Mapeo por asociación de resistencia a la enfermedad Mal de Río Cuarto en maíz

El Mal de Río Cuarto (MRC) es la enfermedad viral más importante del maíz (Zea mays L.) en Argentina. El uso de genotipos resistentes es el medio más económico, ambientalmente sostenible y efectivo para controlar enfermedades en cultivos extensivos. El objetivo de este trabajo fue identificar regiones genómicas asociadas con la resistencia a la enfermedad MRC en un grupo de líneas de maíz de CIMMYT. Una revisión sistemática y un meta-análisis se realizaron con el propósito de identificar cromosomas que portan QTL de efecto mayor para resistencia a enfermedades virales en maíz. La evaluación fenotípica de 291 líneas de maíz se realizó en cuatro localidades de la provincia de Córdoba, Argentina durante 2015/16, 2016/17 y 2017/18. La combinación año-localidad definió nueve ambientes. A partir de los síntomas observados se estimaron los caracteres severidad (SEV), incidencia (INC) e índice de severidad de la enfermedad (ISE) MRC. Las medias ajustadas de las líneas de maíz en cada uno de tres ambientes y la mejor predicción lineal insesgada (BLUP) a través de éstos se estimaron mediante modelos lineales mixtos. A partir de la caracterización genotípica disponible públicamente de las líneas de maíz, se seleccionaron 45.925 SNPs. El análisis de estructura genética poblacional indicó la presencia de tres subgrupos definidos en base a la adaptación ambiental de las líneas de maíz. El análisis del desequilibrio de ligamiento (DL) mostró una rápida caída (10-20 kb; r2<0,10) que brindó la posibilidad de alcanzar una alta resolución de mapeo. El análisis de mapeo por asociación se realizó para los tres ambientes que permitieron diferenciar a los genotipos. Este permitió identificar 54 marcadores SNPs, en 46 regiones genómicas, asociados significativamente con la resistencia a la enfermedad MRC. La variación fenotípica explicada por estos QTL osciló entre 6% y 24%, con un valor medio de 10%. Veintitrés de estos marcadores se encuentran en regiones donde previamente se reportaron grupos de genes y QTL para resistencia a enfermedades virales en maíz. El análisis de regresión lineal múltiple con los marcadores significativos en la asociación permitió identificar 2, 3, 4 y 5 SNPs que explicaron entre 21% y 44% de la variación fenotípica, según carácter y ambiente. Estos SNPs resultan promisorios para la selección de líneas de maíz de CIMMYT con alelos favorables para la resistencia a la enfermedad MRC.Mal de Rio Cuarto(MRC) is the most important viral disease of maize (Zea maysL.) in Argentina. The development of resistant genotypes is the most economical, environmentally sustainable and effective wayfor controlling this disease. The aim of this study was to detect genomic regions associated with resistance to MRC disease in maize lines. Systematic review and meta-analysis were performed to identify chromosomes carrying major-effect QTL for resistance to viral diseases in maize. Severity (SEV), incidence (INC) and disease severity index (DSI) estimated in three environments and 45,925 SNPsin a population of genotypes were used to identify genomic regions associated with MRC disease resistance. Mixed models were used to estimate the best linear unbiased estimation(BLUE) of maize linesin each environment and the best linear unbiased prediction (BLUP) across environment. Population structure analysis showed three subgroups. Linkage disequilibrium(LD) analysis indicated faster LD decay(10-20 kb; r2<0,10),that allowed achievement a higher mapping resolution. Association mapping allowed to identify 54 significant SNPs associated to MRC resistancein all environments. These SNPs were grouped in 46 genomic regions.The phenotypic variation explained by these QTL ranged between 6% and 24%,with an average value of 10%. Twenty-three SNPs were localized in the same genomic regions where previously were reported maize viral diseases resistance QTLs and gene clusters. The ability of multiple linear regression models toexplain large proportions of the phenotypic variances suggests that simple assays involving a small number of SNP scould be designed for selecting lines with favorable alleles for MRC disease resistance.Fil: Rossi, Ezequiel Alejandro. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Preparation of an environmentally friendly lead adsorbent. A contribution to the rational design of heavy metal adsorbents

