A finite-difference scheme for three-dimensional incompressible flows in spherical coordinates

In this study we have developed a flexible and efficient numerical scheme for the simulation of three-dimensional incompressible flows in spherical coordinates. The main idea, inspired by a similar strategy as (Verzicco, R., Orlandi, P., 1996, A Finite-Difference Scheme for Three-Dimensional Incompressible Flows in Cylindrical Coordinates) for cylindrical coordinates, consists of a change of variables combined with a discretization on a staggered mesh and the special treatment of few discrete terms that remove the singularities of the Navier-Stokes equations at the sphere centre and along the polar axis. This new method alleviates also the time step restrictions introduced by the discretization around the polar axis while the sphere centre still yields strong limitations, although only in very unfavourable flow configurations. The scheme is second-order accurate in space and is verified and validated by computing numerical examples that are compared with similar results produced by other codes or available from the literature. The method can cope with flows evolving in the whole sphere, in a spherical shell and in a sector without any change and, thanks to the flexibility of finite-differences, it can employ generic mesh stretching (in two of the three directions) and complex boundary conditions

Procjena prošlih promjena u okolišu proučavanjem sedimenata u hiperslanoj laguni

Carbon and oxygen isotopes, organic matter elemental composition, and mineralogy of carbonates were used as proxies to investigate environmental changes recorded in the carbonate-rich sediment of the hypersaline lagoon "Vermelha", Rio de Janeiro. Isotopic and other data suggest that two striking shifts in environmental conditions occurred about 1900 and 3200 years ago. Carbonates δ(18O) and δ(13C) were found in the range of +1.5‰ to +4.5 ‰ (PDB), and –2 ‰ to –11‰ (PDB), respectively. In organic matter, δ(13C) ranged from –22 ‰ to –15 ‰ (PDB). Calcites and dolomites are present in the studied core; their relative abundance seems to be related to the observed changes. Calcites are enriched up 38 % in MgCO3 (mole fraction, x). As distinct from calcites with lower magnesium contents, Mg-calcite with x(Mg) > 20 % shows an additional peak at 0.2929 nm in the X-ray diffractogram. Samples that contain Mg-calcite or 100 % dolomite show similar δ(13C) values. There are strong indications for an early formation of dolomite already in the microbial mat region. 18O and 2H determinations in lagoon water confirm evaporation as the water balance controlling processU radu je opisana uporaba izotopa ugljika i kisika, elementnog sastava organske tvari i mineralogije karbonata kao faktora u istraživanju promjena na okolišu utvrđenih u karbonatom bogatim sedimentima hiperslane lagune "Vermelha" kod Rio de Janeira u Brazilu. Izotopski i drugi podaci ukazuju na dvije značajne promjene okolišnih uvjeta, koje su se dogodile prije 1900 odnosno 3200 godina. U karbonatima, vrijednosti δ(18O) i δ(13C) izmjerene su u rasponu od +1,5 ‰ do +4,5 ‰, odnosno od –2 ‰ do –11 ‰ (standard Pee Dee Belemnite – PDB). Kod organske tvari, vrijednost δ(13C) varira u rasponu od –22 ‰ do –15 ‰ (PDB). U istraživanoj su sedimentnoj jezgri utvrđeni kalcit i dolomit, a njihova relativna zastupljenost povezana je s utvrđenim okoliš nim promjenama. Kalciti sadrže do 38 % MgCO3 (molni udjeli, x). Za razliku od kalcita s nižim sadržajem magnezija, magnezijev kalcit (x(Mg) > 20 %) pokazuje dodatnu liniju na rendgenskom difraktogramu kod 2929 nm. Uzorci koji sadrže magnezijev kalcit ili čisti dolomit pokazuju slične vrijednosti δ(13C). Postoje snažne indicije za stvaranje dolomita već u području mikrobnih pokrova. Vrijednosti 18O i 2H u vodi lagune ukazuju na to da je isparavanje proces koji kontrolira bilancu vode u sustavu

Understanding pregnancy planning in a low-income country setting: validation of the London measure of unplanned pregnancy in Malawi

