Un algorithme hors-ligne en temps linéaire pour calculer les vitesses du processeur qui minimisent la consommation d'énergie

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Assemblage et dysfonctionnement de ribosomes mammifères : une étude structure/fonction par cryo-MET

Le ribosome, qui traduit le code génétique en protéines, est une machinerie moléculaire essentielle au fonctionnement optimal des cellules. La formation, ou biogenèse, de ces ribosomes est un processus très complexe, qui doit être finement contrôlé et régulé pour produire rapidement des sous-unités ribosomiques matures et fonctionnelles. Des mutations dans des composants de cet appareil cellulaire essentiel sont à l'origine de diverses maladies, comme des anémies, des retards de croissance mais aussi certains cancers. Dans ce contexte, la caractérisation précise de l'ensemble des mécanismes d'assemblage et de fonctionnement des ribosomes en conditions normales et pathologiques devient un enjeu primordial. Ces questions scientifiques ont récemment connu des avancées majeures, notamment grâce à l'utilisation de la cryo-microscopie électronique (cryo-EM). En effet, couplée à des analyses fonctionnelles, la résolution de différents états structuraux du ribosome a permis la description de nombreux mécanismes moléculaires responsables de la biogenèse des ribosomes, ainsi que de différentes étapes de la traduction. Mon projet de thèse s'inscrit pleinement dans ces analyses structure/fonction de l'assemblage et du fonctionnement des ribosomes. Mon premier projet de thèse s'est focalisé sur les étapes finales de la maturation de la petite sous-unité ribosomique humaine, aussi appelée sous-unité 40S. Pour cela, en me basant sur des analyses structurales par cryo-EM, j'ai mené des études fonctionnelles sur des particules pré-40S purifiées à une étape tardive de leur maturation, grâce à la forme catalytiquement inactive de l'ATPase RIO1. Ce travail m'a permis de mettre en évidence les rôles combinés de RIO1 et de la protéine ribosomique RPS26 dans le déclenchement du clivage du pré-ARNr 18S-E par l'endonucléase NOB1, entrainant la maturation finale de l'ARNr 18S. Mon second projet de thèse visait à comprendre les effets d'une mutation ponctuelle de la protéine ribosomique RPS15 (mutation RPS15-P131S) sur les mécanismes de traduction. Des mutations ponctuelles dans le domaine C-terminal de cette protéine de la petite sous-unité ribosomique sont en effet retrouvées dans de nombreux cas de leucémies et de tumeurs solides. Pour cela, j'ai entamé une analyse structure/fonction de ces ribosomes mutants. J'ai purifié et déterminé par cryo-EM les structures 3D de ribosomes en cours de traduction. J'ai comparé les structures de ribosomes " sauvages " à leurs homologues mutants, portant la mutation RPS15-P131S. Mes résultats montrent que la mutation provoque la déstabilisation structurale du domaine C-terminal de RPS15, ce qui entraînerait un ralentissement de l'étape d'élongation de la traduction. Une hypothèse pour expliquer ce phénomène serait que la déstructuration du domaine C-ter de RPS15 empêche l'accommodation correcte des ARNt amino-acylés dans le site A du ribosome.The ribosome, which translates the genetic code into proteins, is an essential molecular machinery for the optimal functioning of cells. The formation, or biogenesis, of these ribosomes is a very complex process, which must be finely tuned to rapidly produce mature and functional ribosomal subunits. Mutations in components of this essential cellular apparatus are at the origin of various diseases, such as anemia, growth retardation but also some cancers. In this context, the precise characterization of the assembly and functioning mechanisms of ribosomes in normal and pathological conditions becomes crucial. This topic has recently seen major advances, notably thanks to the use of cryo-electron microscopy (cryo-EM). Indeed, coupled with functional analyses, the resolution of different structural states of ribosomes or precursors of ribosomal subunits has allowed to describe many molecular mechanisms responsible for ribosome biogenesis, as well as different steps of translation. My thesis project is fully in line with these structure/function analyses of ribosome assembly and function. My first thesis project focused on the final maturation steps of the human small ribosomal subunit, also called 40S subunit. For this purpose, based on structural analysis by cryo-EM, I conducted functional studies on pre-40S particles purified at a late stage of their maturation, thanks to a tagged and catalytically inactive form of the ATPase RIO1. This work allowed to demonstrate the combined action of both RIO1 with the ribosomal protein RPS26 in triggering the cleavage of the pre-rRNA 18S-E by the NOB1 endonuclease, leading to the final maturation of 18S rRNA. My second thesis project aimed at understanding the effects of a point mutation in the ribosomal protein RPS15 (S15-P131S mutation) on translation mechanisms. Point mutations in the C-terminal domain of this protein of the small ribosomal subunit are indeed found in many cases of leukemia and solid tumors. For this purpose, I initiated a structure/function analysis of these mutant ribosomes. I purified and determined the cryo-EM 3D structures of translating ribosomes. I compared the structures of wild type ribosomes to their mutant counterparts, carrying the S15-P131S mutation. My results show that the mutation causes structural destabilization of the C-terminal domain of RPS15, which results in a slowing down of the elongation step of translation. One hypothesis to explain this phenomenon would be that the destructuring of the C-terminal domain of RPS15 prevents the proper accommodation of aminoacylated tRNAs in the A-site of the ribosome

