Genetic characterization of indigenous rhizobia strains from the coastal tableland efficient for the pigeonpea and cowpea crops

O objetivo deste trabalho foi caracterizar geneticamente sete estirpes de rizóbios nativos dos tabuleiros costeiros de Sergipe com alta eficiência de fixação biológica do N2 em associação com guandu (Cajanus cajan) e caupi (Vigna unguiculata). A amplificação do DNA pela técnica de PCR (polymerase chain reaction) com o oligonucleotídeo específico BOX indicou um grau elevado de diversidade genética, uma vez que todas as estirpes apresentaram perfis únicos de DNA. A análise por BOX-PCR revelou, ainda, que essa metodologia é eficiente para diferenciar estirpes, mas não para a diferenciação de espécies de rizóbio. Pela técnica do RFLP (restriction fragment length polymorphism) da região do DNA que codifica o gene 16S rRNA e da região intergênica entre os genes 16S e 23S rRNA, com cinco enzimas de restrição, bem como pelo seqüenciamento parcial da região do 16S rRNA, foi possível classificar as estirpes nos gêneros Bradyrhizobium e Rhizobium. Houve coerência entre as análises envolvendo a região do 16S rRNA, mas o agrupamento com uma das estirpes diferiu pela análise do espaço intergênico. Os resultados obtidos com a estirpe R11 indicam variabilidade genética elevada em relação às espécies de rizóbios descritas, inclusive diferindo em diversas bases da região do 16S rRNA, e podem indicar uma nova espécie.The objective of this work was to characterize genetically seven indigenous rhizobial strains from the coastal tableland of Sergipe, Brazil, with high efficiency of biological nitrogen fixation with the pigeonpea (Cajanus cajan) and cowpea (Vigna unguiculata) crops. The DNA amplification with the PCR (polymerase chain reaction) technique and the specific primer BOX indicated a high level of genetic diversity, with all isolates showing unique profiles of DNA. The BOX-PCR analysis also indicated that this method is efficient to characterize strains but not to define rhizobial species. The RFLP (restriction fragment length polymorphism) analysis of the 16S rRNA region and of the intergenic region between the 16S and the 23S rRNA genes with five restriction enzymes, as well as the partial sequencing of the 16S rRNA region allowed the classification of the strains into the genera Bradyrhizobium and Rhizobium. There was an agreement between the results obtained by the analysis of the 16S rRNA region, but one strain differed when the intergenic space was considered. The results obtained with strain R11 showed a high level of genetic diversity when compared to the described rhizobial species, including differences in several bases of the 16S rRNA region, and might indicate a new species

Diazotrophic bacteria associated to coconut palms in a coastal lowland region in Sergipe State, Brazil

Objetivou-se neste trabalho, isolar, identificar e quantificar bactérias diazotróficas existentes nas raízes e folhas de coqueiro (híbrido PB121) cultivados na baixada litorânea de Sergipe. As populações de bactérias diazotróficas nesses órgãos foram quantificadas pela técnica do número mais provável (NMP) em meios semi-sólidos JNFb e NFb, e identificadas por meio de avaliações microscópicas, culturais e de testes bioquímicos dos sistemas API 20-E e API 20-NE. O conteúdo de N em meios semi-sólidos NFb e JNFb foi determinado colorimetricamente, após oito dias de incubação das bactérias, a 32ºC, para estimar a capacidade de fixação biológica dos isolados. Enterobactérias pertencentes ao gênero Enterobacter e bactérias com características semelhantes às do gênero Pseudomonas (pseudomonadas) foram predominantes entre os isolados obtidos. As enterobactérias e pseudomonadas isoladas de folhas foram predominantemente endofíticas. Quanto às diazotróficas isoladas de raízes, observou-se predominância de enterobactérias na sua superfície, ao passo que as pseudomonadas ocorreram em proporções semelhantes na superfície e no interior desse órgão. Após oito dias de incubação, os conteúdos de N nos meios com inoculação das bactérias pseudomonadas foram maiores do que nos meios com inoculação das enterobactérias.The aim of this work was to isolate, identify and quantify diazotrophic bacteria existing in roots and leaves of coconut palms (hybrid PB121) grown in a coastal lowland of Sergipe, in Brazil. Diazotrophic populations in these organs were quantified by the most probable number (MNP) technique on NFb and JNFb semi-solid media and identified by the evaluation of microscopic, cultural and biochemical characteristics of the isolates. Biochemical characteristics were evaluated using the API 20-E and API 20-NE galleries. Nitrogen content in NFb and JNFb semi-solid media inoculated with each of the isolates and incubated for eight days at 32ºC was colorimetrically evaluated to estimate the biological nitrogen fixation capacity of the isolates. Bacteria of the Enterobacter genus and pseudomonads formed the predominant types of N2-fixers. Enterobacteria and pseudomonads isolated from leaves were predominantly endophytic. Regarding to the diazotroph bacteria isolated from roots, it was observed that enterobacteria were predominant in the root-surface, while pseudomonads were found in nearly equivalent proportions in the surface and in the interior of this organ. After eight days of incubation, pseudomonads isolates presented higher N fixation capacity than enterobacteria