This work described the preparation and characterization of water insoluble chitosan derivatives as lead adsorbents. In highly regioselective reactions, N-substituted crosslinked chitosan derivatives were obtained by crosslinking native chitosan with mucic and adipic acid (a polyhydroxylated and a non-functionalized diacid of the same length chains). The crosslinking degree of the chitosan modified with adipic acid was significantly higher than that crosslinked with mucic acid (0.446 and 0.316, respectively), while the degree of substitution was almost the same (approximately 80 %). Lead adsorption isotherms were constructed at different temperatures and adjusted to well-known models, obtaining the best fit to the experimental data with Langmuir model. The lead adsorption capacity of new materials was greater than many of the adsorbents described in literature (76.3 and 69.7 mg g−1 for chitosan modified with mucic and adipic acid, respectively). Moreover, thermodynamic parameters were calculated, and results showed that the lead adsorption on the derivatives was spontaneous, exothermic, and governed by chemical interaction. Besides, kinetic studies were performed and adjusted to well-known models. The pseudo-second order kinetic equation was the one that most appropriately described the lead adsorption on the new materials. Results were consistent with the strong electrostatic attraction established between the lead cations and the free carboxylate groups of the derivatives.Fil: Rossi, Ezequiel. Instituto Tecnológico de Buenos Aires. Departamento de Ingeniería Química; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Avila Ramirez, Jhon Alejandro. Instituto Tecnológico de Buenos Aires. Departamento de Ingeniería Química; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Errea, María Inés. Instituto Tecnológico de Buenos Aires. Departamento de Ingeniería Química; Argentin

Identifying inbred lines with resistance to endemic diseases in exotic maize germplasm

Mal de Rio Cuarto (MRC) and common rust (CR), caused by Mal de Rio Cuarto virus (MRCV) and Puccinia sorghi, respectively, are endemic diseases affecting maize (Zea mays L.) production in Argentina. Exotic maize germplasm is an important source of resistance to these diseases. The aim of this work was to identify maize lines that exhibit MRC and CR resistance. A multienvironment trial was performed to phenotypically assess a diverse panel of inbred lines from the International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT). The maize lines were evaluated using a disease severity index (DSI) for MRC and CR in the central area of Argentina. A multitrait mixed linear model (MLM) was used to identify the lines with the best performance for both diseases and estimate genetic parameters. No correlation of resistance between MRC and CR was found among the tested lines. Additionally, best linear unbiased predictions (BLUPs) of genotypic effects were used as response variable to perform a genome-wide association study (GWAS). The GWAS revealed promising alleles for maize breeding, two associated with MRC and three with CR. Lines with lower DSI for MRC and CR were identified as novel materials for incorporating resistance to the local germplasm.Fil: Rossi, Ezequiel Alejandro. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; ArgentinaFil: Ruiz, Marcos. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; ArgentinaFil: Bonamico, Natalia Cecilia. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; ArgentinaFil: Balzarini, Monica Graciela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; Argentin

Genome-wide association study of resistance to Mal de Río Cuarto disease in maize

Argentine maize has been extensively screened for incidence (INC) and severity (SEV) of Mal de Río Cuarto disease (MRC), caused by Mal de Río Cuarto virus (MRCV), family Reoviridae, genus Fijivirus, narrowing the breeding genetic basis. Both traits are highly heritable phenotypic measurements, and quantify the strong disease impact on grain yield. The adaptation of exotic germplasm to variation of those traits has not been explored. The aim of this work was to identify, in a non-local and diverse panel of maize inbred lines, novel genomic regions associated with resistance to MRC. First, we phenotyped 206 maize inbred lines from the International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), in several environments of the MRC-endemic area under natural virus infection, to obtain the best linear unbiased predictor (BLUP) of line effects regarding INC and SEV. A multi-environment and multi-trait mixed linear model was fitted to derive the multivariate BLUPs. Genetic variance and mean-basis heritability were high in both traits and a significant genetic correlation among them was found. Second, we performed a genome-wide association study (GWAS) by linking the BLUPs with 78,376 SNP markers available for 186 lines. The GWAS identified new alleles for resistance to MRC in six genomic regions from the exotic germoplasm. Four of them reduce symultaneously the appearance and severity of disease symptoms. Improved susceptible parental lines through marker-assisted recurrent selection would allow us to increase the resistance of maize hybrids to MRC disease.Fil: Rossi, Ezequiel Alejandro. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; ArgentinaFil: Ruiz, Marcos. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; ArgentinaFil: Bonamico, Natalia Cecilia. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; ArgentinaFil: Balzarini, Monica Graciela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; Argentin

