Implementation of the Polish version of the 11th revision of the International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems (ICD-11): importance for oncology

Member States of the World Health Organization (WHO), after several years of joint review, approved and implemented the update of the International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems (ICD) in May 2019. Usually, the abbreviated name ICD-11 (International Classification of Diseases, 11th Revision) is used. The new version was created in fully digital form with a search easy-to-use search engine available to every user. Many changes were introduced, and the most important is the redesign of the coding system to adapt it for digital use. ICD-11 codes are divided into main and supplementary codes. Main codes are at least 4 characters long, and 2 levels of extensions, up to 7 characters, are possible. In Poland, the entire process of implementing the ICD-11 is carried out as part of a project coordinated by the Medical Center for Postgraduate Education in cooperation with the Department of Healthcare of the Ministry of Health and the e-Health Centre. The implementation of the new version and the official introduction of ICD-11 in Poland must be preceded primarily by the amendment of legal acts (laws and regulations) and orders of the President of the National Health Fund, such as those regarding the reimbursement for refunded services and the keeping of medical records. An important element is the change in the cluster codes in oncology. Selected oncology groups were based on analyses of international reports on morbidity, mortality, cancer registries, and clinical reports. Cluster 02, which deals with cancer, contains 8 subsections detailing disease states associated with abnormal or uncontrolled cell proliferation. This article summarizes and discusses the most important changes in ICD-11, along with providing an introduction to the classification rules in the coding system and individual subsections on cancer

Production of recombinant colicin M in Nicotiana tabacum plants and its antimicrobial activity

Antibiotic-resistant microorganisms causing a life-threatening infection pose a serious challenge for modern science. The rapidly growing number of incidents for which the use of standard antibiotics is ineffective forces us to develop new alternative methods of killing microorganisms. Antimicrobial proteins and peptides (AMPs) can be promising candidates to solve this problem. Colicin-M is one of the representatives of this group and is naturally produced by Escherichia coli acting on other closely related bacterial strains by disrupting their outer cell membrane. This bacteriocin has huge potential as a potent antimicrobial agent, especially, since it was recognized by the FDA as safe. In this work, we present the expression of colicin M in model transgenic Nicotiana tabacum L. plants. We demonstrate that purified colicin retains its antibacterial activity against the control Escherichia coli strains and clinical isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae. Our results also show that plant-derived ColM is not toxic for L929 and HeLa cell line, which allows us to suppose that plant-based expression could be an alternative production method of such important proteins

Is Nuchal Translucency of 3.0-3.4 mm an Indication for cfDNA Testing or Microarray?:-A Multicenter Retrospective Clinical Cohort Study

Introduction: This study aimed to evaluate the occurrence of clinically relevant (sub)microscopic chromosomal aberrations in fetuses with the nuchal translucency (NT) range from 3.0 to 3.4 mm, which would be potentially missed by cfDNA testing. Methods: A retrospective data analysis of 271 fetuses with NT between 3.0 and 3.4 mm and increased first trimester combined test (CT) risk in five cohorts of pregnant women referred for invasive testing and chromosomal microarraywas performed. Results: A chromosomal aberration was identified in 18.8% fetuses (1:5; 51/271). In 15% (41/271) of cases, trisomy 21, 18, or 13 were found. In 0.7% (2/271) of cases, sex chromosome aneuploidy was found. In 1.1% (3/271) of cases, CNV &gt;10 Mb was detected, which would potentially also be detected by genome-wide cfDNA testing. The residual risk for missing a submicroscopic chromosome aberration in the presented cohorts is 1.8% (1:54; 5/271). Conclusion: Our results indicate that a significant number of fetuses with increased CT risk and presenting NT of 3.0-3.4 mm carry a clinically relevant chromosomal abnormality other than common trisomy. Invasive testing should be offered, and counseling on NIPT should include the test limitations that may result in NIPT false-negative results in a substantial percentage of fetuses.</p

