Relación entre el tipo de percha y el comportamiento de agresividad en el lagarto Norops polylepis (Squamata: Dactyloidae)

A intensidade da agressão contra intrusos por detentores de um território tem sido relacionada ao tipo de recurso disponível para um indivíduo no interior de seu território. A influência das características do poleiro sobre o comportamento de agressão de machos residentes de Norops polylepis na presença de um macho intruso foi investigada neste estudo. Em cada poleiro, foram conduzidos encontros nos quais foi registrado o comportamento agressivo dos machos residentes, além do diâmetro do poleiro e o número de poleiros das proximidades. O comportamento agressivo de machos residentes aumentou em poleiros maiores e em algum grau em áreas com maior densidade de plântulas ao redor. São discutidas explicações potenciais para o alto grau de comportamento de agressão de N. polylepis em poleiros grandes e com elevado número de plântulas ao redor.The intensity of aggression against intruders by owners of a territory has been related to the type of resources available to an individual within its territory. The influence of perch-site characteristics on aggressive behavior of resident male Norops polylepis in presence of an intruder male was investigated in this study. At each perch site, pairwise encounters were conducted in which the aggressive behavior of resident males was recorded, along with the diameter of the perch and the number of nearby perches. Aggressive behavior of resident males increased on larger perches and to some extent in areas having greater density of nearby saplings. Potential explanations for the high aggressive behavior of N. polylepis on broad perches with high number of neighboring saplings are explored.La intensidad de agresión por individuos que son dueños de un territorio hacia los intrusos se ha relacionado con el tipo de recurso disponible en sus territorios. La influencia de las características del sitio de percha con el comportamiento de agresividad de los machos residentes de Norops polylepis en presencia de un macho intruso se investigó en este estudio. En cada sitio de percha se registró el comportamiento agresivo de los residentes, junto con los diámetros de percha y árboles jóvenes alrededor. Se encontró evidencia de que la agresión de los residentes incrementó en perchas con mayor diámetro y áreas con mayor densidad de árboles jóvenes. Explicaciones potenciales por el alto nivel de agresividad de N. polylepis en perchas anchas y con mayor número de árboles jóvenes alrededor fueron exploradas

Tratamiento físico, químico y biológico de residuos químicos de los laboratorios de docencia de la Universidad Nacional, Costa Rica

Herein, we report the physical, chemical, and biological treatment of wastewater generated in the teaching laboratories at Universidad Nacional, Costa Rica. Initial physicochemical treatment included neutralization and coagulation-flocculation, followed by a biological treatment with fungi (Aspergillus sp. and Penicillium dipodomyicola) or bacterias, the latter were isolated from the sludge from the campus’ wastewater treatment plant and the greywater collection tank at the School of Chemistry. The samples’ pH prior to treatment was ≤ 2, while COD ranged between 3000 and 30 000 mg/L. Gas chromatography-mass spectra analysis indicated the presence of 55 organic compounds in the wastewater, some of which reached undetectable concentrations after treatment. The fungi and the bacterial strain removed up to 50% of the substances, while the toxicity decreased with respect to time of exposure to the treatment. Results support the potential use of these microorganisms as bioremediators. Although the organic compounds were partially removed, the treated wastewater exhibited high toxicity for Daphnia magna (water flea). Further experiments with longer treatment times or other strains might be needed for effective removal of pollutants.En este trabajo, se reporta el tratamiento físico, químico y biológico de las aguas residuales generadas en los laboratorios de docencia de la Universidad Nacional, Costa Rica. El tratamiento fisicoquímico inicial incluyó la neutralización y la coagulación-floculación, seguido de un tratamiento biológico con hongos (Aspergillus sp. y Penicillium dipodomyicola) o bacterias; estos se aislaron del lodo de la planta de tratamiento de aguas residuales del campus y del tanque de recolección de aguas grises en la Escuela de Química. El pH de las muestras antes del tratamiento fue ≤ 2, mientras que la DQO osciló entre 3000 y 30 000 mg /L. El análisis de cromatografía de gases con detector de masa (GC/MS) indicó la presencia de 55 compuestos orgánicos en las aguas residuales, algunos de los cuales alcanzaron concentraciones indetectables después del tratamiento. Los hongos y la cepa bacteriana eliminaron hasta el 50 % de las sustancias, mientras que la toxicidad disminuyó con respecto al tiempo de exposición al tratamiento. Los resultados sugieren el uso potencial de estos microorganismos como biorremediadores. Aunque los compuestos orgánicos se eliminaron parcialmente, las aguas residuales tratadas exhibieron una alta toxicidad para Daphnia magna (pulga de agua). Son necesarios más experimentos con tiempos de tratamiento más largos u otras cepas, para la eliminación efectiva de contaminantes

