Blind protein structure prediction using accelerated free-energy simulations.

We report a key proof of principle of a new acceleration method [Modeling Employing Limited Data (MELD)] for predicting protein structures by molecular dynamics simulation. It shows that such Boltzmann-satisfying techniques are now sufficiently fast and accurate to predict native protein structures in a limited test within the Critical Assessment of Structure Prediction (CASP) community-wide blind competition

CPT, Lorentz invariance and anomalous clash of symmetries

In this paper we first discuss the analysis regarding the role of Lorentz symmetry in the perturbative non-gravitational anomalies for a family of fermions, which has been recently performed in arXiv:0809.0184. The theory is assumed to be translational invariant, power-counting renormalizable and based on a local action, but is allowed to have general Lorentz violating operators, including those that break CPT. The main result is that Lorentz symmetry does not participate in the clash of symmetries that leads to the anomalies. Moreover, here we provide a simple "semiclassical" argument that shortly illustrates the origin of this fact.Comment: 8 pages, no figures. To appear in the proceedings of Discrete '08: Symposium on Prospects in the Physics of Discrete Symmetries, Valencia, Spain, 11-16 Dec 200

Words make people think, ... but pictures make people feel: The effect negative vs. positive images on charitable behavior

We ran an experiment where the subjects initially played a four-round dictator game, after which each subject was shown either a set of positive images or a set of negative images. Finally the subjects played another four-round dictator game.
The effect of the sign of images shown is clear on the players’ behaviors: positive images have moderate effects on charitable behavior while negative images dramatically increase charity.
We could therefore infer from our experimental results that showing negative images of the Haitian and Chilean catastrophes to the international public would have significant positive impacts on international donations to the victims and the rebuilding programs in both countries

Povezanost slike o vlastitu tijelu s tjelesnom aktivnošću, zadovoljstvom životom i mediteranskom prehranom španjolskih adolescenata

The aim of this study was to examine the association between physical self-concept and physical activity, the intention to be physically active, life satisfaction, and adherence to the Mediterranean diet in adolescents. A total of 1,808 Spanish adolescents (12-16 years of age) participated in this cross-sectional study. Physical Self Questionnaire, Moderate-to-Vigorous Physical Activity Screening Measure, Intention to be Physically Active Scale, Satisfaction with Life Scale, and Mediterranean Diet Quality Index were administered. The boys with a lower physical self-concept showed higher odd ratios of being inactive, having low intentions of being physically active, poor life satisfaction and low adherence to the Mediterranean diet. Similarly, most of the associations were also statistically significant in girls as well. In conclusion, the study reveals that having a low level of physical self-concept increases the risk of being inactive and of having a low level of intention to be physically active, life satisfaction and adherence to the Mediterranean diet in adolescents.Cilj je ovog istraživanja bio utvrditi povezanost između samopoimanja tijela i tjelesne aktivnosti, namjere da se bude tjelesno aktivan, zadovoljstva životom i pridržavanja mediteranske prehrane kod adolescenata. U ovo transverzalno istraživanje bilo je uključeno ukupno 1.808 španjolskih adolescenata (u dobi od 12 do 16 godina). U istraživanju su korišteni sljedeći mjerni instrumenti: Physical Self Questionnaire, Moderate-to-Vigorous Physical Activity Screening Measure, Intention to be Physically Active Scale, Satisfaction with Life Scale, i Mediterranean Diet Quality Index. Dječaci s nižom razinom zadovoljstva vlastitim tijelom, u bilo kojoj njegovoj dimenziji, pokazali su veću sklonost tjelesnoj neaktivnosti, nižu odlučnost da budu tjelesno aktivni, manifestirali su nisku razinu zadovoljstva životom i slabo pridržavanje načela mediteranske prehrane. Slično kao i kod dječaka, većina relacija bila je statistički značajna i kod djevojčica. Zaključno, istraživanje je ukazalo na činjenicu da niska razina samopoimanja povećava rizik za neaktivnost i za nisku razinu namjere za kasniju tjelesnu aktivnost te da je povezano sa slabijim zadovoljstvom životom i slabijim pridržavanjem načela mediteranske prehrane kod adolescenata

