Collection of Human Genomic DNA From Buccal Cells for Genetics Studies: Comparison Between Cytobrush, Mouthwash, and Treated Card

Alternative sources such as buccal cells have already been tested for genetic studies and epidemiological investigations. Thirty-seven volunteers participated in this study to compare cytology brushes, mouthwash, and treated cards for DNA collection. Quantity and quality of DNA and cost and feasibility were assessed. The mean DNA yield at 260 nm was found to be 3.5, 4, and 2.6 μg for cytobrushes, mouthwashes, and treated cards, respectively. A second quantification technique by fluorescence showed differences in the DNA yield with 1.1 and 5.2 μg for cytobrushes and mouthwash, respectively. All buccal samples allowed isolation of DNA suitable for polymerase chain reaction. According to the procedure of sample collection, the yield and purity of collected DNA, and storage conditions, the use of cytobrush appears to be the more appropriate method for DNA collection. This protocol has been validated and is currently applied in three large-scale multicentric studies including adults or children

A semi-parametric approach to estimate risk functions associated with multi-dimensional exposure profiles: application to smoking and lung cancer

A common characteristic of environmental epidemiology is the multi-dimensional aspect of exposure patterns, frequently reduced to a cumulative exposure for simplicity of analysis. By adopting a flexible Bayesian clustering approach, we explore the risk function linking exposure history to disease. This approach is applied here to study the relationship between different smoking characteristics and lung cancer in the framework of a population based case control study

A Case–Control Study of Lung Cancer Nested in a Cohort of European Asphalt Workers

BACKGROUND: We conducted a nested case-control study in a cohort of European asphalt workers in which an increase in lung cancer risk has been reported among workers exposed to airborne bitumen fume, although potential bias and confounding were not fully addressed. OBJECTIVE: We investigated the contribution of exposure to bitumen, other occupational agents, and tobacco smoking to the risk of lung cancer among asphalt workers. METHODS: Cases were cohort members in Denmark, Finland, France, Germany, the Netherlands, Norway, and Israel who had died of lung cancer between 1980 and the end of follow-up (2002-2005). Controls were individually matched in a 3:1 ratio to cases on year of birth and country. We derived exposure estimates for bitumen fume and condensate, organic vapor, and polycyclic aromatic hydrocarbons, as well as for asbestos, crystalline silica, diesel motor exhaust, and coal tar. Odds ratios (ORs) were calculated for ever-exposure, duration, average exposure, and cumulative exposure after adjusting for tobacco smoking and exposure to coal tar. RESULTS: A total of 433 cases and 1,253 controls were included in the analysis. The OR was 1.12 [95% confidence interval (CI), 0.84-1.49] for inhalation exposure to bitumen fume and 1.17 (95% CI, 0.88-1.56) for dermal exposure to bitumen condensate. No significant trend was observed between lung cancer risk and duration, average exposure, or cumulative exposure to bitumen fume or condensate. CONCLUSIONS: We found no consistent evidence of an association between indicators of either inhalation or dermal exposure to bitumen and lung cancer risk. A sizable proportion of the excess mortality from lung cancer relative to the general population observed in the earlier cohort phase is likely attributable to high tobacco consumption and possibly to coal tar exposure, whereas other occupational agents do not appear to play an important role

Investigation of occupational and environmental causes of respiratory cancers (ICARE): a multicenter, population-based case-control study in France

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Occupational causes of respiratory cancers need to be further investigated: the role of occupational exposures in the aetiology of head and neck cancers remains largely unknown, and there are still substantial uncertainties for a number of suspected lung carcinogens. The main objective of the study is to examine occupational risk factors for lung and head and neck cancers.</p> <p>Methods/design</p> <p>ICARE is a multi-center, population-based case-control study, which included a group of 2926 lung cancer cases, a group of 2415 head and neck cancer cases, and a common control group of 3555 subjects. Incident cases were identified in collaboration with cancer registries, in 10 geographical areas. The control group was a random sample of the population of these areas, with a distribution by sex and age comparable to that of the cases, and a distribution by socioeconomic status comparable to that of the population. Subjects were interviewed face to face, using a standardized questionnaire collecting particularly information on tobacco and alcohol consumption, residential history and a detailed description of occupational history. Biological samples were also collected from study subjects. The main occupational exposures of interest are asbestos, man-made mineral fibers, formaldehyde, polycyclic aromatic hydrocarbons, chromium and nickel compounds, arsenic, wood dust, textile dust, solvents, strong acids, cutting fluids, silica, diesel fumes, welding fumes. The complete list of exposures of interest includes more than 60 substances. Occupational exposure assessment will use several complementary methods: case-by-case evaluation of exposure by experts; development and use of algorithms to assess exposure from the questionnaires; application of job-exposure matrices.</p> <p>Discussion</p> <p>The large number of subjects should allow to uncover exposures associated with moderate increase in risks, and to evaluate risks associated with infrequent or widely dispersed exposures. It will be possible to study joint effects of exposure to different occupational risk factors, to examine the interactions between occupational exposures, tobacco smoking, alcohol drinking, and genetic risk factors, and to estimate the proportion of respiratory cancers attributable to occupational exposures in France. In addition, information on many non-occupational risk factors is available, and the study will provide an excellent framework for numerous studies in various fields.</p