Aislamiento de cepas bacterianas amonio y nitrito oxidantes a partir de suelo y su aplicación potencial en la disminución de nitrógeno en aguas residuales de tipo doméstico

Rodríguez Rodríguez, J. A. (2014). Aislamiento de cepas bacterianas amonio y nitrito oxidantes a partir de suelo y su aplicación potencial en la disminución de nitrógeno en aguas residuales de tipo doméstico. [Tesis de Licenciatura]. Universidad Nacional, Heredia, C.R.El suelo es la matriz fundamental donde suceden las reacciones químicas y biológicas que permiten el desarrollo de la vida en la tierra, y donde ocurren procesos fundamentales como la mineralización de los elementos y la fijación del nitrógeno. El nitrógeno es uno de los elementos fundamentales para el desarrollo de la vida al formar parte de la mayoría de las estructuras y componentes celulares, el cual es inaccesible a la mayoría de los organismos hasta que este sea fijando por parte de los microorganismos. Hoy en día el nitrógeno se ha transformado en uno de los principales elementos contaminantes de los cuerpos de agua, causando consecuencias como la eutrofización de ríos, lago y costas. En los ambientes acuáticos, el nitrógeno puede ser encontrado en forma de amonio N-NH4+, nitritos N-N02-o nitratos N-N03-, los cuales pueden ser utilizados por las bacterias nitrificantes amonio y nitrito oxidantes y desnitrificantes para su crecimiento y consecuente remoción. En este trabajo se realizó el recuento de bacterias nitrificantes, su aislamiento, identificación y la cuantificación de su capacidad nitrificante; las bacterias dieron aisladas de un punto del río Pirro contaminado con nitrógeno de aguas residuales de tipo doméstico. Por medio de la técnica de aislamiento en placa con medio mínimo mineral se lograron aislar y purificar siete cepas de microorganismos nitrificantes entre las que se encuentran cuatro de Streptomyces sp., una de Pseudomonas putida, una de Sphingomonas sp.y una de Aeromonas sp. utilizando la secuenciación genética y microplacas Biolog. Se encontró que existen 2,23 x105 UFC/g de suelo de bacterias amonio oxidantes y 2,2 x104 UFC/g de suelo de las nitrito oxidantes. La cuantificación de la capacidad nitrificante de las cepas por medio de los métodos colorimétricos determinó que la capacidad máxima de remoción de amonio es de 0,050 mg N/Vdía y la de nitrito en 0,903 mg N/Wdía. Se concluye que es posible realizar el recuento, aislamiento, identificación y cuantificación de la capacidad nitrificante de bacterias amonio y nitrito oxidantes aisladas del río Pirro.The soil is the fundamental matrix where the chemical and biological reactions that allow the development of life on earth take place, and where fundamental processes such as the mineralization of elements and nitrogen fixation occur. Nitrogen is one of the fundamental elements for the development of life as it is part of most cellular structures and components, which is inaccessible to most organisms until it is fixed by microorganisms. Today nitrogen has become one of the main polluting elements of water bodies, causing consequences such as eutrophication of rivers, lakes and coasts. In aquatic environments, nitrogen can be found in the form of ammonium N-NH4+, nitrites N-N02- or nitrates N-N03-, which can be used by oxidizing and denitrifying ammonium and nitrite nitrifying bacteria for their growth and consequent removal. In this work, the count of nitrifying bacteria, their isolation, identification and the quantification of their nitrifying capacity were carried out; The bacteria were isolated from a point in the Pirro River contaminated with nitrogen from domestic wastewater. Using the plate isolation technique with minimal mineral medium, it was possible to isolate and purify seven strains of nitrifying microorganisms, including four Streptomyces sp., one Pseudomonas putida, one Sphingomonas sp., and one Aeromonas sp. using genetic sequencing and Biolog microplates. It was found that there are 2.23 x105 CFU/g of soil of oxidizing ammonium bacteria and 2.2 x104 CFU/g of soil of oxidizing nitrite bacteria. Quantification of the nitrifying capacity of the strains by means of colorimetric methods determined that the maximum ammonium removal capacity is 0.050 mg N/Vday and that of nitrite is 0.903 mg N/Wday. It is concluded that it is possible to count, isolate, identify and quantify the nitrifying capacity of oxidizing ammonium and nitrite bacteria isolated from the Pirro River.Universidad Nacional, Costa RicaEscuela de Ciencias Biológica

