Association between sleep-disordered breathing and breast cancer aggressiveness

Background Sleep-disordered breathing (SDB) has been associated with cancer aggressiveness, but studies focused on specific tumors are lacking. In this pilot study we investigated whether SDB is associated with breast cancer (BC) aggressiveness. Methods 83 consecutive women <65 years diagnosed with primary BC underwent a home respiratory polygraphy. Markers of SDB severity included the apnea-hypopnea index (AHI) and the 4% oxygen desaturation index (ODI4). The Ki67 proliferation index, lack of hormone receptors (HR-), Nottingham Histological Grade (NHG), and tumor stage were used as markers of BC aggressiveness. The association between SDB and molecular subtypes of BC was also assessed. Results The mean (SD) age was 48.8 (8.8) years and body mass index was 27.4 (5.4) Kg/m2. 42 women (50.6%) were post-menopausal. The median (IQR) AHI was 5.1 (2–9.4), and ODI4 was 1.5 (0.5–5.8). The median (IQR) AHI did not differ between the groups with Ki67>28% and Ki6728% and Ki67<29% (51.2% vs 52.3%, p = 0.90), HR- and HR+ (58.3% vs 49.1%, p = 0.47), NHG categories (p = 0.89), different tumor stages (p = 0.71), or molecular subtypes (p = 0.73). These results did not change when the ODI4 was used instead of the AHI. Conclusion Our results do not support an association between the presence or severity of SDB and BC aggressiveness.Asociación de Neumología y Cirugía Torácica del Sur (NEUMOSUR) 1/201

Biomarkers of Venous Thromboembolism Recurrence after Discontinuation of Low Molecular Weight Heparin Treatment for Cancer-Associated Thrombosis (HISPALIS-Study)

The most appropriate duration of anticoagulant treatment for cancer-associated venous thromboembolism (CAT) remains unclear. We have conducted a prospective multicenter study in CAT patients with more than 6 months of anticoagulant treatment to predict the risk of venous thromboembolism (VTE) recurrence after anticoagulation discontinuation. Blood samples were obtained when patients stopped the anticoagulation, at 21 days and at 90 days. In each sample we assessed different coagulation-related biomarkers: D-dimer (DD), high-sensitivity C-reactive protein (hs-CRP), P-selectin (PS), phospholipids, soluble tissue factor, factor VIII and the thrombin generation test. It was evaluated 325 CAT patients and 166 patients were included in the study, mean age 64 ± 17 years. VTE recurrence until 6 months after stopping anticoagulation treatment was 9.87% [95% confidence interval (CI): 6–15]. The biomarkers sub-distribution hazard ratios were 6.32 for ratio DD basal/DD 21 days > 2 (95% CI: 1.82–21.90), 6.36 for hs-CRP > 4.5 (95% CI: 1.73–23.40) and 5.58 for PS > 40 (95% CI: 1.46–21.30) after 21 days of stopping anticoagulation. This is the first study that has identified the DD ratio, hs-CRP and PS as potential biomarkers of VTE recurrence in cancer patients after the discontinuation of anticoagulation treatment. A risk-adapted strategy may allow the identification of the optimal time to withdraw the anticoagulation in each CAT patientmThis research was funded by Instituto de Salud Carlos III, grant number (PI15/01085; PI18/01640, PI20/00075), Sociedad Española de Trombosis y Hemostasia; Fundación Respira, grant number (140/2013), Fundación Neumosur, grant number (5/2013) and the LEO Pharma Research Foundation. Partial funding for open access charge: Universidad de Málaga