Interacción genotipo-ambiente de la resistencia a Mal de Rio Cuarto en maíz y su implicancia en la selección genómica

La variación de los niveles de infección de la enfermedad Mal de Rio Cuarto (MRC) en maíz (Zea mays L.) impacta en las varianzas de interacción. La interacción genotipo-ambiente (GxE) para resistencia a MRC, a su vez, impacta la selección genómica. Nuestro objetivo fue analizar la eficiencia de la predicción genómica de resistencia a MRC bajo distintos escenarios de interacción GxE. Evaluamos un panel diverso de 290 líneas de maíz respecto al índice de severidad (ISE) en 11 ambientes de la región donde la enfermedad es endémica. Se estimó varianza genotípica (Var(G)) y Var(GxE) y se realizó predicción genómica (PG) a partir de 10810 SNPs y diferentes modelos para las estructuras de (co)varianzas para GxE y residual. La PG se realizó trabajando con los 11 ambientes y con subgrupos de tres ambientes de menor incidencia (56%). La Var(GxE) fue menor a Var(G) en ambientes de incidencia alta (H2=0.70), donde la eficiencia de la PG también fue mayor (r2=0,43 para predecir nuevos genotipos). En ambientes de baja incidencia Var(GxE) representó el 86% de la variabilidad total del ISE y la eficiencia de la PG fue baja (r2=0,08). Trabajar con todos los ambientes, incrementó las estimaciones de varianza ambiental pero no la H2 y consecuentemente no mejoró la PG. Un mejor entendimiento fenotípico de la interacción GxE es esencial para tomar mejores decisiones basadas en información genómica.Fil: Rossi, Ezequiel Alejandro. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; ArgentinaFil: Ruiz, Marcos. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; ArgentinaFil: Bonamico, Natalia Cecilia. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; ArgentinaFil: Balzarini, Monica Graciela. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Desarrollo Rural. Area de Estadística y Biometría; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; ArgentinaXVIII Congreso Latinoamericano de Genética LIV Reunión Anual de la Sociedad de Genética de Chile; XLIX Congreso Argentino de Genética; VIII Congreso de la Sociedad Uruguaya de Genética; I Congreso Paraguayo de Genética y V Congreso Latinoamericano de Genética HumanaVirtualChileSociedad Argentina de Genétic

Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz

El Mal de Río Cuarto (MRC) es una de las enfermedades virales más importantes del maíz en Argentina. El índice de severidad de enfermedad (ISE) permite combinar la incidencia y la severidad de una enfermedad en una métrica única. La reacción genotípica a MRC ha sido muy estudiada en poblaciones biparentales, sin embargo este carácter complejo no se ha analizado mediante estudios de mapeo por asociación. El objetivo del presente trabajo es identificar nuevos alelos de resistencia asociados con el ISE de la enfermedad MRC de maíz en un germoplasma exótico del Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT). Una población de líneas de maíz del CIMMYT se evaluó fenotípicamente en ambientes donde la enfermedad es endémica. Los predictores del efecto genotípico (BLUP, best linear unbiased predictor) del ISE de MRC y 78.376 marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) se usaron para realizar el mapeo por asociación en 186 líneas de maíz. Los componentes de varianza y los valores de heredabilidad sugieren una amplia variabilidad genotípica en la población de líneas. El mapeo por asociación permitió identificar 11 posibles QTL de resistencia a MRC. La incorporación de germoplasma exótico en los programas de mejoramiento de maíz locales podría contribuir favorablemente a la creación de genotipos híbridos con mayor nivel de resistencia a MRC. La capacidad predictiva de los marcadores asociados con la resistencia a MRC indican que la selección asistida por marcadores es una herramienta recomendable para seleccionar genotipos resistentes a MRC.Mal de Río Cuarto (MRC) is one of the most important viral diseases of maize in Argentina.The disease severity index (DSI) allows to combine the incidence and severity of a disease ina single metric. The genotypic reaction to MRC has been extensively studied in biparentalpopulations. However, this complex trait has not been analyzed by genome-wide associationstudies (GWAS). The aim of this work is to identify new resistance alleles associated withDSI of MRC in an exotic germplasm from the International Maize and Wheat ImprovementCenter (CIMMYT). A population of maize lines from CIMMYT was phenotypicallyevaluated in environments in the area where the disease is endemic. The predictors ofgenetic effects (BLUP, best linear unbiased predictor) and 78,376 SNP markers (SingleNucleotide Polymorphism) were used to perform the GWAS in 186 maize lines. The valuesof variance components and mean-basis heritability suggest a wide genotypic variabilityin the population. The GWAS allowed to identify 11 putative QTL of resistance to MRC. Theincorporation of exotic germplasm into local maize breeding programs could contributefavorably to the creation of hybrids with a higher level of resistance to MRC. The predictiveability of associated markers with MRC resistance indicates that marker-assisted selectionis an advisable tool for selecting MRC resistant genotypes.Fil: Rossi, Ezequiel Alejandro. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; ArgentinaFil: Ruiz, Marcos. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; ArgentinaFil: Bonamico, Natalia Cecilia. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnológicas; ArgentinaFil: Balzarini, Monica Graciela. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Desarrollo Rural. Area de Estadística y Biometría; Argentin