The relationship between perch type and aggressive behavior in the lizard Norops polylepis (Squamata: Dactyloidae)

The intensity of aggression against intruders by owners of a territory has been related to the type of resources available to an individual within its territory. The influence of perch-site characteristics on aggressive behaviour of resident male Norops polylepis in presence of an intruder male was investigated in this study. At each perch site, pairwise encounters were conducted in which the aggressive behavior of resident males was recorded, along with the diameter of the perch and the number of nearby perches. Aggressive behavior of resident males increased on larger perches and to some extent in areas having greater density of nearby saplings. Potential explanations for the high aggressive behavior of N. polylepis on broad perches with high number of neighboring saplings are explored.La intensidad de la agresión contra intrusos por parte de los propietarios de un territorio se ha relacionado con el tipo de recursos disponibles para un individuo dentro de su territorio. En este estudio se investigó la influencia de las características del sitio de la percha en el comportamiento agresivo del macho residente Norops polylepis en presencia de un macho intruso. En cada sitio de percas, se realizaron encuentros por parejas en los que se registró el comportamiento agresivo de los machos residentes, junto con el diámetro de la perca y el número de perchas cercanas. El comportamiento agresivo de los machos residentes aumentó en perchas más grandes y, en cierta medida, en áreas con mayor densidad de retoños cercanos. Se exploran las posibles explicaciones del comportamiento altamente agresivo de N. polylepis en perchas amplias con un alto número de retoños vecinos.Universidad Nacional, Costa RicaEscuela de Ciencias Biológica

Qualidade da água superficial e pressões socioambientais na microbacia alta do rio Poás

