Caracterización genética de aislamientos de Klebsiella pneumoniae, resistentes a carbapenémicos, remitidos al grupo de resistencia bacteriana de Bogotá GREBO por hospitales del distrito, en un periodo de 3 años

Klebsiella pneumoniae resistente a carbapenémicos (KPRC) es una de las especies de Enterobacterias, más comúnmente aisladas en el mundo, siendo la variante KPC-2 la reportada más ampliamente, la variante KPC-3 se ha relacionado sobre todo con brotes en hospitales. En Colombia la población bacteriana productora de carbapenemasas es endémica. Sin embargo, en aislamientos de enviados GREBO dentro de las actividades de vigilancia, la variante KPC-3 fue identificada más frecuentemente en varios hospitales de Bogotá, durante tres años consecutivos. Buscando caracterizar mejor este fenómeno en Bogotá, decidimos determinar las características genéticas de 82 aislamientos. La Concentración Inhibitoria Mínima encontradas frente a carbapenémicos los clasificaron como altamente resistentes y se encontraron diseminados en diferentes grupos clonales. Se realizó un estudio más detallado de 6 representantes de los grupos clonales. Todos fueron productores de TEM-1 y SHV-12, tienen un integrón clase I con dos genes casettes, dfrA12 y aadA2. El estudio de porinas, mostro que la OmpK35 no se expresó en ninguno de los clones evaluados, mientras que a OmpK36, mostro una IS5 en dos aislamientos, para el gen OmpK37 no se presentaron mutaciones. Todos los aislamientos pertenecieron al linaje clonal ST-258, la secuenciación del contexto del gen blaKPC-3 muestra que se encuentra flaqueando upstream por la ISKpn7 (ItsA y ItsB), que está dentro del transposon Tn4401. Nuestros resultados proporcionan un acercamiento a la diversidad genética de aislamientos tipo KPC-3, la cual se constituyó como el mecanismo de resistencia a carbapenémicos, más frecuente entre los aislamientos de Bogotá, lo que no es usual en América ya que esto se ha reportado más frecuentemente en Europa y Asia, aunque presentan características genéticas similares a las variantes KPC-2 reportadas previamente en Colombia. Nuestros hallazgos sugieren que la circulación y permanencia en el tiempo han incrementado la capacidad de estas cepas para adquirir mecanismos de resistencia adicionales y diseminarse hasta constituirse en un microorganismo de difícil contención a nivel hospitalario. Palabras clave: Carbapenemasas K. pneumoniae, resistencia bacterianaAbstract. Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) is one of the most commonly recovered Enterobacteriaceae species in the world. The variant producing the KPC-2 carbapenemase is the most frequently reported, and the variant KPC-3 has been mainly associated with nosocomial outbreaks. Colombia is considered an endemic country for strains producing both types of enzymes, however, during three consecutive years we have found KPC-3 in several non-outbreak related isolates in nine hospitals from Bogotá. To better understand this phenomenon we determine the genetic characteristics to 82 isolates of K. pneumoniae isolates producing KPC-3 enzyme, recovered in Bogota. We found high MIC to carbapenems and three major clonal groups scattered. We perform a more detailed study on six representative isolates of clonal groups. All presented TEM-1 and SHV-12, and a class I integron with two gene cassettes, dfrA12 and aadA2. The porin OmpK35 was not expressed in any of the isolates, while the porins OmpK36 and OmpK37 were expressed, with two isolates presenting the mutation IS5 in the OmpK36 porin. ST-258 was determined in all isolates, and the sequence of blaKPC-3 gene showed that it is flanking upstream by ISKpn7 (ITSA and ITSB), which is inside the transposon Tn4401 as previously reported. Our results provide more insights into the genetic diversity of isolates producing KPC-3, which is the most common mechanism of resistance to carbapenems, although it has not been commonly reported in Latin America, but more frequently in Europe and Asia. However, similar genetic characteristics have been reported in KPC-2 isolates in Colombia. Our findings suggest that the circulation of K. penumoniae has increased its ability to acquire additional mechanisms of resistance, which leads the microorganism to spread and become difficult to eradicate specially in hospitals.Maestrí

