Patients non-covıd-19 diagnosis in pandemic clinics: three case reports

With the pandemic process, the frequency of clinicians' referrals for thoracic imaging has increased. In this article, three cases diagnosed other than COVID-19 in pandemic clinics are presented. A 33-years-old male admitted to the pandemic clinic with sore throat and dyspnea for two days. A large pneumothorax was observed on thorax imaging. The tube thoracostomy was performed. The patient was discharged after 14 days of follow-up. A 31-years-old female patient was admitted to pandemic clinic with the complaints of exertional dyspnea, cough, sore throat and abdominal pain for two weeks. Massive effusion was observed on thorax imaging. As a result of further examinations, the patient was diagnosed with metastatic colon carcinoma. An 18-years-old male patient was admitted to the pandemic clinic with chest pain lasting for a day. Mediastinal emphysema was observed on thorax imaging. The increased number of thoracic imaging during the pandemic process will lead to an increase in the incidence of asymptomatic and subclinical thoracic pathologies. This increase of incidence should be reveled with further epidemiological studies.Pandemi süreciyle birlikte klinisyenlerin toraks görüntülesine başvuru sıklığı artmıştır. Bu yazımızda pandemi kliniklerinde COVİD-19 dışı tanı konulan üç olgu sunulmuştur. Otuzüç yaşında erkek hasta pandemi kliniğine iki gündür devam eden göğüs ağrısı nefes darlığı şikayeti ile başvurdu. Toraks görüntülemesinde geniş pnömotoraks izlendi. Hastaya tüp torakostomi uygulandı. Hasta 14 gün izlem sonrası taburcu edildi. Otuzbir yaşında kadın hasta pandemi kliniğine iki haftadır devam eden efor dispnesi, öksürük, göğüs ağrısı ve karın ağrısı şikayeti ile başvurdu. Toraks görüntülemesinde massif efüzyon izlendi. Ileri tetkikler sonucu hastaya metastatic kolon carsinomu tanısı konuldu. Onsekiz yaşında erkek hasta pandemi kliniğine bir gündür devam eden göğüs ağrısı nedeniyle kabul edildi. Toraks görüntülemesinde mediastinal amfizem izlendi. Pandemik süreç sırasında artan torasik görüntüleme sayısı, asemptomatik ve subklinik torasik patolojilerin görülme sıklığında artışa neden olacaktır. İnsidanslardaki bu artış geniş epidemiyolojik çalışmalar ile ortaya konulmalıdır

Characteristics of school injuries presenting to the emergency department

School injuries account for approximately one-fifth of pediatric injuries. We aimed to investigate the frequency and severity of school injuries among school-aged children and determine clinical diagnoses and surgery requirement data. Methods In this prospective study, children who were admitted to the emergency department due to school accidents over a 5-month period were included. Demographics, activity during trauma, mechanism of trauma, nature, severity, emergency department outcomes, and surgery requirement were evaluated. Results The study included a total of 504 school-aged children, of whom 327 (64.9%) were male and 177 (35.1%) were female. Of the children, 426 (84.5%) had no evidence of injury or minor injury, while 78 (15.5%) had moderate or severe injury. There was a statistically significant difference between these two groups in terms of gender ( p = 0.031). Of the 78 children with moderate or severe injuries, 45 had extremity fractures, 18 had lacerations, 5 had maxillofacial injuries, 4 had cerebral contusion, 1 had lung contusion, and 1 had cervical soft-tissue damage. Two patients with fractures and two with eyelid lacerations were treated surgically, and four patients with brain contusion were hospitalized for a close follow-up. Conclusion This study revealed that the most common moderate or severe injuries in school accidents referred to emergency department were distal radius fractures and lacerations

Yakıotunun Ksenobiyotik Metabolizması Üzerine Etkilerinin ve İlaç-Diyet Etkileşim Potansiyelinin Proteomik ve Moleküler Yaklaşımlar ile Aydınlatılması

TÜBİTAK TBAG Proje15.05.201

Determination relationship between oxalate (kidney stone) degredation and exopolysaccharide production of different probiotic strains belonging to Lactobacillus sp.