Diversidad genotípica de 291 líneas de maíz de CIMMYT y caracterización fenotípica en el sur de Córdoba, Argentina

El maíz (Zea mays L.) posee un genoma complejo y una amplia diversidad genética. La información de caracteres fenotípicos y marcadores moleculares en su conjunto provee una mejor descripción e interpretación de la variabilidad genética. El objetivo del trabajo fue estimar la diversidad genética y caracterizar fenotípicamente un panel de 291 líneas de maíz de CIMMYT. Las líneas corresponden a ocho grupos establecidos de acuerdo a su adaptación ambiental y origen geográfico. Éstas se evaluaron fenotípicamente por medio de nueve caracteres agro-morfológicos en tres ambientes del sur de la provinciade Córdoba, Argentina. El intervalo antesis-estigma (IAE) presentó la mayor variabilidad fenotípica. El 40% de las líneas de maíz registraron un IAE menor a cinco días, indicando buena adaptación a los ambientes de evaluación. La estructura poblacional dada por los subgrupos de adaptación ambiental es sólo un factor menor que contribuye a la variabilidad fenotípica del panel estudiado. El análisis de componentes principales (ACP) permitió obtener el ordenamiento fenotípico y el genotípico, mientras que el análisis de procrustes generalizado indicó un consenso del 60% entre ambos ordenamientos para el total de líneas. El consenso entre el ordenamiento obtenido con caracteres agro-morfológicos y con marcadores moleculares indica desequilibrio de ligamiento entre los SNPs y los genes que controlan los caracteres agro-morfológicos. Los resultados muestran una amplia diversidad genética en el germoplasma evaluado, lo que sugiere que esta colección de líneas es un recurso importante para impulsar ganancias genéticas futuras en los programas de mejoramiento de maíz de Argentina.CIMMYT maize inbred lines (CMLs) are freely distributed to breeding programs around the world. Better information on phenotypic and genotypic diversity may provide guidance to breeders on how to use more efficiently the CMLs in their breeding programs. In this study a group of 291 CIMMYT maize inbred lines,was phenotyped by nine agro-morphological traits in south Córdoba, Argentina and genotyped using 18,082 SNPs. Based on the geographic information and the environmental adaptation, 291 CMLs were classified into eight subgroups. Anthesis-silking interval (IAE) was the trait with higher phenotypic diversity. A 40% of maize inbred lines, with IAE less than five days, show a good adaptation to growing conditions in south Córdoba, Argentina. The low phenotypic variation explained by environmental adaptation subgroups indicates that population structure is only a minor factor contributing to phenotypic diversity in this panel. Principal component analysis (ACP) allowed us to obtain phenotypic and genotypic orderings. Generalized procrustes analysis (APG) indicated a 60% consensus between both data type from the total panel of maizelines. In each environmental adaptation subgroup, the APG consensus was higher. This result, which might indicate linkage disequilibrium between SNPs markers and the genes controlling these agro-morphological traits, is promising and could be used as an initial tool in the identification of Quantitative Trait Loci (QTL). Information on genetic diversity, population structure and phenotypic diversity in local environments will help maize breeders to better understand how to use the current CIMMYT maize inbred lines group.Fil: Rossi, Ezequiel Alejandro. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; ArgentinaFil: Ruiz, Marcos. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; ArgentinaFil: Di Renzo, Miguel Angel. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; ArgentinaFil: Bonamico, Natalia Cecilia. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Agronomia y Veterinaria. Departamento de Biología Agrícola. Cátedra de Mejoramiento Genetico; Argentina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Cs.exactas Fisicoquimicas y Naturales. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Instituto de Investigaciones Agrobiotecnologicas.; Argentin

