Caracterización genómica y fisiológica de la capacidad degradadora de hidrocarburos aromáticos de Citreicella aestuarii 357

La cepa 357 fué aislada en el año 2002 de una muestra de arena (Praia da Seda,Galicia, España) contaminada con petróleo del Prestige. Esta cepa, presuntamente afiliada al grupo Roseobacter, fue capaz de crecer utilizando naftaleno como única fuente de carbono y energía. Ante la falta de información genética y bioquímica sobre degradación de naftaleno en el grupo Roseobacter, decidimos abordar el trabajo presentado en esta tesis. Así, se ha confirmado taxonómicamente la afiliación de la cepa 357 a la especie Citreicella aestuarii. A continuación, utilizando técnicas genómicas, fisiológicas y analíticas, se ha caracterizado el potencial metabólico de la cepa 357 en el contexto del grupo Roseobacter. Además, se ha definido fisiológica, genética y bioquímicamente la vía catabólica del naftaleno. Así, C. aestuarii 357 es capaz de metabolizar el naftaleno vía salicilato y gentisato. Adicionalmente, hemos demostrado la capacidad de la cepa 357 de crecer con dibenzotiofeno como fuente única de carbono, energía y azufre.Strain 357 was isolated in 2002 from an oil-polluted sand sample from Praia da Seda (Galicia, Spain). This strain, a plausible member of the Roseobacter clade, was able to grow using naphthalene as sole carbon and energy source. Due to the lack of genetic and biochemical information about naphthalene degradation in Roseobacter, the work presented in this PhD Thesis was started. Thus, it has been taxonomically demonstrated that strain 357 is a member of the Citreicella aestuarii species. Using physiology, genomic and analytical techniques the metabolic potential of strain 357 in the context of the Roseobacter clade has been characterized. Furthermore, it has been demonstrated that C. aestuarii 357 is able to metabolize naphthalene via salicylate and gentisate. Finally, it has been proven that strain 357 is able to use dibenzothiophene as unique carbon, energy and sulfur source

Caracterización genómica y fisiológica de la capacidad degradadora de hidrocarburos aromáticos de Citreicella aestuarii 357

La cepa 357 fué aislada en el año 2002 de una muestra de arena (Praia da Seda,Galicia, España) contaminada con petróleo del Prestige. Esta cepa, presuntamente afiliada al grupo Roseobacter, fue capaz de crecer utilizando naftaleno como única fuente de carbono y energía. Ante la falta de información genética y bioquímica sobre degradación de naftaleno en el grupo Roseobacter, decidimos abordar el trabajo presentado en esta tesis. Así, se ha confirmado taxonómicamente la afiliación de la cepa 357 a la especie Citreicella aestuarii. A continuación, utilizando técnicas genómicas, fisiológicas y analíticas, se ha caracterizado el potencial metabólico de la cepa 357 en el contexto del grupo Roseobacter. Además, se ha definido fisiológica, genética y bioquímicamente la vía catabólica del naftaleno. Así, C. aestuarii 357 es capaz de metabolizar el naftaleno vía salicilato y gentisato. Adicionalmente, hemos demostrado la capacidad de la cepa 357 de crecer con dibenzotiofeno como fuente única de carbono, energía y azufre.Strain 357 was isolated in 2002 from an oil-polluted sand sample from Praia da Seda (Galicia, Spain). This strain, a plausible member of the Roseobacter clade, was able to grow using naphthalene as sole carbon and energy source. Due to the lack of genetic and biochemical information about naphthalene degradation in Roseobacter, the work presented in this PhD Thesis was started. Thus, it has been taxonomically demonstrated that strain 357 is a member of the Citreicella aestuarii species. Using physiology, genomic and analytical techniques the metabolic potential of strain 357 in the context of the Roseobacter clade has been characterized. Furthermore, it has been demonstrated that C. aestuarii 357 is able to metabolize naphthalene via salicylate and gentisate. Finally, it has been proven that strain 357 is able to use dibenzothiophene as unique carbon, energy and sulfur source

Effect of probiotic microorganisms isolated from Hypostomus plecostomus in Oreochromis sp juveniles

ABSTRACT Objective. The aim of this study was to assess the behavior of red tilapia juveniles (Oreochromis sp.) in presence of the possible probiotic microorganisms isolated from the gastrointestinal tract of panche fish (Hypostomus plecostomus). Materials and methods. During the phase of assessment of probiotics, 120 red tilapia (Oreochromis sp) juveniles were selected, with average weight of 1.28±0.22 g and average length of 2.99±0.27 cm. Three experimental treatments were formulated taking into account the nourishment needs of red tilapia (Oreochromis sp.). The statistical method employed was a completely random design. Results. The three strains of Lactobacillus genus (Lactobacillus plantarum, Lactobacillus pentosus, Lactobacillus rhamnosus) isolated from the digestive tract of H. plecostomus, yielded diverse results in the biometrical variables considered, as well as in the SGR, PER, AE, AC. Conclusions. The best rapports regarding the gain in length were for the treatment with native probiotics, and it is deduced that they were easily settled in the intestines of the fish (Oreochromis sp.). It is also determined that there are significant differences in the results or gain in length for the Control Concentrate feed (CC) against Concentrate feed plus Native Probiotic (CNP) for red tilapia (Oreochromis sp.) in the juvenile stag for a 30 day time span.RESUMEN Objetivo. El objetivo del estudio fue evaluar el comportamiento de juveniles de tilapia roja (Oreochromis sp.) frente a los posibles microorganismos probióticos aislados del tracto gastrointestinal del pez panche (Hypostomus plecostomus). Materiales y métodos. En la fase de evaluación del probiótico, se seleccionaron 120 juveniles de Tilapia roja (Oreochromis sp) con un peso promedio de 1.28±0.22 g y una longitud promedio de 2.99±0.27 cm. Se formularon tres tratamientos experimentales teniendo en cuenta las necesidades nutricionales de la tilapia roja (Oreochromis sp.). El modelo estadístico que se empleó fue un diseño completamente al azar. Resultados. Las tres cepas del género Lactobacillus (Lactobacillus plantarum, Lactobacillus pentosus, Lactobacillus rhamnosus) aisladas del tracto digestivo del H. plecostomus, dieron resultados diversos en las variables biométricas consideradas, así como en la TCE, TEP, EA y CA. Conclusiones. Los mejores reportes en cuanto a ganancia en longitud fueron para el tratamiento con el probiótico nativo y se deduce que se establecieron con facilidad en el intestino del pez (Oreochromis sp.) se determinó que si existen diferencias significativas en los resultados de ganancia de longitud, para Concentrado Control (CC) vs., Concentrado más Probiótico Nativo (CPN) para Tilapia roja (Oreochromis sp.) en la etapa de juveniles por un período de 30 días