Distribución y caracterización fenotípica y genotípica de Listeria monocytogenes en aislamientos de alimentos, Colombia, 2010-2018

Introduction: Listeria monocytogenes is a food-borne pathogen that may cause infections in humans such as meningitis, meningoencephalitis, and septicemia, as well as abortions. By serological typing 13 serotypes have been identified of which 4b is responsible for most of the outbreaks in the world.Objective: To determine the frequency and distribution of serotypes and molecular subtypes of L. monocytogenes isolated in Colombia from food from 2010 to 2018.Materials and methods: We conducted a retrospective and descriptive study based on the analysis of 2,420 isolates confirmed as L. monocytogenes and other species using biochemical and serological tests, and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) for molecular subtyping.Results: Of the 2,420 isolates received, 2,326 were confirmed as L. monocytogenes.The serotypes found were 4b (52%), 4d-4e (14.5%), 1/2a (11%), 1/2c (9.4%), 1/2b (9%), and 3a, 3b, 3c, 4c, 4d, 4e and 7 (less than 2%). The isolates came from Bogotá (43%), Antioquia (25%), Valle (10%), Nariño (9%), and other departments (7%). The genotypic characterization grouped the isolates in 167 PFGE patterns. The most frequent patterns were identified in various dairy and meat products, and in prepared foods.Conclusion: A 96.1% of the isolates corresponded to L. monocytogenes showing good agreement between isolates and identification. Serotype 4b, highly virulent, was the most frequent. The molecular analysis showed the possible dissemination and permanence over time of several serotypes, which highlights the importance of including this pathogen in epidemiological food surveillance programs.Introducción. Listeria monocytogenes es un patógeno transmitido por alimentos que causa infecciones en humanos, entre ellas, meningitis, meningoencefalitis y septicemias, así como abortos. Con la tipificación serológica se han identificado 13 serotipos, siendo el 4b el causante de la mayoría de los brotes en el mundo.Objetivo. Determinar la frecuencia y la distribución de los serotipos y subtipos moleculares de L. monocytogenes aislados de alimentos en Colombia entre el 2010 y el 2018.Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo y retrospectivo a partir del análisis de 2.420 aislamientos que fueron identificados como L. monocytogenes y otras especies, por medio de pruebas bioquímicas, serológicas y de subtipificación molecular mediante electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE).Resultados. De los 2.420 aislamientos recibidos, 2.326 fueron confirmados como L. monocytogenes. Los serotipos encontrados fueron: 4b (52 %), 4d-4e (14,5 %), 1/2a (11 %), 1/2c (9,4 %), 1/2b (9 %), y 3a, 3b, 3c, 4c, 4d, 4e y 7 (menos de 2 %). Procedían de Bogotá (43 %), Antioquia (25 %), Valle (10 %), Nariño (9 %) y otros departamentos (7 %). La caracterización genotípica agrupó los aislamientos evaluados en 167 patrones de PFGE; los perfiles más frecuentes se presentaron en productos lácteos, cárnicos y alimentos preparados.Conclusión. El 96,1 % de los aislamientos correspondieron a L. monocytogenes, con una buena concordancia entre el aislamiento y la identificación; el serotipo 4b, extremadamente virulento, fue el más frecuente. El análisis molecular evidenció la posible diseminación y permanencia en el tiempo de varios serotipos, lo que resalta la importancia de incluir este patógeno en los programas de vigilancia epidemiológica en alimentos

Listeria monocytogenes en manipuladores de alimentos: un nuevo enfoque para tener en cuenta en los peligros de la industria alimentaria