Bu çalışmada, Türkiye'nin çeşitli yöresel peynirlerinden izole edilerek tanımlanan Lactobacillus rhamnosus (8), Lactobacillus fermentum (3), Lactobacillus brevis (3) ve Lactobacillus helveticus (2) olmak üzere toplam 16 bakteri kullanılmıştır. Lactobacillus suşlarının gastrointestinal sistem koşullarına dirençlilikleri ve ürettikleri eksopolisakkaritin (EPS) bu koşullardaki koruyucu etkileri araştırılmıştır. Ayrıca tüm suşların oksalata dirençlilikleri ile bu ortamda EPS üretimleri belirlenerek, oksalatlı ortama direnç gösteren ve bu ortamlarda yüksek EPS üretimi gösteren suşların oksalat degradasyonları oksalatın farklı konsantrasyonlarında (10 mM ve 20 mM) belirlenmiştir. Laktobasil türlerinin pH:2'deki gelişim sonuçlarını karşılaştırıldığında, L. rhamnosus'ların %50'si, L. fermentum'ların %34'ü ve L. brevis'lerin ise %67'si pH:2'de canlılıklarını sürdürmüştür. L. helveticus suşları ise pH:2'ye dirençli türler olarak belirlenmiştir. Genel olarak tüm suşların %0,3 safralı ortamda gelişim gösterdikleri saptanmıştır. Test edilen Lactobacillus sp. suşlarının ortalama EPS üretimlerinin ortalama sonuçlarının L. rhamnosus'larda 229,94 mg/L, L. fermentum'larda 260,02 mg/L, L. brevis'lerde 234,98 mg/L ve L. helveticus'larda 317,23 mg/L olduğu gözlemlenmiştir. Lactobacillus suşlarının 20 mM sodyum oksalat içeren MRS besi ortamında geliştikleri ancak kontrol grubuna göre MRS-ox'taki gelişimlerinin düşük oranda azaldığı belirlenmiştir. 20 mM oksalat içeren ortamda suşların ortalama EPS üretimleri 100,45 ile 149,13 mg/L aralığında bulunmuştur. Gastrointestinal sistem koşullarına dirençli, EPS üretimi yüksek, oksalatlı ortama direnç gösteren ve 10 mM oksalatı degrede edebilen L. rhamnosus ACS5, SMC5, L. brevis KMP1, BP8 ve L. helveticus KMP5, BT11 suşları ve karşılaştırmak için yine bu özellikler bakımından düşük performans gösteren L. rhamnosus BT8 suşunun oksalat degradasyonları oksalatın yüksek konsantrasyonun da (20 mM) araştırılmıştır. EPS üretimi yüksek olan L. helveticus BT11, L. brevis KMP1 ve L. rhamnosus SMC5 suşlarının sodyum oksalatı yüksek oranda degrade ettiği belirlenmiştir. Elde edilen veriler doğrultusunda asit-safra direnci, EPS üretimi, sodyum oksalata direnci bakımından yüksek performans gösteren L. brevis KMP1 suşunun oksalat degradasyonunda probiyotik bakteri olarak kullanımı önerilmektedir.In this study, Lactobacillus rhamnosus (8), Lactobacillus fermentum (3), Lactobacillus brevis (3), Lactobacillus helveticus (2); 16 strains in total those of which were evaluated after being isolated from several regional cheeses of Turkey have been used. The resistance of Lactobacillusstrains to gastrointestinal system conditions and the protective effects of exopolysaccharide (EPS) that they produce have been investigated. Besides, oxalate tolerance of all strains and EPS productions in that condition have been determined and the strains which are resistive to oxalate conditions and produce high EPS have been evaluated with degragation in different oxalate concentrations (10 mM and 20 mM). As we compare the growing results of Lactobacillus species at pH:2, 50% L. rhamnosus, 34% L. fermentum, and 67% L. brevis have sustained vitality at pH:2. On the other hand, L. helveticus strains have been determined as resistant species to pH:2. All strains in general have been found to progress in 0.3% bile conditions. The average EPS production of the tested Lactobacillus sp. strains has been observed as 229,94 mg/L in L. rhamnosus, 260,02 mg/L in L. fermentum, and 234,98 mg/L in L. brevis and 317,23 mg/L in L. helveticus. The Lactobacillus strains have been found to grow in MRS medium containing 20 mM sodium oxalate, however, it has been determined that their growth at MRS-ox decreases at low rate in comparison with the control group. The EPS production of the strains in 20mM oxalate conditions has been observed between 100,45 and 149,13 mg/L.L. rhamnosus ACS5, SMC5, L. brevis KMP1, BP8 and L. helveticus KMP5, BT11 strains that are resistive to gastrointestinal tract conditions, have high EPS production, and resistive to oxalate conditions and the oxalate degradations of L. rhamnosus BT8 strain, with low performance in regards to these features to compare, have been investigated in varying concentrations of the oxalate (20 mM). L. Helveticus BT11, L. brevis KMP1 ve L. rhamnosus SMC5 strains with high EPS production have been observed to degrade sodium oxalate at a high leveL. As a result of the obtained data, acid-bile resistance, EPS production, and the use of L. brevis KMP1, with high performance in regard to its resistance to sodium oxalate, as a probiotic bacteria in oxalate degradation is recommended

