24 research outputs found

    Spatiotemporal Characteristics of the Largest HIV-1 CRF02_AG Outbreak in Spain: Evidence for Onward Transmissions

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    Background and Aim: The circulating recombinant form 02_AG (CRF02_AG) is the predominant clade among the human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) non-Bs with a prevalence of 5.97% (95% Confidence Interval-CI: 5.41–6.57%) across Spain. Our aim was to estimate the levels of regional clustering for CRF02_AG and the spatiotemporal characteristics of the largest CRF02_AG subepidemic in Spain.Methods: We studied 396 CRF02_AG sequences obtained from HIV-1 diagnosed patients during 2000–2014 from 10 autonomous communities of Spain. Phylogenetic analysis was performed on the 391 CRF02_AG sequences along with all globally sampled CRF02_AG sequences (N = 3,302) as references. Phylodynamic and phylogeographic analysis was performed to the largest CRF02_AG monophyletic cluster by a Bayesian method in BEAST v1.8.0 and by reconstructing ancestral states using the criterion of parsimony in Mesquite v3.4, respectively.Results: The HIV-1 CRF02_AG prevalence differed across Spanish autonomous communities we sampled from (p < 0.001). Phylogenetic analysis revealed that 52.7% of the CRF02_AG sequences formed 56 monophyletic clusters, with a range of 2–79 sequences. The CRF02_AG regional dispersal differed across Spain (p = 0.003), as suggested by monophyletic clustering. For the largest monophyletic cluster (subepidemic) (N = 79), 49.4% of the clustered sequences originated from Madrid, while most sequences (51.9%) had been obtained from men having sex with men (MSM). Molecular clock analysis suggested that the origin (tMRCA) of the CRF02_AG subepidemic was in 2002 (median estimate; 95% Highest Posterior Density-HPD interval: 1999–2004). Additionally, we found significant clustering within the CRF02_AG subepidemic according to the ethnic origin.Conclusion: CRF02_AG has been introduced as a result of multiple introductions in Spain, following regional dispersal in several cases. We showed that CRF02_AG transmissions were mostly due to regional dispersal in Spain. The hot-spot for the largest CRF02_AG regional subepidemic in Spain was in Madrid associated with MSM transmission risk group. The existence of subepidemics suggest that several spillovers occurred from Madrid to other areas. CRF02_AG sequences from Hispanics were clustered in a separate subclade suggesting no linkage between the local and Hispanic subepidemics

    Çédille, revista de estudios franceses

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    Presentació

    Seasonal forecasts of winter reservoirs inflow

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    Vídeo elaborado con motivo de la celebración del 15º Mediterranean Climate Outlook Forum (MedCOF) desarrollado de forma online entre el 15 de octubre y el 24 de noviembre de 2020

    La comprensión lectora : comprensión, interpretación y valoración de los textos literarios

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    Este proyecto de innovación educativa se presentó en el Congreso Internacional de Innovación en la Educación celebrado en Valladolid los días 26, 27 y 28 de abril de 2005Proyecto desarrollado en el centro de Educación Infantil y Primaria 'Teresa Revilla' ubicado en la localidad de 'Fresno el Viejo', al sur de la provincia de Valladolid, en la comarca de Medina del Campo. En el colegio se imparten en la actualidad los niveles de Educación Infantil, Educación Primaria y Educación Secundaria Obligatoria (primer ciclo). Participan en el proyecto un total de 100 alumnos pertenecientes a todas las etapas educativas. Se parte del planteamiento de que al fomento del uso de la biblioteca se le añade la introducción de las tecnologías de la información y de la comunicación en el aula, siendo una herramienta para el diseño de las unidades didácticas desarrolladas en el centro dirigidas a trabajar las técnicas de estudio, centradas básicamente en la comprensión lectora. La finalidad es conseguir un mayor aprovechamiento del trabajo de comprensión, que habitualmente se desarrolla en las diferentes asignaturas, prestando especial atención a las técnicas básicas para aumentar la comprensión lectora de los alumnos y a la formación del profesorado, orientada a la elaboración de programas educativos o trabajo con otros ya diseñados que permitan la utilización del ordenador como una herramienta más. Los objetivos operativos que se plantean son: 1) Buscar y aplicar nuevas técnicas para trabajar la comprensión lectora, a través de la aplicación de las tecnologías de la información y de la comunicación; 2) Continuar aplicando técnicas tradicionales (teatro, escritura creativa, talleres de diccionario, cuestionarios de comprensión lectora...); 3) Formar al profesorado en técnicas de comprensión lectora y en las tecnologías de la información y de la comunicación y 4) Realizar la Segunda Semana del Teatro Escolar del centro. El proceso de trabajo de forma secuencial ha sido el siguiente: a) Durante los dos primeros meses del curso se trabajó en la puesta a punto de los equipos para configurar un aula. En todos los equipos se instaló el programa CLIC, paralelamente se diseñó un horario para el acceso de los alumnos al aula de informática. b) En la formación del profesorado, hasta diciembre, se ha trabajado cómo estimular a los alumnos para adquirir unas pautas de trabajo individual levándose a las aulas. c) A partir del mes de noviembre, se ha desarrollado con el profesorado un curso para aprender a manejar el programa CLIC. d) De noviembre a mayo se han ido realizando los módulos de este curso que combinan tanto aspectos teóricos como actividades y ejercicios prácticos implementados en las aulas. e) Se han pasado a las alumnos fichas lectoras, con la intención de que ellos aprendan a comprender un texto de forma autónoma, evaluándose los resultados. f) Se ha realizado la 'Segunda Semana del Teatro' a finales de marzo con una alta participación de todos los miembros de la comunidad educativa. La metodología utilizada para el desarrollo del proyecto se ha sustentado en el trabajo del coordinador, bajo una estructura de trabajo común en el centro fundamentada en el diseño de actividades y propuestas que parten de los ciclos y después de analizarlos en Claustro se acuerdan y se ponen en práctica. La incidencia en el centro ha sido muy alta ya que se han reactivado las tareas de comprensión lectora, la búsqueda de materiales y la elaboración de los mismos incidiendo en: una mejor organización de los equipos, del espacio y de los tiempos; una preparación mayor en el profesorado que ha influido en la de los alumnos y alumnas; un mejor conocimiento de las técnicas informáticas; una mejora en los alumnos, en cuanto a dotarles de técnicas, pautas, ante cualquier trabajo de comprensión lectora. La valoración final se considera muy satisfactoria ya que se trabajan todos los objetivos propuestos con un índice de implicación del profesorado alto y con una incidencia favorable en la dinámica del centro. Se planteará mantener esta iniciativa buscando más aplicaciones directas en el aula aprovechando la preparación actual del profesorado, y las bases conseguidas con este proyecto. Señalar los materiales elaborados a partir del desarrollo de los contenidos del proyecto: CD con la recopilación de las diferentes fichas de comprensión lectora elaboradas, reseña de las fichas que de forma trimestral han trabajado los alumnos y alumnas; memoria con los trabajos y materiales elaborados junto con las conclusiones y reseña en vídeo de las obras de teatro correspondientes a la Segunda Semana del Teatro.Junta de Castilla y LeónCastilla y LeónJunta de Castilla y León. Consejería de Educación y Cultura; Monasterio de Nuestra Señora de Prado, Autovía Puente Colgante, s. n.; 47071 Valladolid; Tel. +34983411881; Fax +34983411939ES