Diagnostyka molekularna nowotworów – podejście praktyczne

Wprowadzenie do leczenia chorób nowotworowych terapii celowanych opartych na przeciwciałach monoklonalnych lub drobnocząsteczkowych inhibitorach kinaz doprowadziło, u wybranych chorych, do istotnej poprawy efektów leczenia. Uzyskanie wydłużenia czasu przeżycia bez progresji choroby czy przeżycia całkowitego wiąże się jednak z koniecznością wykonania na etapie diagnostyki szeregu oznaczeń molekularnych. Ich mnogość narzucana zapisami programów lekowych stwarza ogromne problemy we właściwym doborze poszczególnych oznaczeń oraz stanowi istotne wyzwanie w procesie rozliczenia wykonanych badań. W niniejszym opracowaniu podsumowano najważniejsze aspekty diagnostyki molekularnej nowotworów zalecanej i dostępnej w praktyce klinicznej w Polsce.Wprowadzenie terapii celowanych opartych na przeciwciałach monoklonalnych lub drobnocząsteczkowych inhibitorach kinaz do leczenia chorob nowotworowych doprowadziło do istotnej poprawy wynikow leczenia wybranych chorych. Wydłużenie czasu przeżycia bez progresji choroby czy przeżycia całkowitego wiąże się jednak z koniecznością wykonania na etapie diagnostyki szeregu oznaczeń molekularnych. Ich mnogość – narzucana zapisami programow lekowych – stwarza ogromne problemy we właściwym doborze poszczegolnych oznaczeń oraz stanowi istotne wyzwanie w procesie rozliczania wykonanych badań. W tym opracowaniu podsumowano najważniejsze aspekty diagnostyki molekularnej nowotworow zalecanej i dostępnej w praktyce klinicznej w Polsce

Molecular diagnostics of cancers – practical approach

Wprowadzenie do leczenia chorób nowotworowych terapii celowanych opartych na przeciwciałach monoklonalnych lub drobnocząsteczkowych inhibitorach kinaz doprowadziło, u wybranych chorych, do istotnej poprawy efektów leczenia. Uzyskanie wydłużenia czasu przeżycia bez progresji choroby czy przeżycia całkowitego wiąże się jednak z koniecznością wykonania na etapie diagnostyki szeregu oznaczeń molekularnych. Ich mnogość narzucana zapisami programów lekowych stwarza ogromne problemy we właściwym doborze poszczególnych oznaczeń oraz stanowi istotne wyzwanie w procesie rozliczenia wykonanych badań. W niniejszym opracowaniu podsumowano najważniejsze aspekty diagnostyki molekularnej nowotworów zalecanej i dostępnej w praktyce klinicznej w Polsce.Wprowadzenie do leczenia chorób nowotworowych terapii celowanych opartych na przeciwciałach monoklonalnych lub drobnocząsteczkowych inhibitorach kinaz doprowadziło, u wybranych chorych, do istotnej poprawy efektów leczenia. Uzyskanie wydłużenia czasu przeżycia bez progresji choroby czy przeżycia całkowitego wiąże się jednak z koniecznością wykonania na etapie diagnostyki szeregu oznaczeń molekularnych. Ich mnogość narzucana zapisami programów lekowych stwarza ogromne problemy we właściwym doborze poszczególnych oznaczeń oraz stanowi istotne wyzwanie w procesie rozliczenia wykonanych badań. W niniejszym opracowaniu podsumowano najważniejsze aspekty diagnostyki molekularnej nowotworów zalecanej i dostępnej w praktyce klinicznej w Polsce

Religia a współczesne stosunki międzynarodowe

Praca recenzowana / peer-reviewed pape

Fully Automatic Fall Risk Assessment Based on a Fast Mobility Test

This paper presents a fall risk assessment approach based on a fast mobility test, automatically evaluated using a low-cost, scalable system for the recording and analysis of body movement. This mobility test has never before been investigated as a sole source of data for fall risk assessment. It can be performed in a very limited space and needs only minimal additional equipment, yet provides large amounts of information, as the presented system can obtain much more data than traditional observation by capturing minute details regarding body movement. The readings are provided wirelessly by one to seven low-cost micro-electro-mechanical inertial measurement units attached to the subject’s body segments. Combined with a body model, these allow segment rotations and translations to be computed and for body movements to be recreated in software. The subject can then be automatically classified by an artificial neural network based on selected values in the test, and those with an elevated risk of falls can be identified. Results obtained from a group of 40 subjects of various ages, both healthy volunteers and patients with vestibular system impairment, are presented to demonstrate the combined capabilities of the test and system. Labelling of subjects as fallers and non-fallers was performed using an objective and precise sensory organization test; it is an important novelty as this approach to subject labelling has never before been used in the design and evaluation of fall risk assessment systems. The findings show a true-positive ratio of 85% and true-negative ratio of 63% for classifying subjects as fallers or non-fallers using the introduced fast mobility test, which are noticeably better than those obtained for the long-established Timed Up and Go test