Potencial antimicrobiano de extratos extracelulares de isolados de actinobactérias e de suas frações orgânicas/ Antimicrobial potential of extracellular extracts of actinobacterial isolates and their organic fractions

A utilização de micro-organismos antagonistas e seus metabólitos secundários no controle de fitopatógenos é alvo de grande interesse, já que pode constituir uma alternativa de menor impacto no ambiente em relação aos químicos sintéticos. O cultivo de novos isolados de bactérias antagonistas, além dos gêneros Streptomyces e Bacillus, os quais são fontes da ampla maioria dos antibióticos conhecidos, amplia a possibilidade de descobrir novas moléculas com potencial antimicrobiano. Desse modo, o presente trabalho teve como objetivo avaliar o potencial antimicrobiano de extratos extracelulares de culturas de actinobactérias do solo e de suas frações orgânicas contra os organismos–alvo Xanthomonas campestris 629, Bacillus cereus ATCC14579 e Saccharomyces cerevisiaeV200. Neste estudo foram utilizados cinco isolados de actinobacterias do solo (isolados TC42, TC44, TC70, TC105 e TCX, da Embrapa Tabuleiros Costeiros). Potencial antimicrobiano de extratos extracelulares de isolados de actinobactérias e de suas frações orgânicas/ Antimicrobial potential of extracellular extracts of actinobacterial isolates and their organic fraction

Cytokinin Dehydrogenase activity in primary roots and characterization of primary metabolites from leaves and rootlets of Ricinus Communis

The aim of this study was to determine the activity of cytokinin dehydrogenase (CKX) and to measure other biochemical components in the primary leaves and radicles of castor seedlings (BRS Energia) in the initial phase of growth. The crude protein extract obtained after a 1-h extraction from the root tissues of seedlings showed no detectable CKX enzymatic activity when incubated with the substrate isopentenyl adenine for 1 h. However, after precipitation with ammonium sulfate at 70% saturation, the pellet showed CKX activity. The peroxidase enzyme activity was higher in the leaves than in the radicles. The total and reducing sugar content was 1.5 times higher in the leaves than in the radicles. The amino acid and protein contents were 6.4 and 9.2 times higher in the leaves than in the radicles, respectively

Avaliação da viabilidade de embriões de coqueiro criopreservados por meio de condutividade elétrica e lixiviação de potássio

The objective of this work was to adapt the application of electrolytic conductivity and potassium leaching tests to assess the viability of cryopreserved embryos of 'Anão Verde do Brasil de Jiqui' (AVeJBr) coconut. The zygotic embryos were excised, sterilized and subjected to four cryoprotectant treatments combined with three incubation times (12, 16 and 20 hours), totaling 12 treatments. The pre‑treatment of mature zygotic embryos of AVeJBr coconut using a cryoprotectant with 1.75 mol L‑1 of sucrose + 15% glycerol for 12 and 16 hours promoted lower embryo humidity and increased viability in electrolytic conductivity and potassium leaching tests. Samples with ten embryos are sufficient for electrolytic conductivity analysis in cryopreserved or non‑cryopreserved AVeJBr coconut zygotic embryos. The 4 to 8 hour imbibition period of the embryos is promising for the electrolytic conductivity analysis of non‑cryopreserved mature zygotic embryos of AVeJBr coconut.O objetivo deste trabalho foi adaptar a aplicação de testes de condutividade elétrica e lixiviação de potássio para avaliar a viabilidade de embriões de coqueiro 'Anão Verde do Brasil de Jiqui' (AVeJBr) criopreservados. Os embriões zigóticos foram excisados, esterilizados e submetidos a quatro tratamentos crioprotetores combinados a três tempos de incubação (12, 16 e 20 horas), o que totalizou 12 tratamentos. O pré‑tratamento de embriões zigóticos maduros de coco AVeJBr com crioprotetor contendo 1,75 mol L‑1 de sacarose + 15% de glicerol por 12 e 16 horas promoveu menor umidade dos embriões e maior viabilidade em testes de condutividade elétrica e lixiviação de potássio. Amostras com dez embriões são suficientes para análise de condutividade elétrica em embriões zigóticos de coqueiro AVeJBr criopreservados ou não. O período de embebição de 4 a 8 horas é promissor para a análise da condutividade elétrica em embriões zigóticosmaduros de coco AVeJBr não criopreservados

Desempenho de clones de batata doce para a produção de bioetanol em função de períodos de cultivo