    Developmental outcome of electroencephalographic findings in SYNGAP1 encephalopathy

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    SYNGAP1 haploinsufficiency results in a developmental and epileptic encephalopathy (DEE) causing generalized epilepsies accompanied by a spectrum of neurodevelopmental symptoms. Concerning interictal epileptiform discharges (IEDs) in electroencephalograms (EEG), potential biomarkers have been postulated, including changes in background activity, fixation-off sensitivity (FOS) or eye closure sensitivity (ECS). In this study we clinically evaluate a new cohort of 36 SYNGAP1-DEE individuals. Standardized questionnaires were employed to collect clinical, electroencephalographic and genetic data. We investigated electroencephalographic findings, focusing on the cortical distribution of interictal abnormalities and their changes with age. Among the 36 SYNGAP1-DEE cases 18 presented variants in the SYNGAP1 gene that had never been previously reported. The mean age of diagnosis was 8 years and 8 months, ranging from 2 to 17 years, with 55.9% being male. All subjects had global neurodevelopmental/language delay and behavioral abnormalities; 83.3% had moderate to profound intellectual disability (ID), 91.7% displayed autistic traits, 73% experienced sleep disorders and 86.1% suffered from epileptic seizures, mainly eyelid myoclonia with absences (55.3%). A total of 63 VEEGs were revised, observing a worsening of certain EEG findings with increasing age. A disorganized background was observed in all age ranges, yet this was more common among older cases. The main IEDs were bilateral synchronous and asynchronous posterior discharges, accounting for ≥50% in all age ranges. Generalized alterations with maximum amplitude in the anterior region showed as the second most frequent IED (≥15% in all age ranges) and were also more common with increasing age. Finally, diffuse fast activity was much more prevalent in cases with 6 years or older. To the best of our knowledge, this is the first study to analyze EEG features across different age groups, revealing an increase in interictal abnormalities over infancy and adolescence. Our findings suggest that SYNGAP1 haploinsufficiency has complex effects in human brain development, some of which might unravel at different developmental stages. Furthermore, they highlight the potential of baseline EEG to identify candidate biomarkers and the importance of natural history studies to develop specialized therapies and clinical trials

    Discovering HIV related information by means of association rules and machine learning

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    Acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) is still one of the main health problems worldwide. It is therefore essential to keep making progress in improving the prognosis and quality of life of affected patients. One way to advance along this pathway is to uncover connections between other disorders associated with HIV/AIDS-so that they can be anticipated and possibly mitigated. We propose to achieve this by using Association Rules (ARs). They allow us to represent the dependencies between a number of diseases and other specific diseases. However, classical techniques systematically generate every AR meeting some minimal conditions on data frequency, hence generating a vast amount of uninteresting ARs, which need to be filtered out. The lack of manually annotated ARs has favored unsupervised filtering, even though they produce limited results. In this paper, we propose a semi-supervised system, able to identify relevant ARs among HIV-related diseases with a minimal amount of annotated training data. Our system has been able to extract a good number of relationships between HIV-related diseases that have been previously detected in the literature but are scattered and are often little known. Furthermore, a number of plausible new relationships have shown up which deserve further investigation by qualified medical experts
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