Aproximación a la mecánica de los cabalgamientos en el contexto general de la deformación en el NW de la península Ibèrica

En la cadena herciniana del NW de la Peninsula Ibérica, las Zonas Cantábrica y Asturoccidental-leonesa proporcionan buenos ejemplos de cabalgamientos desarrollados en diferentes momentos en el transcurso de la secuencia deformacional. Así, en la Zona Asturoccidental-leonesa, al existir temperaturas y presiones de confinamiento relativamente elevadas, las rocas reaccionaron ante los esfuerzos de manera dúctil, originándose pliegues; al progresar la deformación, se alcanzó la resistencia de las rocas en algunos puntos y estas se fracturaron originándose cabalgamientos. Las fracturas cortan pues a plieguesanteriores y en consecuencia no se producen sobre planos de debilidad preexistentes. Debido a la gran resistencia que ofrecen las superfícies de fractura al deslizamiento, se asocian a ellas numerosas fracturas menores y otras estructuras a veces muy penetrativas. Por el contrario, en la Zona Cantábrica. La temperatura y la preslón de confinamiento fueron menores, lo cual debió dificultar la deformación dúctil y disminuyó probablemente la resistencia de las rocas. Por otro lado, se desarrolló una superfície de debilidad en las rocas debida a la existencia de una presión de fluidos alta y tal vez a la presencia de algunos niveles poco resistentes a la deformación. Todo ello condicionó el que se originase un despegue generalizado cuya ascensión mediante fallas lístricas dio lugar a mantos de tipo apalachense. Desaparecidas las condiciones quefavorecieron el emplazamiento de estos mantos, el acortamiento posterior se llevó a cabo por un proceso de plegamiento

Conifers behaviour under irrigation in the Yaucha dam : Mendoza, Argentina

La provincia de Mendoza, que se ubica en el Centro-Oeste de la República Argentina, posee una extensión de 150.830 km2. Prácticamente todas las actividades agropecuarias y forestales están concentradas en el 3% de su territorio que es posible irrigar. Al oeste, en el límite con la República de Chile, está la cadena montañosa que forma parte de la región fitogeográfica del Desierto Andino que se extiende por más de 500 km, con un ancho promedio de 100 km. El objetivo de este trabajo fue evaluar la supervivencia y el comportamiento de distintas especies de coníferas en zonas del piedemonte mendocino. Para ello se instaló una parcela experimental en el Dique Yaucha, ubicado en el Departamento de San Carlos a 34°00' S y 69°07' O, a una altura de 1213 msnm. Las especies del ensayo fueron: Pinus pinea L., Pinus halepensis Mill. y Cupressus arizonica Greene. Se llevaron plantas de aproximadamente 0,70 m de altura, que se instalaron a una distancia de plantación definitiva de 3 x 3 m y se regaron superficialmente