Estimativa de parâmetros genéticos utilizando diferentes níveis de saturação no mapeamento genômico

Genetic mappings were simulated using different saturation levels by markers to estimate the following parameters: phenotypicvalue, endogamy, favorable fixed allele and frequency of allele of the trait, in the marker-assisted selection (MAS). Clusteranalysis was realized, using the phenotypic values in order to obtain densities that could optimize the phenotypic increments.The genetic simulation system - Genesys was used to simulate the genome, consisting of a heritability quantitative characteristic(0.10), and the base and initial populations. The initial population was submitted to MAS for twenty consecutive generations.It was conducted at different saturation levels, represented by the distance in centiMorgan (cM) among adjacent markers. 15MAS were realized, each one corresponding to densities: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28 and 30 cM. Mapping usingmedium to high density of markers indicated efficiency of phenotypic progress along generations under selection. This highsaturation was also a benefit to the setting of favorable alleles, increasing the frequency of alleles related to the trait, althoughthe most prominent increase in inbreeding. Cluster analysis indicated optimization and correlation in phenotypic values, whenassuming the densities of 4 and 6 cM, and significant gains for the saturation of 2, 8, 10, 12 and 14 cM.Foram simulados mapeamentos genéticos utilizando diferentes níveis de saturação por marcadores para estimar osparâmetros: valor fenotípico, endogamia, alelos favoráveis fixados e frequência de alelos da característica, na seleção assistidapor marcadores (MAS). Procedeu-se àanálise de agrupamento com os valores fenotípicos, com a finalidade de se obteremdensidades que otimizassem os incrementos fenotípicos. O sistema de simulação genética Genesys foi utilizado para simularo genoma, constituído de uma característica quantitativa de herdabilidade 0,10, e as populações base e inicial. A populaçãoinicial foi submetida à MAS por vinte gerações consecutivas. Ela foi conduzida em diferentes níveis de saturação, representadospela distância, em centiMorgan (cM), entre marcadores adjacentes. Foram praticadas 15 MAS, cada qual correspondendo àsdensidades: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28 e 30 cM. O mapeamento, empregando de média a alta densidadede marcadores, assinalou eficiência nos progressos fenotípicos ao longo das gerações sob seleção. Essa alta saturação tambémbeneficiou a fixação de alelos favoráveis, elevando a frequência de alelos relacionados à característica, apesar do acréscimomais eminente na endogamia. A análise de agrupamento indicou otimização e correspondência nos valores fenotípicos aoadmitir as densidades de 4 e 6 cM, além de ganhos expressivos para a saturação de 2, 8, 10, 12 e 14 cM

Atividade enzimática da lipase em rã-touro na fase pós-metamórfica

The knowledge of the digestive system of bullfrogs is an important step for the determination of their nutritional requirements throughout growth phases. With the objective of evaluating the enzymatic activity of lipase in the intestinal content of bullfrogs (Rana catesbeiana Shaw, 1802), 100 animals with median weight of 3.6 g were distributed in stalls under controlled temperature and photoperiod. The frogs, selected at the post-metamorphic phase, received commercial extruded diet ad libitum throughout the 87-day experiment. The collections of the intestinal content were performed by the desensitization of the frogs in ice and water at 0ºC and subsequent isolation of the small intestine. Determination of lipase activity was performed with a commercial enzymatic kit (Lipase-Bioclin, MG, Brazil), first measured in samples taken at day three (3.46 UI). During the initial phase the bullfrog possesses low lipase hydrolysis capacity was found, having a specific activity of 217 UI mg-1. In the subsequent period both lipase activity and specific lipase activity continuously increased. Lipase activity as a function of bullfrog weight fell after day twenty and reached 0.33 UI g-1, for frogs of medium weight (179 g). Feed for bullfrogs at the post-metamorphic phase weighing more than 10 g can have larger amounts of ingredients containg lipids, due to the increased digestive capacity of these frogs.O conhecimento do sistema digestório da rã-touro é um passo importante para a determinação de sua exigência nutricional nas diferentes fases de crescimento. Com o objetivo de avaliar a atividade enzimática da lipase no conteúdo intestinal da rã-touro (Rana catesbeiana Shaw, 1802), 100 animais com peso médio de 3,6 g foram distribuídos em baias-teste com temperatura e fotoperíodo controlados. As rãs, selecionadas na fase pos-metamórfica receberam ração extruzada comercial ad libitum. Durante 87 dias de experimento, 29 coletas (87 rãs) foram feitas em intervalos que variaram de um a oito dias. As rãs foram insensibilizadas em água e gelo a 0ºC para subseqüente isolamento do intestino delgado e retirada do conteúdo intestinal. Para determinação da atividade da lipase foram usados conjuntos enzimáticos da BIOCLIN. A atividade da lipase foi registrada no terceiro dia (3,46 UI). Na fase inicial, a rã-touro possui baixa capacidade de hidrólise para a lipase que teve atividade específica de 217 UI mg-1. No período subseqüente, observou-se aumento contínuo da atividade e da atividade específica da lipase. A atividade da lipase em função do peso da rã-touro depois do 20º dia apresentou redução contínua, alcançando valor de 0,33 UI g-1, registrado para rãs com peso médio de 179 g. As rações para rã-touro com peso superior a 10 g podem conter quantidades maiores de ingredientes que contenham lipídos, devido ao aumento da capacidade da digestão