Anales del Instituto Español de Edafología, Ecología y Fisiología Vegetal Tomo 3

[Volumen 1] Cruz Rodríguez Muñoz / Suspensiones cromáticas de inulina.-- Enrique Gutiérrez Ríos / Acerca del potencial red-ox en suelos.-- José Mª Rodríguez de la Borbolla y Alcalá / Sobre la determinación del nitrógeno total en el tabaco.-- Salvador Rivas Goday.-EI. Schoenetum nigricantis, en la Ammophiletalia y Salicornetalia mediterráneas (Dehesa de la Albufera, Valencia).-- Salvador Rivas Goday y Francisco Bellot Rodríguez / Las formaciones del Zizyphys Lotus (L.) Lamk., en las dunas del Cabo de Gata.-- Luis Cavanillos Rodríguez / Una iniciación de estudios de Hidrología vegetal.-- José Mª Alboreda Herrera y Ángel Hoyos de Castro / Clasificaciones y tipos de suelos III : Clasificaciones químícas.-- Joaquín Agra Cadarso y Tomás Alvira Alvira / Sistematización de tierras y minerales a principios del siglo XVIII.-- Fritz Scheffer / Las formas del humus y su relación con la fertilidad del suelo[Volumen 2] Tomás Alvira Alvira / Contribución al estudio de los tierras rojas españolas.-- Enrique Gutiérrez Ríos / Procesos de erosión y tipos de suelos del Pirineo español.-- Miguel Deán Guelbenzu, Ángel Santos Ruiz y José María López Azcona / Estudio espectroquímico de algunos suelos españoles.-- Salvador Rivas Goday y Luis Mª Esteban Márquez de Prado / Observaciones ecológicas en la comarca de Tomajón (provincia de Guadalajara). (Nota previa).-- Francisco Bellot Rodríguez / Acerca del habitat del Montagnites radiosus (Poll) Holl en España.-- Fritz Scheffer / Movilización de las sustancies nutritivas del suelo por métodos agrícolasPeer reviewe

Anales de Edafología y Fisiología Vegetal Tomo 10 Número 3

Aleixandre Ferrandis, V. y García Verduch, A. / Relaciones entre algunas propiedades físicas, químicas y técnicas de las arcillas (ll).-- Burriel Martí, F. y Suárez y Suárez, A. / Sobre la influencia del abonado fosfatado en la composición química de los forrajes.-- R. de la Borbolla y Alcalá, J. M. y Cortés Muñoz, V. / Sobre la determinación de calcio y magnesio en el tabaco, sin previa mineralización.-- Botelho da Costa, J. V. / Importancia científica y práctica de la clasificación y cartografía de los suelos.-- Examen crítico del sistema americanoINFORMACIÓN III Congreso Internacional de Ingeniería Agronómica, en Italia, por E. Aranda.-- Acerca de los suelos colombianos.-- Notas: Los Dres. Wallace, Ogg y Roach, en el Instituto.-- Visita del Prof. Virtanen.-- Reunión de final de curso.-- Otras notas.-- Sociedad Española de Ciencia del SueloBIBLIOGRAFÍA Norman Carew: Ploughmann's Wisdom.-- A. DEmolon: La carence phosphorique. Ses repercussions en Biologie.-- V. S. C. Lawrence y J. Newell: Seed and Poting Compost.-- John J. Finan: Maize in the Great Herbals.-- E. Zander: Beitrage zur Herkumftsbestimmung bei Honing.-- A. E. Murneek y R. O. Whyte: Vernalization and Photoperiodism.-- L. Zechmeister: Progress in chromatographyPeer reviewe

Anales del Instituto Español de Edafología, Ecología y Fisiología Vegetal Tomo 7

[Volumen 1] Narcisa Martín Retortillo / Contribución al estudio de las turbas españolas.-- A. Hoyos de Castro y F. González García / Determinaciones analítica en la turba del Padul (Granada).-- M. Alía Medina y T. Alvira Alvira / Estudio geológico-edáfico de unas muestras del suelo salino de la sebja de Ougranat (Sáhara español).-- V. Aleixandre Ferrandis y J. García Vicente / Estudio físico-químico de algunos silico-aluminatos artificiales.-- F. Burriel y V. Hemando / El fósforo en los suelos II Sobre las interferencias del hierro y otros elementos en la valoración calorimétrica de fósforo.-- Luis Cavanillas / Estudios sobre transpiración vegetal (experiencias con trigo cultivado en lisímetros).-- Cruz Rodríguez / Aspectos ópticos en el desarrollo de semillas de «Gleditschia Lnacanthos» L..-- Conferencias del Prof. Emeleus en el Instituto Español de Edafología, Ecología y Fisiología Vegetal.-- Conferencias del Prof. Edelman en el Instituto Español de Edafología, Ecología y Fisiología Vegetal.-- Reseña[Volumen 2] Ángel Hoyos / Contribución al estudio de los suelos canarios.-- A. Hoyos de Castro y M. Pascual Talavera / Influencia del pH sobre las propiedades de suspensión de materiales arcillosos.-- Ernesto Vieitez y Ramón Dios / Influencia del riego intensivo sobre la composición química del «Holcus lanatus», «Lolium multiflorum» y «Po a annua».-- Luis Recalde Martínez / Influencia de la harmina en el crecimiento de plántulas de trigo.-- G. Erdtman / Algunos aspectos de la Palinología.-- José Mª. R. de la Borbolla y Alcalá y Mª de los Angeles Camoyán de R. de la Borbolla / La preparación de soluciones nutritivas para investigaciones de nutrición vegetal.-- Juan Ramírez Muñoz / Los yacimientos de lignito en la provincia de Granada.-- Libros recibidos.-- Reseña[Volumen 3] J. M. Albareda, F. Burriél y M. Muñoz Taboadela / Manganeso total en relación con el color de las tierras negras andaluzas.-- F. Burriel y V. Hernando / El fósforo en los suelos españoles.-III. Extracción del fósforo total de los suelos.-- V. Aleixandre Ferrandis y J. García Vicente / La variación de las propiedades físico-químicas de las arcillas con el tamaño de grano.-- E. Gutiérrez Ríos y F. González García / Sobre la serie isomorfa, mont-morillonita-beidellita.-- E. Gutiérrez Ríos y L. Hernando / Yacimientos de bentonita en Marruecos español.-- M. Font-Altaba.-Sobre un método de medida del grado de agregación en suelos.--Josefina Pérez Mateos / El estudio mineralógico de las arenas.-- José Antonio Jiménez Salas / El II Congreso Internacional de Mecánica del Suelo.-- Libros y Revistas.-- ReseñaPeer reviewe

