Rapporto tecnico sulla valutazione della biomassa ittioplanctonica mediante l'utilizzo del Multi Plankton Sampler (MPS)

Il piano di campionamento della campagna oceanografica BANSIC'14, condotta a bordo della N/O "URANIA" dal 22 Luglio al 9 Agosto 2014, lungo transetti sotto costa e a largo delle coste meridionali della Sicilia, ha avuto l’obiettivo generale dello studio delle relazioni tra le strutture oceanografiche a mesoscala (vortici verticali ed orizzontali, upwelling, etc.) e le strutture spaziali dei fenomeni biologici relativi ai primi anelli della catena trofica (zooplancton, distribuzione e abbondanza di larve di piccoli pelagici e grandi pelagici) (vedi Rapporto finale BANSIC 2014) per la stima dell’abbondanza dello stock riproduttore. E' una campagna di ricerca nell'ambito del WP3 del progetto SSD-Pesca, finanziato dal MIUR su fondi MISE, a supporto della pesca italiana nelle Regioni Obiettivo 1 e del progetto RITMARE (SP2_WP4_AZ2_UO04). Il campionamento ittioplanctonico è inserito anche nel piano di lavoro del progetto regionale MIPAF-FAO “MedSudMed” (“Assessment and Monitoring of the Fishery Resources and the Ecosystems in the Straits of Sicily”). Il campionamento dell’ittioplancton, durante questa campagna, oltre ai metodi tradizionali quali le reti di tipo Bongo, ha visto l'utilizzo del Multi Plankton Sampler (MPS) MultiNet. I campionatori ittioplanctonici hanno lo scopo di prelevare porzioni di mesozooplancton da un massimo di 100 m fino alla superficie, in quanto le uova di pesci pelagici possiedono una galleggiabilità tale che nonostante le turbolenze superficiali dell’acqua, un campionamento entro i primi metri restituisce un dato affidabile della distribuzione anche se alcune uova possono trovarsi a maggiore profondità (Ahlstrom, 1959). Il campionatore MPS consente, a differenza di altri strumenti, di prelevare la frazione di zooplancton d'interesse con diverse modalità di campionamento: orizzontale, verticale e obliquo e, allo stesso tempo, permette di campionare a differenti quote di profondità. Le informazioni così ottenute sono state utilizzate per valutare la variazione della biomassa ittioplanctonica, l'abbondanza e la composizione delle specie lungo gli strati della colonna d'acqua anche in relazione alle componenti oceanografiche. Grazie all'utilizzo di questo strumento è possibile validare e verificare alcune informazioni e acquisirne delle nuove sull’ecologia delle specie larvali e sul mesozooplancton, sul modo in cui queste si distribuiscono lungo la colonna d'acqua e sulle interazioni intra ed interspecifiche legate anche a fattori oceanografici. Ciò consente di ottenere maggiori informazioni e contribuire al miglioramento della comprensione della biologia e dell'ecologia delle specie rinvenute e, nel contempo, approfondire e migliorare le conoscenze sugli stadi di sviluppo di uova di specie ittiche che allo stadio embrionale sono ancora poco conosciuti

Variability of water mass properties in the Strait of Sicily in summer period of 1998–2013

The Strait of Sicily plays a crucial role in determining the water-mass exchanges and related properties between the western and eastern Mediterranean. Hydrographic measurements carried out from 1998 to 2013 allowed the identification of the main water masses present in the Strait of Sicily: a surface layer composed of Atlantic water (AW) flowing eastward, intermediate and deep layers mainly composed of Levantine intermediate water (LIW), and transitional eastern Mediterranean deep water (tEMDW) flowing in the opposite direction. Furthermore, for the first time, the signature of intermittent presence of western intermediate water (WIW) is also highlighted in the northwestern part of the study area (12.235◦ E, 37.705◦ N). The excellent area coverage allowed to highlight the high horizontal and vertical inter-annual variability affecting the study area and also to recognize the permanent character of the main mesoscale phenomena present in the surface water layer. Moreover, strong temperature-salinity correlations in the intermediate layer, for specific time intervals, seem to be linked to the reversal of surface circulation in the central Ionian Sea. The analysis of CTD data in deeper water layer indicates the presence of a large volume of tEMDW in the Strait of Sicily during the summers of 2006 and 2009.peer-reviewe

Ki67 proliferation in core biopsies versus surgical samples - a model for neo-adjuvant breast cancer studies

