enseñanza obligatoria : guía práctica

Resumen basado en el de la publicación. Contiene anexos con diferentes modelos de informe y fichas de actividadesSe presenta una iniciativa elaborada con el objetivo de ofrecer a los profesionales que trabajan en la enseñanza (equipos directivos, orientadores y profesores de Primaria y Secundaria, y al resto de la comunidad educativa) pautas que faciliten su labor en la prevención e intervención de las dificultades de aprendizaje y fracaso escolar que puedan presentar los alumnos, especialmente en las áreas instrumentales básicas. De tal manera, en primer lugar se establece el marco teórico en lo que a medidas de apoyo y refuerzo educativo se refiere, para posteriormente definir aspectos y objetivos que se pretenden conseguir con esta guía practica.MadridBiblioteca de Educación del Ministerio de Educación, Cultura y Deporte; Calle San Agustín 5 -3 Planta; 28014 Madrid; Tel. +34917748000; [email protected]

Diseño de materiales ADEI: el blog como recurso interactivo en la atención a la diversidad

Comunicación y póster presentados en las VII Jornadas de Redes de Investigación en Docencia Universitaria "La calidad del proceso de enseñanza/aprendizaje universitario desde la perspectiva del cambio", Universidad de Alicante, 4-5 junio 2009.Las tecnologías de la información y la comunicación se han incorporado en el contexto educativo como herramientas de aprendizaje unidas a la tarea docente y al aprendizaje del alumnado. Desde el punto de vista educativo presentan una gran cantidad de ventajas tanto para el alumnado como para el profesorado. El nuevo modelo educativo que se vislumbra demanda de una transformación de los elementos formativos en los que las estrategias didácticas a utilizar por el profesorado se encaminan hacia el objeto del proceso de aprendizaje: el alumnado. La incorporación de uno de los elementos de la Web 2.0. (Blogs) en el ámbito educativo puede incardinarse con el planteamiento del marco de Educación Superior que aboga por una metodología docente facilitadota del aprendizaje activo del alumno y en el marco de una pedagogía más constructivista. El objetivo de nuestro trabajo es dar a conocer nuestra experiencia en el diseño de materiales sobre la atención a la diversidad y educación inclusiva a través de la incorporación del Blog como recurso metodológico interactivo en la docencia universitaria, convirtiendo al alumnado constructor de su aprendizaje. La metodología utilizada está dentro del planteamiento de la investigación en la acción y su implementación en la docencia universitaria del título de Maestro en la asignatura troncal Bases Pedagógicas de la Educación Especial. Concluimos dando a conocer las aplicaciones metodológicas y aportaciones que se derivan de nuestra práctica y propuesta

SARS-CoV-2 pandemic impact in asthmatic exacerbations emergency visits in Spain

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