A batata doce é tecnicamente uma planta perene, plantada e explorada como anual. A identificação do período de cultivo e de clones é importante para melhorar o aproveitamento dessa cultura, tanto na alimentação humana e animal, como para produção de etanol. Objetivou-se avaliar o desempenho de clones de batata doce cultivados em diferentes períodos de cultivo para a produção de bioetanol. Foram testados nas parcelas três períodos de cultivo (3, 5 e 7 meses), e nas subparcelas, cinco clones de batata doce (acessos IBP-007, IBP-038, IBP-075, IBP-079 e IBP-149), além da cultivar Brazlândia Rosada. Foram analisados o teor de matéria seca de raiz, amido e amilose e rendimento de amido e etanol. O clone IPB-007 apresentou elevados valores para rendimento de amido (6,63 t/ha) e etanol (4.379 L/ha). Já para teor de matéria seca de raiz (38,32%) e amido (26,70%) e rendimento de etanol (176,26 L/t), o clone IPB-149 se destacou. Não houve diferença significativa para o teor de amilose. O teor de amido (13,94%) e rendimento de amido (1,64 t/ha), e etanol (1.034 L/ha e 92,04 L/t) foram menores para a maioria dos clones avaliados nos períodos de cultivo de três meses. Recomenda-se adotar o período de cultivo de cinco meses e os clones IPB-007 e IPB-149.Sweet potato is a perennial plant but cultivated as an annual crop. Thus, identifying the best period of cultivation is important for optimizing production, aiming human and animal consumption, as well as ethanol production. The aim of this work was to evaluate the performance of sweet potato clones grown in different cultivation periods for the production of bioethanol. Plots consisted of three cultivation periods (3, 5 and 7 months), and the subplots of five sweet potato clones (accessions IBP-007, IBP-038, IBP-075, IBP-079 and IBP-149) and the cultivar Brazlândia Rosada, considering a split plot scheme. We studied the root dry mass, starch and amylose content and starch and ethanol yield. Clone IPB-007 showed high values for starch yield (6.63 t/ha) and ethanol yield (4,379 L/ha). For root dry mass (38.32%) and starch (26.70%) and etha,nol yield (176.26 L/t), clone IPB-149 stood out. There was no significant difference for amylose content. Starch content (13.94%) and starch (1.64 t/ha) and ethanol yield (1,034 L/ha and 92.04 L/t) were lower for most of the clones in the three-month period of cultivation. We recommend the five-month period of cultivation and clones IPB-007 and IPB-14

LOCAL ECOLOGICAL KNOWLEDGE ON THE GOLIATH GROUPER Epinephelus itajara (LICHTENSTEIN, 1822) IN THE NORTHEAST PARAENSE AMAZON

Foi investigado o conhecimento ecológico local (CEL) de pescadores a respeito das características bioecológicas de Epinephelus itajara no Nordeste Paraense Amazônico, uma espécie criticamente ameaçada de extinção. O estudo foi desenvolvido em três municípios da região Bragantina: Augusto Corrêa, Bragança (Península de Ajuruteua) e Tracuateua (Chapada). Os dados foram obtidos através de entrevistas com pescadores, utilizando-se formulários semi-estruturados, no período de junho a outubro de 2014, por meio da técnica snowball (“Bola de Neve”). Uma lista de 27 atributos, na forma de variáveis categóricas, com até 6 classes para cada uma, foi elaborada para caracterizar o sistema pesqueiro ”mero”. Os atributos foram classificados de acordo com 5 dimensões: tecnológica, econômica, ecológica, social e de sustentabilidade. O RAPFISH elencou padrões muito particulares para o sistema ‘mero’, porém nenhuma das dimensões foi considerada excelente, entretanto, a dimensão social se destacou por que todos os atributos elencados receberam notas muito próximas umas das outras, homogeneizando o perfil social destes. Diferentemente do observado para as demais dimensões, principalmente a econômica e de sustentabilidade, que foram responsáveis pela maior deformidade do polígono, já que o status da produção vem decaindo mesmo sutilmente embora a pesca seja contínua.Palavras-chave: Conhecimento ecológico local, rapfish, moratória pesqueira.Were investigated the local ecologic knowledge (CEL) by fishermen about biological characteristic of Goliath Grouper Epinephelus itajara in northern Paraense Amazon, a critical endanger specie. This research was development in three municipality of Bragantine region: Augusto Corrêa, Bragança (Ajuruteua Peninsula) and Tracuateua (Chapada). Data were obtained by interviews with semi structure formularies to fishermen between June to October of 2014, by snowball technical. A list of 27attributes, with categorical variables, with until 6 classes by each one, were draw up to fishery system ‘Atlantic Goliath Grouper’. These attributes were classified according 5 dimensions: technologic, economic, ecologic, social and sustainability.  RAPFISH shows particular patterns to ‘Atlantic Goliath Grouper’ system, but no dimension was regard excellent, however, social dimension headline by all attributes listed received notes very closer one by other, become homogeneous their social profile, differently of observed to the other dimensions, mainly economic and sustainability, that were responsible by high polygon deformity, once production status were subtly even with continuous fisheries.Keywords: Local ecological knowledge; rapfish; fishing moratorium