Introduction: Foodborne diseases are a high-impact health problem. Listeria monocytogenesis frequently associated with contaminated meat and dairy foods. Monitoring their presence at various stages during production is important to control the spread of this microorganism.Objective: To determine the prevalence of L. monocytogenes in meat and dairy food handlers in ten departments of Colombia and to find an association between the presence of this microorganism and possible risk factors.Materials and methods: A cross sectional study was carried out to determine the presence of L. monocytogenes in fecal samples and swabs taken from the hands of 1322 food handlers. A questionnaire was applied to determine possible risk factors and a statistical analysis was carried out to determine frequencies and relationships between potential risk factors and the presence of L. monocytogenes.Results: 138 (10.4%) food handlers were positive for L. monocytogenes and a statistically significant association was found between the presence of this microorganism and the following risk factors: “Lack of knowledge about the concept of cross-contamination” (OR ( CI 95%) = 1.518 P = 0.004), and “Not practicing cleaning and disinfection procedures appropriately” (OR ( CI 95%) = 1.292 P = 0.005).Conclusion: Prevalence of L. monocytogenes carriers was established among meat and dairy food handlers and food handlers practices were associated as risk factors for carrier condition. This study is a useful tool for the monitoring, epidemiological characterization and definition of strategies to control this pathogen. http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v33i2.716 handling.Introducción. Las enfermedades transmitidas por alimentos constituyen un problema sanitario dealto impacto. Listeria monocytogenes se asocia frecuentemente con contaminación de alimentos lácteos y cárnicos. Vigilar su presencia en varios puntos de esta producción, es vital para controlar la diseminación del microorganismo.Objetivo. Determinar la prevalencia de L. monocytogenes en manipuladores de alimentos de lácteos y cárnicos en 10 departamentos de Colombia y buscar la asociación entre la presencia del microorganismo y posibles factores de riesgo.Materiales y métodos. Se llevó a cabo un estudio descriptivo de corte transversal, en el cual se determinó la presencia de L. monocytogenes en muestras de materia fecal y frotis de manos, provenientes de 1.322 manipuladores de alimentos. Se aplicó un cuestionario para conocer posibles factores de riesgo, y se llevó a cabo un análisis estadístico para determinar frecuencias y establecer relaciones entre los posibles factores de riesgo y el estado del portador.Resultados. Hubo 138 (10,4 %) manipuladores de alimentos que resultaron positivos para L. monocytogenes y se encontró asociación estadísticamente significativa entre la presencia del microorganismo y “no conocer el concepto de contaminación cruzada” (OR (IC95%)=1,518; p=0,004), así como con “no practicar procedimientos de limpieza y desinfección adecuados” (OR (IC95%)=1,292;p=0,005).Conclusión. Se estableció una prevalencia de portadores de L. monocytogenes entre manipuladoresde alimentos de derivados lácteos y cárnicos, y se logró asociar las prácticas higiénicas de los manipuladores de alimentos como factores de riesgo. El estudio se convierte en una herramienta útil para la vigilancia, la caracterización epidemiológica y el planteamiento de estrategias de control de este microorganismo. doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v33i2.716

Diseminación de Klebsiella pneumoniae productoras de KPC-3 en hospitales de Bogotá durante un periodo de tres años

Introduction: One of the major worldwide public health problems today are the infections caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE), among which carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP), constitutes one of the most common pathogens causing nosocomial infection.Objective: This study was aimed at describing the dissemination of KPC-3 enzyme-producing Klebsiella pneumoniae in clinical isolates from hospitals in Bogotá.Materials and methods: Eighty-two CRKP isolates collected from 10 hospitals in Bogota from 2008-2010 were analysed; disk diffusion and microdilution were used for phenotypic detection of enzymes and PCR for genotyping. Automated and manual methods were used for determining profiles for antimicrobial susceptibility testing (AST) with 13 agents. PFGE was used for obtaining the isolates’ genetic relationship.Results: This study gives an overview of CRKP to present resistance to multiple antibiotic families. The CRKPs were grouped in different clones, each having different subtypes, and were spread in the 10 hospitals over the three-year period (2008-2010).Conclusions: The dissemination of KPC-3-producing Klebsiella pneumoniae nosocomial isolates in Bogotá highlights the need for strengthening epidemiological surveillance against this type of microorganism and the development of specific priority activities for preventing and controlling such infection. Introducción. Uno de los principales problemas de salud pública a nivel mundial son las infecciones producidas por enterobacterias resistentes a los carbapenémicos, entre las cuales Klebsiella pneumoniae es uno de los patógenos que con mayor frecuencia causa infecciones en el ámbito hospitalario.Objetivo. El objetivo del estudio fue describir la diseminación de aislamientos clínicos de K. pneumoniae productores de la enzima KPC-3 recuperados en hospitales de Bogotá.Materiales y métodos. Se analizaron 82 aislamientos de K. pneumoniae resistentes a antibióticos carbapenémicos recuperados entre el 2008 y el 2010 en 10 hospitales, a los cuales se les realizaron pruebas de detección fenotípica de enzimas por difusión de disco y microdilución, y de detección genotípica por PCR. La determinación de perfiles de sensibilidad frente a 13 antimicrobianos se realizó por métodos automatizados y manuales. La relación genética de los aislamientos se obtuvo por la técnica de PFGE.Resultados. Este estudio presenta el panorama del comportamiento de las enterobacterias resistentes a los carbapenémicos diseminadas en el curso de tres años en 10 hospitales de la ciudad, con características de resistencia a múltiples familias de antibióticos y pertenecientes a varios grupos de clones, cada uno con diferentes subtipos.Conclusiones. La diseminación de aislamientos clínicos de K. pneumoniae productores de enzima KPC-3 en Bogotá plantea la necesidad de fortalecer las acciones de vigilancia epidemiológica frente a este tipo de microorganismos y el desarrollo prioritario de actividades específicas de prevención y control de infecciones