PLoS One

Quantifying the association between lifetime exposures and the risk of developing a chronic disease is a recurrent challenge in epidemiology. Individual exposure trajectories are often heterogeneous and studying their associations with the risk of disease is not straightforward. We propose to use a latent class mixed model (LCMM) to identify profiles (latent classes) of exposure trajectories and estimate their association with the risk of disease. The methodology is applied to study the association between lifetime trajectories of smoking or occupational exposure to asbestos and the risk of lung cancer in males of the ICARE population-based case-control study. Asbestos exposure was assessed using a job exposure matrix. The classes of exposure trajectories were identified using two separate LCMM for smoking and asbestos, and the association between the identified classes and the risk of lung cancer was estimated in a second stage using weighted logistic regression and all subjects. A total of 2026/2610 cases/controls had complete information on both smoking and asbestos exposure, including 1938/1837 cases/controls ever smokers, and 1417/1520 cases/controls ever exposed to asbestos. The LCMM identified four latent classes of smoking trajectories which had different risks of lung cancer, all much stronger than never smokers. The most frequent class had moderate constant intensity over lifetime while the three others had either long-term, distant or recent high intensity. The latter had the strongest risk of lung cancer. We identified five classes of asbestos exposure trajectories which all had higher risk of lung cancer compared to men never occupationally exposed to asbestos, whatever the dose and the timing of exposure. The proposed approach opens new perspectives for the analyses of dose-time-response relationships between protracted exposures and the risk of developing a chronic disease, by providing a complete picture of exposure history in terms of intensity, duration, and timing of exposure

