Dissemination of blaIMP-8 among Enterobacteriaceae isolates from a Buenos Aires Hospital

Entre agosto de 2008 y diciembre de 2011 se detectaron en el Hospital Interzonal General de Agudos «Evita» de Lanús 6 aislamientos de enterobacterias productoras de metalo- β-lactamasas, distribuidos en tres especies: Enterobacter cloacae (4), Klebsiella oxytoca (1) y Citrobacter freundii (1). Los seis aislamientos presentaron un perfi l de multirresistencia y se confi rmó la presencia del gen blaIMP-8. Cinco aislamientos además expresaron la β-lactamasa de espectro extendido PER-2. El gen blaIMP-8 fue hallado como primer casete de un integrón de clase 1. Sin embargo, la secuencia 3´ conservada no pudo detectarse en tres aislamientos. En todos los casos, el gen blaIMP-8 fue transferido por conjugación a Escherichia coli resistente a azida. Mediante PFGE se observó que los cuatro aislamientos de E. cloacae no estuvieron genéticamente relacionados. Estos son los primeros hallazgos de metalo-β-lactamasas en la institución, que sugieren una posible diseminación horizontal del gen blaIMP-8 intra e interespecies.From August 2008 to December 2011, six metallo-β-lactamase-producing isolates, four Enterobacter cloacae, one Klebsiella oxytoca and one Citrobacter freundii, were detected at Hospital Interzonal General de Agudos “Evita” in Lanús. All six isolates showed multiresistant profi les and the presence of the blaIMP-8 gene. Five isolates also expressed PER-2 extended spectrum β-lactamase. The blaIMP-8 gene was found as the fi rst cassette in a class 1 integron. However, the 3´ conserved sequence could not be detected in three isolates. In all cases, blaIMP-8 was transferred by conjugation to azide-resistant Escherichia coli J53. PFGE analysis revealed that the four E. cloacae isolates were not genetically related. These are the fi rst metallo-β-lactamases detected in this institution and our results suggest a possible intra- and inter-species horizontal dissemination of blaIMP-8.Fil: Togneri, Ana M.. Hospital Interzonal General de Agudos Evita. Laboratorio de Bacteriología; ArgentinaFil: Gómez, Sonia Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Area de Antimicrobianos; ArgentinaFil: Podestá, Laura B.. Hospital Interzonal General de Agudos Evita. Laboratorio de Bacteriología; ArgentinaFil: Pérez, Marcela P.. Hospital Interzonal General de Agudos Evita. Laboratorio de Bacteriología; ArgentinaFil: Faccone, Diego Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Area de Antimicrobianos; ArgentinaFil: Ríos, Lidia E.. Hospital Interzonal General de Agudos Evita. Laboratorio de Bacteriología; ArgentinaFil: Gañete, Marcelo A.. Hospital Interzonal General de Agudos Evita. Laboratorio de Bacteriología; ArgentinaFil: Anchordoqui, María S. . Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Area de Antimicrobianos; ArgentinaFil: Pasterán, Fernando G.. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Area de Antimicrobianos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Corso, Alejandra C.. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Area de Antimicrobianos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

New Carbenicillin-Hydrolyzing β-Lactamase (CARB-7) from Vibrio cholerae Non-O1, Non-O139 Strains Encoded by the VCR Region of the V. cholerae Genome

In a previous study, an analysis of 77 ampicillin-nonsusceptible (resistant plus intermediate categories) strains of Vibrio cholerae non-O1, non-O139, isolated from aquatic environment and diarrheal stool, showed that all of them produced a β-lactamase with a pI of 5.4. Hybridization or amplification by PCR with a probe for bla(TEM) or primers for bla(CARB) gene families was negative. In this work, an environmental ampicillin-resistant strain from this sample, ME11762, isolated from a waterway in the west region of Argentina, was studied. The nucleotide sequence of the structural gene of the β-lactamase was determined by bidirectional sequencing of a Sau3AI fragment belonging to this isolate. The gene encodes a new 288-amino-acid protein, designated CARB-7, that shares 88.5% homology with the CARB-6 enzyme; an overall 83.2% homology with PSE-4, PSE-1, CARB-3, and the Proteus mirabilis N29 enzymes; and 79% homology with CARB-4 enzyme. The gene for this β-lactamase could not be transferred to Escherichia coli by conjugation. The nucleotide sequence of the flanking regions of the bla(CARB-7) gene showed the occurrence of three 123-bp V. cholerae repeated sequences, all of which were found outside the predicted open reading frame. The upstream fragment of the bla(CARB-7) gene shared 93% identity with a locus situated inside V. cholerae's chromosome 2. These results strongly suggest the chromosomal location of the bla(CARB-7) gene, making this the first communication of a β-lactamase gene located on the VCR island of the V. cholerae genome

Molecular characteristics of mcr-1-carrying plasmids and new mcr-1 variant recovered from polyclonal clinical Escherichia coli from Argentina and Canada.

