Kinome expression profiling and prognosis of basal breast cancers

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Basal breast cancers (BCs) represent ~15% of BCs. Although overall poor, prognosis is heterogeneous. Identification of good- <it>versus </it>poor-prognosis patients is difficult or impossible using the standard histoclinical features and the recently defined prognostic gene expression signatures (GES). Kinases are often activated or overexpressed in cancers, and constitute targets for successful therapies. We sought to define a prognostic model of basal BCs based on kinome expression profiling.</p> <p>Methods</p> <p>DNA microarray-based gene expression and histoclinical data of 2515 early BCs from thirteen datasets were collected. We searched for a kinome-based GES associated with disease-free survival (DFS) in basal BCs of the learning set using a metagene-based approach. The signature was then tested in basal tumors of the independent validation set.</p> <p>Results</p> <p>A total of 591 samples were basal. We identified a 28-kinase metagene associated with DFS in the learning set (N = 73). This metagene was associated with immune response and particularly cytotoxic T-cell response. On multivariate analysis, a metagene-based predictor outperformed the classical prognostic factors, both in the learning and the validation (N = 518) sets, independently of the lymphocyte infiltrate. In the validation set, patients whose tumors overexpressed the metagene had a 78% 5-year DFS <it>versus </it>54% for other patients (p = 1.62E-4, log-rank test).</p> <p>Conclusions</p> <p>Based on kinome expression, we identified a predictor that separated basal BCs into two subgroups of different prognosis. Tumors associated with higher activation of cytotoxic tumor-infiltrative lymphocytes harbored a better prognosis. Such classification should help tailor the treatment and develop new therapies based on immune response manipulation.</p

certaine hésitation : Perspectives 2000-2001 pour l'économie mondiale.

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Functional muscle impairment in facioscapulohumeral muscular dystrophy is correlated with oxidative stress and mitochondrial dysfunction

International audienceFacioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD),the most frequent muscular dystrophy, is an autosomal dominant disease. In most individuals with FSHD, symptoms are restricted to muscles of the face, arms, legs, and trunk. FSHD is genetically linked to contractions of the D4Z4 repeat array causing activation of several genes.One of these maps in the repeat itself and expresses the DUX4 (the double homeobox 4) transcription factor causing a gene deregulation cascade. In addition, analyses of the RNA or protein expression profiles in muscle have indicated deregulations in the oxidative stress response. Since oxidative stress affects peripheral muscle function, we investigated mitochondrial function and oxidative stress in skeletal muscle biopsies and blood samples from patients with FSHD and age-matched healthy controls, and evaluated their association with physical performances.We show that specifically, oxidative stress (lipid peroxidation and protein carbonylation), oxidative damage (lipofuscin accumulation), and antioxidant enzymes (catalase, copper–zinc-dependent super- oxide dismutase, and glutathione reductase) were higher in FSHD than in control muscles. FSHD muscles also presented abnormal mitochondrial function (decreased cytochrome c oxidase activity and reduced ATP synthesis). In addition, the ratio between reduced (GSH) and oxidized glutathione (GSSG) was strongly decreased in all FSHD blood samples as a consequence of GSSG accumulation. Patients with FSHD also had reduced systemic antioxidative response molecules, such as low levels of zinc (a SOD cofactor), selenium (a GPx cofactor involved in the elimination of lipid peroxides), and vitamin C. Half of them had a low ratio of gamma/alpha tocopherol and higher ferritin concentrations. Both systemic oxidative stress and mitochondrial dysfunction were correlated with functional muscle impairment. Mitochondrial ATP production was significantly correlated with both quadriceps endurance (TLimQ) and maximal voluntary contraction (MVCQ) values (rho¼0.79, P¼0.003; rho¼0.62, P¼0.05, respectively). The plasma concentration of oxidized glutathione was negatively correlated with the TLimQ, MVCQ values, and the 2-min walk distance (MWT) values (rho¼0.60, P¼0.03; rho¼0.56, P¼0.04; rho¼0.93, Po0.0001, respectively). Our data characterized oxidative stress in patients with FSHD and demonstrated a correlation with their peripheral skeletal muscle dysfunction. They suggest that antioxidants that might modulate or delay oxidative insult maybe useful in maintaining FSHD muscle functions