El objetivo de esta investigación fue determinar la relación entre la calidad del agua superficial en la parte alta de la microcuenca del río Poás y las principales presiones socioambientales que pueden alterar este factor. Para ello se realizó un estudio exploratorio, con enfoque cuantitativo, donde se identificaron las principales presiones socioambientales que experimenta el recurso hídrico en la zona. Además, se analizó la calidad del agua superficial a través de indicadores físicos, químicos y microbiólogos, para la aplicación de dos índices de calidad. Se encontraron seis presiones socioambientales de impacto negativo al recurso, materializadas a través de acciones puntuales ejecutadas desde el hogar y otras actividades de tipo socioeconómico. A pesar de que la evidencia mostró cumplimiento mayoritario de los parámetros analizados con los criterios de calidad sugeridos a nivel nacional e internacional, los índices revelaron niveles de contaminación incipiente, además de calidad buena y media. Estadísticamente, se encontró que la calidad del agua de la microcuenca no varía espacialmente; sin embargo, sí lo hace de manera temporal, debido a la incidencia de los patrones de lluvia en la zona. Este hallazgo, en conjunto con la determinación de correlaciones significativas entre los parámetros monitoreados, contribuyó a reconocer que los sitios analizados en época lluviosa mantienen mayor relación con parámetros asociados con contaminación orgánica debido a procesos de escorrentía y descarga de agua residual. Por tanto, se plantea la necesidad de coordinar esfuerzos que garanticen la sostenibilidad de la microcuenca, que mejoren la infraestructura sanitaria local, fortalezcan los procesos de gestión del agua y se dirijan al establecimiento de una red de monitoreo desde un marco de referencia con visión de cuenca.The objective of this research was to determine the quality of surface water in the upper part of the Poás river micro basin and the main socio-environmental pressures that may be related to current quality indices. An exploratory study with a quantitative approach was carried out in which the main socio-environmental pressures experienced by the water resource in the area were identified, while the quality of the surface water was determined based on physical, chemical, and microbiological indicators, as well as the application of two quality indices. Six socio-environmental pressures with a negative impact on the resource were found and related to specific actions carried out in homes and other socio-economic activities. Despite the fact that the evidence showed overall compliance between the analyzed parameters and quality criteria used nationally and internationally, the indices revealed incipient contamination levels, as well as good and medium quality. Statistically, it was found that water quality of the micro-basin does not vary spatially; however, it does vary temporarily due to the incidence of rainfall patterns in the area. This finding, along with the determination of significant correlations between the monitored parameters, contributed to the recognition that the sites monitored in the rainy season have a stronger relationship with parameters associated with organic pollution linked to runoff and wastewater discharge processes. Therefore, it is necessary to coordinate efforts that guarantee sustainability of the micro basin that improve the local sanitary infrastructure, strengthen water management processes, and are focused on the establishment of a monitoring network within a reference framework oriented towards basins.O objetivo desta pesquisa foi determinar a relação entre a qualidade da água superficial na parte alta da microbacia do rio Poás e as principais pressões socioambientais que podem alterar esse fator. Para isso, foi realizado um estudo exploratório, com abordagem quantitativa, em que se identificaram as principais pressões socioambientais que o recurso hídrico experimenta na área. Além disso, foi analisada a qualidade da água superficial por meio de indicadores físicos, químicos e microbiológicos, para a aplicação de dois índices de qualidade. Foram encontradas seis pressões socioambientais de impacto negativo para o recurso, materializadas através de ações pontuais executadas desde casa e outras atividades de tipo socioeconômico. Apesar de a evidência mostrar a execução majoritária dos parâmetros analisados com os critérios de qualidade sugeridos no âmbito nacional e internacional, os índices revelaram níveis de contaminação incipiente, além da boa e média qualidade. Estatisticamente, descobriu-se que a qualidade da água da microbacia não varia espacialmente; porém, temporariamente, devido à incidência dos padrões de chuva na área. Esta descoberta, junto à determinação de correlações significativas entre os parâmetros monitorados, contribuiu para reconhecer que os lugares analisados na época chuvosa mantêm maior relação com parâmetros associados à contaminação orgânica causada por processos de escoamento e descarga de águas residuais. Portanto, estabelece-se a necessidade de coordenar esforços que garantam a sustentabilidade da microbacia, melhorem a infraestrutura sanitária local, reforcem os processos de gestão da água e conduzam ao estabelecimento de uma rede de monitoramento a partir de marco de referência com visão de bacia.Universidad Nacional, Costa RicaEscuela de QuímicaEscuela de Ciencias Biológica

Calidad fisicoquímica y microbiológica del agua superficial del río Grande de Tárcoles, Costa Rica: un enfoque ecológico​