por surcos. Se tomaron periódicamente datos dasométricos de diámetro altura de pecho (DAP) de todas las plantas, altura total de los árboles promedio de cada especie, registrándose además las fallas producidas y el estado sanitario. Los resultados obtenidos a la edad de 17 años son: Pinus pinea: diámetro promedio 17 cm, altura 6,60 m y 22,5% de fallas; Pinus halepensis: diámetro promedio 16 cm, altura 8,60 m y 12,2% de fallas; Cupressus arizonica: diámetro promedio 20 cm, altura 7,75 m y 18,1% de fallas. Es de destacar que P. pinea presenta el 6% de fustes bifurcados a baja altura. Todas las especies tienen un buen estado sanitario, no registrándose hasta la fecha plagas o enfermedades que hayan afectado el desarrollo del ensayo.The Province of Mendoza is ubicated in the Mid-Western part of República Argentina with an extention of 150.830 km2. There all agrarian and forestry activities are concentrated in a 3% of its territory which is able to be irrigated. On the West side part of the province by the border with Republic of Chile appears the mountain ridge (Cordillera de Los Andes) which is a part of the fitogeographical region called Andinian Desert. It extents for over 500 km with an average wide of 100 km. This work is aimed to evaluate survival and behaiviours of different species of conifers in the mountanious country side of Mendoza. To do so there was installed an experimental plots in Yaucha dam, placed in San Carlos department at 34°00' S and 69°07' W, at an altitude of 1213 mosl. Species on test were Pinus pinea L., Pinus halepensis Mill., and Cupressus arizonica Greene. For the experience were used plants of approximately 0.70 m height and were installed at a definite plantation distance of 3 x 3 m whit surface irrigation stream water by furrows. Periodically dasometric data is taken about diameter, chest height of every plant, total average height of trees of each specie, registering failures and sanitary situation. Results obtained at the age of 17 years are: Pinus pinea: average diameter 17 cm, height 6.60 m, failure 22.5%; Pinus halepensis: average diameter 16 cm, height 8.60 m, failure 12.2%; Cupressus arizonica: average diameter 20 cm, height 7.75 m, failure 18.1%. It is to be noted that Pinus pinea presents 6% of low height forked branches. All species are in good sanitary shape not registering any pests or diseases affecting the experiment up to date.Fil: Calderón, Alberto. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Producción AgropecuariaFil: Bustamante, Juan A.. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Producción AgropecuariaFil: Riu, Nuria. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Producción AgropecuariaFil: Perez, Silvina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Producción Agropecuari