Adaptive Inverse Control

Tez (Yüksek Lisans) -- İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2002Thesis (M.Sc.) -- İstanbul Technical University, Institute of Science and Technology, 2002Adaptif ters kontrol (ATK), sonlu impuls cevabı olan (FIR) filtre kullanarak elde edilen dinamik sistem ters modelinin, dinamik sistem ile seri bağlı olan adaptif kontrolörün transfer karakteristiklerini belirlediği bir açık çevrim kontroldür. Bu çalışmada, sırası ile adaptif ters kontrol analizleri için kararsız lineer bir dinamik sistem ve bozucu etkiyen lineer uçak modeli test platformu olarak seçilmiştir. Filtered-X LMS algoritmasını kullanan online ATK sisteminin performansı, kararsız olan dinamik sistem kullanılarak incelenmiş ve uygun yakınsama faktörü ve ağırlık vektörü uzunluğunun seçilmesi halinde bu tip bir ATK sistemi konfigurasyonu ile hassas bir dinamik kontrol gerçeklenebileceği gösterilmiştir. Bu durumda, model referans ters modelleme özelliği eklenerek kontrol sistemi performansı arttırılabilmektedir. İç model kontrol (IMK) şemasına dayalı ATK konfigurasyonu ise basamak, rampa ve rastgele değişen karakterde bozucuya maruz lineer uçak modeli üzerinde test edilmiştir. Bu konfigurasyon ile adaptasyon hızına bağlı olmadan herhangi bir anda bozucu kestirimini veren direkt model mevcut olacağından, bozucu yok etme sinyali geri beslemesinin aktif hale getirilmesi ile etkin biçimde dinamik sisteme etkiyen bozucu yok edilmektedir.Adaptive inverse control (AIC) system is an open loop control where the inverse model of a plant obtained by using a FIR (Finite Impulse Response) filter is copied to the controller position whicih is connected cascade with the plant. In this work an unstable plant and a lineer aircraft model subject to disturbance are selected as test platforms for AIC analsys. The performance of online AIC system with filtered-x lms algorithm is evaluated using the unstable plant and it is shown that the performance of this kind of AIC configuration can be made superior by choosing adequate convergence constant and weight vector lengths. AIC system performance is improved by adding reference model feature in this case. Consequently, AIC system configuration based on internal model control (IMC) is tested on the aircraft model subject to step, ramp and random type disturbances. Disturbance on the plant output is counteracted immediateley as the disturbance cancellation feedback loop is turned on, due to the existence of the plant model at any time giving the disturbance estimate regardless of the adaptation speed.Yüksek LisansM.Sc

Investigation of the contribution of side-plate beam-column connection to the seismic behavior of single-story multi-span steel frames with the help of nonlinear time-history analysis method