Introduction: The quality of the water in a hydrographic basin and its potential use are affected by anthropic and natural factors. The Tárcoles River is the final receiver of waters from the central region of Costa Rica, where the treatment of wastewater is inadequate or non-existent. Objective: To evaluate water pollution in the river and review macroinvertebrates as ecosystem bioindicators. Methods: Physicochemical, microbiological and macroinvertebrate evaluations of the surface water were done in four sites for twelve consecutive months, including two water quality indices (ICA-NSF and Dutch). Monthly visits were made for the placement and collection of artificial substrates for aquatic macroinvertebrates, and bimonthly visits for the collection of water samples for ex situ analysis of the physicochemical and microbiological parameters. In addition, the land use in the lower part of Tárcoles was characterized from cover raster files. Results: Some physicochemical variables showed similar concentrations to those reported for other Costa Rican rivers, while oxygen showed lower values. The microbiological variables indicated high pollution levels, especially in the rainy season. In the dry season, there were more aquatic macroinvertebrates, and Chironomidae, Oligochaeta and Hydrobiidae were the most abundant. River pollution is categorized as “incipient” according to the Dutch index and as “medium quality” according to the ICA-NSF. Conclusions: the pollution of the Tárcoles River is mainly due to inadequate land use and anthropic activities. We recommend a basin management plan and research on ecosystem health and conservation of vulnerable species. Introducción: La calidad del agua en una cuenca hidrográfica, y su uso potencial, se ven afectados por factores antrópicos y naturales. El río Tárcoles es el receptor final de aguas de la región central de Costa Rica, donde el tratamiento de aguas residuales es inadecuado o inexistente. Objetivo: Evaluar la contaminación del agua en el río y evaluar a los macroinvertebrados como bioindicadores del ecosistema. Métodos: Se realizaron evaluaciones fisicoquímicas, microbiológicas y de macroinvertebrados del agua superficial en cuatro sitios durante doce meses consecutivos, incluidos dos índices de calidad del agua (ICA-NSF y holandés). Hicimos visitas mensuales para la colocación y recolección de sustratos artificiales para macroinvertebrados acuáticos, y visitas bimensuales para la recolección de muestras de agua para análisis ex situ de los parámetros fisicoquímicos y microbiológicos. Además, se caracterizó el uso del suelo en la parte baja de Tárcoles a partir de archivos tipo “raster” de cobertura. Resultados: Algunas variables fisicoquímicas tuvieron concentraciones similares a las informadas para otros ríos costarricenses, mientras que el oxígeno fue inferior. Las variables microbiológicas indicaron altos niveles de contaminación, especialmente en la época de lluvias. En la estación seca, hubo más macroinvertebrados acuáticos, siendo Chironomidae, Oligochaeta e Hydrobiidae los más abundantes. La contaminación de los ríos se clasifica como "incipiente" según el índice holandés y como "calidad media" según el ICA-NSF. Conclusiones: la contaminación del río Tárcoles se debe principalmente a un uso inadecuado del suelo y actividades antrópicas. Recomendamos un plan de gestión de cuencas e investigación sobre la salud del ecosistema y la conservación de especies vulnerables

Physical, chemical, and biological treatment of chemical waste from teaching laboratories at Universidad Nacional, Costa Rica

Herein, we report the physical, chemical, and biological treatment of wastewater generated in the teaching laboratories at Universidad Nacional, Costa Rica. Initial physicochemical treatment included neutralization and coagulation-flocculation, followed by a biological treatment with fungi (Aspergillus sp. and Penicillium dipodomyicola) or bacterias, the latter were isolated from the sludge from the campus’ wastewater treatment plant and the greywater collection tank at the School of Chemistry. The samples’ pH prior to treatment was ≤ 2, while COD ranged between 3000 and 30 000 mg/L. Gas chromatography-mass spectra analysis indicated the presence of 55 organic compounds in the wastewater, some of which reached undetectable concentrations after treatment. The fungi and the bacterial strain removed up to 50% of the substances, while the toxicity decreased with respect to time of exposure to the treatment. Results support the potential use of these microorganisms as bioremediators. Although the organic compounds were partially removed, the treated wastewater exhibited high toxicity for Daphnia magna (water flea). Further experiments with longer treatment times or other strains might be needed for effective removal of pollutants.En este trabajo, se reporta el tratamiento físico, químico y biológico de las aguas residuales generadas en los laboratorios de docencia de la Universidad Nacional, Costa Rica. El tratamiento fisicoquímico inicial incluyó la neutralización y la coagulación-floculación, seguido de un tratamiento biológico con hongos (Aspergillus sp. y Penicillium dipodomyicola) o bacterias; estos se aislaron del lodo de la planta de tratamiento de aguas residuales del campus y del tanque de recolección de aguas grises en la Escuela de Química. El pH de las muestras antes del tratamiento fue ≤ 2, mientras que la DQO osciló entre 3000 y 30 000 mg /L. El análisis de cromatografía de gases con detector de masa (GC/MS) indicó la presencia de 55 compuestos orgánicos en las aguas residuales, algunos de los cuales alcanzaron concentraciones indetectables después del tratamiento. Los hongos y la cepa bacteriana eliminaron hasta el 50 % de las sustancias, mientras que la toxicidad disminuyó con respecto al tiempo de exposición al tratamiento. Los resultados sugieren el uso potencial de estos microorganismos como biorremediadores. Aunque los compuestos orgánicos se eliminaron parcialmente, las aguas residuales tratadas exhibieron una alta toxicidad para Daphnia magna (pulga de agua). Son necesarios más experimentos con tiempos de tratamiento más largos u otras cepas, para la eliminación efectiva de contaminantes

