Diamantina: An endemic new genus of Neotropical Atalophlebiinae (Ephemeroptera: Leptophlebiidae) evidenced by morphological and molecular data

A new genus and species is described based on nymphs and adults collected exclusively at the Chapada Diamantina National Park, in Brazil. The generic category of this new taxon was tested by reanalyzing a morphological dataset used to access the phylogenetic relationships of species of Ulmeritus and Ulmeritoides and by the use of molecular analysis, using two different genes. Both analysis corroborated the new taxon belongs to a new genus and species, sister group of Ulmeritus-Ulmeritoides, herein described as Diamantina ulmeri gen et sp. nov. Among members of this complex, Diamantina gen nov. presents a unique apomorphy: absence of setae on lateral margins of abdominal segments. Diagnostic features include the anterior position of the proximal row of setae on dorsal surface of labrum, the U shaped emargination of labrum, eyes of male imago widely separated and shape of penis lobes. © 2019 Elsevier Gmb

Karyology of the Atlantic forest rodent Juliomys (Cricetidae): A new karyotype from southern Brazil

Juliomys is a small rodent from the family Cricetidae which inhabits the Atlantic forest and forests from Argentina to eastern Brazil. The three species recognized so far have different karyotypes. In this paper, we describe a new karyotype with 2n = 32, FN = 48 found in Juliomys specimens from a high-altitude area in the Atlantic forest of southern Brazil. The karyotype was analyzed after G- and C-banding and silver staining of the nucleolus organizer regions (Ag-NOR) and its G-banding patterns were compared with those of the newly described species Juliomys ossitenuis (2n = 20, FN = 36). The 2n = 32 karyomorph presented peculiar features and was very different from those of the other species of the genus: J. pictipes (2n = 36, FN = 34), J. rimofrons (2n = 20, FN = 34) and J. ossitenuis (2n = 20, FN = 36). Differences were mostly due to centric and tandem fusions, pericentric inversion and loss of heterochromatin. The karyotype represents a powerful tool to differentiate Juliomys species and our data suggest that the karyotype described herein belongs to a new species

Diversification of the Oligoryzomys species Bangs 1900 (Rodentia, Sigmodontinae) from Neotropical region

O gênero Oligoryzomys é um dos mais complexos e diversos da subfamília Sigmodontinae e da tribo Oryzomyini. Dentre os mamíferos destaca-se por apresentar notável incongruência taxonômica, já que o número de espécies não é consenso entre os autores. Esta tese tem a finalidade de esclarecer alguns pontos conflitantes da taxonomia deste grupo e fornecer mapas atualizados da distribuição das espécies do gênero. Espero que os dados coligidos e analisados aqui possam contribuir significativamente para qualquer tentativa de revisão sistemática do Gênero no futuro. Para tanto, foram feitas comparações utilizando dados cariotípicos (2n e NFa), morfológicos e sequências do gene mitocondrial citocromo b e do íntron 7 do beta fibrinogênio. O presente trabalho está estruturado em 5 capítulos. O primeiro capítulo apresenta uma breve história da diversificação dos sigmodontíneos, uma introdução sobre o nível atual de conhecimento do gênero Oligoryzomys e por fim traz uma explanação dos aspectos filosóficos envolvidos no reconhecimento de espécie. O segundo capítulo trata dos métodos utilizados na aquisição dos espécimes em trabalhos de campo, na obtenção do material para análises citogenéticas, da extração de DNA e subsequente sequenciamento do gene mitocondrial citocromo b e do íntron 7 do beta fibrinogênio. Descreve ainda as estimativas de relacionamento filogenético, a metodologia de análise da estrutura e história populacional e como foram exploradas a variação morfológica e delimitação taxonômica. O terceiro capítulo discorre sobre aspectos citogenéticos e moleculares das espécies da Bolívia, cuja amostra foi gentilmente cedida pelo Prof. Dr. Jorge Salazar-Bravo no intuito de preencher com tais informações a lacuna existente nesta fauna. As lâminas deste material boliviano foram analisadas por mim para obter os dados brutos de cariótipo assim como todo o sequenciamento do material e posterior análises. Dentro dessa abordagem foram documentadas a variação cariotípica de algumas populações e discutidas questões taxonômicas visando responder quem são e onde estão as espécies reconhecidas para a Bolívia. O quarto capítulo visa reconhecer as espécies válidas de Oligoryzomys e estabelecer as relações filogenéticas entre elas. Neste capítulo foram testadas as hipóteses dos grupos de espécies de acordo com as propostas de Carleton e Musser (1989) e Miranda et al. (2009). A partir dos resultados obtidos foram realizadas comparações entre as espécies dos grupos, as quais, permitiram fornecer dados qualitativos capazes de auxiliar na diagnose das espécies e da sua distribuição. O quinto capítulo apresenta hipóteses dos processos e eventos envolvidos na diversificação do gênero na região Neotropical e encerra a monografia apresentando uma cronologia de diversificação das espécies estudadas.O gênero Oligoryzomys é um dos mais complexos e diversos da subfamília Sigmodontinae e da tribo Oryzomyini. Dentre os mamíferos destaca-se por apresentar notável incongruência taxonômica, já que o número de espécies não é consenso entre os autores. Esta tese tem a finalidade de esclarecer alguns pontos conflitantes da taxonomia deste grupo e fornecer mapas atualizados da distribuição das espécies do gênero. Espero que os dados coligidos e analisados aqui possam contribuir significativamente para qualquer tentativa de revisão sistemática do Gênero no futuro. Para tanto, foram feitas comparações utilizando dados cariotípicos (2n e NFa), morfológicos e sequências do gene mitocondrial citocromo b e do íntron 7 do beta fibrinogênio. O presente trabalho está estruturado em 5 capítulos. O primeiro capítulo apresenta uma breve história da diversificação dos sigmodontíneos, uma introdução sobre o nível atual de conhecimento do gênero Oligoryzomys e por fim traz uma explanação dos aspectos filosóficos envolvidos no reconhecimento de espécie. O segundo capítulo trata dos métodos utilizados na aquisição dos espécimes em trabalhos de campo, na obtenção do material para análises citogenéticas, da extração de DNA e subsequente sequenciamento do gene mitocondrial citocromo b e do íntron 7 do beta fibrinogênio. Descreve ainda as estimativas de relacionamento filogenético, a metodologia de análise da estrutura e história populacional e como foram exploradas a variação morfológica e delimitação taxonômica. O terceiro capítulo discorre sobre aspectos citogenéticos e moleculares das espécies da Bolívia, cuja amostra foi gentilmente cedida pelo Prof. Dr. Jorge Salazar-Bravo no intuito de preencher com tais informações a lacuna existente nesta fauna. As lâminas deste material boliviano foram analisadas por mim para obter os dados brutos de cariótipo assim como todo o sequenciamento do material e posterior análises. Dentro dessa abordagem foram documentadas a variação cariotípica de algumas populações e discutidas questões taxonômicas visando responder quem são e onde estão as espécies reconhecidas para a Bolívia. O quarto capítulo visa reconhecer as espécies válidas de Oligoryzomys e estabelecer as relações filogenéticas entre elas. Neste capítulo foram testadas as hipóteses dos grupos de espécies de acordo com as propostas de Carleton e Musser (1989) e Miranda et al. (2009). A partir dos resultados obtidos foram realizadas comparações entre as espécies dos grupos, as quais, permitiram fornecer dados qualitativos capazes de auxiliar na diagnose das espécies e da sua distribuição. O quinto capítulo apresenta hipóteses dos processos e eventos envolvidos na diversificação do gênero na região Neotropical e encerra a monografia apresentando uma cronologia de diversificação das espécies estudadas