Brote de Salmonella Enteritidis resistente a ácido nalidíxico en Popayán, Cauca, 2011

Introduction. Salmonella Enteritidis is recognized worldwide as one of the main agents of human gastrointestinal infection. Several reports indicate the presence of isolates with decreased sensitivity to ciprofloxacin that can lead to a delayed response or the development of resistance during treatment. Objective. To describe and characterize isolates of Salmonella Enteritidis associated to an outbreak of food-borne diseases in Popayán, Cauca. Materials and methods. Ten Salmonella Enteritidis isolates from nine patients and one food sample (chicken sandwich) were analyzed by biochemical tests, serotyping and antimicrobial sensitivity. The minimum inhibitory concentration to ciprofloxacin was determined by E-test and the genetic profile of the isolates was tested by pulsed field gel electrophoresis (PFGE) with XbaI and Blnl enzymes. Results. Salmonella Enteritidis was identified in all isolates. They were resistant to nalidixic acid and had a decreased sensitivity to ciprofloxaxin between 0.25 and 0.5 µg/ml; all isolates were sensitive to all the other antimicrobials we tested. Ten isolates were grouped by PFGE with the XbaI enzyme in the COIN11.JEG.X01.0038 pattern, and seven isolates were confirmed with the BlnI enzyme using the COIN11.JEG.A26.0009 pattern. Conclusion. We report for the first time an outbreak of nalidixic acid-resistant Salmonella Enteritidis in Colombia and confirmed by phenotypic and genotypic analysis the association between the isolates from patients and the chicken sandwich as the source of infection. http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v32i4.750 Introducción. Salmonella Enteritidis es reconocida a nivel mundial como uno de los principales agentes de infección gastrointestinal. Varios reportes indican la presencia de aislamientos con sensibilidad disminuida a la ciprofloxacina que puede conllevar a una respuesta retardada o al desarrollo de resistencia durante el tratamiento. Objetivo. Describir y caracterizar los aislamientos de Salmonella Enteritidis asociados a un brote de enfermedad transmitida por alimentos en Popayán, Cauca. Materiales y métodos. Se analizaron 10 aislamientos de Salmonella Enteritidis, nueve de pacientes y uno de alimentos (emparedado de pollo), por pruebas bioquímicas, serotipificación y sensibilidad antimicrobiana. La concentración inhibitoria mínima a la ciprofloxacina se determinó por E-test y el perfil genético de los aislamientos se evaluó por electroforesis en gel de campo pulsado (Pulsed Field Gel Electrophoresis, PFGE) con las enzimas Xbal y Blnl. Resultados. En todos los aislamientos se identificó Salmonella Enteritidis con resistencia al ácido nalidíxico y sensibilidad disminuida a la ciprofloxaxina entre 0,25 y 0,5 µg/ml; todos fueron sensibles a los demás antimicrobianos ensayados. La PFGE agrupó los 10 aislamientos con la enzima Xbal en el patrón COIN11.JEG.X01.0038 y siete aislamientos se confirmaron con la enzima BlnI con el patrón COIN11.JEG.A26.0009. Conclusión. Se reporta por primera vez en Colombia un brote de Salmonella Enteritidis con resistencia al ácido nalidíxico y se confirma por análisis fenotípico y genotípico la asociación entre los aislamientos de los pacientes con el del emparedado de pollo como la fuente de infección. doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v33i1.810