Características ruminais e eficiência de síntese microbiana em novilhos alimentados com cama de frango e suplemento à base de microbiota ruminal

O experimento foi realizado para avaliar o efeito de dois níveis de cama de frango (15,0 e 30,0%), associada ou não a um suplemento à base de microbiota ruminal liofilizada de bovinos adultos (0 e 10 g/anim.dia), na alimentação de novilhos Holandês/Zebu. Quatro novilhos fistulados no rúmen e abomaso foram distribuídos em quadrado latino 4 x 4 em arranjo fatorial 2 x 2 (nível de cama de frango x com ou sem micobiota ruminal), alimentados à vontade e individualmente. Composição microbiana, eficiência de síntese microbiana, pH e concentração de nitrogênio amoniacal no rúmen foram avaliados. O nível de 30,0% de cama de frango nas dietas de novilhos não influenciou a composição dos microrganismos ruminais, a eficiência de síntese microbiana e o pH ruminal. Maiores concentrações médias de N-NH3 ruminal foram observadas em animais submetidos a dietas com 30% de cama de frango. A ingestão diária de 10 g do suplemento à base de microbiota ruminal por animal não influiu na composição dos microrganismos ruminais, na eficiência de síntese, no pH ruminal e na concentração de amônia no rúmen.The experiment was carried out to evaluate the effect of different levels of broiler litter (15 and 30%), associated or not to a supplement based on bovine lyophilized ruminal microbiota (0 and 10 g/anim.day), in Holstein/Zebu steers feeding. Four steers fistulated in the rumen and abomasum were allotted to a 4 x 4 latin square in a 2 x 2 factorial arrangement (level of broiler litter x with or without ruminal microbiota), full fed individually. The ruminal microorganisms composition, efficiency of microbial synthesis, ruminal pH and N-NH3 ruminal concentration were evaluated. The level of 30.0% of broiler litter in the steers diets did not affect the composition of ruminal microorganisms, the efficiency of microbial synthesis and ruminal pH. Higher concentration means of ruminal N-NH 3 were observed in animals fed diets with 30.0% of broiler litter. The daily intake of 10 g of the supplement based on ruminal microbiota by the animals did not affect the composition of ruminal microorganisms, efficiency of microbial synthesis, ruminal pH and N-NH3