Infected pancreatic necrosis: outcomes and clinical predictors of mortality. A post hoc analysis of the MANCTRA-1 international study

: The identification of high-risk patients in the early stages of infected pancreatic necrosis (IPN) is critical, because it could help the clinicians to adopt more effective management strategies. We conducted a post hoc analysis of the MANCTRA-1 international study to assess the association between clinical risk factors and mortality among adult patients with IPN. Univariable and multivariable logistic regression models were used to identify prognostic factors of mortality. We identified 247 consecutive patients with IPN hospitalised between January 2019 and December 2020. History of uncontrolled arterial hypertension (p = 0.032; 95% CI 1.135-15.882; aOR 4.245), qSOFA (p = 0.005; 95% CI 1.359-5.879; aOR 2.828), renal failure (p = 0.022; 95% CI 1.138-5.442; aOR 2.489), and haemodynamic failure (p = 0.018; 95% CI 1.184-5.978; aOR 2.661), were identified as independent predictors of mortality in IPN patients. Cholangitis (p = 0.003; 95% CI 1.598-9.930; aOR 3.983), abdominal compartment syndrome (p = 0.032; 95% CI 1.090-6.967; aOR 2.735), and gastrointestinal/intra-abdominal bleeding (p = 0.009; 95% CI 1.286-5.712; aOR 2.710) were independently associated with the risk of mortality. Upfront open surgical necrosectomy was strongly associated with the risk of mortality (p &lt; 0.001; 95% CI 1.912-7.442; aOR 3.772), whereas endoscopic drainage of pancreatic necrosis (p = 0.018; 95% CI 0.138-0.834; aOR 0.339) and enteral nutrition (p = 0.003; 95% CI 0.143-0.716; aOR 0.320) were found as protective factors. Organ failure, acute cholangitis, and upfront open surgical necrosectomy were the most significant predictors of mortality. Our study confirmed that, even in a subgroup of particularly ill patients such as those with IPN, upfront open surgery should be avoided as much as possible. Study protocol registered in ClinicalTrials.Gov (I.D. Number NCT04747990)

Aprendizajes y prácticas educativas en las actuales condiciones de época: COVID-19

“Esta obra colectiva es el resultado de una convocatoria a docentes, investigadores y profesionales del campo pedagógico a visibilizar procesos investigativos y prácticas educativas situadas en el marco de COVI-19. La misma se inscribe en el trabajo llevado a cabo por el equipo de Investigación responsable del Proyecto “Sentidos y significados acerca de aprender en las actuales condiciones de época: un estudio con docentes y estudiantes de la educación secundarias en la ciudad de Córdoba” de la Facultad de Filosofía y Humanidades. Universidad Nacional de Córdoba. El momento excepcional que estamos atravesando, pero que también nos atraviesa, ha modificado la percepción temporal a punto tal que habitamos un tiempo acelerado y angustiante que nos exige la producción de conocimiento provisorio. La presente publicación surge como un espacio para detenernos a documentar lo que nos acontece y, a su vez, como oportunidad para atesorar y resguardar las experiencias educativas que hemos construido, inventado y reinventando en este contexto. En ella encontrarán pluralidad de voces acerca de enseñar y aprender durante la pandemia. Este texto es una pausa para reflexionar sobre el hacer y las prácticas educativas por venir”.Fil: Beltramino, Lucia (comp.). Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Filosofía y Humanidades. Escuela de Archivología; Argentina