The spread of KPC-3 Klebsiella pneumoniae in hospitals in Bogotá over a three-year period (2008-2010)

Introducción. Uno de los principales problemas de salud pública a nivel mundial son las infecciones producidas por enterobacterias resistentes a los carbapenémicos, entre las cuales Klebsiella pneumoniae es uno de los patógenos que con mayor frecuencia causa infecciones en el ámbito hospitalario. Objetivo. El objetivo del estudio fue describir la diseminación de aislamientos clínicos de K. pneumoniae productores de la enzima KPC-3 recuperados en hospitales de Bogotá. Materiales y métodos. Se analizaron 82 aislamientos de K. pneumoniae resistentes a antibióticos carbapenémicos recuperados entre el 2008 y el 2010 en 10 hospitales, a los cuales se les realizaron pruebas de detección fenotípica de enzimas por difusión de disco y microdilución, y de detección genotípica por PCR. La determinación de perfiles de sensibilidad frente a 13 antimicrobianos se realizó por métodos automatizados y manuales. La relación genética de los aislamientos se obtuvo por la técnica de PFGE. Resultados. Este estudio presenta el panorama del comportamiento de las enterobacterias resistentes a los carbapenémicos diseminadas en el curso de tres años en 10 hospitales de la ciudad, con características de resistencia a múltiples familias de antibióticos y pertenecientes a varios grupos de clones, cada uno con diferentes subtipos. Conclusiones. La diseminación de aislamientos clínicos de K. pneumoniae productores de enzima KPC-3 en Bogotá plantea la necesidad de fortalecer las acciones de vigilancia epidemiológica frente a este tipo de microorganismos y el desarrollo prioritario de actividades específicas de prevención y control de infecciones.224-231Introduction: One of the major worldwide public health problems today are the infections caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE), among which carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP), constitutes one of the most common pathogens causing nosocomial infection. Objective: This study was aimed at describing the dissemination of KPC-3 enzyme-producing Klebsiella pneumoniae in clinical isolates from hospitals in Bogotá. Materials and methods: Eighty-two CRKP isolates collected from 10 hospitals in Bogotá from 2008-2010 were analysed; disk diffusion and microdilution were used for phenotypic detection of enzymes and PCR for genotyping. Automated and manual methods were used for determining profiles for antimicrobial susceptibility testing (AST) with 13 agents. PFGE was used for obtaining the isolates’ genetic relationship. Results: This study gives an overview of CRKP patterns in 10 hospitals in Bogota which were found to present resistance to multiple antibiotic families. The CRKPs were grouped in different clones, each having different subtypes, and were spread in the 10 hospitals over the three-year period (2008-2010). Conclusions: The dissemination of KPC-3-producing Klebsiella pneumoniae nosocomial isolates in Bogota highlights the need for strengthening epidemiological surveillance against this type of microorganism and the development of specific priority activities for preventing and controlling such infection

Vigilancia por el laboratorio de Shigella spp. aislada de casos clínicos humanos en Colombia, 1997-2018

