FOSS4G as a key building block for case-based learning in Geographic Information education

In the sector of Geographic Information (GI) there is a gap between the education and training currently being offered by European universities and the knowledge and skills required by enterprises and public authorities. New forms of collaboration based on innovative methods are needed to cope with the challenges derived from the fast technological developments in the geospatial and ICT field. This paper presents the approach and the first findings of the EU Erasmus+ project giCASES – Creating a University-Enterprise Alliance for a Spatially Enabled Society (2016–2018) which addresses this challenge by introducing new methods for case-based and collaborative learning, and for the co-creation, management and sharing of knowledge between universities and enterprises. The aim of the project is to develop new training material and create innovative, multi-disciplinary learning processes based on real-world case studies (case-based learning). The paper focuses on the methodological approach developed during the first half of the project, and presents the 6 case studies where this approach will be tested during the second half. Despite the diversity of application domains (indoor mapping, environmental hazards, e-Government, utility networks, energy saving policies, and forestry), the case studies are all relevant to open source software and FOSS4G technologies will play a key role in their implementation, thus demonstrating their matureness and flexibility not only as GI teaching tools at the universities, but also as powerful means to develop innovative new services at the companies

Open source geospatial software for education and co-creation of knowledge in the field of Geographic Information: giCASES

giCASES – Creating a University-Enterprise Alliance for a Spatially Enabled Society – is a Knowledge Alliance project co-funded within the EC ERASMUS+ Programme over the years 2016-18. The project objectives are: a) to enable and strengthen innovation in Geographic Information (GI) education and industry to facilitate the collaborative creation, management and sharing of knowledge; b) These objectives are addressed by developing new, innovative and multidisciplinary approaches to teaching and learning within the Geographic Information (GI) sector, and facilitating the exchange, flow and co-creation of knowledge. In particular, giCASES aims to: a) improve the quality and relevance of GI courses provided by the University members of the consortium; b) facilitate the growth of new knowledge-sharing processes and tools between enterprises and universities improve the management of knowledge by the partners. The overall approach to address these objectives is to develop new learning material and processes based on case-based learning. In the approach taken in the project, enterprises and academia collaborate both when creating learning material based on real cases and also during and after the courses (through a collaborative platform)

Utilizzo di software geografico open source per l’istruzione e co-creazione di conoscenza nel settore dell’Informazione Geografica: il progetto giCASES

