Selective sweep on human amylase genes postdates the split with Neanderthals

Humans have more copies of amylase genes than other primates. It is still poorly understood, however, when the copy number expansion occurred and whether its spread was enhanced by selection. Here we assess amylase copy numbers in a global sample of 480 high coverage genomes and find that regions flanking the amylase locus show notable depression of genetic diversity both in African and non-African populations. Analysis of genetic variation in these regions supports the model of an early selective sweep in the human lineage after the split of humans from Neanderthals which led to the fixation of multiple copies of AMY1 in place of a single copy. We find evidence of multiple secondary losses of copy number with the highest frequency (52%) of a deletion of AMY2A and associated low copy number of AMY1 in Northeast Siberian populations whose diet has been low in starch content

The University of Waikato Radiocarbon Dating Laboratory Report on Radiocarbon Age Determinations, upper Karawari region, Papua New Guinea (2017)

<p>Radiocarbon age reports for Wk-45980 and Wk-45981</p&gt

The University of Waikato Radiocarbon Dating Laboratory Report on Radiocarbon Age Determinations, Papua New Guinea (2018)

<p>Radiocarbon age reports for Wk-47758, Wk-47759, Wk-47756, and Wk-47757</p&gt

ADN ancien et populations du passé (le cas de l'Altaï et de la Sibérie orientale)

L'identification génétique (région HV1 de l'ADNmt et STR des autosomes et du chromosome Y) de restes humains anciens appartenant aux populations Scythe du sud de la Sibérie (2500 ans BP), Yakout de Sibérie centrale (500-300 ans BP) et néolithique de l'extrême nord-est Sibérien (6000 ans BP) a été réalisé avec succès. Les résultats confirment l'hypothèse (i) d'un (re)peuplement de la Sibérie à partir de deux zones distinctes correspondant aux deux zones de refuge glaciaire en place il y a 10000 ans, et (ii) d'une poussée des populations mongoloïdes de l'est vers l'ouest de la Sibérie, décelable dès le 1er millénaire BC. La forte hétérogénéité génétique des populations Scytho-Sibérienne et Yakout, la présence caucasoïde en Altaï plusieurs siècles avant le développement de la route de la soie et la complexité des modes de recrutement funéraire Yakout a été mis en évidence, ainsi que leur ethnogénèse à partir des populations d'Asie centrale.Molecular analysis (region HV1 of mtDNA and Y and autosomal STR) of ancient human remains belonging to the Scytho-Siberian of south Siberia (2500 years BP), Yakut of central Siberia (500-300 years BP) and north-eastern Neolithic (3600 BP) populations have been successful accomplish. Results are in agreement with the hypothesis (i) of a Siberia peopling from two distinct glacial refuge regions corresponding to north-eastern Siberia and southern Siberia and (ii) mongoloid population movement westward from the 1st millenary BC. We also underlined the strong genetic heterogeneity of Scytho-Siberian and Yakut populations, the Caucasoid presence in Altai several centuries before the silk road development, and that commercial exchange with neighbouring population (notably Chinese) were coupled with genetic exchange. Moreover, our genetic results suggested the Yakut funeral practice diversity and confirmed the hypothesis of their ethnogenesis from central Asian populations.PARIS3-BU (751052102) / SudocSudocFranceF

Ancient DNA analysis of human Neolithic remains found in northeastern Siberia.

International audienc

Populations anciennes et ADN ancien: état actuel de la question

International audienceLes possibilités offertes par la biologie moléculaire dans le domaine de l'anthropologie sont aujourd'hui largement reconnues. Après un rappel très succinct des marqueurs utilisés pour étudier l'ADN extrait de tissus anciens, cet article cherche à souligner les limites et les difficultés inhérentes à l'analyses de molécules dégradées et se propose de faire le point sur l'intérêt d'une approche moléculaire en anthropologie au travers d'exemples issus de la littérature

Populations anciennes et ADN ancien: état actuel de la question

International audienceLes possibilités offertes par la biologie moléculaire dans le domaine de l'anthropologie sont aujourd'hui largement reconnues. Après un rappel très succinct des marqueurs utilisés pour étudier l'ADN extrait de tissus anciens, cet article cherche à souligner les limites et les difficultés inhérentes à l'analyses de molécules dégradées et se propose de faire le point sur l'intérêt d'une approche moléculaire en anthropologie au travers d'exemples issus de la littérature

Genetic analysis of a Scytho-Siberian skeleton and its implications for ancient Central Asian migrations.

International audienceThe excavation of a frozen grave on the Kizil site (dated to be 2500 years old) in the Altai Republic (Central Asia) revealed a skeleton belonging to the Scytho-Siberian population. DNA was extracted from a bone sample and analyzed by autosomal STRs (short tandem repeats) and by sequencing the hypervariable region I (HV1) of the mitochondrial DNA. The resulting STR profile, mitochondrial haplotype, and haplogroup were compared with data from modern Eurasian and northern native American populations and were found only in European populations historically influenced by ancient nomadic tribes of Central Asia