This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/2.0), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.Background: The London Measure of Unplanned Pregnancy (LMUP) is a new and psychometrically valid measure of pregnancy intention that was developed in the United Kingdom. An improved understanding of pregnancy intention in low-income countries, where unintended pregnancies are common and maternal and neonatal deaths are high, is necessary to inform policies to address the unmet need for family planning. To this end this research aimed to validate the LMUP for use in the Chichewa language in Malawi.Methods: Three Chichewa speakers translated the LMUP and one translation was agreed which was back-translated and pre-tested on five pregnant women using cognitive interviews. The measure was field tested with pregnant women who were recruited at antenatal clinics and data were analysed using classical test theory and hypothesis testing.Results: 125 women aged 15-43 (median 23), with parities of 1-8 (median 2) completed the Chichewa LMUP. There were no missing data. The full range of LMUP scores was captured. In terms of reliability, the scale was internally consistent (Cronbach's alpha = 0.78) and test-retest data from 70 women showed good stability (weighted Kappa 0.80). In terms of validity, hypothesis testing confirmed that unmarried women (p = 0.003), women who had four or more children alive (p = 0.0051) and women who were below 20 or over 29 (p = 0.0115) were all more likely to have unintended pregnancies. Principal component analysis showed that five of the six items loaded onto one factor, with a further item borderline. A sensitivity analysis to assess the effect of the removal of the weakest item of the scale showed slightly improved performance but as the LMUP was not significantly adversely affected by its inclusion we recommend retaining the six-item score.Conclusion: The Chichewa LMUP is a valid and reliable measure of pregnancy intention in Malawi and can now be used in research and/or surveillance. This is the first validation of this tool in a low-income country, helping to demonstrate that the concept of pregnancy planning is applicable in such a setting. Use of the Chichewa LMUP can enhance our understanding of pregnancy intention in Malawi, giving insight into the family planning services that are required to better meet women's needs and save lives. © 2013 Hall et al.; licensee BioMed Central Ltd.Dr Hall’s Wellcome Trust Research Training Fellowship, grant number 097268/Z/11/Z

Comparação de técnicas analíticas para a determinação de sódio, potássio e fósforo em mostras de solos tropicais.

O fósforo, sódio e potássio são elementos importantes para a avaliação da fertilidade de solos (1, 2). A grande maioria dos laboratórios de análise de fertilidade de solo no Brasil utiliza a fotometria de chama para a determinação de sódio e potássio e a espectrofotometria molecular no UV-VIS para a determinação de fósforo(1). Entretanto, estes elementos também podem ser determinados por espectrometria de emissão óptica com plasma indutivamente acoplado (ICP OES)(3, 4, 5). Apesar dessa técnica apresentar inúmeras vantagens, há uma carência de estudos que a validem para a determinação de K, P, Na em amostras de solos tropicais(1, 2, 4). O objetivo deste trabalho foi comparar os resultados de fósforo disponível assim como potássio e sódio trocáveis após serem extraídos com solução Mehlich 1 e determinados por espectrofotometria UV-VIS (P) e fotometria de chama (Na e K) com aqueles obtidos pelo ICP OES, utilizando um teste de identidade entre métodos analíticos(6). Foram analisadas quinze amostras de solo, amostradas em diferentes regiões do Brasil, oriundas do programa de análise da qualidade de laboratórios de fertilidade (PAQLF) realizado pela EMBRAPA. Foi utilizado um ICP OES Perkin Elmer modelo OPTIMA 3000, vista radial

Comparação de métodos convencional e alternativo para determinar Cu, Fe, Mn E Zn em extratos de solos obtidos com solução de Mehlich-1.