Anales del Instituto Español de Edafología, Ecología y Fisiología Vegetal Tomo 5

[Volumen 1] Tomás Alvira Alvira y Manuel Alía Medina / Estudio geológico-edáfico de las tierras rojas situadas al Norte de Toledo.-- Emilio Zapatero Ballesteros y Agapito San Juan / Trabajos de microbiología forestal y agrícola en la provincia de Valladolid (I parte).-- Cruz Rodríguez Muñoz / Motril: un extenso microclima.-- Emilio Guinea / Phitobiología tropicalis¿Un caso de batracofilia en Orchidaceae?.-- Luis Cavanillas Rodrlguez y Mª Dolores Angulo Carpio / Estudios de transpiración vegetal.-- José Mª R. de la Borbolla y Alcalá y A. de Castro Brzezicki / Análisls de plantas II: La determínación de Nicotina.-- José Antonio Jiménez Salas / La mecánica del suelo, una nueva rama de la Edafología.-- Florencio Bustinza Lachiondo / Contribución a la historia de la penicilina.-- Hermann Stremme.-La cartografía de los tipos de suelos biogenéticos y el mapa edafológico internacional de Europa.-- Gerhard C. Redtich / Agricultura y su organización en Holanda.-- Reseña.-- Libros publicados[Volumen 2] E. Gutierrez Ríos y A. Mª Medina Ortega / Procesos de erosión en Sierra Nevada(I).-- José Antonio Jiménez Salas / Suelos de la zona del Protectorado de España en Marruecos.-- Ernesto Vieitez Cortizo / Estudios botánicos sobre la flora alergógena y contenido en polen de la atmósfera de la comarca de Santiago de Compostela.-- Luis Cavanillas Rodríguez / Estudios de transpiración vegetal.-- Arnaldo Socías Amorós / Un ciclo vital en el Pseudomonas aeruginosa.-- José Manuel Pertierra.-La conservación del suelo en los Estados Unidos de América del Norte y el problema español de la erosión.-- ReseñaPeer reviewe