Pinus nigra behaviour under irrigation in the Yaucha dam : Mendoza, Argentina

La provincia de Mendoza, que se ubica en el Centro-Oeste de la República Argentina, posee una extensión de 150.830 km2. Prácticamente todas las actividades agropecuarias y forestales están concentradas en el 3% de su territorio que es posible irrigar. Al Oeste, en el límite con la República de Chile, está la cadena montañosa que forma parte de la región fitogeográfica del Desierto Andino que se extiende por más de 500 km, con un ancho promedio de 100 km. El objetivo de este trabajo fue evaluar la supervivencia y el comportamiento de distintas procedencias de Pinus nigra en zonas del piedemonte mendocino. Para ello se instaló una parcela experimental en el Dique Yaucha, ubicado en el Departamento de San Carlos a 34°00’ S y 69°07’ O, a una altura de 1.213 msnm. Las procedencias del ensayo fueron: Pinus nigra var. clusiana (Francia), Pinus nigra var. austríaca (Livo - Italia), Pinus nigra var. austríaca (Lasa - Italia), Pinus nigra var. knin (ex Yugoslavia) y Pinus nigra var. pyramidalis (Turquía). Se llevaron plantas de aproximadamente 0,30 m de altura que se instalaron a una distancia de plantación definitiva de 3 x 3 m y se regaron superficialmente por surcos. Se tomaron periódicamente datos dasométricos de diámetro altura de pecho (DAP) de todas las plantas, altura total de los árboles promedio de cada procedencia, registrándose además las fallas producidas y el estado sanitario. Los resultados obtenidos a la edad de 17 años son: Pinus nigra var. clusiana (Francia): diámetro promedio 12,1 cm, altura 5,2 m y 10% de fallas; Pinus nigra var. austríaca (Livo -Italia): diámetro promedio 13 cm, altura 4,6 m y 25% de fallas; Pinus nigra var. austríaca (Lasa - Italia): diámetro promedio 13,9 cm, altura 5,60 m y 0% de fallas; Pinus nigra var. knin (ex Yugoslavia): diámetro promedio 14,1cm, altura 6,2 m y 15% de fallas y Pinus nigra var. pyramidalis (Turquía): diámetro promedio 11,6 cm, altura 5,8 m y 40% de fallas. Las plantas presentan una gran variabilidad de formas desde porte abierto a muy fastigiado. Todas las procedencias presentan un buen estado sanitario, no registrándose hasta la fecha plagas o enfermedades que hayan afectado el desarrollo del ensayo.The Province of Mendoza is located in the Mid-Western part of República Argentina with an extension of 150.830 km2. There all agrarian and forestry activities are concentrated in a 3% of its territory which is able to be irrigated. On the West side part of the province by the border with Republic of Chile appears the mountain ridge (Cordillera de Los Andes) which is a part of the fitogeographical region called Andinian Desert. It extents for over 500 km with an average wide of 100 km. This work was aimed to evaluate survival and behaviour of different provenience of Pinus nigra in the mountainous country side of Mendoza. To do so there was installed an experimental plot in Yaucha dam, placed in San Carlos Department at 34°00’ S and 69°07’ W, at an altitude of 1.213 mosl. Proveniences on test were Pinus nigra var. clusiana (France), Pinus nigra var. austriaca (Livo - Italy), Pinus nigra var. austriaca (Lasa - Italy), Pinus nigra var. knin (ex Yugoslavia) y Pinus nigra var. pyramidalis (Turkey). For the experience were used plants of approximately 0.30m height and were installed at a definite plantation distance of 3 x 3 m whit surface irrigation stream water by furrows. Periodically, dasometric data is taken about diameter, chest height of every plant, total average height of trees of each provenience, registering failures and sanitary situation. Results obtained at the age of 17 years are: Pinus nigra var. clusiana (Francia): dbh 12,1 cm, height 5.2 m and 10% failures; Pinus nigra var. austriaca (Livo - Italia): dbh 13 cm, height 4.6 m and 25% failures; Pinus nigra var. austriaca (Lasa - Italia): dbh 13,9 cm, height 5.60 m y 0% failures; Pinus nigra var. knin (ex Yugoslavia): dbh 14,1cm, height 6.2 m and 15% failures and Pinus nigra var. pyramidalis (Turquía): dbh 11,6 cm, height 5,8 m and 40% failures. All provenience are in good sanitary shape not registering any pests or diseases affecting the experiment up to date.Fil: Calderón, Alberto. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Producción AgropecuariaFil: Bustamante, Juan A.. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Producción AgropecuariaFil: Riu, Nuria. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Producción AgropecuariaFil: Perez, Silvina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Departamento de Producción Agropecuari