Amylase activity in the bullfrog during the post-metamorphic phase

O objetivo deste trabalho foi avaliar a atividade da amilase no quimo da rã-touro, Rana catesbeiana Shaw 1802 (3,6 a 200 g). Oitenta e sete animais foram distribuídos em baias-testes com temperatura e fotoperíodo controlados. As rãs selecionadas na fase pós-metamórfica receberam ração comercial extrusada ad libitum. Durante 87 dias de experimento, foram efetuadas 29 coletas em intervalos de 1 a 8 dias. As coletas do conteúdo intestinal foram feitas mediante a insensibilização das rãs em gelo e água e isolamento posterior do intestino delgado das mesmas. Para os testes da atividade da amilase, foram utilizados kits enzimáticos comerciais. A atividade da amilase foi observada a partir do terceiro dia e apresentou aumento até alcançar estabilidade, quando os animais pesavam 4,35 g. Do sétimo dia até o final do experimento, ocorreu a manutenção da estabilidade da atividade (137,44 UI) e atividade específica da amilase (14.688 UI mg-1).The objective of this work was to evaluate the amylase activity in the chime of the bullfrog Rana catesbeiana Shaw 1802 (3.6 to 200 g). Eighty-seven animals were distributed in test stalls with controlled temperature and photoperiod. The frogs selected in the post-metamorphic phase received commercial extruded diet ad libitum. During 87 days of the experiment, 29 samples were collected in intervals varying from one to eight days. The intestinal content samples were made by first desensitizing of the frogs in ice and water, and subsequently removing the small intestine. For the tests of amylase activity, commercial enzymatic kits were used. Amylase activity was observed since the third day and it increased until reaching stability, when the animals weighed 4.35 g. Amylase activity (137.44 UI) and specific activity (14,688 UI mg-1) remained stable from the seventh day until the end of the experiment

Características ruminais e eficiência de síntese microbiana em novilhos alimentados com cama de frango e suplemento à base de microbiota ruminal liofilizada

O experimento foi realizado para avaliar o efeito de dois níveis de cama de frango (15,0 e 30,0%), associada ou não a um suplemento à base de microbiota ruminal liofilizada de bovinos adultos (0 e 10 g/anim.dia), na alimentação de novilhos Holandês/Zebu. Quatro novilhos fistulados no rúmen e abomaso foram distribuídos em quadrado latino 4 x 4 em arranjo fatorial 2 x 2 (nível de cama de frango x com ou sem micobiota ruminal), alimentados à vontade e individualmente. Composição microbiana, eficiência de síntese microbiana, pH e concentração de nitrogênio amoniacal no rúmen foram avaliados. O nível de 30,0% de cama de frango nas dietas de novilhos não influenciou a composição dos microrganismos ruminais, a eficiência de síntese microbiana e o pH ruminal. Maiores concentrações médias de N-NH3 ruminal foram observadas em animais submetidos a dietas com 30% de cama de frango. A ingestão diária de 10 g do suplemento à base de microbiota ruminal por animal não influiu na composição dos microrganismos ruminais, na eficiência de síntese, no pH ruminal e na concentração de amônia no rúmen.The experiment was carried out to evaluate the effect of different levels of broiler litter (15 and 30%), associated or not to a supplement based on bovine lyophilized ruminal microbiota (0 and 10 g/anim.day), in Holstein/Zebu steers feeding. Four steers fistulated in the rumen and abomasum were allotted to a 4 x 4 latin square in a 2 x 2 factorial arrangement (level of broiler litter x with or without ruminal microbiota), full fed individually. The ruminal microorganisms composition, efficiency of microbial synthesis, ruminal pH and N-NH3 ruminal concentration were evaluated. The level of 30.0% of broiler litter in the steers diets did not affect the composition of ruminal microorganisms, the efficiency of microbial synthesis and ruminal pH. Higher concentration means of ruminal N-NH 3 were observed in animals fed diets with 30.0% of broiler litter. The daily intake of 10 g of the supplement based on ruminal microbiota by the animals did not affect the composition of ruminal microorganisms, efficiency of microbial synthesis, ruminal pH and N-NH3