Facteurs de risque de cancer du poumon chez la femme

Le cancer du poumon chez la femme était une maladie rare au début du XXème siècle. Son incidence a fortement augmenté durant ces vingt dernières années dans les pays développés et particulièrement en France du fait de l augmentation de la consommation de cigarettes dans la population féminine. L étude des risques de cancer du poumon liés à la consommation de cigarettes des femmes a soulevé la question d une éventuelle plus grande susceptibilité des femmes vis-à-vis du tabac dans la survenue du cancer du poumon par rapport aux hommes. Les résultats des études épidémiologiques sur le sujet sont divergents et l hypothèse selon laquelle les hormones joueraient un rôle dans cette plus grande susceptibilité des femmes a été proposée pour expliquer ces différences. Objectifs : Les objectifs de cette thèse sont de donner des estimations récentes du risque de cancer du poumon chez la femme associé à la consommation de cigarettes en France, de comparer le risque de cancer du poumon chez les femmes et chez les hommes et d étudier le rôle des hormones dans le risque de cancer du poumon.Matériel et méthodes : L étude de la consommation de cigarettes chez les femmes et la comparaison des risques de cancer du poumon associé à cette consommation a été réalisée à partir des données de l étude ICARE. Les cas de cancer du poumon ont été identifiés dans 10 départements incluant un registre général de cancer. Au total, 2276 cas de cancer du poumon chez les hommes et 2780 témoins ont été inclus ainsi que 650 cas de cancers du poumon féminins et 775 témoins. Les témoins étaient issus de la population générale, avec une distribution âge et sexe conforme à celle des cas et une répartition par statut socioéconomique conforme à celle des départements dont sont issus les cas. L analyse du rôle des hormones et des facteurs reproductifs sur le risque du cancer du poumon a été menée par une analyse poolée, réunissant 9 études internationales. Cette étude a été réalisée dans le cadre du consortium ILCCO. Au total, 4547 cas et 4176 témoins ont été inclus dans l analyse.Résultats : Notre étude a montré que le risque de cancer du poumon associé à la consommation de cigarettes est 8 fois plus élevé chez les femmes fumeuses par rapport aux non fumeuses en France. La quantité moyenne fumée, la durée totale de consommation et le délai depuis l arrêt sont les 3 principales caractéristiques de consommation qui modulent le risque de cancer du poumon. La fraction de risque attribuable à la consommation de cigarettes est estimée à 55% [47 %-63 %]. La comparaison du risque de cancer du poumon entre les hommes et les femmes est très influencée par la présence des non fumeurs. . Bien que nous n ayons pas trouvé de différence de risque de cancer du poumon entre les hommes et les femmes fumeurs lorsque l on considère tous les types histologiques réunis, nous avons constaté que les femmes relativement aux hommes étaient plus à risque de cancer à petites cellules et de cancer épidermoïde, qui sont les types histologiques les plus liés à la consommation de cigarettes. Concernant l étude sur le rôle des hormones dans la survenue de cancer du poumon, nos résultats montrent que plus l âge à la ménopause est tardif et plus la durée des cycles menstruels est longue, moins le risque de cancer du poumon est important. Nous avons également montré que l ovariectomie était associée positivement avec le risque de cancer du poumon. Conclusion : Nos résultats semblent indiquer que les femmes fumeuses sont peut-être plus à risque de développer un carcinome à petites cellules ou un cancer épidermoïde par rapport aux hommes fumeurs. L étude sur les facteurs hormonaux a montré une association négative avec l exposition prolongée aux hormones, qui n est pas très cohérente avec un risque de cancer du poumon associé au tabac plus important chez les femmes que chez les hommes.The incidence of female lung cancer in developed countries has been increasing since 1950 and particularly in France where the cigarettes consumption has also increased. Since 1980, a growing number of epidemiological surveys have pinpointed the risk of female lung cancer related to smoking. Consecutively, a debate on gender differences in lung cancer risk has appeared, but still in progress nowadays. The reproductive factors could explain these differences. In order to have recent and reliable data on the association between cigarettes smoking and the risk of lung cancer in women and to compare the lung cancer risk associated with smoking exposure between genders, we analyzed the data of a French population-based case-control study, ICARE. The role of the reproductive factors in lung cancer was analyzed pooling, 9 international epidemiological studies included in ILCCO consortium.The ICARE study included 2276 male and 650 female cases and 2780 male and 775 female controls. Lifetime smoking exposure was represented by the comprehensive smoking index (CSI) which combines total duration of smoking, the mean intensity and the time since cessation. The pooled analysis of the reproductive factors included a total of 4547 cases and 4176 controls were included.Among the ever smokers, the relative risk of lung cancer was similar among men and women after adjustments for age, département, education, BMI, occupational exposure and chronic bronchitis. However, we found that women have a 2-fold greater risk than men of developing either small cell carcinomas or squamous cell carcinomas. Alternatively, the association was similar between men and women for the adenocarcinomas. As regard the reproductive factors, we found that longer is the age at menopause, lower is the lung cancer risk. Moreover, longer is the duration of cycle, lower is the lung cancer risk. The ovariectomy is also associated with an increasing risk of lung cancer.Our findings suggest that women might be more susceptible than men to develop small cell carcinoma or squamous cell carcinoma in response to the carcinogenic effect of cigarettes smoking. The analysis on the reproductive factors showed an inverse association between hormonal exposure and lung cancer indicating a likely complex relationship between the two factors.PARIS11-SCD-Bib. électronique (914719901) / SudocSudocFranceF

Indice de masse corporelle et cancer broncho-pulmonaire (étude cas-témoins française en population générale (Etude ICARE))

Le cancer broncho-pulmonaire (CBP) constitue un enjeu majeur de santé publique par sa fréquence et sa gravité. Le tabac est responsable de 90% des CBP, les autres facteurs de risque majeurs étant les expositions professionnelles. L indice de masse corporelle (IMC) est un facteur évoqué depuis une vingtaine d années mais controversé dans son lien avec le CBP. L objectif de notre travail est d étudier l association entre l IMC et le CBP en utilisant les IMC antérieurs au diagnostic et la variation pondérale au cours de la vie adulte et en tenant compte de la consommation tabagique de façon détaillée. L étude cas-témoins ICARE (2625 cas, 3381 témoins) a été réalisée en collaboration avec le réseau de registre général des cancers (FRANCIM). Les sujets ont été interrogés en face-à-face sur leur consommation tabagique vie entière, taille et poids à l interview, deux ans avant l interview et à l âge de 30 ans. L association entre l IMC et le CBP a été analysée par régression logistique non-conditionnelle stratifiée sur le sexe et le statut tabagique. Notre étude a mis en évidence chez les fumeurs actifs un gradient d augmentation du risque de CBP avec la diminution de l IMC (OR=0.91, IC95% :0.88-0.95). Ces résultats n étaient pas observés chez les non-fumeurs et la relation était moins forte chez les anciens fumeurs. Comparé aux sujets ayant pris du poids au cours de la vie, les fumeurs actifs ayant perdu au moins 3 kg avaient un risque de CBP très fortement augmenté (OR=5.9, IC95% :2.0-17.3). La relation est moins forte chez les sujets de plus de 60 ans au diagnostic. Ces résultats sont en faveur d une susceptibilité individuelle au CBP des sujets ayant un IMC bas.PARIS6-Bibl.Pitié-Salpêtrie (751132101) / SudocSudocFranceF