Comportamiento de coníferas bajo riego : Mendoza, Argentina

La provincia de Mendoza, ubicada en el centro-oeste de la Argentina, tiene una extensión de 150 830 km2. Prácticamente todas las actividades agropecuarias y forestales están concentradas en el 3 % de su territorio que es posible irrigar. Al oeste, en el límite con Chile, está la cadena montañosa que forma parte de la región fitogeográfica del Desierto Andino que se extiende por más de 500 km, con un ancho promedio de 100 km. El objetivo del trabajo fue introducir algunas especies de coníferas y evaluar su comportamiento en dicha región fitogeográfica, con la finalidad de lograr un aprovechamiento forestal, proteger el suelo contra la erosión hídrica y/o eólica, modificar el paisaje y desarrollar áreas de explotación turística. Las especies seleccionadas en esta primera etapa fueron: Cedrus deodara, Cupressus arizonica, Cupressus macrocarpa, Juniperus virginiana, Pinus griffithii, Pinus halepensis, Pinus nigra, Pinus pinaster, Pinus pinea y Pinus radiata. Las experiencias se llevaron a cabo en dossitios, separados por más de 150 km, y situados a 1 050 y 2 000 msnm, respectivamente. Se tomaron datos de supervivencia, altura y diámetro de los individuos, y se efectuaron observaciones sobre su hábito de crecimiento y condiciones fitosanitarias. Las principales conclusiones fueron las siguientes: 1. Todas las especies mostraron buen estado fitosanitario sin haberse detectado ninguna plaga o enfermedad de importancia. 2. El hábito de crecimiento fue el correspondiente a cada especie; sólo hubo fustes bifurcados en algunos individuos de Pinus pinea. 3. Las especies que evidenciaron mayor aptitud fueron: Juniperus virginiana, Cupressus arizonica, Pinus pinea, Pinus pinaster y Cupressus macrocarpa.Mendoza is situated at the centerwestern of Argentina. It have 150 830 km2.Every agricultural and forestry activities areconcentrated in the irrigated lands which ones are only the 3 % of the territory.At the western of the province, in the limit with Chile, it is the mountain range which is part of the phytogeographical region of the Andean Desert. It has an approximated extension of 500 km, with an average width of 100 km.This work was done in order to insert coniferous and valuate their behavior of in this phytogeographical region for forestal exploitation, soil protection against water and/or wind erosion, landscape modification and tourist exploitation. The species selected in this first stage were: Cedrus deodara, Cupressus arizonica, Cupressus macrocarpa, Juniperus virginiana,Pinus griffithii, Pinus halepensis, Pinus nigra,Pinus pinaster, Pinus pinea y Pinus radiata.The experience was carrying on two sites separate by 150 km and situated at 1 050 and 2 000 meters over sea level, respectively. It was taken survival, height and diameter data, observations about growth habits and plant health conditions.Main conclusions: 1. Every species showed a good health state without important pests or diseases. 2. Growth habit was normal for each specie. It was detected double stem in Pinuspinea only. 3. The species which showed better aptitude are: Juniperus virginiana, Cupressus arizonica, Pinus pinea, Pinus pinaster and Cupressus macrocarpa.Fil: Calderón, Alberto. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto ForestalFil: Riu, Nuria. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto ForestalFil: Bustamante, Juan A.. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto ForestalFil: Perez, Silvina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto ForestalFil: Settepani, Valeria. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto Foresta

Defensive plats responses induced by Nesidiocoris tenuis (Hemiptera:Miridae) on tomato plants

In the last decade, biological control programs for greenhouse tomatoes and other crops have been successfully implemented using zoophytophagous plant bugs (Miridae), which can feed on both plant tissues and insect prey. It is well known that plants respond to herbivore attacks by releasing volatile compounds through diverse pathways triggered by phytohormones. These herbivore-induced plant volatiles can alert neighboring plants, repel or attract herbivores, and attract natural enemies of these herbivores. Nevertheless, the possible benefits of induced plant responses by zoophytophagous predators that could add to their usefulness as biocontrol agents have not been studied until now. Here we show that the zoophytophagous predator Nesidiocoris tenuis activated abscisic acid and jasmonic acid (JA) signaling pathways in tomato plants, which made them less attractive to the whitefly Bemisia tabaci, a major tomato pest worldwide, and more attractive to the whitefly parasitoid, Encarsia formosa. We also found that intact tomato plants exposed to volatiles from N. tenuis-punctured plants activated the JA pathway, and as a consequence, E. formosa was also attracted to these intact plants with activated defense systems. Thus, our results demonstrate that N. tenuis not only benefits tomato plants directly by entomophagy but also indirectly by phytophagy, which induces a physiological response in the tomato plant.The research leading to these results was funded by the European Union Seventh Framework Programme (FP7/2007–2013) under grant agreement no. 265865, the Spanish Ministry of Science and Innovation (AGL2011-30538-C03) and the Conselleria d’Agricultura, Pesca i Alimentació de la Generalitat Valenciana. The authors thank Virginia Pedroche (IVIA) and Blas Agut (UJI) for their technical assistance, Javier Calvo (KOPPERT BS) for the supply of insects, Universitat Jaume I-SCIC for technical support and two anonymous reviewers for their valuable comments on a previous version of this manuscript