Reverse transcriptases can clamp together nucleic acids strands with two complementary bases at their 3′-termini for initiating DNA synthesis

We present evidence that the reverse transcriptase (RT) of human immunodeficiency virus type-1 stabilizes in vitro very short (2-nt) duplexes of 3′-overhangs of the primer strand that are annealed to complementary dinucleotides tails of DNA or RNA template strands, provided that these sequences contain at least one C or G. This RT-induced strand ‘clamping’ activity promotes RT-directed DNA synthesis. This function is achieved only when the functional template strand is adjacent to a second DNA or RNA segment, annealed upstream to most of the primer (without gaps). The combined clamp/polymerase activity is typical to RTs, as it was found in different RTs from diverse retroviral groups, whereas cellular DNA-polymerases (devoid of 3′→5′ exonucleolytic activity) showed no clamp activity. The clamp-associated DNA-binding activity is markedly stabilized by dGTP, even when dGTP is not incorporated into the nascent DNA strand. The hereby-described function can help RTs in bridging over nicks in the copied RNA or DNA templates, encountered during reverse transcription. Moreover, the template-independent blunt-end synthesis of RTs can allow strand transfers onto compatible acceptor strands while synthesizing DNA. These RT properties can shed light on potentially-new roles of RTs in the reverse-transcription process and define new targets for anti-retroviral drugs

The politics of Russia on the Ottoman empire at the beginning of the 20th Century

Osmanlı Devleti ile Rusya'nın ortak tarihine bakıldığında Rusya'nın Boğazlar üzerinde hakimiyet kurma mücadelesinden dolayı bunun büyük bir bölümünde rekabetçi ilişkilerin egemen olduğunu görebiliriz. Fakat Berlin Kongresi'nden sonra Osmanlı Devleti ile ilgili politikalarında bağımsız bir güç olarak hareket edemeyeceğinin farkına varan Rusya sürekli müttefik arayışı içerisinde olmuştu. 20.yüzyıla gelindiğinde Rusya'nın Osmanlı İmparatorluğu'nda yürüttüğü bütün politikalar onun Boğazlar politikasının birer parçalarıydı denilebilir. Diğer yandan Boğazlar üzerindeki tasarıları hep engellerle karşılaşıyordu. Bunları bertaraf etmek için Rusya bölgede meydana gelen krizlerin yarattığı fırsatlardan faydalanarak Boğazları ele geçirmeyi denemişti. Fakat bu dönemde Boğazlar'ı ele geçirmek için gerekli olanaklara sahip olmadığından bölgede statükonun korunması politikasını izleyecekti. Böylece Rusya'nın temel amacı Osmanlı Devleti'nin dağılmasını ve Boğazlar'ın kontrolünün üçüncü bir devletin eline geçmesini önlemek olmuştu. Bu nedenle Rusya Balkanlar'da Slavların Doğu Anadolu'da ise Ermenilerin durumunun düzeltilmesi için ıslahat yapılması talebinde bulunacaktı. Fakat bunu yaparken ne Slavların ne de Ermenilerin bağımsızlıklarını arzulamıyordu. Rusya'nın kendi nüfuz bölgelerindeki devrimci faaliyetleri korkusu Slav ve Ermeni devrimci hareketlerine karşı olumsuz tavır sergilemesine neden olmuştu. Bunun için hem Balkanlarda hem de Doğu Anadolu'da kendi denetiminde tampon devletler yaratmak istiyordu. Görüldüğü üzere Rusya'nın hem Balkan hem de Doğu Anadolu politikası kendi içerisinde tutarsızdı. Balkanlarda Rusya, Boğazlar