Ce que commémorer veut dire : la Smithsonian Institution et l’État fédéral à l’approche du Bicentenaire de la Révolution américaine, 1964-1976

À travers l’exemple des pratiques commémoratives à la Smithsonian Institution pour le Bicentenaire de la Révolution aux États-Unis (1964-1976), cet article renouvelle les travaux entrepris dans les années 1990 sur les commémorations nationales et la mémoire officielle. Il met en lumière la définition problématique des activités commémoratives en en soulignant la nature hétérogène. L’étude de la préparation des célébrations de 1976 à la Smithsonian Institution permet de redéfinir la commémoration en ne la cantonnant pas à son aboutissement rituel. Elle apparaît alors comme un processus collectif de construction d’un consensus qui n’existe pas a priori. Ce consensus est régi par le fonctionnement hiérarchique de la bureaucratie d’État. L’injonction à commémorer pénètre donc le quotidien professionnel d’acteurs qui l’intériorisent de manière inégale, notamment en fonction de leur statut professionnel et de leur position hiérarchique.This article renews the study of national commemorations and public memory that was undertaken in the 1990s through the case study of commemorative practices at the Smithsonian Institution in the years preceding the Bicentennial of the American Revolution (1964-1976). It shows that beyond their heterogeneous forms, commemorative activities share strong common points. The process of preparing for the Bicentennial at the Smithsonian sheds new light on what commemoration is, and pleads for a definition of commemorative activities that is not restricted to their ritual outcome. Commemoration appears to be a collective process of consensus-building, which is framed by the vertical organization of the federal bureaucracy. A top-down commemorative demand pervades the everyday professional activities of actors, who more or less adopt it as their own, depending on their professional status and their places in the chain of command

[Book Review] Parliamentarism: From Burke to Weber

William Selinger’s Parliamentarism: from Burke to Weber aims to redefine our understanding of what it means to live in a free state. It displaces the concept of “democracy” as a (supposedly) central concern for a range of canonical nineteenth-century authors, and demonstrates that another concept, that of “parliamentarism”, stood at the core of many European liberal writers’ quest for liberty. Selinger shows that Montesquieu’s description of a “balanced” English constitution protected by a system of checks and balances was challenged by a number of contemporary observers of British politics (including Jean-Louis de Lolme and Edmund Burke), who elaborated rival accounts emphasizing instead the dominant position of a powerful representative assembly which mirrored the nation it represented. The resulting doctrine of “parliamentarism”, the book demonstrates through a series of case studies that include Tocqueville, Mill and Weber, subsequently became the “dominant paradigm of a free state across Europe” (p. 9) in the nineteenth century

Performance Analysis of an Assembly System: a Case Study

International audiencePetri nets are well suited for modelling production systems and analysis of their performance. In this paper we study a flowshop system driven by a set of local command units and a central controller, modelled with Timed Coloured Petri nets by means of CPN Tools. We show that Petri nets can be applied not only to improve its production rate by comparing various algorithms for the controller policy service, but also to analyse the significance of parameters as conveying and mechanical delays, maximum work-in-process or to understand problems appeared in the real syste

Sodium and chloride channelopathies with myositis:Coincidence or connection?

Introduction: A proximal myopathy develops in some patients with muscle channelopathies, but the causative molecular mechanisms are unknown. Methods: We reviewed retrospectively all clinical and muscle biopsy findings of 3 patients with channelopathy and additional myositis. Direct DNA sequencing was performed. Results: Pathogenic mutations were identified in each case. Biopsies demonstrated inflammatory infiltrates. Conclusions: Clinicians should consider muscle biopsy in channelopathy patients with severe myalgia and/or subacute weakness and accompanying elevated creatine kinase. Chance association of myositis and channelopathy is statistically unlikely. An alternative hypothesis suggests that inflammatory insults could contribute to myopathy in some patients. Muscle Nerve 44: 283-288, 201

Délier les langues sans défaire les liens

« Restons groupés ! » L’injonction semble parfois vaine, parfois dangereuse. Quels qu’en soient les effets, elle reflète le travail social de création, d’entretien et de mise en cause des collectifs et des discours sur ces collectifs. Que signifie « appartenir à un groupe » lorsque la société est travaillée par des logiques individualistes tout autant que par le renouvellement des modalités de l’engagement collectif et la composition/recomposition des groupes ? Les discours jouent à cet égard..

Un processus à décision de Markov en temps discret pour minimiser l'énergie sous des contraintes d'échéances

This paper proposes a Discrete Time Markov Decision Process (MDP) approach to compute the optimal on-line speed scaling policy to minimize the energy consumption of a single processor executing a finite or infinite set of jobs with real-time constraints. We provide several qualitative properties of the optimal policy: monotonicity with respect to the jobs parameters, comparison with on-line deterministic algorithms. Numerical experiments in several scenarios show that our proposition performs well when compared with off-line optimal solutions and out-performs on-line solutions oblivious to statistical information on the jobs