Análisis retrospectivo de caracteres reproductivos en hembras bovinas criollas colombianas Romosinuano

The study’s objective is to estimate the repeatability of calving intervals and establish its relationship with different Romosinuano females’ reproductive efficiency characteristics. We analyzed a database with 3,112 useful records of 871 females, collected in 1936-2016 from the Nation’s Germplasm Bank System for Food and Agriculture, Turipaná research center. The model used to calculate the variance components needed to estimate the repeatability of calving intervals value was an animal model of repeated measures over time. The variance components were estimated using the rptR package of the R software, specialized in statistical data analysis. Based on the estimated repeatability value, we calculated and correlated each female’s genetic value and most probable producing ability. The estimated average values of the calving interval, repeatability, reproductive efficiency, and correlation between genetic value and most probable producing ability were 379.74 ± 47.74 days, 0.02 ± 0.01, 96 %, and 93.7 %, respectively. The estimated repeatability for the calving interval was low, showing a low correlation between the females’ calving intervals of the analyzed herd. The high reproductive efficiency of the Romosinuano breed indicates great adaptation to the environment, making crossbreeding an opportunity for the national herd’s reproductive efficiency improvement.El objetivo del estudio fue estimar la repetibilidad del intervalo entre partos y establecer la relación con diferentes caracteres de eficiencia reproductiva de hembras Romosinuano. Una base de datos con 3.112 registros útiles de 871 hembras, colectados en el periodo 1936-2016, y provenientes del hato de conservación del Sistema de Bancos de Germoplasma de la Nación para la Alimentación y la Agricultura, del centro de investigación Turipaná, fue analizada. El modelo empleado para calcular los componentes de varianza necesarios para estimar el valor de repetibilidad del intervalo entre partos consistió en un modelo animal de medidas repetidas en el tiempo. Los componentes de varianza fueron estimados usando paquete rptR del software R, especializado en el análisis estadístico de datos. Con base en el valor estimado de la repetibilidad, se calculó y correlacionó el valor genético y la capacidad más probable de producción para cada hembra. Los valores promedio estimados del intervalo entre partos, la repetibilidad, la eficiencia reproductiva y la correlación entre el valor genético y la capacidad más probable de producción fueron 379,74 ± 47,74 días, 0,02 ± 0,01, 96 % y 93,7 %, respectivamente. La repetibilidad estimada para el intervalo entre partos fue baja, lo que demuestra también una baja correlación entre los intervalos de las hembras del hato analizado. La alta eficiencia reproductiva de la raza Romosinuano indica una gran adaptación al medio ambiente y la perfila como una oportunidad de mejora reproductiva del hato nacional mediante cruzamiento con otras razas

Influencia de la inclusión del efecto materno en la estimación de parámetros genéticos del peso al destete en un hato de ganado de carne

ABSTRACT: The component of (co)variance and genetic parameters for weaning weight trait in animals of pure (Brahman) or crossbreed (Zebu cattle) breeds were estimated, with the aim to estimate and to compare the genetic parameters and genetic value with or without including the maternal genetic effects by mean of Animal model, using MTDFREML program. Five models were considered including 1) the maternal genetic group, 2) calving, and 3) contemporary group as fixed effects, 4) direct and maternal genetic effects and 5) maternal permanent environmental effects, as random effects, and finally the residual error effect. Direct heritability coefficients varied form median to low (h2 a, 0.10 to 0.29) in all models. Models that included the maternal genetic effect presented the lowest values of maternal heritability (h2 m, 0.07 to 0.17). The genetic correlations between direct and maternal effects were negative and with low magnitude (-0.18 and -0.29). The models were compared between each other using the Maximum Likelihood method (- 2 log L) based on a X2 test, and it gave as result that the best model was the five one (Y = Xb + Z1a + Z3m + Z2ep + e) which included all effects.RESUMEN: En el presente trabajo se estimaron componentes de (co)varianza y parámetros genéticos para la característica peso al destete en animales de las razas brahman y cebú comercial. El objetivo general fue estimar y comparar los parámetros genéticos incluyendo o no el efecto genético materno por medio del Modelo Animal, usando el programa MTDFREML. Se consideraron cinco modelos que incluyeron como efectos fijos el grupo genético materno, el número de partos y el grupo contemporáneo, y como aleatorios los efectos genéticos directos y maternos y los efectos del ambiente permanente materno, además del efecto del error residual. Los coeficientes de heredabilidad directa fueron de medios a bajos (h2 a, 0.10 a 0.29) en todos los modelos. Los modelos que incluyeron el efecto genético materno presentaron valores de heredabilidad materna bajos (h2 m, 0.07 a 0.17). Las correlaciones genéticas entre los efectos directo y materno fueron de baja magnitud y negativas (-0.18 y -0.29). Se compararon los modelos entre sí realizando la prueba de máxima verosimilitud (-2LogL) a través de la prueba de ji cuadrado, obteniéndose como resultado que el mejor modelo fue el número 5 (Y = Xβ + Z1a + Z3m + Z2ep + e), el cual tuvo en cuenta todos los efectos

Efecto de caracteres propios e inherentes al animal sobre la edad al primer parto en la hembra bovina de la raza Romosinuano