Bu çalışma, yeni nesil yan levhalı kolon-kiriş birleşimlerinin tek katlı ve bir doğrultuda çok açıklıklı moment-aktaran çelik çerçevelerin deprem davranışlarına etkilerinin incelenmesi amacıyla yapılmıştır. Klasik guseli ve alın levhalı birleşim detayı ile yan levhalı birleşim detayına sahip iki çerçeve modelinin zaman-tanım alanında doğrusal olmayan deprem analizleri gerçekleştirilmiştir. Bu analizlerde, Türkiye Bina Deprem Yönetmeliği (TBDY) 2018 tasarım ivme spektrumuna göre ölçeklendirilmiş üç adet deprem kaydı (1990 Manjil, 1995 Kobe, 1999 Hector Mine) kullanılmıştır. Bu deprem kayıtlarının her birinin şiddetleri ve yapı üzerindeki etkilerinin arttırılması için, farklı deprem tekrarlanma periyodu (2475, 4950, 9900, 12375, 14850, 17325, 19800, 22275, 24750, 27225, 29700, 32175 yıl) değerlerine göre düzenlemeler yapılmıştır. Bu sayede, tek katlı depo, antrepo veya üretim tesisi gibi özel çelik yapısal sistemlerin göçmeye ulaşacakları deprem seviyeleri tespit edilmiş ve yan levhalı birleşim detayının çerçeve davranışına etkileri ortaya konulmuştur. Yapının yer aldığı konumdaki zemin sınıfı, ZD olduğu varsayılmıştır. Kolon-kiriş birleşim bölgelerinde ortaya çıkması muhtemel plastik mafsalların tanımlanmasında kolon ucu plastik dönme sınırı, kiriş ucu plastik dönme sınırı ve birleşim dönme sınırı ölçütlerinden tamamı dikkate alınmıştır. Her iki birleşim çeşidi için de birleşim bölgesi dönme sınırı daha kritik sonuçlar verdiği için, birleşimlerdeki kapasite tükenmesinin bu sınırın etkisiyle ortaya çıktığı varsayılmıştır. Deprem analizleri, tek katlı çerçevelerde ortaya çıkan plastik mafsalların kat seviyesinin altında olmasından dolayı, kolon-kiriş birleşim bölgesinde yapılan iyileştirmelerin etkisiz kaldığını göstermiştir. Buna göre, her iki birleşim tipine sahip çerçevede de aynı deprem hareketinin birleşim göçmesine neden olan tekrarlanma periyodu değerleri aynıdır. Kolon uçlarında ortaya çıkan plastik mafsallaşmalar, birleşim güçlendirmesinin etkinliğine engel olmuştur. Ayrıca, analizler sonucu, kısa süreli depremlerin, doğal titreşim periyodu değerleri nispeten düşük olan tek katlı çerçeveler üzerinde daha yıkıcı etkilere sahip olduğunu göstermiştir. Yatay kat ötelenmelerinin zamana bağlı değişimleri incelendiğinde kısa süreli deprem hareketleri ile kısa süreli yapı salınımlarının rezonans benzeri ilişkisinin bu yıkıcı etkiye sebep olduğu anlaşılmıştır.The present study aimed at investigating the contribution of the new side-plated beam-column connection detail to the seismic behavior of single-story moment frames with multiple spans in one direction. Within this respect, a steel moment frame model with conventional end plate and side-plate types of beam-column connections were analyzed with the help of the nonlinear time-history analysis method. In these analyses, three seismic records (Manjil 1990, Kobe 1995, Hector Mine 1999), scaled to match the design acceleration spectrum of the Turkish Building Earthquake Code (TBEC) 2018 were used. The seismic records were adjusted according to the earthquake return period value (2475, 4950, 9900, 12375, 14850, 17325, 19800, 22275, 24750, 27225, 29700, 32175 years) to enhance the intensity and influence of the seismic movements. In this way, the seismic intensities, under which the steel frames are subject to failure, and the contribution of the SidePlate connections to frame behavior were tried to be set forth. The soil type for the location of the analyzed structure was assumed to be ZD. In the definition of the plastic hinges at the beam-column connections, the plastic rotation limits of the column end, plastic rotation limits at the beam end and the tolerable rotation values of the beam-column connection were taken into account. For both types of connections, the tolerable rotation limits of the connections governed the plastic hinge definitions. The seismic analyses indicated that the improvements in the beam-column connection regions cease to be effective due to the formation of plastic hinges below the floor level. In this respect, the return period values for the two frames with different types of beam-column connections are identical for each seismic record. The plastic hinging at the column ends prevented the efficiency of the beam-column connection region strengthening. Furthermore, the seismic records with shorter durations proved to be more influential on the single-story structures, which are known to possess lower natural vibration period values. Examining the variation of the lateral story drift values over time indicates that the short seismic movements become resonant with the frequent natural vibrations of the structure, exacerbating the devastating effects of the seismic movement