Anatomia comparada e morfometria de oligoryzomys nigripes e o. flavescens (rodentia, sigmodontinae) no Rio Grande do Sul, Brasil

Oligoryzomys nigripes e O. flavescens são amplamente distribuídos e simpátricos em diversos biomas. Os caracteres diagnósticos para seus reconhecimentos não são claramente estabelecidos. Neste estudo, foram realizadas a descrição e comparação da morfologia externa, anatomia do crânio, dentes, esqueleto pós crânio, morfologia estomacal e peniana. Análises estatísticas foram geradas a partir de dados morfométricos. A amostra consiste de 208 exemplares provenientes de 24 localidades do Brasil. O. nigripes é maior, com pelagem dorsal mais escura e pelagem ventral esbranquiçada e salpicada de preto. Crânio maior e mais robusto que O. flavescens. O. flavescens é menor, com pelagem dorsal levemente mais clara e ventre amarelado. O padrão de circulação cefálica das duas espécies é derivada de segundo tipo. Em O. flavescens são visualizados acidentes proeminentes na escápula e úmero, enquanto O. nigripes demonstrou maiores diferenças localizadas na crista íliaca, orientação do ísquio e acidentes proeminentes na tíbia e fíbula. A morfologia estomacal de ambos os táxons possui padrão Unilocular-hemiglandular. A morfologia do pênis consiste de báculo central tri-digitado. A análise de função discriminante reconhecem claramente a distinção de dois grupos homogêneos representados pelas espécies. Segundo o teste t duas variáveis morfométricas (largura da placa zigomática e largura do primeiro molar superior) não são relevantes (P > 0.05) para a discriminação dos táxons. Dimorfismo sexual baseado na morfometria foi sustentado pelo teste t para O. nigripes. Em O. flavescens esta condição não é estatisticamente verificada

The imagos of some enigmatic members of the Hermanella complex (Ephemeroptera, Leptophlebiidae)

The imago stages of three species of the Hermanella complex are described mostly based on material from Roraima, northern Brazil: Hydrosmilodon gilliesae, Hydromastodon sallesi and Leentvaaria palpalis. Male imagos of Hydrosmilodon gilliesae and Leentvaaria palpalis both have a pair of large, broad projections at the posterior margin of the styliger plate, nearly covering the penis lobes; in L. palpalis, however, these projections are fused. The male imago of Hydromastodon sallesi resembles Hydrosmilodon plagatus in that both species have a styliger plate with a robust projection that is curved towards the penis lobes. DNA barcoding is likely to be a powerful investigative tool for identifying and understanding species limits among these Ephemeroptera taxa, especially if it is used within an integrative taxonomic context. An updated identification key to the genera of the Hermanella complex is proposed