The aim of the work was to characterize phenotypically and genetically the age at first calving of bovine females of the Romosinuano breed of the Bovine Germplasm Bank of the Turipaná Research Center. For this, 1190 records of age at first calving, obtained between 1936 and 2015, were used. Initially, a bootstrapping was carried out to determine which variables had an effect on that character. Subsequently, the genetic parameters for the same, were obtained after estimation of the components of variance from the animal model, by maximum restricted likelihood, using the MTDFREML program. The mean and deviation for age at first calving was 34.56 ± 3.48 months and the inheritance index of 0.32 ± 0.09. The fixed effects of sex of the calf, and the year and month of birth classes of the bovine female were evaluated, of which the last two had significant influence on the character. In general, the inheritance index indicated that selection for age at first calving may have an interesting effect to promote desirable changes in genetic composition, should it be desired to promote genetic gains for this character in the bovine population of the breed. Romosinuano.El objetivo del trabajo consistió en caracterizar fenotípica y genéticamente la edad al primer parto de hembras bovinas de la raza Romosinuano del banco de Germoplasma Bovino del Centro de Investigación Turipaná. Para esto, se usaron 1190 registros de edad al primer parto, obtenidos entre los años de 1936 al 2015. Inicialmente, un bootstrapping se llevó a cabo para determinar que variables tenían efecto sobre dicho carácter. Posteriormente, los parámetros genéticos para el mismo, fueron obtenidos previa estimación de los componentes de varianza a partir del modelo animal, mediante máxima verosimilitud restringida, utilizando el programa MTDFREML. La media y desviación para la edad al primer parto fue de 34.56 ± 3.48 meses y el índice de herencia de 0.32 ± 0.09. Se evaluaron los efectos fijos de sexo de la cría, y las clases de año y mes de nacimiento de la hembra bovina, de los cuales las dos últimas tuvieron influencia significativa sobre el carácter. En general, el índice de herencia indicó que la selección para la edad al primer parto puede tener un efecto interesante para promover cambios deseables en la composición genética, en caso de que se desease promover ganancias genéticas para este carácter en la población bovina de la raza Romosinuano

Análisis retrospectivo de caracteres reproductivos en hembras bovinas criollas colombianas Romosinuano

The study’s objective is to estimate the repeatability of calving intervals and establish its relationship with different Romosinuano females’ reproductive efficiency characteristics. We analyzed a database with 3,112 useful records of 871 females, collected in 1936-2016 from the Nation’s Germplasm Bank System for Food and Agriculture, Turipaná research center. The model used to calculate the variance components needed to estimate the repeatability of calving intervals value was an animal model of repeatedmeasures over time. The variance components were estimated using the rptR package of the R software, specialized in statistical data analysis. Based on the estimated repeatability value, we calculated and correlated each female’s genetic value and most probable producing ability. The estimated average values of the calving interval, repeatability, reproductive efficiency, and correlation between genetic value and most probable producing ability were 379.74 ± 47.74 days, 0.02 ± 0.01, 96%, and 93.7%, respectively. The estimated repeatability for the calving interval was low, showing a low correlation between the females’ calving intervals of the analyzed herd. The high reproductive efficiency of the Romosinuano breed indicates great adaptation to the environment, makingcrossbreeding an opportunity for the national herd’s reproductive efficiency improvement.El objetivo del estudio fue estimar la repetibilidad del intervalo entre partos y establecer la relación con diferentes caracteres de eficiencia reproductiva de hembras Romosinuano. Una base de datos con 3.112 registros útiles de 871 hembras, colectados en el periodo 1936-2016, y provenientes del hato de conservación del Sistema de Bancos de Germoplasma de la Nación para la Alimentación y la Agricultura, del centro de investigación Turipaná, fue analizada. El modelo empleado para calcular los componentes de varianza necesarios para estimar el valor de repetibilidad del intervalo entre partos consistió en un modelo animal de medidas repetidas en el tiempo. Los componentes de varianza fueron estimados usando paquete rptR del softwareR, especializado en el análisis estadístico de datos.Con base en el valor estimado de la repetibilidad, se calculó y correlacionó el valor genético y la capacidad más probable de producción para cada hembra. Los valores promedio estimados del intervalo entre partos, la repetibilidad, la eficiencia reproductiva y la correlación entre el valor genético y la capacidad más probable de producción fueron 379,74±47,74 días, 0,02±0,01, 96% y 93,7%, respectivamente. La repetibilidad estimada para el intervalo entre partos fue baja, lo que demuestra también una baja correlación entre los intervalos de las hembras del hato analizado. La alta eficiencia reproductiva de la raza Romosinuano indica una gran adaptación al medio ambiente y la perfila como una oportunidad de mejora reproductiva del hato nacional mediante cruzamiento con otras raza

Fitting lactation curves in a Colombian Holstein herd using nonlinear models

Statistical characterization of dairy cows lactation curves allows prediction of total milk yield from one or a few test-day records. The objectives were the characterization of milk production in a Colombian Holstein herd under tropical dairy production and to evaluate the statistical performance of six different lactation curve models on test-day records. The data set included 425 full lactations and 244,876 test day records of 14 consecutive years. Records of adjusted milk yield at 305 days, lactation length, production peak, time to the peak, and lactation persistence were analyzed under an univariate mixed linear model, and six non-linear lactation curve models were evaluated on the basis of their goodness of fit on test day records. Cows averaged 5830 ± 59 kg of milk at 305 days, 330 ± 3 days of lactation, 27.7 ± 0.3 kg of milk at peak, 4.7 ± 0.1 wk to the peak and 63.1 ± 0.6 % of persistence calculated for a 6 month period. Adjusted milk yield, lactation length and production peak increased with the number of calving. The best goodness of fit for each lactation curve or minimum means square error for records of average daily milk production of each week was reached by the two-phase lactation curve of Grossman and Koops. Under the conditions of this tropical dairy herd, results provide substantial evidence favoring the two-phase lactation curve of Grossman and Koops for research and technical purposes, while the model of Wood would be the best choice for livestock use