Nel settore dell’Informazione Geografica (GI), esiste in generale un gap a livello europeo tra l’istruzione e la preparazione offerte dalle università e le competenze e capacità richieste sul mercato da aziende ed enti pubblici. Per far fronte alle nuove sfide poste dai continui sviluppi tecnologici in atto (basti pensare a temi quali Geo Big Data, posizionamento indoor, Internet of Things, ecc.) è perciò necessario introdurre nuove forme di collaborazione università-impresa. giCASES – Creation of a University-Enterprise Alliance for a Spatially Enabled Society (http://www.gicases.eu) è un’Alleanza per le Conoscenze, co-finanziata dal Programma UE Erasmus+, che affronta questo problema con l’obiettivo di sviluppare approcci innovativi e multidisciplinari all’insegnamento e all’apprendimento nel settore GI facilitando lo scambio, il flusso e la co-creazione di conoscenza. L’approccio consiste nello sviluppo collaborativo e condiviso, tra università ed imprese, di nuovi materiali didattici e processi di apprendimento basati su casi reali (case-based learning). In maniera innovativa rispetto alle tradizionali forme di collaborazione tra università ed imprese (spesso limitate a semplici tirocini e allo sviluppo di tesi presso le imprese), la collaborazione con le università finalizzata alla co-creazione di conoscenza si esplica sin dalla fase iniziale di progettazione del corso accademico e del processo di apprendimento. Il progetto, iniziato nel 2016 e formato da un consorzio di 14 partner da 8 diversi Paesi europei (con una componente bilanciata di università e imprese), ha visto una prima fase volta alla definizione della metodologia di case-based learning e alla progettazione dei casi di studio. Un questionario inizialmente distribuito tra università, imprese ed enti pubblici europei nel settore GI ha evidenziato che: a) la collaborazione tra il settore accademico e quello industriale è spesso organizzata in modo tradizionale; b) le competenze richieste dal mercato del lavoro (specialmente programmazione, analisi e modellazione spaziale) spesso non sono in linea con l’istruzione universitaria; c) l’apprendimento basato su casi reali è uno dei metodi suggeriti per rendere la preparazione degli studenti conforme alle richieste del mondo del lavoro. Utilizzando lo standard BPMN (Business Process Model and Notation), è stata quindi sviluppata una metodologia rigorosa per la modellazione degli schemi di co-creazione di conoscenza tra università ed imprese (ad esempio per lo sviluppo collaborativo del materiale didattico e la formazione congiunta degli studenti). Questi schemi descrivono analiticamente i processi di collaborazione utilizzati, i relativi attori e le loro reciproche interazioni. Un insieme di linee guida, modelli e bozze di convenzioni/accordi è stato prodotto per facilitare l’implementazione pratica degli schemi sviluppati. Parallelamente, è stata definita e condivisa una serie di strumenti software per garantire funzionalità collaborative (sviluppo congiunto di codice, produzione congiunta di materiale didattico, ecc.), facilitando così lo sviluppo pratico di conoscenze condivise e la messa in opera dei casi di studio. Il materiale didattico e la metodologia di apprendimento sviluppati sono infine sottoposti ad un’accurata fase di test e validazione (al momento in corso) tramite l’implementazione in 6 casi di studio (CS), ognuno dei quali prevede la partecipazione congiunta di un partner accademico ed uno industriale e si concentra su un tema attuale nel panorama GI: CS1 “Use of indoor GIS in healthcare”; CS2 “Environmental analysis using cloud service system”; CS3 “From INSPIRE to e-Government”; CS4 “Integrated management of the underground”; CS5 “Harmonizing data flows in Energy saving EU policies”; CS6 “GIS applications in Forestry”. Per ognuno di essi è stato definito un dettagliato piano di lavoro comprendente la descrizione degli attori coinvolti (studenti, professori, tutor accademici, tutor industriali, ecc.), il contesto applicativo (ovvero la modalità con cui il CS è incluso nel corso/programma accademico), le tempistiche di svolgimento e i risultati attesi. Questi ultimi, che includono il materiale didattico e i processi collaborativi applicati, saranno resi disponibili con licenza aperta sulla piattaforma del progetto, in modo da massimizzarne l’adozione da parte di altre comunità e portatori di interesse. I risultati parziali ottenuti dall’implementazione dei CS stanno dimostrando, a giudizio non solo degli studenti ma di tutti gli attori coinvolti, elementi positivi in termini di innovazione ed efficacia. Benché l’uso di software open source (e in particolare FOSS4G) non fosse formalmente richiesto dalle specifiche del progetto, è interessante notare come in tutti i 6 CS sia largamente prevista l’adozione di tali tecnologie, in particolare di QGIS, GRASS GIS, PostGIS, GeoServer, OpenLayers, Leaflet e Geomajas. Ciò testimonia come le soluzioni open source siano già fortemente utilizzate tanto come strumenti didattici presso le università quanto, da parte delle imprese, come mezzi per realizzare prodotti da immettere sul mercato. Si può anzi affermare che il software open source (che, oltre all’ecosistema FOSS4G, comprende in questo contesto strumenti di condivisione e documentazione di codice, piattaforme di e-Learning e strumenti di Project Management) sia un elemento essenziale per il case-based learning. Non solo: le comunità ed i progetti open source sono per natura un habitat ideale per la co-creazione di conoscenza, fondandosi essi stessi sull’idea della creazione collaborativa del software per il bene comune. Il progetto giCASES, tra i cui partner figurano membri attivi della Open Source Geospatial Foundation (OSGeo), intende fare tesoro di queste esperienze per assicurare il successo dei propri risultati

Iodine contrast agents do not influence Platelet-Rich Plasma function at an early time point in vitro