Molecular identification of Streptococcus sp. and antibiotic resistance genes present in Tilapia farms (Oreochromis niloticus) from the Northern Pacific region, Costa Rica

Streptococcosis is a bacterial disease in tilapia that produces economic losses, caused mainly by Streptococcus agalactiae and S. iniae. It is treated using oxytetracycline and florfenicol, which when inappropriately used promotes the selection of antibiotic resis tance genes (ARGs). The disease has been mainly associated with stress events such as variations in temperature. The aims of the present study were (1) to detect by molecular methods two species of Streptococcus sp. in a tilapia farm, (2) to relate their presence to physicochemical parameters in the culture system, and (3) to detect the presence of ARGs in tilapia tissues and/or ponds. Tilapia grow-out ponds (n = 30) were sampled, collecting 15 individuals per pond. The physicochemical parameters of water were measured in each pond. Per pond, organs such as the liver, spleen, brain, and eyes were collected from each individual. Then, each organ type was pooled with the respective organ of the other individuals, processed for DNA extraction, and used for PCR analyses to determine the presence of S. agalactiae and S. iniae and for the detection of ARGs (tetM, tetO, fexA, and ermB). The correlations between the presence of S. agalactiae and water physico chemical parameters were determined. Sixty percent of the ponds and 46% of the organ pools were positive for S. agalactiae, whereas S. iniae was not detected. The positive samples showed the following resistance genes: tet(O) (29.1%), tet(M) (12.7%), and erm(B) (1.8%). A moderate but significant positive correlation was found between temperature and the presence of S. agalactiae. This work reported the molecular detection of two species of Streptococcus and ARGs, providing information that allows fast and effective control of these pathogens in tilapia farming. In addition, a future complemen tary study on Streptococcus sp. serotype distribution and antibiotic resistance genes from tilapia cultured in Costa Rica could also contribute to increase the knowledge of S. agalactiae infections in tilapia farming worldwide.La estreptococosis es una enfermedad bacteriana en la tilapia que produce pérdidas económicas, causadas principalmente por Streptococcus agalactiae y S. iniae. Se trata con oxitetraciclina y florfenicol, que cuando se utiliza de forma inapropiada promueve la selección de genes de resistencia a los antibióticos (ARG). La enfermedad se ha asociado principalmente con eventos de estrés como variaciones de temperatura. Los objetivos del presente estudio fueron (1) detectar por molecular métodos dos especies de Streptococcus sp. en una granja de tilapia, (2) relacionar su presencia con parámetros fisicoquímicos en el sistema de cultivo, y (3) detectar la presencia de ARG en tejidos de tilapia y/o estanques. Se tomaron muestras de estanques de engorde de tilapia (n = 30), recolectando 15 individuos por estanque. Los parámetros fisicoquímicos del agua se midieron en cada estanque. Por estanque, se recolectaron órganos como el hígado, el bazo, el cerebro y los ojos de cada individuo. Luego, cada tipo de órgano se combinó con el órgano respectivo del otro. individuos, procesados ​​para la extracción de ADN y utilizados para análisis de PCR para determinar la presencia de S. agalactiae y S. iniae y para la detección de ARG (tetM, tetO, fexA, y ermB). Se determinaron las correlaciones entre la presencia de S. agalactiae y los parámetros físico-químicos del agua. El sesenta por ciento de los estanques y el 46% del órgano. Los grupos fueron positivos para S. agalactiae, mientras que no se detectó S. iniae. Lo positivo Las muestras mostraron los siguientes genes de resistencia: tet(O) (29,1%), tet(M) (12,7%) y em(B) (1,8%). Se encontró una correlación positiva moderada pero significativa entre temperatura y presencia de S. agalactiae. Este trabajo reportó la detección molecular de dos especies de Streptococcus y ARGs, proporcionando información que permite una rápida y control efectivo de estos patógenos en el cultivo de tilapia. Además, un futuro estudio complementario sobre Streptococcus sp. distribución de serotipos y genes de resistencia a antibióticos de La tilapia cultivada en Costa Rica también podría contribuir a aumentar el conocimiento de Infecciones por S. agalactiae en el cultivo de tilapia en todo el mundo.Universidad Nacional, Costa RicaEuropean Aquaculture Society, BélgicaEscuela de Ciencias Biológica