Anales del Instituto Español de Edafología, Ecología y Fisiología Vegetal Tomo 6

[Volumen 1] Mariano Claver Aliod / Contribución al estudio de los suelos salícico-húmicos de la Sierra de Guadarrama.-- Enrique Gutiérrez Ríos y Lorenzo Hernando / Yacimientos de hentonita en Marruecos Español.-- A. Hoyos de Castro y F. González García / Identificación y propiedades de un caolín español.-- A. Hoyos de Castro y J. M. Ahumada Buesa / Nota sobre materiales de alfarería.-- F. Pino y J. Acosta Rodríguez / Nota sobre la determinación de hierro (II) en silicatos y rocas.-- Isidoro Asensio Amor / Estudio comparativo de métodos de análisis granulométricos de suelos.-- Luis Cavanillas Rodríguez / Estudios de transpiración vegetal (experiencías en Iisímetros con cultivos de maíz).--José Mª Rodríguez de la Borbolla y Alcalá / La influencia del cloro sobre las plantas.-- J. A. Jiménez Salas / La mecánica del suelo, una nueva rama de la Edafología (II).-- Charles Thom / Control de la población microbiana del suelo.-- Libros publicados.-- Reseña[Volumen 2] Manuel Carlos Alvarez Querol / Variables que influyen sobre la razón molecular sílice/alúmina en los suelos graníticos españoles.-- Ángel Hoyos de Castro / Contribución al estudio de los suelos silícicos españoles.-- Arturo Caballero López / Estudios fisiológicos relacionados con las fitohormonas en Sterubergia Lutea Gawl. et Ker.-- Charles Thom / The Penicillia. Molds men meet everyday (Los Penicillium, mohos que vemos todos los días).-- José Mª Sierra de la Guerra / ¿Edafología o Geonomía?.-- Reseña[Volumen 3] Vicente Aleixandre Ferrandis / Caracterización de algunas arcillas españolas por cambio de bases y curvas de deshidratación.-- José Mª Albareda Herrera y Cruz Rodríguez Muñoz.-Fenómenos de ordenación y reoanisotropía de arcillas.-- Fernando Burriel Martí y Valentín Hernando Fernández / El fósforo en los suelos españoles : I. Contribución a la determinación colorimétrica del fósforo.-- Florencio Bustinza Lachiondo y Arturo Caballero López / Sobre el empleo de un excipiente hidrosoluble en las técnicas de aplicación de fitohormonas.-- Ernesto Vieitez Cortizo y José L. Blanco / Relaciones entre la condición genética del maíz y las características biométricas de su polen (Trabajo preliminar).-- José Mª Albareda Herrera y Vicente Aleixandre Ferrandis / Sobre la aditividad en las deshidrataciones de mezclas de los minerales de arcilla.-- Libros publicados.--ReseñaPeer reviewe

Sorting Transcriptomics Immune Information from Tumor Molecular Features Allows Prediction of Response to Anti-PD1 Therapy in Patients with Advanced Melanoma

Immunotherapy based on anti-PD1 antibodies has improved the outcome of advanced melanoma. However, prediction of response to immunotherapy remains an unmet need in the field. Tumor PD-L1 expression, mutational burden, gene profiles and microbiome profiles have been proposed as potential markers but are not used in clinical practice. Probabilistic graphical models and classificatory algorithms were used to classify melanoma tumor samples from a TCGA cohort. A cohort of patients with advanced melanoma treated with PD-1 inhibitors was also analyzed. We established that gene expression data can be grouped in two different layers of information: immune and molecular. In the TCGA, the molecular classification provided information on processes such as epidermis development and keratinization, melanogenesis, and extracellular space and membrane. The immune layer classification was able to distinguish between responders and non-responders to immunotherapy in an independent series of patients with advanced melanoma treated with PD-1 inhibitors. We established that the immune information is independent than molecular features of the tumors in melanoma TCGA cohort, and an immune classification of these tumors was established. This immune classification was capable to determine what patients are going to respond to immunotherapy in a new cohort of patients with advanced melanoma treated with PD-1 inhibitors Therefore, this immune signature could be useful to the clinicians to identify those patients who will respond to immunotherapy

Multi-omics Characterization of Response to PD-1 Inhibitors in Advanced Melanoma

Immunotherapy improves the survival of patients with advanced melanoma, 40% of whom become long-term responders. However, not all patients respond to immunotherapy. Further knowledge of the processes involved in the response and resistance to immunotherapy is still needed. In this study, clinical paraffin samples from fifty-two advanced melanoma patients treated with anti-PD-1 inhibitors were assessed via high-throughput proteomics and RNA-seq. The obtained proteomics and transcriptomics data were analyzed using multi-omics network analyses based on probabilistic graphical models to identify those biological processes involved in the response to immunotherapy. Additionally, proteins related to overall survival were studied. The activity of the node formed by the proteins involved in protein processing in the endoplasmic reticulum and antigen presentation machinery was higher in responders compared to non-responders; the activity of the immune and inflammatory response node was also higher in those with complete or partial responses. A predictor for overall survival based on two proteins (AMBP and PDSM5) was defined. In summary, the response to anti-PD-1 therapy in advanced melanoma is related to protein processing in the endoplasmic reticulum, and also to genes involved in the immune and inflammatory responses. Finally, a two-protein predictor can define survival in advanced disease. The molecular characterization of the mechanisms involved in the response and resistance to immunotherapy in melanoma leads the way to establishing therapeutic alternatives for patients who will not respond to this treatment.ISSN:2072-669