Background: An increasing number of neo-adjuvant breast cancer studies are being conducted and a novel model for tumor biological studies, the "window-of-opportunity" model, has revealed several advantages. Change in tumor cell proliferation, estimated by Ki67-expression in pre-therapeutic core biopsies versus post-therapeutic surgical samples is often the primary end-point. The aim of the present study was to investigate potential differences in proliferation scores between core biopsies and surgical samples when patients have not received any intervening anti-cancer treatment. Also, a lack of consensus concerning Ki67 assessment may raise problems in the comparison of neo-adjuvant studies. Thus, the secondary aim was to present a novel model for Ki67 assessment. Methods: Fifty consecutive breast cancer cases with both a core biopsy and a surgical sample available, without intervening neo-adjuvant therapy, were collected and tumor proliferation (Ki67, MIB1 antibody) was assessed immunohistochemically. A theoretical model for the assessment of Ki67 was constructed based on sequential testing of the null hypothesis 20% Ki67-positive cells versus the two-sided alternative more or less than 20% positive cells.. Results: Assessment of Ki67 in 200 tumor cells showed an absolute average proliferation difference of 3.9% between core biopsies and surgical samples (p = 0.046, paired t-test) with the core biopsies being the more proliferative sample type. A corresponding analysis on the log-scale showed the average relative decrease from the biopsy to the surgical specimen to be 19% (p = 0.063, paired t-test on the log-scale). The difference was significant when using the more robust Wilcoxon matched-pairs signed-ranks test (p = 0.029). After dichotomization at 20%, 12 of the 50 sample pairs had discrepant proliferation status, 10 showed high Ki67 in the core biopsy compared to two in the surgical specimen (p = 0.039, McNemar's test). None of the corresponding results for 1000 tumor cells were significant - average absolute difference 2.2% and geometric mean of the ratios 0.85 (p = 0.19 and p = 0.18, respectively, paired t-tests, p = 0.057, Wilcoxon's test) and an equal number of discordant cases after dichotomization. Comparing proliferation values for the initial 200 versus the final 800 cancer cells showed significant absolute differences for both core biopsies and surgical samples 5.3% and 3.2%, respectively (p < 0.0001, paired t-test). Conclusions: A significant difference between core biopsy and surgical sample proliferation values was observed despite no intervening therapy. Future neo-adjuvant breast cancer studies may have to take this into consideration

Engraulis encrasicolus (Linnaeus, 1758): technical report about extraction and recognition of the digestive tract contents in early stages of the life cycle

The study of ichthyio-plankton stages and its relations with the environment and other organisms is therefore crucial for a correct use of fishery resources. In this context, the extraction and the analysis of the content of the digestive tract, is a key method for the identification of the diet in early larval stages, the determination of the resources they rely on and possibly a comparison with the diet of other species. Additionally this approach could be useful in determination on occurrence of species competition. This technique is preceded by the analysis of morphometric data (Blackith & Reyment, 1971; Marcus, 1990), that is the acquisition of quantitative variables measured from the morphology of the object of study. They are linear distances, count, angles and ratios. The subsequent application of multivariate statistical methods, aims to quantify the changes in morphological measures between and within groups, relating them to the type and size of prey and evaluate if some changes appear in food choices along the larvae growth

Studio dell'attività delle glutathione s-transferasi nel Mytilus galloprovincialis nella Laguna di Venezia

Le glutatione S-transferasi (GSTs) sono una famiglia di isoenzimi detossificanti che catalizzano la coniugazione di varie molecole tossiche con il glutatione rendendole meno reattive e più facilmente eliminabili dall’organismo. Poiché molti induttori della sintesi delle GSTs sono specie inquinanti, è stata suggerita la possibilità di utilizzare l’espressione delle GSTs citosoliche come indice di inquinamento. Sono stati prelevati campioni di Mytilus galloprovincialis in differenti siti della laguna veneziana a differenti gradi di inquinamento. Per ogni sito è stata misurata l’attività transferasica di campioni rappresentativi del mitilo intero, dell’epatopancreas e del mitilo privato di epatopancreas. Studi preliminari sulle modalità, la riproducibilità del metodo di trattamento e sulla misura dell’attività transferasica hanno evidenziato la necessità di ottimizzare la procedura di trattamento dei campioni in quanto l’attività transferasica è particolarmente sensibile alla temperatura ed all’effetto delle proteasi. In generale l’attività delle GSTs è risultata particolarmente elevata nei campioni raccolti nei siti più inquinati dimostrando così che le GSTs nel Mytilus Galloprovincialis possono essere utili biomarcatori dell’inquinamento ambientale. Si sta esaminando la possibilità di quantificare ed identificare le singole isoforme di GSTs tramite cromatografia di affinità ed HPLC

Persistent and Emerging Organic Pollutants in the Marine Coastal Environment of the Gulf of Milazzo (Southern Italy): Human Health Risk Assessment

The Gulf of Milazzo (north-eastern Sicily) has been recognized as Italian Site of National Interest (SNI; areas characterized by high level of contamination with potential effects on human health) in 2005 because of its high level of pollution. In this study we measured the concentration of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), organochlorine pesticides (OCPs), and polyBrominated diphenyl ether (PBDE) in seawater and sediments sampled from the Gulf of Milazzo in order to assess (i) the environmental status of contamination, and (ii) cancer and non-cancer human health risk potentially due to dermal absorption from contaminated seawater and/or ingestion of contaminated fish. Particularly, POPs content in pelagic and demersal fish of different size classes (small, medium, and large) were estimated, starting from the measured seawater and sediments concentrations, using the KABAM model. In particular, Monte Carlo simulation techniques were applied to address uncertainty in assessment of the risk and to provide quantitative estimates of probability of exposition. Ingestion of contaminated pelagic and demersal fish was the dominant pathway of exposition with high probability of significant cancer risk (Ingestion Cancer Risk &gt;10–4) and significant non-cancer risk (Hazard Index &gt;1). No human health risks emerged to be associated to dermal adsorption from contaminated seawater. Benzo(a)pyrene show the highest Ingestion Cancer Risk with respect to the other PAHs, while the highest Hazard Index for non-cancerogenic molecules was estimated for the PBDE47 congener