Nowatorski system do oceny i rehabilitacji układu równowagi

Introduction: Mobile posturography is based on wearable inertial sensors; it allows to test static stability (static posturography) and gait disturbances. Aim: The aim of this work was to present the results of research on the innovative MEDIPOST system used for diagnosis and rehabilitation of balance disorders. Material and methods: Fourteen articles published in influenced foreign journals were presented and discussed. The deve-lopment and construction of the device was preceded by a literature review and methodological work. The Dizziness Handi-cap Inventory (DHI) questionnaire was translated and validated. The methodology of posturography with head movements with a frequency of 0.3 Hz was also developed in the group with chronic vestibular disorders. Simultaneous measurements were performed (static posturogrphy vs. MEDIPOST) in the CTSIB-M (Modified Clinical Test of Sensory Interaction in Balance) test in healthy subjects and patients with unilateral peripheral dysfunction. Results: In the posturography with head movements the improvement of sensitivity (67 to 74%) and specificity (65 to 71%) was noted. In the CTSIB-M test the intraclass correlation coefficients for both methods were 0.9. The greatest differences between examinations were observed for the mean angular velocity in the tests on the foam (trials no. 3 and 4), in particular on the foam with eyes closed (trial no. 4 – sensitivity 86.4%, specificity 87.7%). Two functional tests were analyzed: the Swap Seats test and the 360 degree turn test. In the former, the results are studied from 6 sensors – 86% of the true positives and 73% of the true negatives for the fall/ no-fall group classification. The second test differentiates people with vestibular impairment and healthy people. It can be analyzed with 1 (sensitivity 80%) and 6 sensors (sensitivity 86%, specificity 84%). Currently, the MEDIPOST device is in the development and certification phaseWstęp: Posturografia mobilna, oparta o czujniki sensoryczne montowane na tułowiu, pozwala na badanie stabilności statycznej (posturografia statyczna), a także na rejestracje zaburzeń podczas chodu. Cel: Celem tej pracy było przedstawienie wyników badań z zastosowaniem nowatorskiego systemu MEDIPOST, wykorzystanego do diagnostyki i rehabilitacji zaburzeń układu równowagi. Materiał i metody: Przedstawiono i omówiono 14 artykułów opublikowanych w zagranicznych czasopismach. Opracowanie i skonstruowanie urządzenia poprzedził przegląd literatury oraz prace metodyczne. Przetłumaczono i zwalidowano kwestionariusz niepełnosprawności Dizziness Handicap Inventory (DHI). Opracowano również metodykę posturografii z ruchami głowy o częstotliwości 0,3 Hz w grupie osób z przewlekłymi zawrotami głowy. Przeprowadzono jednoczasowo pomiary przy użyciu posturografii mobilnej ME-DIPOT i postruografii statycznej w teście MCTSIB (ang. Modified Clinical Test of Sensory Interaction in Balance) u osób zdrowych i chorych z jednostronną dysfunkcją obwodową układu równowagi. Wyniki: W badaniu posturografii z ruchami głowy stwierdzono poprawę czułości (z 67 do 74%) oraz swoistości (z 65 do 71%). W teście MCTSIB współczynniki korelacji wewnątrzklasowej dla obu metod (posturografia mobilna MEDIPOST vs statyczna) wynosiły 0,9. Największe różnice między badaniami zaobserwowano dla średniej prędkości kątowej środka ciężkości w próbach na piance (próba 3. i 4.), w szczególności zaś w próbach na piance z oczami zamkniętymi (próba 4. – czułość 86,4%, swoistość 87,7%). Dwa testy funkcjonalne poddano szczegółowej analizie: test przesiadania się między krzesłami (ang. Swap Seats) oraz test obrotu o 360 stopni. W pierwszym wyniki odczytywane są z 6 czujników – 86% wyników prawdziwie dodatnich i 73% wyników prawdziwie ujemnych dla klasyfikacji grup upadający/nieupadający. Drugi test pozwala różnicować osoby z uszkodzeniami przedsionkowymi i zdrowymi. Wynik może być analizowany z 1 (czułość 80%) i 6 czujników (czułość 86%, swoistość 84%). Aktualnie urządzenie MEDIPOST jest w fazie opracowywania i certyfikacji

A data mining paradigm for identifying key factors in biological processes using gene expression data.

A large volume of biological data is being generated for studying mechanisms of various biological processes. These precious data enable large-scale computational analyses to gain biological insights. However, it remains a challenge to mine the data efficiently for knowledge discovery. The heterogeneity of these data makes it difficult to consistently integrate them, slowing down the process of biological discovery. We introduce a data processing paradigm to identify key factors in biological processes via systematic collection of gene expression datasets, primary analysis of data, and evaluation of consistent signals. To demonstrate its effectiveness, our paradigm was applied to epidermal development and identified many genes that play a potential role in this process. Besides the known epidermal development genes, a substantial proportion of the identified genes are still not supported by gain- or loss-of-function studies, yielding many novel genes for future studies. Among them, we selected a top gene for loss-of-function experimental validation and confirmed its function in epidermal differentiation, proving the ability of this paradigm to identify new factors in biological processes. In addition, this paradigm revealed many key genes in cold-induced thermogenesis using data from cold-challenged tissues, demonstrating its generalizability. This paradigm can lead to fruitful results for studying molecular mechanisms in an era of explosive accumulation of publicly available biological data