Introduction: Shigellosis is endemic in low-and middle-income countries, causing approximately 125 million episodes of diarrhea and leading to approximately 160 .000 deaths annually one-third of which is associated with children.Objective: To describe the characteristics and antimicrobial resistance profiles of Shigella species recovered in Colombia from 1997 to 2018.Materials and methods: We received isolates from laboratories in 29 Colombian departments. We serotyped with specific antiserum and determined antimicrobial resistance and minimal inhibitory concentrations for ten antibiotics with Kirby-Bauer tests following the Clinical and Laboratory Standards Institute recommendations.Results: We analyzed 5,251 isolates of Shigella spp., most of them obtained from stools (96.4%); 2,511 (47.8%) were from children under five years of age. The two most common species were S. sonnei (55.1%) and S. flexneri (41.7%). The highest resistance rate was that of tetracycline (88.1%) followed by trimethoprim-sulfamethoxazole (79.3%) and ampicillin (65.5%); 50.8% of isolates were resistant to chloramphenicol, 43.6% to amoxicillin/clavulanic acid, and less than 1% to cefotaxime, ceftazidime, gentamicin, and ciprofloxacin. In S. sonnei, the most common resistance profile corresponded to trimethoprim-sulfamethoxazole (92%) whereas in S. flexneri the most common antibiotic profiles were multidrug resistance.Conclusions. In Colombia, children under five years are affected by all Shigella species. These findings should guide funders and public health officials to make evidence based decisions for protection and prevention measures. The antimicrobial resistance characteristics found in this study underline the importance of combating the dissemination of the most frequently isolated species, S. sonnei and S. flexneri.Introducción. La shigelosis es endémica en los países de ingresos bajos y medios y ocasiona aproximadamente 125 millones de episodios de diarrea y 160.000 muertes al año, un tercio de los cuales se presenta en niños.Objetivo. Describir las características y los perfiles de resistencia antimicrobiana en aislamientos de Shigella spp. recuperados en Colombia entre 1997 y 2018.Materiales y métodos. Los aislamientos provenían de laboratorios en 29 departamentos de Colombia. La serotipificación se hizo con antisueros específicos de Shigella spp. y, la determinación de los perfiles de resistencia y la concentración inhibitoria mínima de diez antibióticos, por Kirby-Bauer.Resultados. Se estudiaron 5.251 aislamientos de Shigella spp. obtenidos de materia fecal (96,4 %); el 47,8 % de ellos correspondía a niños menores de cinco años. Las especies más frecuentes fueron S. sonnei (55,1 %) y S. flexneri (41,7 %). Se presentó resistencia a tetraciclina (88,1 %), trimetoprim-sulfametoxasol (79,3 %), ampicilina (65,5 %), cloranfenicol (50,8 %) y amoxicilina-acido clavulánico (43,6 %). La resistencia no superó el 1 % contra cefotaxime, ceftazidima, gentamicina y ciprofloxacina. Para S. sonnei, el perfil de resistencia más frecuente correspondió a trimetoprim-sulfametoxasol, en contraste con S. flexneri, cuyos perfiles fueron todos multirresistentes.Conclusiones. Los niños menores de cinco años se vieron afectados por todas las especies de Shigella spp., aspecto que los legisladores en salud pública deben considerar a la hora de tomar decisiones en torno a las medidas de prevención y protección frente a esta enfermedad. Las características de resistencia antimicrobiana de los aislamientos de Shigella spp. en Colombia ponen de manifiesto la importancia de combatir la diseminación de las dos especies más frecuentes en casos clínicos, S. sonnei y S. flexneri

Caracterización de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en aislamientos clínicos colombianos de Salmonella enterica no tifoidea 1997 – 2022.