Relationship between morphological traits and milk yield in Gir breed cows

O objetivo deste trabalho foi determinar parâmetros genéticos relacionados a características morfológicas e suas correlações genéticas com a produção de leite, em vacas da raça Gir. Utilizaram-se 3.805 registros provenientes de 2.142 vacas. O modelo utilizado na análise de características morfológicas continha os efeitos fixos de rebanho, ano e estação de classificação, estádio da lactação e idade da vaca à classificação, além da identificação do classificador. Quanto à produção de leite, foram incluídos no modelo os efeitos fixos de rebanho, ano e estação de parição e idade da vaca ao parto. Os parâmetros genéticos foram obtidos por meio do aplicativo REMLF90. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,09 a 0,54. A variabilidade genética aditiva da maioria das características é suficiente para que ganhos genéticos anuais significativos possam ser alcançados com o processo de seleção. As correlações genéticas entre as características morfológicas variaram de baixas a altas e, entre elas e a produção de leite, de baixas a moderadas. Altas correlações genéticas entre algumas características morfológicas implicam a possibilidade de exclusão de algumas delas do programa de melhoramento genético da raça Gir, no Brasil. As correlações genéticas entre produção de leite e algumas características morfológicas indicam que estas podem ser utilizadas na formação de índices de seleção.The objective of this work was to determine genetic parameters related to morphological traits and their genetic correlation with milk yield of Gir breed cows. A total of 3,805 records from 2,142 cows was used. For morphological trait analysis, the used model included the herd fixed effects, classification year and season, lactation phase and animal age at evaluation, besides the classifier identification. For milk yield, the fixed herd effects, year and season of calving and cow age at calving were included in the model. The genetic parameters were estimated using the REMLF90 software. The heritability estimates varied from 0.09 to 0.54. The additive genetic variability of the majority of traits is sufficient to achieve significative annual genetic gain by selection practices. The genetic correlations among morphological traits varied from low to high and, between them and milk yield, from low to moderate. High genetic correlations among some morphological traits implies on the possibility of exclusion of some of them from the breeding program, for Gir breed in Brazil. The genetic correlations between milk yield and some morphological traits indicate that they may be used in the formation of selection indexes

Seleção tradicional e associada a marcadores moleculares na avaliação genética animal

The objective of this work was to compare selection based on breeding values predicted by classical best linear unbiased prediction (BLUP), BLUP associated with molecular markers (BLUPM) and individual selection (IS) using data simulated with the Genesys program. To obtain the genetic similarity matrix to be used in BLUPM, a hundred microsatellite markers (simple sequence repeats) were simulated using a similarity coefficient corresponding to the mean Euclidean distance between quantitative data. The different selection methods were compared using populations of an effective size of 66.66 and a mean of 30 repetitions, and mean phenotypic values were determined. Genetic gain obtained over 20 generations of selection was higher for BLUP than BLUPM, which in turn was superior to IS. Similar genetic gains were obtained for BLUPM and BLUP only when the gain for the first five generations was considered, and these gains were higher than those obtained with IS. Selected reproducers mating systems did not lead to differences in genetic gain for the BLUP-based methods.O objetivo deste trabalho foi comparar a seleção, utilizando valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP), BLUP marcadores (BLUPM) e pela seleção individual (SI), usando simulação com o programa Genesys. Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR – Simple Sequence Repeat), por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclideana média para dados quantitativos. A fim de comparar os diferentes métodos, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Os ganhos ao longo das 20 gerações de seleção foram maiores para o BLUP em relação ao BLUPM, e este foi superior à SI. Quanto ao ganho obtido nas cinco primeiras gerações, o BLUPM apresentou ganhos semelhantes ao BLUP e superiores à SI. Diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados não revelaram diferenças em ganho genético nos métodos baseados no BLUP

Traditional and associated selection with molecular markers in the genetic evaluation of animals

O objetivo deste trabalho foi comparar a seleção, utilizando valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP), BLUP marcadores (BLUPM) e pela seleção individual (SI), usando simulação com o programa Genesys. Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR – Simple Sequence Repeat), por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclideana média para dados quantitativos. A fim de comparar os diferentes métodos, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Os ganhos ao longo das 20 gerações de seleção foram maiores para o BLUP em relação ao BLUPM, e este foi superior à SI. Quanto ao ganho obtido nas cinco primeiras gerações, o BLUPM apresentou ganhos semelhantes ao BLUP e superiores à SI. Diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados não revelaram diferenças em ganho genético nos métodos baseados no BLUP.The objective of this work was to compare selection based on breeding values predicted by classical best linear unbiased prediction (BLUP), BLUP associated with molecular markers (BLUPM) and individual selection (IS) using data simulated with the Genesys program. To obtain the genetic similarity matrix to be used in BLUPM, a hundred microsatellite markers (simple sequence repeats) were simulated using a similarity coefficient corresponding to the mean Euclidean distance between quantitative data. The different selection methods were compared using populations of an effective size of 66.66 and a mean of 30 repetitions, and mean phenotypic values were determined. Genetic gain obtained over 20 generations of selection was higher for BLUP than BLUPM, which in turn was superior to IS. Similar genetic gains were obtained for BLUPM and BLUP only when the gain for the first five generations was considered, and these gains were higher than those obtained with IS. Selected reproducers mating systems did not lead to differences in genetic gain for the BLUP-based methods