ile ilgili çıkarlarına yardımcı olacak biçimde Slavları desteklemişti. Bu konuda Rusya'nın en büyük silahı ise Panslavizm ideali olmuştu. Fakat Balkan Savaşları'ndan önce kurduğu Balkan İttifakı kısa sürede Rusya'nın kontrolünden çıkmıştı. Birinci Dünya Savaşı'nda ise Rusya Bulgaristan'ın Mihver Devletleri'ne katılmasına engel olamamıştı. Bütün bunlar Rusya'nın Balkan politikasının iflasını da beraberinde getirecekti. Diğer yandan Boğazları diplomasi yoluyla açma çabaları da sonuçsuz kalmıştı. Birinci Dünya Savaşı sırasında Rusya'da meydana gelen devrim ve bunun sonucunda imzalanan Brest-Litovsk Antlaşması ise Rus-Türk ilişkilerinde bir dönüm noktası olmuştur. Anahtar Kelimeler: 1) Rusya, 2) Panslavizm, 3) Islahat, 4) Boğazlar Meselesi, 5) Ermeni Politikası When we look at the common history of the Ottoman Empire and Russia, we can see that a major part of this consists of a competitive relationship due to Russia's struggle to gain the control of the Straits. However after the Berlin Congress Russia noticed that she can not act as an independent power regarding the policies concerning the Ottoman Empire, and she was constantly in a search of an ally. In the 20th century it can be said that all the policies that Russia carried out in the Ottoman Empire, were a part of her Strait policy. On the other hand her plans about the Straits always encountered obstacles. Russia in order to overcome these tried take hold of the Straits by benefitting from the opportunities which came out of the crisis in the region. Yet in this period Russia had no means to take hold of the Straits so she followed the policy of preserving the status quo in the regions. Therefore Russia's main goal was to prevent the disintegration of the Ottoman Empire and to prevent the control of the Straits by a third state. For this reason Russia would ask for a reformation in order to improve the conditions of Slavs in the Balkans and Armenians in the East Anatolia. But Russia meanwhile desired the independence of neither Slavs nor Armenians. The fear of revolutionist activities within Russia's own power spheres led Russia to take a negative attitude towards the Slavic and Armenian revolutionist activities. Therefore she wanted to form buffer states in her control both in the Balkans and in the East Anatolia. As it can be seen the policy of Russia both in the Balkans and in the East Anatolia is inconsistent. Russia in the Balkans supported the Slavs in a way that would be useful for her interests concerning the Straits. The ideal of Panislavism was the greatest weapon of Russia in this subject. Yet the Balkan Alliance which was formed short before the Balkan Wars soon was out of the control of Russia. And in the First World War, Russia could not prevent Bulgaria from joining the Axis Powers. All this would bring the failure of the Russia's Policy in the Balkans alongside. On the other hand the efforts to open the Straits by diplomacy was resultless. The Brest-Litovsk, which was signed as a result of the Revolution in the Russia occurred in the First World War, is a turning point in the Russian-Turkish Relations. Key Words: 1) Russia, 2) Panislavism, 3) Reformation, 4) The Straits Question, 5) The Armenian Questio

