Multidrug-Resistant and Clinically Relevant Gram-Negative Bacteria Are Present in German Surface Waters

Water is considered to play a role in the dissemination of antibiotic-resistant Gram-negative bacteria including those encoding Extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) and carbapenemases. To investigate the role of water for their spread in more detail, we characterized ESBL/Carbapenemase-producing bacteria from surface water and sediment samples using phenotypic and genotypic approaches. ESBL/Carbapenemase-producing isolates were obtained from water/sediment samples. Species and antibiotic resistance were determined. A subset of these isolates (n = 33) was whole-genome-sequenced and analyzed for the presence of antibiotic resistance genes and virulence determinants. Their relatedness to isolates associated with human infections was investigated using multilocus sequence type and cgMLST-based analysis. Eighty-nine percent of the isolates comprised of clinically relevant species. Fifty-eight percent exhibited a multidrug-resistance phenotype. Two isolates harbored the mobile colistin resistance gene mcr-1. One carbapenemase-producing isolate identified as Enterobacter kobei harbored bla(VIM-)(1). Two Escherichia coli isolates had sequence types (ST) associated with human infections (ST131 and ST1485) and a Klebsiella pneumoniae isolate was classified as hypervirulent. A multidrug-resistant (MDR) Pseudomonas aeruginosa isolate encoding known virulence genes associated with severe lung infections in cystic fibrosis patients was also detected. The presence of MDR and clinically relevant isolates in recreational and surface water underlines the role of aquatic environments as both reservoirs and hot spots for MDR bacteria. Future assessment of water quality should include the examination of the multidrug resistance of clinically relevant bacterial species and thus provide an important link regarding the spread of MDR bacteria in a One Health context.Peer reviewe

Umgang mit Unsicherheiten und Vagheiten bei der Georeferenzierung von Geo-Locations in der Archäologie und in den Geowissenschaften

Archäologische Forschung muss bei der Datenmodellierung mit Zweifeln wie Vagheiten, Unsicherheit und Mehrdeutigkeiten umgehen. Dies ist insbesondere bei der Georeferenzierung der Fall (Unold/Bruhn 2019; Schmidt/Thiery 2022). Um FAIRe, reproduzierbare und verständliche Daten für die Nachnutzung zu schaffen und gleichzeitig die Datenqualität archäologischer Daten zu gewährleisten, müssen Zweifel und Unsicherheiten offengelegt werden (Thiery/Mees 2022; Thiery et al. 2021a). Dies ist auch für die Daten-FAIRifizierung von Daten wichtig, welche in NFDI behandelt wird (Thiery et al. 2021b). Insbesondere die Aspekte Vagheit und Unsicherheit müssen für die Arbeit mit Geodaten modelliert werden (Unold et al. 2019; Unold/Bruhn 2019; Dubois/Prade 2001). Für die Verknüpfung von Daten und die FAIRifizierung ist jedoch die von Berners-Lee (2006) vorgeschlagene graphbasierte Modellierung als Linked Open Data (LOD) die Methode der Wahl. In diesem Beitrag wird anhand von drei data-driven, interdisziplinären Use-Cases der Umgang mit und die Modellierung von vagen und unsicheren Georeferenzen (Fundstellen) in einer Ontologie, in einer Wikibase-Instanz und in Wikidata auf Basis von Literatur als Linked Open Data aus den Bereichen Archäologie und Geowissenschaften vorgestellt

FAIRifizierung mit Citizen Science? Herausforderungen bei der Integration von archäologischen Daten in das Wikiversum und Open Street Map

Zur FAIRifizierung von archäologischen Forschungsdaten dienen nicht nur semantisch modellierte Linked Open Data (LOD) und interoperable Austauschformate, die über machinenlesbare Schnittstellen (z. B. WFS) der wissenschaftlichen Fachwelt zur Verfügung gestellt werden. Als modernes strategisches Element können auch Citizen Scientists über Web-Plattformen wie das Wikiversum und Open Street Map (OSM) an den Forschungsdaten partizipieren. Auch das archäologisch-geprägte NFDI4Objects-Konsortium der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) beteiligt sich an der Erstellung von Whitepapers zu Workflows zur Integration von Daten in diese Citizen Science Hubs. Dieser Vortrag zeigt anhand von Fallbeispielen die Herausforderungen bei der Integration von archäologischen Daten in das Wikiversum und OSM auf: Welche Herausforderungen entstehen bei einer FAIRifizierung mit Citizen Science? Wie sehen konkrete Lösungswege und Hilfestellungen aus

Transition-Metal-Free Synthesis of Benzimidazoles Mediated by KOH/DMSO

Benzimidazoles are prepared by intramolecular N-arylations of amidines mediated by potassium hydroxide in DMSO at 120 °C. In this manner, diversely substituted products have been obtained in moderate to very good yields

Effects of the mushroom-volatile 1-octen-3-ol on dry bubble disease

Dry bubble disease caused by Lecanicillium fungicola is a persistent problem in the cultivation of the white button mushroom (Agaricus bisporus). Because control is hampered by chemicals becoming less effective, new ways to control dry bubble disease are urgently required. 1-Octen-3-ol is a volatile that is produced by A. bisporus and many other fungi. In A. bisporus, it has been implicated in self-inhibition of fruiting body formation while it was shown to inhibit spore germination in ascomycetes. Here, we show that 1-octen-3-ol inhibits germination of L. fungicola and that enhanced levels of 1-octen-3-ol can effectively control the malady. In addition, application of 1-octen-3-ol stimulates growth of bacterial populations in the casing and of Pseudomonas spp. specifically. Pseudomonas spp. and other bacteria have been demonstrated to play part in both the onset of mushroom formation in A. bisporus, as well as the inhibition of L. fungicola spore germination. A potential role of 1-octen-3-ol in the ecology of L. fungicola is discussed.</p

The Münzkabinett, Staatliche Museen zu Berlin (Preußischer Kulturbesitz), in 2020

Jahresbericht 2020 des Berliner Münzkabinetts.Annual report 2020 of the Berlin Münzkabinett