BACKGROUND: Iodine contrast agents (ICAs) are routinely used by radiologists to help guide intra-articular infiltrations. The aim of this study was to assess the in vitro effects of ICA on platelet function of human autologous Platelet-Rich Plasma (PRP). METHODS: One hundred thirty-seven consecutive patients with symptomatic femoral-patellar osteoarthritis were included. All were addressed to our institution for a fluoroscopy-guided intra-articular PRP infiltration of the pathological femoral-patellar joint. For each patient, 500 μl of PRP were sampled before intra-articular injection. First, PRP samples were mixed with 50 μl of 2 widely used ICA: Visipaque270® (Iodixanol, n = 58) and Iopamiron200® (Iopamidol, n = 69). PRP concentration ([PRP]) was measured at different delays of incubation (t = 0, 5, 10, 15, 20 and 30 min) enabling to calculate PRP ratio (defined as [PRP](t)/[PRP](0mn)) at each delay, for each mixture, in order to quantitatively assess the influence of ICA on PRP ratio. Second, the PRP samples of 10 additional patients were mixed with Visipaque270®, Visipaque270®, Iopamiron200® and phosphate buffer saline (PBS: control solution) in order to qualitatively assess the influence of ICA on platelet aggregation, using ADP, Collagen, Arachidonic acid and TRAP tests. The surface expression of human P-selectin, a marker of α-granule release, in the PRP + Visipaque270® and PRP + Iopamiron200® mixtures was finally compared. Repeated-measures ANOVA, classical 2-way ANOVA and Wilcoxon matched-pairs test were used to study the influence of ICA on PRP quality. RESULTS: There was no significant change in PRP ratio during the first 30mn of incubation (p = 0.991) whatever the ICA (p = 0.926). Whatever the aggregation test, there was no significant difference in the percentage of platelet aggregation between PRP + PBS, PRP + Visipaque270® and PRP + Iopamiron200® (p = 0.998), nor between PRP + PBS and PRP + Visipaque320® (p = 0.470). Finally, there was no significant difference in P-selectin expression between the PRP + Visipaque270® and PRP + Iopamiron200® mixtures (p = 0.500). CONCLUSION: At early delays of incubation, Visipaque® and Iopamiron®, which are two widely used ICA for intra-articular infiltrations, did not influence the in vitro platelet function nor the quality of PRP

Characterisation of <i>Candida</i> within the Mycobiome/Microbiome of the Lower Respiratory Tract of ICU Patients

<div><p>Whether the presence of <i>Candida spp</i>. in lower respiratory tract (LRT) secretions is a marker of underlying disease, intensive care unit (ICU) treatment and antibiotic therapy or contributes to poor clinical outcome is unclear. We investigated healthy controls, patients with proposed risk factors for <i>Candida</i> growth in LRT (antibiotic therapy, ICU treatment with and without antibiotic therapy), ICU patients with pneumonia and antibiotic therapy and candidemic patients (for comparison of truly invasive and colonizing <i>Candida spp</i>.). Fungal patterns were determined by conventional culture based microbiology combined with molecular approaches (next generation sequencing, multilocus sequence typing) for description of fungal and concommitant bacterial microbiota in LRT, and host and fungal biomarkes were investigated. Admission to and treatment on ICUs shifted LRT fungal microbiota to <i>Candida spp</i>. dominated fungal profiles but antibiotic therapy did not. Compared to controls, <i>Candida</i> was part of fungal microbiota in LRT of ICU patients without pneumonia with and without antibiotic therapy (63% and 50% of total fungal genera) and of ICU patients with pneumonia with antibiotic therapy (73%) (p<0.05). No case of invasive candidiasis originating from <i>Candida</i> in the LRT was detected. There was no common bacterial microbiota profile associated or dissociated with <i>Candida spp</i>. in LRT. Colonizing and invasive <i>Candida</i> strains (from candidemic patients) did not match to certain clades withdrawing the presence of a particular pathogenic and invasive clade. The presence of <i>Candida spp</i>. in the LRT rather reflected rapidly occurring LRT dysbiosis driven by ICU related factors than was associated with invasive candidiasis.</p></div