Rôle de l'exposition professionnelle aux laines minérales dans les cancer broncho-pulmonaires (analyse de l'étude cas- témoins icare)

Les expositions professionnelles représentent la 2nde étiologie de cancer du poumon. Parmi elles, les laines minérales (LM) utilisées comme substitut à l amiante sont suspectées d augmenter le risque de cancer du poumon en raison de leur structure proche de celle de l amiante. Dans ce contexte, ce travail a pour objectif d'évaluer le rôle de l'histoire professionnelle et en particulier celui de l'exposition professionnelle aux LM dans la survenue de cancer du poumon en tenant compte des expositions à l'amiante, à la silice, autres substances très prévalentes dans le secteur de la construction. Une dernière partie a consisté à étudier le risque de cancer du poumon associé à l'exposition professionnelle aux poussières de ciment.Nous avons analysés les histoires professionnelles complètes des cas et témoins inclus dans l'étude cas-témoins en population générale ICARE, identifiés dans 10 départements français abritant un registre général de cancer. Au total, 2 276 cas de cancer du poumon chez les hommes et 2 780 témoins ont été inclus ainsi que 650 cas de cancers du poumon féminins et 775 témoins. Deux stratégies d'évaluation des expositions aux LM et à l'amiante ont été utilisées: une matrice emplois-expositions (MEE) et une matrice tâche-exposition élaborée par des hygiénistes industriels et tenant compte des données individuelles. Les expositions à la silice et au ciment ont toujours été évaluées par MEE. Nos résultats confirment le rôle important des expositions professionnelles comme déterminant du risque de cancer du poumon en mettant en évidence des associations avec de nombreuses professions et secteurs d'activité. L'hypothèse d'une association entre le risque de cancer du poumon et l'exposition professionnelle aux LM est suggérée sans toutefois pouvoir exclure une confusion résiduelle par l'amiante car ces deux expositions sont très corrélées. Par ailleurs, nos résultats confirment le rôle cancérogène de l'amiante et de la silice et suggèrent une association entre l'exposition aux poussières de ciment et le risque de cancer du poumon.Occupational exposures are the second main risk factor of lung cancer. Asbestos has progressively been substituted by mineral wools (MW). Because of their similarity in shape with asbestos, they have been suspected of causing cancer of the respiratory system. In this context, the objectives of this work were to assess the role of occupational history in lung cancer risk; to investigate in details lung cancer risk associated with exposure to MW, carefully taking into account occupational exposures to asbestos and crystalline silica, two common potential carcinogenic exposure among construction workers; and to study the risk of lung cancer associated with occupational exposure to cement dusts.We analysed lifetime occupational history of cases and controls included in the ICARE study, a large multi-centre, population-based, case-control study. They were recruited in 10 French départements with a general cancer registry. The study included 6481 subjects (men: 2 276 lung cancer cases and 2 780 controls, women: 650 lung cancer cases and 775 controls). Two strategies of assessment of occupational exposure to MW and asbestos were used: a job-exposure matrix (JEM) and a task-exposure matrix constructed by trained hygienist and taking into account individual information. Occupational exposures to crystalline silica and cement dusts were both assessed using specific JEMs.Our results confirm the important role of occupational exposure as a determinant of lung cancer risk by showing associations between lung cancer risk and several occupations or industries. An association between MW exposure and lung cancer risk is suggested without being able to exclude a potential residual confounding by asbestos since these two exposures are deeply correlated. Our results also confirm asbestos and silica carcinogenicity and suggest an association between cement dusts and lung cancer risk.PARIS11-SCD-Bib. électronique (914719901) / SudocSudocFranceF