Alergia a la proteína de leche de vaca en la infancia: microbiota, hidrolizados y tolerancia

Trabajo presentado al XIII Workshop Sociedad Española de Microbiota, Probióticos y Prebióticos, celebrado en Valencia (España), del 7 la 9 de junio de 2022.Introducción La alergia a proteínas de leche de vaca (APLV) es la alergia alimentaria más frecuente en la infancia, habiéndose descrito posibles relaciones con la microbiota intestinal y con el tipo de alimentación. El objetivo de este trabajo es profundizar en el estudio de la microbiota intestinal en menores de un año con APLV y su relación con la adquisición de tolerancia y dieta, comparando muestras al diagnóstico y a los 6 meses de seguimiento con dieta de exclusión láctea. Metodología Se reclutaron 22 pacientes diagnosticados con APLV (14 mediados por IgE y 8 no mediados) y un grupo control de 25 niños sanos. Se recogieron muestras de heces y se realizó un análisis metataxonómico del ADNr 16S y de las regiones ITS de bifidobacterias por secuenciación. Se evaluaron las características clínico-epidemiológicas de los pacientes y se realizó un seguimiento a los 6 meses para evaluar tolerancia y el uso de distintas fórmulas terapéuticas de sustitución alimentaria. Resultados Se detectó un mayor porcentaje de secuencias pertenecientes al filo Actinobacteria (¿60%) en controles frente a casos (¿30%) al diagnóstico. Además, el patrón de abundancias relativas de bifidobacterias fue diferente entre controles y pacientes no mediados por IgE, con una menor proporción de B. longum en estos últimos. Tras la dieta de exclusión, sólo 3 de los pacientes, que estaban tomando distintos tipos de fórmulas terapéuticas, adquirió tolerancia, de los cuales 2 eran casos no mediados por IgE. Conclusiones En los pacientes APLV no IgE mediada se observaron perfiles microbianos distintos de los lactantes sanos, encontrándose a su vez en este grupo una mayor tolerancia al cabo de 6 meses. En tratamiento y seguimiento de la APLV la determinación de la microbiota intestinal puede ser clave para establecer posibles vínculos con la adquisición de tolerancia y el tipo de hidrolizado

Eliminating Error in the Chemical Abundance Scale for Extragalactic HII Regions

In an attempt to remove the systematic errors which have plagued the calibration of the HII region abundance sequence, we have theoretically modeled the extragalactic HII region sequence. We then used the theoretical spectra so generated in a double blind experiment to recover the chemical abundances using both the classical electron temperature + ionization correction factor technique, and the technique which depends on the use of strong emission lines (SELs) in the nebular spectrum to estimate the abundance of oxygen. We find a number of systematic trends, and we provide correction formulae which should remove systematic errors in the electron temperature + ionization correction factor technique. We also provide a critical evaluation of the various semi-empirical SEL techniques. Finally, we offer a scheme which should help to eliminate systematic errors in the SEL-derived chemical abundance scale for extragalactic HII regions.Comment: 24 pages, 9 Tables, 13 figures, accepted for publication in MNRAS. Updated considering minor changes during the final edition process and some few missing reference

Búsqueda de marcadores intestinales asociados a alergia a la proteína de leche de vaca

Resumen trabajo presentado en el XII Workshop Sociedad Española de Microbiota, Probióticos y Prebióticos (SEMiPyP) y I Congreso Sociedad Iberoamericana de Microbiota, Probióticos y Prebióticos (SIAMPYP), celebrado de forma virtual del 15 al 18 de septiembre de 2021.Introducción. De las reacciones de hipersensibilidad causadas por alimentos, la alergia a la proteína de la leche de vaca (APLV) es la más común en los lactantes. En la mayoría de casos se trata de una alergia mediada por IgE, si bien las formas no mediadas son las más desconocidas y difíciles de diagnosticar, con una afectación retardada y fundamentalmente digestiva. Dentro de estas destaca por su gravedad el síndrome de enterocolitis inducida por proteínas de leche de vaca (FPIES). Objetivo. El objetivo de este estudio es buscar biomarcadores microbianos e inflamatorios en heces asociados con distintas formas de presentación de APLV que pudieran facilitar el diagnóstico de estas patologías en la infancia. Metodología. Se parte de un grupo de pacientes = 1 año con distintas formas de presentación de APLV reclutados a lo largo de un año en tres Hospitales de Asturias. Con fines comparativos, se recluta en centros de atención primaria un grupo control de lactantes sanos sin ninguna enfermedad digestiva ni alérgica. A partir de las heces de los niños se realiza el análisis de parámetros inflamatorios, así como de la composición microbiana y de sus metabolitos. Resultados. Se detectaron distintos perfiles entre el grupo control y los pacientes en función del tipo de hipersensibilidad. Destaca la disminución de la excreción fecal de ácidos grasos de cadena corta (AGCC) en aquellos niños con formas no mediadas por IgE respecto al grupo de niños sanos y a los pacientes con APLV mediada por IgE. Conclusiones. Las poblaciones microbianas que se desarrollan en el intestino del lactante y la producción de metabolitos bacterianos específicos pueden ser claves en la interacción con el sistema inmunitario del lactante en este tipo de alergias. El análisis de muestras de heces podría ayudar al diagnóstico, sobre todo en los casos no mediados por IgE