Nos laboratórios brasileiros, a determinação de micronutrientes para estudos de fertilidade de solos é realizada por extração com solução de Mehlich-1 (M-1), utilizando-se uma razão solo: extrator de 1:5 m/v e posterior quantificação por espectrometria de absorção atômica (AAS). No entanto, muitos laboratórios também empregam razão solo:extrator M-1 de 1:10 m/v para determinar macronutrientes e, ou, quantificar por espectrometria de emissão óptica com plasma indutivamente acoplado (ICP OES), em substituição ao AAS. Como estudos comparativos entre as concentrações de micronutrientes obtidos por esses métodos alternativos são escassos, o objetivo deste trabalho foi investigar se essas diferentes condições experimentais gerariam diferentes resultados. Os resultados foram estatisticamente tratados e revelaram que as concentrações de Fe e Mn, utilizando se ambas as razões de solo:extrator M-1 (1:5 e 1:10 m/v) e de Zn, na razão solo: extrator M-1 de 1:10 m/v, foram estatisticamente iguais, enquanto as concentrações de Cu em ambas as razões solo:extrator M-1 e de Zn na razão solo:extrator de 1:5 m/v foram diferentes, quando as duas técnicas de quantificação (ICP OES e AAS) foram comparadas. Também, todas as concentrações de Cu, Fe, Mn e Zn obtidas utilizando razão solo: extrator M-1 de 1:5 m/v foram diferentes daquelas encontradas com a razão de 1:10 m/v, independentemente da técnica de quantificação. A maioria dessas concentrações foi maior quando se usou a razão de 1:5 m/v e alterou a classe de interpretação dos teores. Portanto, não recomenda-se o uso da razão solo: extrator de 1:5 para as extrações dos micronutrientes Cu, Fe, Mn e Zn com solução M-1 de amostras de solo

Uso de ICP OES e titrimetria para a determinação de cálcio, magnésio e alumínio em amostras de solos.

O crescente interesse dos laboratórios brasileiros de análise de fertilidade de solos pela espectrometria de emissão óptica com plasma indutivamente acoplado (ICP OES) em detrimento da técnica de titrimetria deve-se à possibilidade da determinação simultânea de diferentes metais em uma ampla faixa de concentrações em extratos de interesse agronômico. Este estudo compara a precisão, reprodutibilidade e exatidão das duas técnicas de determinação de Ca, Mg e Al trocáveis extraídos com KCl 1 mol L-1 em amostras de solos. Foram analisadas 15 amostras de solos de referência, sendo três deles selecionados para avaliar a precisão e a reprodutibilidade das técnicas de determinação. A titrimetria e o ICP OES forneceram resultados mais reprodutíveis e precisos para a determinação de Ca, Mg e Al quando o extrato foi analisado sem diluição. As técnicas de determinação diferiram estatisticamente (p < 0,05) pelo teste de identidade aplicado para comparação dos resultados de Ca, Mg e Al. Nas condições testadas, não se recomenda o uso de ICP OES para as determinações de Ca, Mg e Al trocáveis em amostras de solos

Comparação de métodos convencional e alternativo para determinar Cu, Fe, Mn e Zn em extratos de solos obtidos com solução de MEHLICH-1.

Nos laboratórios brasileiros, a determinação de micronutrientes para estudos de fertilidade de solos é realizada por extração com solução de Mehlich-1 (M-1), utilizando-se uma razão solo: extrator de 1:5 m/v e posterior quantificação por espectrometria de absorção atômica (AAS). No entanto, muitos laboratórios também empregam razão solo:extrator M-1 de 1:10 m/v para determinar macronutrientes e, ou, quantificar por espectrometria de emissão óptica com plasma indutivamente acoplado (ICP OES), em substituição ao AAS. Como estudos comparativos entre as concentrações de micronutrientes obtidos por esses métodos alternativos são escassos, o objetivo deste trabalho foi investigar se essas diferentes condições experimentais gerariam diferentes resultados. Os resultados foram estatisticamente tratados e revelaram que as concentrações de Fe e Mn, utilizandose ambas as razões de solo:extrator M-1 (1:5 e 1:10 m/v) e de Zn, na razão solo:extrator M-1 de 1:10 m/v, foram estatisticamente iguais, enquanto as concentrações de Cu em ambas as razões solo:extrator M-1 e de Zn na razão solo:extrator de 1:5 m/v foram diferentes, quando as duas técnicas de quantificação (ICP OES e AAS) foram comparadas. Também, todas as concentrações de Cu, Fe, Mn e Zn obtidas utilizando razão solo:extrator M-1 de 1:5 m/v foram diferentes daquelas encontradas com a razão de 1:10 m/v, independentemente da técnica de quantificação. A maioria dessas concentrações foi maior quando se usou a razão de 1:5 m/v e alterou a classe de interpretação dos teores. Portanto, não recomenda-se o uso da razão solo:extrator de 1:5 para as extrações dos micronutrientes Cu, Fe, Mn e Zn com solução M-1 de amostras de solo