We have characterized nine mcr-1-harboring plasmids from clinical Escherichia coli isolates previously described in Argentina and Canada. Three of these plasmids carried a mcr-1-variant called here mcr-1.5. All these E. coli isolates were not clonally related and were recovered in different years and locations. However, their mcr-1-harboring plasmids showed high identity among them and to others characterized in other countries, which strongly suggests that this plasmid-type is playing an important role in spreading this mechanism of resistance to polymyxins

Emergence of PER-2 and VEB-1a in Acinetobacter baumannii Strains in the Americas

Fil: Pasteran, Fernando. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Antimicrobianos; Argentina.Fil: Rapoport, Melina. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Antimicrobianos; Argentina.Fil: Petroni, Alejandro. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Antimicrobianos; Argentina.Fil: Faccone, Diego. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Antimicrobianos; Argentina.Fil: Corso, Alejandra. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Antimicrobianos; Argentina.Fil: Galas, Marcelo. ANLIS Dr.C.G.Malbrán. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas. Departamento de Bacteriología. Servicio de Antimicrobianos; Argentina.Fil: Vázquez, Miryam. Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez. Sección Microbiología; Argentina.Fil: Procopio, Adriana. Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez. Sección Microbiología; Argentina.Fil: Tokumoto, Marta. Instituto de Cardiología y Cirugía Cardiovascular Fundación Favaloro; Argentina.Fil: Cagnoni, Viviana. Instituto de Cardiología y Cirugía Cardiovascular Fundación Favaloro; Argentina

CARB-9, a Carbenicillinase Encoded in the VCR Region of Vibrio cholerae Non-O1, Non-O139 Belongs to a Family of Cassette-Encoded β-Lactamases

The gene bla(CARB-9) was located in the Vibrio cholerae super-integron, but in a different location relative to bla(CARB-7). CARB-9 (pI 5.2) conferred β-lactam MICs four to eight times lower than those conferred by CARB-7, differing at Ambler's positions V97I, L124F, and T228K. Comparison of the genetic environments of all reported bla(CARB) genes indicated that the CARB enzymes constitute a family of cassette-encoded β-lactamases

Caracterización molecular de Klebsiella pneumoniae y Enterobacter cloacae productoras de ß-lactamasas de espectro extendido tipo SHV-5 en una UCI neonatal de Lima

Objetivo: Determinar los mecanismos implicados en la transmisión y resistencia antimicrobiana de aislamientos hospitalarios de Klebsiella pneumoniae y Enterobacter cloacae. Materiales y métodos: Se determinó la diversidad genética de 10 aislamientos bacterianos provenientes de pacientes hospitalizados y muestras ambientales procedentes de una unidad de cuidados intensivos de neonatos de un hospital de Lima utilizando el patrón de banda de ADN ribosomal y plasmídico. Posteriormente, se caracterizó la resistencia antimicrobiana y sus principales factores utilizando electroforesis de punto isoeléctrico, Southern Blotting y PCR. Finalmente se evaluó la capacidad de transferencia de la resistencia mediante ensayos de conjugación bacteriana. Resultados: Todos los aislamientos de K. pneumoniae y E. cloacae presentaron el mismo perfil plasmídico. Los aislamientos de E. cloacae presentaron un mismo patrón genético, por el contrario se encontraron cuatro genotipos distintos de K. pneumoniae altamente relacionados. Todos los aislamientos produjeron ß- lactamasa de especto extendido Tipo SHV-5 transferible a otras especies. Conclusiones: El estudio sugiere que la diseminación de estas bacterias en los neonatos pudo haber sido favorecida por un inadecuado manejo asistencial, una defectuosa conservación de leche para el consumo neonatal y el indiscriminado uso de antibióticos, el cual generó una activa transmisión de genes responsables de la resistencia antimicrobiana

Capacidad de los laboratorios nacionales de referencia en Latinoamérica para detectar mecanismos de resistencia emergentes Capability of national reference laboratories in Latin America to detect emerging resistance mechanisms