Concept and Word, the Lexical Meaning of This Word

The paper discloses the depth and multicity of aspects of lexical meaning of the word as a lexicon phenomenon, as well as sheds light on types of lexical meanings of words and gives their characteristics. The lexical meaning of the word is related to concept, is specified and concretized as a part of the phrase and sentence. It has been established that information on a lexical meaning of the word, put in the text by the authors, does not remain invariable. It is characteristic of every period of lexicon development

Osmanlı - Rus İlişkilerinde Makedonya Sorunu (1885-1908)

Tarih boyunca Balkan yarımadasındaki stratejik konumu nedeni ile dikkatleri üzerine çeken Makedonya bölgesi hem Büyük Güçlerin hemde Balkan devletlerinin ilgi odağı olmuştur. Osmanlı egemenliğinin Balkanlarda giderek zayıflamaya yüz tuttuğu bir dönemde Büyük Güçler bölgede çeşitli arayışlar içine girmişlerdir. Çarlık yönetimi, Doğu Sorunu’nun bir parçası olarak addettiği Makedonya Sorunu’nda bölgede statükoyu koruma temel düşüncesi ile hareket etmiş ve Osmanlı Devleti üzerinde her hangi bir Büyük Gücün öne çıkmasını engellemek için yoğun çaba sarfetmiştir. Makedonya vilayetlerinde ya­şanan asayişsizlik karşısında Avusturya-Macaristan ile işbirliği halinde hareket eden Çarlık yönetimi, Osmanlı yönetimine endişelerini bildirmiş ve gerekli tedbirleri alıp bölgede ıslahat sürecini başlatmasını talep etmiştir. Diğer yandan Rusya’nın bölgedeki temsilcileri Balkan devletleri ve komite liderlerine yaptıkları çağrılarında Makedonya’da durumu daha fazla karıştırmamaları hususunda uyarılarda bulunmuştur. Görüldüğü üzere, Balkan Slavlarının geleneksel hamisi olan Rusya bu dönemde daha ziyade kendi çıkarlarını göz önünde bulundurmaya özen göstemiştir. Rusya, ıslahatların uygulanması konusunda çok ısrarcı bir tutum sergilemiş olmasına rağmen Osmanlı Devleti’nin hükümranlık hakkı­na halel getirmemeye çalışmıştır. Bu dönemde Rusya Büyük Güç olma statüsünü güçlükle koruyabil­miş ve Osmanlı Devleti ile ilgili politikalarında sürekli bir müttefik arayışı içinde olmuştur. Rusya’nın Uzakdoğu’daki sorunları ve kendi sınırları içerisindeki devrimci hareketleri korkusu Osmanlı Devleti ile olan ilişkilerinde böyle bir starteji belirlemesinde etkili olmuştur. Bu çalışmada Türkçe ve Rusça kaynaklardan yola çıkılarak Çarlık Rusyası’nın Makedonya Sorunu kapsamında uyguladığı siyaset incelenmiştir. 19 yüzyılın sonundan itibaren Rusya’nın Osmanlı Devleti ile ilgili siyasetinde meydana gelen köklü dönüşümlerin sebepleri anlatılmıştır. Araştırma sonunda Makedonya Sorunu konusunda hem Rusça hem de Türkçe kaynaklar kullanılarak konunun çok yönlü değerlendirilebileceği ortaya konulmuştur

Concept and Word, the Lexical Meaning of This Word

The paper discloses the depth and multicity of aspects of lexical meaning of the word as a lexicon phenomenon, as well as sheds light on types of lexical meanings of words and gives their characteristics. The lexical meaning of the word is related to concept, is specified and concretized as a part of the phrase and sentence. It has been established that information on a lexical meaning of the word, put in the text by the authors, does not remain invariable. It is characteristic of every period of lexicon development

Directions for Improving the Tax Policy of the Republic of Crimea

The article analyzes the structure of the revenue and expenditure side of the budget of the Republic of Crimea in the current year, and the tax receipts at the industry level. The main criteria for the effectiveness of the regional tax policy are highlighted. The directions of the tax policy of the region, and measures to attract financial resources for investment in the economy of the region are analyzed. The authors propose the directions of improving the tax policy of the Republic of Crimea in the near future through the implementation of measures aimed at developing the regional economy and improving budgetary policy

The role of phenylalanine-119 of the reverse transcriptase of mouse mammary tumour virus in DNA synthesis, ribose selection and drug resistance.

Phe-119 in the reverse transcriptase (RT) of mouse mammary tumour virus (MMTV) is homologous with Tyr-115 in HIV type 1 (HIV-1) RT and to Phe-155 in murine leukaemia virus (MLV) RT. By mutating these residues in HIV-1 and MLV RTs (which are strict DNA polymerases) the enzymes were shown to function also as RNA polymerases. Owing to the uniqueness of MMTV as a type B retrovirus, we have generated a Phe-119-Val mutant of MMTV RT to study the involvement of this residue in affecting the catalytic features of this RT. The data presented here show that the mutant MMTV RT can incorporate both deoxyribonucleosides and ribonucleosides while copying either RNA or DNA. In addition, this mutant RT shows resistance to nucleoside analogues and an enhanced fidelity of DNA synthesis; all relative to the wild-type enzyme. The Phe-119-Val mutant is also different from the wild-type enzyme in its preference for most template primers tested and in its ability to synthesize DNA under non-processive and processive conditions. Overall, it is likely that the aromatic side chain of Phe-119 is located at the dNTP-binding site of MMTV RT and thus might be part of a putative "steric gate" that prevents the incorporation of nucleoside triphosphates. Since the only three-dimensional structures of RTs published so far are those of HIV-1 and MLV, it is likely that MMTV RT folds quite similarly to these RTs