Penile shape discriminates two cryptic species of Akodon Meyen, 1833 (Mammalia, Rodentia, Cricetidae) from eastern Brazil

Glans penis morphology has been used as a powerful tool in mammal taxonomy to differentiate cryptic species. Neotropical rodent species Akodon cursor and A. montensis are cryptic, and interspecific hybrids are like their parental species. We investigated non-metric and metric phallic characters aiming to differentiate A. cursor from A. montensis. We also evaluated the parental species’ influence of the phallic characters on hybrids. We analysed 96 male adults—56 A. cursor, 27 A. montensis, and 13 hybrids, subgrouping species by locality and hybrids by parental species (paternal vs maternal). We verified that A. cursor and A. montensis are distinguishable by penile-shape morphology: A. cursor has an elongated penile form with a flare in the distal portion and A. montensis has a barrel-shaped form. Also, dark spots in ventral view, if present in A. montensis, distinguish A. montensis from A. cursor. Although the non-metric characters differentiate the species, they do not distinguish the subgroups of A. cursor, A. montensis, and hybrids. The metric phallic characters indicated a significant difference between species and hybrids. These characters also differentiate the population groups of A. cursor. However, A. montensis subgroups and hybrids subgroups did not present a significant difference. This study shows the importance of penis morphology in the taxonomy of the cryptic rodent species A. cursor and A. montensis, representing a powerful tool to discriminate male specimens in mammal collections without karyotyping or sequencing, even though the specimens occurred in sympatric areas. Since most taxidermy protocols do not preserve the penis in mammal preparations, liquid preservation of some specimens or the removal of the penis before taxidermy for liquid preservation could be beneficial. We also recommend the organisation in museum collections of a penis bank for the A. cursor species group (or even all rodent species) to avoid losing this important information for species identification

Karyotypes of Brazilian non-volant small mammals (Didelphidae and Rodentia): An online tool for accessing the chromosomal diversity

Abstract We have created a database system named CIPEMAB (CItogenética dos PEquenos MAmíferos Brasileiros) to assemble images of the chromosomes of Brazilian small mammals (Rodents and Marsupials). It includes karyotype information, such as diploid number, karyotype features, idiograms, and sexual chromosomes characteristics. CIPEMAB facilitates quick sharing of information on chromosome research among cytogeneticists as well as researchers in other fields. The database contains more than 300 microscopic images, including karyotypic images obtained from 182 species of small mammals from the literature. Researchers can browse the contents of the database online (http://www.citogenetica.ufes.br). The system enables users to locate images of interest by taxa, and to display the document with detailed information on species names, authors, year of the species publication, and karyotypes pictures in different colorations. CIPEMAB has a wide range of applications, such as comparing various karyotypes of Brazilian species and identifying manuscripts of interest

Karyological geographic variation of Oligoryzomys nigripes Olfers, 1818 (Rodentia, Cricetidae) from Brazil

The karyotypes of 85 specimens of Oligoryzomys nigripes (Rodentia, Sigmodontinae) collected in the Cerrado and Atlantic Forest of seven states of Brazil were analyzed. Eighty four specimens presented a karyotype with 2n = 62 and one individual had 2n = 61 due to a monosomy of the X chromosome. High levels of intra- and inter-population karyotypic variability, due to sex chromosomes heteromorphisms and pericentric inversions in four autosomes (pairs 2, 3, 4 and 8), led to a variation of the autosomal arm numbers (fundamental number, FN) from 78 to 82. Synaptonemal complex analyses revealed normal meiosis in males heterozygous for pericentric inversions. We found 39 different cytotypes, 27 of which are herein described for the first time. A literature survey revealed 46 described karyotypes for O. nigripes. We tested the hypothesis that chromosomal variants frequencies are dependent on geographical distribution and we propose a model for the karyotypical evolution of Oligoryzomys nigripes with 2n = 62/FN = 78-82

Non-volant mammals, Parque Nacional do Catimbau, Vale do Catimbau, Buíque, state of Pernambuco, Brazil, with karyologic data

We report the results of a terrestrial small mammal survey at one National Park in the northeastern Brazil, in the state of Pernambuco. The Catimbau National Park is located within the Caatinga domain with the characteristic thorn scrub vegetation. Our sampling encompasses several different vegetation/habitat types within the park area. All specimens collected were prepared as vouchers to be deposited in the Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo. Karyotypes were obtained for all representative purported species collected. We report here the results of this first survey – two species of marsupials and seven of rodents - and added new occurrence localities for several small mammal species of this region, provide karyotypic information and register an undescribed species of arboreal rat of the genus Rhipidomys. This survey illustrates the need for extensive and planned sampling of the Caatinga domain