OBJETIVO: Evaluar la capacidad de 17 laboratorios nacionales de referencia que participan en el Programa Latinoamericano de Control de Calidad en Bacteriología y Resistencia a los Antimicrobianos (LA-EQAS) para detectar mecanismos de resistencia emergentes, a saber: resistencia de enterobacterias a carbapenemes por presencia de Klebsiella pneumoniae carbapenemasa (KPC); resistencia de enterobacterias a carbapenemes por presencia de metalobetalactamasas (MBL) tipo IMP, y resistencia intermedia a vancomicina de aislamientos de Staphylococcus aureus (VISA). MÉTODOS: Se enviaron los siguientes tres aislamientos a los 17 laboratorios participantes del LA-EQAS: Klebsiella pneumoniae OPS-161 productor de KPC, Enterobacter cloacae OPS-166 productor de IMP y S. aureus OPS-165 con resistencia intermedia a vancomicina. Se evaluó la interpretación de las pruebas de sensibilidad y detección del mecanismo de resistencia y el tamaño de los halos de inhibición (método de difusión por discos) o valor de la concentración inhibitoria mínima (CIM). RESULTADOS: La concordancia en la detección de los mecanismos de resistencia fue de 76,4%, 73,3% y 66,7% con respecto a la cepas K. pneumoniae OPS-161, E. cloacae OPS-166 y S. aureus OPS-165, respectivamente. La concordancia entre las zonas de inhibición obtenidas por los laboratorios participantes y los rangos establecidos por el laboratorio coordinador fue aceptable en los tres aislamientos, ya que alcanzó 90,8%, 92,8% y 88,9%, respectivamente, para cada cepa. CONCLUSIONES: La concordancia global en la detección de los mecanismos de resistencia KPC, MBL y VISA fue de 72,1%. Consideramos que los laboratorios nacionales de referencia de América Latina son capaces de reconocer estos mecanismos de resistencia emergentes y se espera que en el futuro la concordancia alcance su nivel máximo.<br>OBJECTIVE: To evaluate the capability of 17 national reference laboratories participating in the Latin American Quality Control Program in Bacteriology and Antibiotic Resistance (LA-EQAS) to detect emerging resistance mechanisms- namely: resistance of enterobacteria to carbapenems due to the presence of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) and metallo-beta-lactamase (MBL) type IMP, and intermediate resistance of Staphylococcus aureus isolates to vancomycin (vancomycin-intermediate resistant S. aureus-VISA). METHODS: The following three isolates were sent to the 17 participating LA-EQAS laboratories: KPC -producing Klebsiella pneumoniae PAHO-161, IMP-producing Enterobacter cloacae PAHO-166, and S. aureus PAHO-165 with intermediate resistance to vancomycin. Performance of each of the following operations was evaluated: interpretation of sensitivity tests, detection of the resistance mechanism, and assessment of either inhibition halo size (disk diffusion method) or minimum inhibitory concentration (MIC). RESULTS: Concordance in the detection of resistance mechanisms was 76.4%, 73.3%, and 66.7% for the K. pneumoniae PAHO-161, E. cloacae PAHO-166, and S. aureus PAHO-165 strains, respectively. Concordance between the inhibition areas observed by the participating laboratories and the ranges established by the coordinating laboratory was acceptable for all three isolates, at 90.8%, 92.8%, and 88.9%, respectively. CONCLUSIONS: Overall concordance in on the detection of KPC, MBL, and VISA resistance mechanisms was 72.1%. We consider the national reference laboratories in Latin America capable of recognizing these emerging resistance mechanisms and expect that maximum levels of concordance will be reached in the future

Diseminación de blaIMP-8 en enterobacterias aisladas en un hospital de Buenos Aires

Entre agosto de 2008 y diciembre de 2011 se detectaron en el Hospital Interzonal General de Agudos «Evita» de Lanús 6 aislamientos de enterobacterias productoras de metalo-ß-lactamasas, distribuidos en tres especies: Enterobacter cloacae (4), Klebsiella oxytoca (1) y Citrobacter freundii (1). Los seis aislamientos presentaron un perfil de multirresistencia y se confirmó la presencia del gen blaIMP-8. Cinco aislamientos además expresaron la ß-lactamasa de espectro extendido PER-2. El gen blaIMP-8 fue hallado como primer casete de un integrón de clase 1. Sin embargo, la secuencia 3´ conservada no pudo detectarse en tres aislamientos. En todos los casos, el gen blaIMP-8 fue transferido por conjugación a Escherichia coli resistente a azida. Mediante PFGE se observó que los cuatro aislamientos de E. cloacae no estuvieron genéticamente relacionados. Estos son los primeros hallazgos de metalo-ß-lactamasas en la institución, que sugieren una posible diseminación horizontal del gen blaIMP-8 intra e interespecies

Comparison of pMCRs described in this study.

<p>Arrows indicate the following predicted open reading frames: conjugation, stability, and accessory genes (green, yellow), antimicrobial resistance genes (<i>mcr-1</i> in red; <i>mcr-1</i>.<i>5</i> in dark red), transposon-related genes (blue), hypothetical proteins (grey), shufflon segments (black), and replicase genes (brown). The light blue-shaded areas show regions with ~100% identity among the compared structures; grey-shaded areas, 50% identity or lower.</p