Induction chemotherapy followed by alternating chemo-radiotherapy in stage IV undifferentiated nasopharyngeal carcinoma

In locally advanced undifferentiated nasopharyngeal carcinoma (UNPC), concomitant chemo-radiotherapy is the only strategy that gave better results over radiation alone in a phase III trial. Adding effective chemotherapy to a concomitant chemo-radiotherapy programme may be a way to improve the results further. 30 patients with previously untreated T4 and/or N2–3 undifferentiated nasopharyngeal carcinoma were consecutively enrolled and initially treated with 3 courses of epidoxorubicin, 90 mg/m2, day 1 and cisplatin, 40 mg/m2, days 1 and 2, every 3 weeks. After a radiological and clinical response assessment patients underwent 3 courses of cisplatin, 20 mg/m2/day, days 1–4 and fluorouracil, 200 mg/m2/day, days 1–4, i.v. bolus, (weeks 1, 4, 7) alternated to 3 courses of radiation (week 2–3, 5–6, 8–9–10), with a single daily fractionation, up to 70 Gy. WHO histology was type 2 in 30% and type 3 in 70% of the patients. 57% had T4 and 77% N2–3 disease. All the patients are evaluable for toxicity and response. All but one received 3 courses of induction chemotherapy. Toxicity was mild to moderate in any case. At the end of the induction phase 10% of CRs, 83.3% of PRs and 6.7% of SD were recorded. All the patients but one had the planned number of chemotherapy courses in the alternating phase and all received the planned radiation dose. One patient out of 3 developed grade III–IV mucositis. Haematological toxicity was generally mild to moderate. At the final response evaluation 86.7% of CRs and 13.3% of PRs were observed. At a median follow-up of 31 months, 13.3% of patients had a loco-regional progression and 20% developed distant metastases. The 3-year actuarial progression-free survival and overall survival rates were 64% and 83%. Induction chemotherapy followed by alternating chemo-radiotherapy is feasible and patients' compliance optimal. This approach showed a very promising activity on locally advanced UNPC and merits to be investigated in phase III studies. © 2000 Cancer Research Campaign http://www.bjcancer.co

Isolation of a SIR-like gene, SIR-T8, that is overexpressed in thyroid carcinoma cell lines and tissues

We used subtractive library screening to identify the changes that occur in gene expression during thyroid cell neoplastic transformation. Complementary DNA from normal thyroid cells (HTC 2) was subtracted from a complementary DNA library constructed from a human thyroid papillary carcinoma cell line. The library was screened for genes upregulated in human thyroid papillary carcinoma cell line cells, and several cDNA clones were isolated. One of these clones has a sirtuin core and high homology with the human silent information regulator protein family. This clone, designated ‘SIR-T8’, was overexpressed in human thyroid carcinoma cell lines and tissues, but not in adenomas. The human SIR-T8 protein has a molecular weight of 39 kDa and is primarily located in the cytoplasm under the nuclear membrane. The SIR-T8 gene is located on chromosome 17q25-1

Abstinence promotion under PEPFAR: The shifting focus of HIV prevention for youth

Abstinence-until-marriage (AUM) – strongly supported by religious conservatives in the U.S. - became a key element of initial HIV prevention efforts under the President’s Emergency Plan for AIDS Relief (PEPFAR). AUM programs have demonstrated limited efficacy in changing behaviors, promoted medically inaccurate information, and withheld life-saving information about risk reduction. A focus on AUM also undermined national efforts in Africa to create integrated youth HIV prevention programs. PEPFAR prevention efforts after 2008 shifted to science-based programming, however vestiges of AUM remain. Primary prevention programs within PEPFAR are essential and nations must be able to design HIV prevention based on local needs and prevention science