Doğal hidroksiapatit toz üretimi, karakterizasyonu ve antibakteriyel özelliklerinin belirlenmesi

06.03.2018 tarihli ve 30352 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan “Yükseköğretim Kanunu İle Bazı Kanun Ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılması Hakkında Kanun” ile 18.06.2018 tarihli “Lisansüstü Tezlerin Elektronik Ortamda Toplanması, Düzenlenmesi ve Erişime Açılmasına İlişkin Yönerge” gereğince tam metin erişime açılmıştır.İnsan yaşamı için en önemli eksiklerden biri yedek parçasının olmamasıdır. Herhangi bir kaza veya hastalık sonucunda kaybedilen veya hasara uğrayan bir organ ancak implant denilen dışarıdan bir malzeme ile onarılabilmektedir. Bu yüzden biyolojik sistemlerle etkileştiğinde uyum sağlayabilecek (biyo uyumlu) ve vücudun istediği mekanik özellikleri taşıyan yeni malzemelerin geliştirilmesi için yoğun çaba harcanmaktadır. Bu konuda son yıllarda yapılan çalışmalar, insanın kemik yapısının %60 hidroksiapatit içerdiğini kanıtlanmıştır. Hidroksiapatitin üretimi temelde kimyasal ve doğal hammaddelerden üretim şeklide ayrılabilir. Bu çalışmada, ülkemizde hayvancılık gelişmiş olduğu ve doğal hammaddelerden üretim yönteminin çok daha ekonomik bir proses olması sebebiyle termal yöntem olarak bilinen doğal hammaddelerden üretim metodu kullanılmıştır. Yapılacak deneysel çalışmaları özetleyecek olursak; termal yöntem ile hayvan kemiklerinin ilik ayırma, yakma, karbon uzaklaştırma, öğütme işlemleri sonunda hidroksi apatit toz eldesi, içerisine biyouyumluluğunu bozmayacak şekilde sinterlemeyi kolaylaştırıcı ilaveler kullanarak veya kullanmadan atmosfer kontrollü fırınlarda yoğun hidroksi apatit parça üretimi gerçekleştirilmiştir. Üretilen hidroksiapatit tozlarının anti bakteriyel testlere tabi tutularak anti bakteriyel özellikleri incelenmiştir. Kullanılacak bakteriler insan vucudunun en çok maruz kaldığı bakterilerden seçilmiştir. Üretilen hidroksi apatit tozu taramalı elektron mikroskobuyla (SEM) tane morfolojisi, X-Işını kırınımı (XRD) ile faz oluşumları karakterize edilecektir. Üretilen tozlara gerekli anti bakteriyel testler uygulanmıştır. Üretilen hidroksiapatit tozu katkısız, farklı sinterleme ilaveleriyle ve farklı oranlarda kullanılarak sinterlenme-yoğunlaşma davranışları incelenmiştir. Elde edilen nihai ürünler Arşimet prensibiyle yoğunlukları, sertlik ve basma mukavemetleri incelenmiştir. XRD analiziyle faz içeriği, SEM yoğunlaşma davranışları ve gözenek morfolojileri FTIR, ICP, XRF analizleri ile element analizleri belirlenmiştir.One of the most important handicaps of human body is not to be available spare parts in the event of missing body parts because of accident, illness or senility. In this case, host organ or body part can recovery and replace with implant materials. Therefore, the result of interaction of the produced implants to body tissues have to be compatible and to exhibit adequate mechanical values for the choice to use in host body. Hydroxyapatite has been intensively studied and these works revealed that human bone structure contains 60 % hydroxyapatite. Fabrication of hydroxyapatite could be mainly divided into two methods; from chemical raw materials and from natural raw materials. In our country, animal raw material source is plentiful because of the improved animal breeding. Thus, the thermal extraction method was picked to produce hydroxyapatite powder. To summary the experimental process, hydroxyapatite powder was produced from bovine bone as a natural raw material by thermal methods, which is fairly inexpensive technique. The HAp powder extraction method involves crushing to small pieces, boiling up at 100°C for 3h on hot plate, burning up the remained organic materials, heat treating of the precursor in heat treatment furnace and grinding by planetary milling.. The powder was subjected to antibacterial tests to investigate bacterial activity. Scanning electron microscopy was performed to examine particle morphology of the fabricated HAp powder. EDS Elemental analyses of the HAp powder the resulting powder were carried out to determine elements in the product. The HAp powder was analysed using XRD, XRF, ICP for identifying its phase compositions. FTIR was used to reveal the presence of the structures. Densification behaviour of the sintered samples was investigated Archimedes technique