Introduction: Salmonella spp., is a zoonotic pathogen transmitted to humans through contaminated water or food. The presence of extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) is a growing public health problem because these enzymes are resistant to third and fourth generation cephalosporins.Objective: To characterize ESBL in Salmonella spp. isolates received by the Acute Diarrheal Disease/Foodborne Disease surveillance program of the Microbiology Group of the National Institute of Health.Materials and methods: Between 1997 and June 2022, 444 Salmonella spp. isolates were obtained, resistant to at least one of the cephalosporins. The ESBL phenotypic detection was performed by the double disk test. DNA extraction was carried out by boiling and with PCR the detection of blaCTX-M, blaSHV and blaTEM type genes was carried out.Results: All the isolates were positive for the ESBL test. The genes identified were: blaCTX-M + blaTEM (n=200), blaCTX-M (n=177), blaSHV (n=16), blaSHV + blaCTX-M (n=6), blaTEM (n=13) y blaSHV + blaCTX-M + blaTEM (n=3) finally, 26 isolates were negative for all evaluated genes. Positive ESBL isolates are identified in Bogotá and 21 departments additionally; Choco, Magdalena, Meta, Bolívar, Casanare, Cesar, Córdoba, Quindío, Atlántico, Tolima, Cauca, Cundinamarca, Huila, Boyacá, Caldas, Norte de Santander, Risaralda, Antioquia, Nariño, Santander y Valle del Cauca.Conclusion: Resistance to third generation cephalosporins in Salmonella spp. isolates was mainly caused by blaCTX-M and resistance to Ampicillin, Tetracycline, Chloramphenicol and Trimethoprim-sulfamethoxazole was present in 44% (197/444). The most frequent ESBL carrier serotypes were S. Typhimurium and S. Infantis.Introducción. Salmonella spp., es un patógeno zoonótico transmitido al humano a través de agua o alimentos contaminados. La presencia de betalactamasas de espectro extendido (BLEE), es un creciente problema para la salud pública debido a que estas enzimas confieren resistencia a cefalosporinas de tercera y cuarta generación.Objetivo. Caracterizar BLEE en aislamientos de Salmonella spp., recibidos por el programa de vigilancia Enfermedad Diarreica Aguda/Enfermedad Transmitida por Alimentos, del Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud.Materiales y métodos. Entre 1997 y junio de 2022, se recibieron 444 aislamientos de Salmonella spp. resistentes a por lo menos una de las cefalosporinas de tercera generación. La detección fenotípica de BLEE se realizó por la prueba de doble disco. La extracción de ADN se realizó por ebullición y con PCR se realizó la detección de genes tipo blaCTX-M, blaSHV y blaTEM.Resultados. Todos los aislamientos fueron positivos para prueba BLEE. Los genes identificados fueron: blaCTX-M + blaTEM (n=200), blaCTX-M (n=177), blaSHV (n=16), blaSHV + blaCTX-M (n=6), blaTEM (n=13) y blaSHV + blaCTX-M + blaTEM (n=3) y 26 aislamientos fueron negativos para los genes evaluados. Los aislamientos BLEE positivos se identificaron en la ciudad de Bogotá, así como en 21 departamentos; Choco, Magdalena, Meta, Bolívar, Casanare, Cesar, Córdoba, Quindío, Atlántico, Tolima, Cauca, Cundinamarca, Huila, Boyacá, Caldas, Norte de Santander, Risaralda, Antioquia, Nariño, Santander y Valle del Cauca.Conclusión. La resistencia a cefalosporinas de tercera generación en aislamientos de Salmonella spp., fue dada principalmente por blaCTX-M y presentaron resistencia a Ampicilina, Tetraciclina, Cloranfenicol y Trimetroprim-sulfametoxazol en 44% (197/444). Los serotipos más frecuentemente portadores de BLEE fueron S. Typhimurium y S. Infantis

Brote de Salmonella enterica subsp. enterica serovar Give asociado con enfermedad transmitida por alimentos en Vichada, Colombia, 2015