SARS-CoV-2 viral load in nasopharyngeal swabs is not an independent predictor of unfavorable outcome

The aim was to assess the ability of nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load at first patient’s hospital evaluation to predict unfavorable outcomes. We conducted a prospective cohort study including 321 adult patients with confirmed COVID-19 through RT-PCR in nasopharyngeal swabs. Quantitative Synthetic SARS-CoV-2 RNA cycle threshold values were used to calculate the viral load in log10 copies/mL. Disease severity at the end of follow up was categorized into mild, moderate, and severe. Primary endpoint was a composite of intensive care unit (ICU) admission and/or death (n = 85, 26.4%). Univariable and multivariable logistic regression analyses were performed. Nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load over the second quartile (≥ 7.35 log10 copies/mL, p = 0.003) and second tertile (≥ 8.27 log10 copies/mL, p = 0.01) were associated to unfavorable outcome in the unadjusted logistic regression analysis. However, in the final multivariable analysis, viral load was not independently associated with an unfavorable outcome. Five predictors were independently associated with increased odds of ICU admission and/or death: age ≥ 70 years, SpO2, neutrophils > 7.5 × 103/µL, lactate dehydrogenase ≥ 300 U/L, and C-reactive protein ≥ 100 mg/L. In summary, nasopharyngeal SARS-CoV-2 viral load on admission is generally high in patients with COVID-19, regardless of illness severity, but it cannot be used as an independent predictor of unfavorable clinical outcome

Deep-sequencing reveals broad subtype-specific HCV resistance mutations associated with treatment failure

A percentage of hepatitis C virus (HCV)-infected patients fail direct acting antiviral (DAA)-based treatment regimens, often because of drug resistance-associated substitutions (RAS). The aim of this study was to characterize the resistance profile of a large cohort of patients failing DAA-based treatments, and investigate the relationship between HCV subtype and failure, as an aid to optimizing management of these patients. A new, standardized HCV-RAS testing protocol based on deep sequencing was designed and applied to 220 previously subtyped samples from patients failing DAA treatment, collected in 39 Spanish hospitals. The majority had received DAA-based interferon (IFN) a-free regimens; 79% had failed sofosbuvir-containing therapy. Genomic regions encoding the nonstructural protein (NS) 3, NS5A, and NS5B (DAA target regions) were analyzed using subtype-specific primers. Viral subtype distribution was as follows: genotype (G) 1, 62.7%; G3a, 21.4%; G4d, 12.3%; G2, 1.8%; and mixed infections 1.8%. Overall, 88.6% of patients carried at least 1 RAS, and 19% carried RAS at frequencies below 20% in the mutant spectrum. There were no differences in RAS selection between treatments with and without ribavirin. Regardless of the treatment received, each HCV subtype showed specific types of RAS. Of note, no RAS were detected in the target proteins of 18.6% of patients failing treatment, and 30.4% of patients had RAS in proteins that were not targets of the inhibitors they received. HCV patients failing DAA therapy showed a high diversity of RAS. Ribavirin use did not influence the type or number of RAS at failure. The subtype-specific pattern of RAS emergence underscores the importance of accurate HCV subtyping. The frequency of “extra-target” RAS suggests the need for RAS screening in all three DAA target regions

Dendritic cell deficiencies persist seven months after SARS-CoV-2 infection

Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus (SARS-CoV)-2 infection induces an exacerbated inflammation driven by innate immunity components. Dendritic cells (DCs) play a key role in the defense against viral infections, for instance plasmacytoid DCs (pDCs), have the capacity to produce vast amounts of interferon-alpha (IFN-α). In COVID-19 there is a deficit in DC numbers and IFN-α production, which has been associated with disease severity. In this work, we described that in addition to the DC deficiency, several DC activation and homing markers were altered in acute COVID-19 patients, which were associated with multiple inflammatory markers. Remarkably, previously hospitalized and nonhospitalized patients remained with decreased numbers of CD1c+ myeloid DCs and pDCs seven months after SARS-CoV-2 infection. Moreover, the expression of DC markers such as CD86 and CD4 were only restored in previously nonhospitalized patients, while no restoration of integrin β7 and indoleamine 2,3-dyoxigenase (IDO) levels were observed. These findings contribute to a better understanding of the immunological sequelae of COVID-19