Comparison of geriatric pulmonary embolism severity index (G-PESI) with PESI and s-PESI in predicting prognosis and mortality

Our objective is to investigate the effect of geriatric pulmonary embolism severity index score on mortality independent of age and to compare it with pulmonary embolism severity index and simplified pulmonary embolism severity index. Material and Method: This is a retrospective observational study including patients over 65 years of age diagnosed with pulmonary embolism, who presented to the emergency medicine clinic of tertiary hospital between January 1, 2016 and January 1, 2021. The relationship between the original PESI and 30-day mortality was evaluated, and age was removed from the original score in the G-PESI. A univariate analysis of PESI, s-PESI, and G-PESI was performed using the chi-square test, Fisher’s exact test, Student’s t-test, and Mann–Whitney U test as appropriate to determine the association of these scores with 30-day mortality. Statistical analysis was performed using SPSS version 26.0. Results: This study included 167 patients, of whom 113 (67.7%) were women. According to the diagnostic test performance analysis report, the pulmonary embolism severity index, simplified pulmonary embolism severity index and geriatric pulmonary embolism severity index scores were statistically significant in predicting mortality, with the area under the curve values of 0.736 (0.34-1.91), 0.635 (0.74-1.81), and 0.739 (0.50-2.18) at the cut-off values of >110, >2, and >40, respectively (p<0.001, p<0.001, and p=0.004 respectively). When the area under the curve values of these three scores were compared, there was no statistically significant difference between pulmonary embolism severity index and geriatric pulmonary embolism severity index (p=0.7241). Discussion: Geriatric pulmonary embolism severity index, similar to pulmonary embolism severity index, can be accepted as an independent predictor in geriatric patients diagnosed with pulmonary embolism

Evaluation of the relationship of hemogram parameters with prognosis in older adults with acute abdominal pathologies

We aimed to investigate the effects of hemogram parameters on the short-term mortality of older adults with acute abdominal pathologies. Secondly, it was aimed to investigate the effect of hemogram parameters on mortality in operated and non-operated patients. Material and Method: This retrospective observational study was conducted in an emergency medicine clinic between June 1, 2019, and June 1, 2020. Data on patients over 65 years of age who presented to the emergency department with acute abdominal pathologies were analyzed. Hemogram parameters, as in our patient group over 65 years old, who presented with all acute abdomen pathologies; It was examined in terms of its relationship with prognosis in our operated and non-operated patient group. Statistical analysis was performed using SPSS v. 26.0. Results: The study included a total of 744 patients, of whom 391(52.6%) were women. Mortality was seen in 114(15.32%) patients, and 83(11.2%) patients underwent surgery. AUC and cut off values are for leukocytes count 0.590 and 10.83 for neutrophils count 0.596 and 9.64 for neutrophil-lymphocyte ratio 0.606 and 8.24 to predict mortality (p=0.002, p=0.001, and p>0.001, respectively Conclusion: In this study, among the hemogram parameters; leukocytes, neutrophils and neutrophil-lymphocyte ratio were determined to have a statistically significant ability to predict mortality in older adults both operaple and non operabl groups groups presenting with acute abdominal pathologies, but their accuracy rates were low