Introduction: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Give is found in ruminants, pigs, poultry, and aquatic environments, but rarely in humans. In Colombia, this serotype was ranked 11th. in the laboratory surveillance of acute diarrheal disease between 2000 and 2013.Objective: To characterize phenotypic and genotypic isolates of Salmonella related to an outbreak of foodborne Illness in the department Vichada in the fifth epidemiological week of 2015.Materials and methods: Following the Instituto Nacional de Salud method, we tested 37 fecal samples for Salmonella spp. while the sample of canned sardines was processed according to the ISO 6579:2002 Cor.1:2004 standard. The isolates were confirmed by serology and/or real-time PCR, antimicrobial susceptibility tests, and pulsed-field gel electrophoresis with the XbaI and BlnI enzymes.Results: All human isolates (11) and that from food (1) were identified as S. Give. The food isolate exhibited tetracycline resistance. PFGE analysis with XbaI grouped ten isolates from samples of human origin in pattern COIN15JEXX01.0005 and the remaining isolates in COIN15JEXX01.0006 with 96.3% similarity. All isolates were confirmed with the BlnI enzyme, and four (three human isolates and the one from food) were matched to the pattern COIN15JEXA26.002 with 95.65% similarity.Conclusion: Our study confirmed that canned sardines were related to the transmission of S. Give in the outbreak, which is the third one caused by this serotype in Colombia.Introducción. Salmonella enterica subsp. enterica serovar Give se encuentra en mamíferos rumiantes, cerdos, aves y ambientes acuáticos, pero rara vez en humanos. En Colombia este serotipo ocupó el decimoprimer lugar en frecuencia en la vigilancia por laboratorio de la enfermedad diarreica aguda entre el 2000 y el 2013.Objetivo. Caracterizar el fenotipo y el genotipo de S. Give en aislamientos relacionados con un brote de enfermedad transmitida por alimentos en el departamento de Vichada en la quinta semana epidemiológica del 2015.Materiales y métodos. Se buscó Salmonella spp. en 37 muestras de materia fecal con el método de estudio del Instituto Nacional de Salud. La muestra de sardinas enlatadas fue procesada según la norma ISO6579:2002 Cor.1:2004. Se determinó el serotipo en los aislamientos confirmados mediante serología o PCR en tiempo real, y se hicieron pruebas de sensibilidad a antimicrobianos y electroforesis en gel de campo pulsado con las enzimas Xbal y BlnI.Resultados. Todos los aislamientos de origen humano (11) y el aislamiento del alimento (1), se identificaron como S. Give y este último presentó resistencia a la tetraciclina. El análisis por PFGE-XbaI agrupó bajo el patrón COIN15JEXX01.0005 diez aislamientos de origen humano y a los restantes bajo el COIN15JEXX01.0006, con un 96,3 % de similitud. Los resultados de todos los aislamientos se confirmaron con la enzima BlnI; cuatro de ellos (tres humanos y el del alimento) se agruparon bajo el patrón COIN15JEXA26.002, con un porcentaje de similitud del 95,65 %.Conclusión. El estudio confirmó que las sardinas enlatadas se relacionaron con la transmisión de S. Give en el brote, que es el tercero ocasionado por este serotipo en Colombia

Phenotypic and genotypic characterization of Salmonella Typhimurium variant 5- isolates associated with an outbreak of food-borne disease in Paz de Rio, Boyacá, Colombia, in 2010 = Caracterización fenotípica y genotípica de Salmonella Typhimurium variante 5- asociada a un brote de enfermedad transmitida por alimentos en el municipio de Paz de Río, Boyacá, 2010 = Caracterización fenotípica y genotípica de Salmonella Typhimurium variante 5- asociada a un brote de enfermedad transmitida por alimentos en el municipio de Paz de Río, Boyacá, 2010

Introduction: Salmonella enterica serotype Typhimuri-um variant 5- is a pathogen closely related to animals, especially pigeons, which has been also associ- ated in rare cases with sporadic infections in humans. However, epidemiological surveillance systems have enabled the detection of this variant in human out- breaks. Objective: To characterize by means of phenotypic and genotypic techniques the isolates of Salmonella Typhimurium variant 5- associated with an outbreak of food-borne disease in Paz de Rio, Boyacá, Colombia (2010), in order to establish their molecular relationships. Materials and methods: Twelve isolates of Salmonella -spp., were analyzed by biochemical, serotyping and antimicrobial susceptibility tests. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) with Xball Blnl enzymes was used to establish their molecular relationships Results: All isolates were confirmed as Salmonella spp. They were resistant to tetracycline and streptomycin and sensitive to the rest of antibiotics tested. Eleven isolates were identified as Salmonella Typhimurium variant 5- and grouped in COIN10.JPX.X01.0168 pattern using the enzyme Xball two isolates in this group were confirmed using the enzyme Blnl with the COIN10.JPX.A26.0002 pattern. One isolate was identified as Salmonella Typhimurium with COIN10.JPX.X01.0221 pattern with the enzyme Xbal Conclusion: This is the first outbreak in Colombia of foodborne illness epidemiologically associated with isolates of Typhimurium variant 5 -, which Epidemiologic Sur were phenotypically and genetically related