Principes, enjeux et usages de la méthode biographique en sociologie

This paper shows that the practice of a biographical method in sociology is a tool particularly useful for this branch of knowledge when the researcher focuses on socialization processes. The biographical method enables analyzing the genesis of social phenomena, through the deep analysis of the dispositions of an individual. It allows grasping social reality in an individual way. The conditions enabling this approach, inspired by Jean Peneff, are considered, together with some examples of its use.Nous défendons dans cet article l'usage de la méthode biographique comme un outil particulièrement opérant dans le cadre d'une démarche sociologique plaçant au centre de sa réflexion les processus de socialisation. La méthode biographique permet de penser la genèse des phénomènes sociaux, à travers la reconstruction fine et précise des dispositions d'un individu, et ainsi de saisir le social sous sa forme individuelle. Après avoir défini le statut épistémologique de cette méthode biographique, inspirée de Jean Peneff, nous réfléchissons à ses conditions pratiques de possibilité et en présentons des usages

Le coût d’une heure de garde en accueil collectif [Une évaluation à partir de données locales]

Raynaud Emilie. Le coût d’une heure de garde en accueil collectif [Une évaluation à partir de données locales]. In: Recherches et Prévisions, n°86, 2006. La nouvelle administration. L'information numérique au service du citoyen. pp. 82-89

Le médecin généraliste, les jeunes et la télé-réalité

La télévision est née il y a 80 ans. Le développement de l interactivité a permis la naissance du phénomène Télé-réalité il y a 5 ans. Alors que de plus en plus d enfants possèdent un poste dans leur chambre, certains professionnels s interrogent : la télévision est-elle nocive ? En s appuyant sur des émissions de télé-réalité, nous tentons de répondre à cette question en abordant trois thèmes : la violence, le sexe et la publicité télévisés. Dans un second temps, nous mettons en évidence que le médecin généraliste pourrait avoir une place dans la prévention de certains de ces effets indésirables (agressivité, anxiété, troubles dans la relation à autrui). Dans ce sens, nous établissons des recommandations, validées, pour aider parents, médecins référents et autres professionnels à participer à la protection des jeunes dans ce domaine. Les maître-mots de ces recommandations sont : dialogue, échanges, accompagnement. Hormis un questionnaire distribué à des médecins généralistes pour connaître leur point de vue d une manière générale sur le thème de la télévision et de la télé-réalité, nous proposons une approche essentiellement bibliographique.TOULOUSE3-BU Santé-Centrale (315552105) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Obésité infantile en France (causes, conséquences et mesures de prévention)

MONTPELLIER-BU Pharmacie (341722105) / SudocSudocFranceF

Parentalité et surdité de l'enfant (étude préliminaire du sentiment de compétence parentale, à propos de 26 cas)

Les parents d'enfant(s) sourd(s) ont souvent été décrits dans la littérature francophone et internationale. Cette description émane le plus souvent des professionnels de la surdité, qui mettent en exergue cette parentalité à risque . Dans une étude préliminaire, nous avons interrogé les parents eux-mêmes, qu'ils soient sourds ou entendants, au travers de deux auto-questionnaires, dont le Questionnaire d'Auto-Évaluation de la Compétence Éducative parentale (QAECEP). Nous avons proposé une version en Langue des Signes Française de ces questionnaires, à l'aide d'un support vidéo (DVD). Les 26 cas recrutés nous montrent que le sentiment de compétence parentale est préservé chez les parents d'enfant(s) sourd(s). Pour les pères, il apparaît que la communication orale avec leur(s) enfant(s) renforce le sentiment de compétence.TOULOUSE3-BU Santé-Centrale (315552105) / SudocSudocFranceF

Les familles monoparentales en Europe : de nouvelles façons de faire famille pour de nouvelles normes ?

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Que reste-t-il du couple marié avec deux enfants ?

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