Variabilidad y estructura genética en líneas endocriadas de maíz

El maíz (Zea mays L), debido a la variabilidad genética disponible, es un excelente modelo vegetal para comprender la variación natural. Posee un genoma complejo y un alto nivel de diversidad en comparación con otras especies de plantas. En el presente estudio, un grupo diverso de 291 líneas endocriadas de maíz desarrolladas en el Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) se evaluó por su fenotipo y se caracterizó por su genotipo. La evaluación fenotípica se realizó en el sur de la provincia de Córdoba, Argentina, en la localidad de Río Cuarto, durante los ciclos agrícolas 2015/2016 (E1) y 2016/2017 (E2), y en la localidad de Chaján durante el ciclo agrícola 2016/2017 (E3). En el ambiente E1 se utilizó un diseño completamente al azar con una repetición. Mientras que para los ambientes E2 y E3 se utilizó un diseño en bloques aumentados parcialmente repetido, donde un 10 de los genotipos presentaron tres repeticiones y el resto solo una repetición. La evaluación fenotípica se realizó por medio de 12 caracteres agro-morfológicos. La caracterización genotípica, obtenida desde el CIMMYT, se realizó mediante marcadores moleculares SNP derivados de genotipado por secuenciación. En la caracterización de la diversidad genética, la estructura poblacional y el desequilibrio de ligamiento presentes en la población se utilizaron 2.498 SNP. El amplio rango de variación para todos los caracteres agro-morfológicos medidos en ambientes individuales y a través de ambientes, y los valores de heredabilidad estimados en sentido amplio entre 49 y 90 indican que las líneas de maíz evaluadas en este estudio poseen amplia variabilidad para los caracteres agro-morfológicos medidos. La descripción de la estructura genética poblacional permitió inferir la presencia de tres sub-grupos. La diversidad genética y el contenido de información polimórfica medios estimados fueron 0,33 y 0,30, respectivamente. Los valores de los coeficientes de parentesco relativo, en el 95 de las comparaciones entre pares de líneas, fueron menores a 0,10 y la distancia genética media fue 0,44. EL desequilibrio de ligamiento presentó una rápida caída y alcanzó un valor de r2 menor de 0,10 a una distancia de 500-1.000 kb. El Análisis de Coordenadas Principales permitió reducir la dimensión de la matriz de información fenotípica y genotípica, luego mediante el Análisis de Procrustes Generalizado se observó un consenso del 62 entre ambos tipos de ordenamientos. El grupo de líneas de maíz presenta estratificación en su estructura genética. Esto debe ser considerado al realizar estudios de mapeo por asociación. El ligamiento físico, como principal causa del desequilibrio de ligamiento presente en la población, y la rápida caída del mismo, indican que este grupo de líneas de maíz es adecuado para posteriores estudios de mapeo por asociación. El moderado valor de consenso observado indica desequilibrio de ligamento entre los marcadores moleculares y los genes que controlan los 12 caracteres agro-morfológicos medidos.Choice of germplasm is critical to the success of association analysis. Genetic or phenotypic surveys can be used to identify genotypically diverse subsets of the available germplasm. The present study was conducted to analyze the variability and population structure among 291 CIMMYT maize inbred lines using agro-morphological traits and SNP markers. Phenotypic evaluation was performing in three environments. A total of 2.498 SNP was used to estímate the genetic diversity, population structure and famitial relatedness. The broad-sense heritability between 49 and 90% for all traits showed abundant genotypic variability in the group of CIMMYT maize inbred lines. Structure analysis showed the presence of three sub-groups. The kinship coefficients were minors at 0.10 in 95 of pair of inbred lines. The average genetic distance was 0.44. Linkage disequilibrium showed a rapid decay of 500-1.000 kb at r2=0.10. Principal coordinate analysis allowed reducing the phenotypic and genotypic data matrix. Generalized procrustes analysis showed a 62 consensus between phenotypic and genotypic ordering. Group is suitable for mapping association studies because it presents a rapid decay of linkage disequilibrium. The consensus value indicated linkage disequilibrium between molecular markers and the genes controlling the agro-morphological traits.Fil: Apellido, Nombre. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil:Rossi, Ezequiel Alejandro. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentin