Promoter elements of rice susceptibility genes are bound and activated by specific TAL effectors from the bacterial blight pathogen, Xanthomonas oryzae pv. oryzae.

Summary • Plant pathogenic bacteria of the genus Xanthomonas inject transcription activator-like effector (TALe) proteins that bind to and activate host promoters, thereby promoting disease or inducing plant defense. TALes bind to corresponding UPT (up-regulated by TALe) promoter boxes via tandemly arranged 34 ⁄ 35-amino acid repeats. Recent studies uncovered the TALe code in which two amino acid residues of each repeat define specific pairing to UPT boxes. • Here we employed the TALe code to predict potential UPT boxes in TALeinduced host promoters and analyzed these via b-glucuronidase (GUS) reporter and electrophoretic mobility shift assays (EMSA). • We demonstrate that the Xa13, OsTFX1 and Os11N3 promoters from rice are induced directly by the Xanthomonas oryzae pv. oryzae TALes PthXo1, PthXo6 and AvrXa7, respectively. We identified and functionally validated a UPT box in the corresponding rice target promoter for each TALe and show that box mutations suppress TALe-mediated promoter activation. Finally, EMSA demonstrate that code-predicted UPT boxes interact specifically with corresponding TALes. • Our findings show that variations in the UPT boxes of different rice accessions correlate with susceptibility or resistance of these accessions to the bacterial blight pathogen

Engineering the rRNA decoding site of eukaryotic cytosolic ribosomes in bacteria

Structural and genetic studies on prokaryotic ribosomes have provided important insights into fundamental aspects of protein synthesis and translational control and its interaction with ribosomal drugs. Comparable mechanistic studies in eukaryotes are mainly hampered by the absence of both high-resolution crystal structures and efficient genetic models. To study the interaction of aminoglycoside antibiotics with selected eukaryotic ribosomes, we replaced the bacterial drug binding site in 16S rRNA with its eukaryotic counterpart, resulting in bacterial hybrid ribosomes with a fully functional eukaryotic rRNA decoding site. Cell-free translation assays demonstrated that hybrid ribosomes carrying the rRNA decoding site of higher eukaryotes show pronounced resistance to aminoglycoside antibiotics, equivalent to that of rabbit reticulocyte ribosomes, while the decoding sites of parasitic protozoa show distinctive drug susceptibility. Our findings suggest that phylogenetically variable components of the ribosome, other than the rRNA-binding site, do not affect aminoglycoside susceptibility of the protein-synthesis machinery. The activities of the hybrid ribosomes indicate that helix 44 of the rRNA decoding site behaves as an autonomous domain, which can be exchanged between ribosomes of different phylogenetic domains for study of function

Area-based management tools to protect unique hydrothermal vents from harmful effects from deep-sea mining: A review of ongoing developments

The deep seabed in areas beyond national jurisdiction, or what is referred to as “the Area,” is the common heritage of humankind, safeguarded by mandating the International Seabed Authority (ISA) to protect the marine environment and to regulate all mining-related activities on the seabed in areas beyond national jurisdiction. So far, the ISA has 7 contracts for polymetallic sulfide (PMS) exploration. PMS deposits are located at and near deep-sea hydrothermal vents, one of the most remarkable ecosystems on Earth. Where hot and mineral rich vent fluids escape from the earth's crusts, minerals precipitate and are deposited, and unique biomass rich microbial and animal communities are thriving. Several intergovernmental organizations suggest that active vents classify as areas in need of conservation. The ISA is currently developing regional environmental plans for PMS and has set some first steps to protect active vents from mining impacts. We review the current regulatory and policy framework for deep-sea spatial management, and set it into the environmental context. We conclude that all current management measures of the ISA would not be suited to protect the marine environment from harmful mining impact. We recognize that ISA's area-based management tools are under development, and suggest that improvements can be achieved by studying and recognizing the ecological attributes of ecosystems and their connectivity, as well as governance connectivity, taking into account area-based management tools of different users in the same area

Histoire de l'art et anthropologie

Le colloque propose de faire le point sur les relations entre l’histoire de l’art et l’anthropologie au lendemain de l’ouverture à Paris du musée du quai Branly (juin 2006) qui regroupe les collections du Laboratoire d’ethnologie du Musée de l’Homme et du Musée des Arts d’Afrique et d’Océanie, ancien Musée des Colonies. La méthode choisie est d’inviter historiens de l’art et anthropologues à réfléchir conjointement au sein du même colloque sur les œuvres d’art et sur leurs méthodes pour les aborder. Le premier ensemble d’objectifs tourne autour d’une histoire croisée des deux disciplines, mettant en exergue les emprunts de l’une à l’autre, les débats et les pierres d’achoppement. Seront proposées et encouragées des mises en parallèle (duos ou diptyques) comme : Alfred Gell/ Michael Baxandall ; Franz Boas/ Alois Riegl ; André Leroi-Gourhan/ Pierre Francastel, etc. ou des regards croisés d’un historien de l’art et d’un anthropologue sur une œuvre comme celle d’Aby Warburg ou celle de Claude Lévi-Strauss, ou encore sur une thématique particulière. Des conférences plénières apporteront les mises en perspective nécessaires. Le second groupe de questions porte sur les procédures, bien souvent semi-automatiques et considérées comme allant de soi, de la construction respective des objets des disciplines (collecte, classification, inventaire, inclusion/exclusion, mises en série – par exemple Pitt-Rivers Museum –, mais aussi « formes du temps » – (Shape of time) selon l’expression de George Kubler, etc.). Dans quelle mesure peut être mis en évidence le jeu de définition réciproque et d’influences ? Il pourrait être intéressant de constituer des « duos » interrogeant le même objet (œuvre, artiste, thème, etc.)Plus théorique et « fondamentale », si l’on peut dire, est la question de l’origine des images et de l’intentionnalité véhiculée par des artefacts, considérée du double point de vue de l’anthropologue et de l’historien d’art. Pourraient également être étudiés, selon le même principe de regards croisés, des objets et des notions comme « masque », « face », « traces », ainsi que les pratiques de création des images et de leur transmission dans des cultures orales ou non. Enfin, la mise en évidence de « cultures visuelles » spécifiques ne doit pas minimiser les différentes opérations de translation qui font passer l’artefact d’un « régime de valeur » (selon l’expression d’Arjun Appadurai) à un autre, ce qu’André Malraux appelle la « métamorphose ». La question de la transformation en œuvre d’art est centrale, en particulier les déplacements de sens qu’induit le passage du « terrain » ou « contexte d’origine » au musée ou au marché. On considérera aussi le processus inverse, qui consiste pour l’artiste contemporain à ré-interroger la fonction sociale de l’art en jouant sur le décalage entre objet et contexte. Seront ainsi abordés les deux phénomènes concomitants d’« artialisation » des objets et de « resocialisation » de l’art. De même, les différents types de collectifs constitués autour des objets (collectionneurs, conservateurs, marchands) et leurs interactions devront être analysés. Une coédition INHA / musée du quai Branly Une sélection de ces textes a fait l'objet d'une publication papier sous le titre Cannibalismes disciplinaires. Quand l'histoire de l'art et l'anthropologie se rencontrent. Lire l'introduction de cet ouvrage en français Lire l'introduction de cet ouvrage en anglai